MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42e

Total Repeats: 10909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_007765	CAG	2	6	213446	213451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360460
4502	NC_007765	AGT	2	6	213460	213465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360460
4503	NC_007765	CTT	2	6	213473	213478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360460
4504	NC_007765	CGG	3	9	213481	213489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360460
4505	NC_007765	GCC	2	6	213500	213505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360460
4506	NC_007765	CGAC	2	8	213571	213578	25 %	0 %	25 %	50 %	86360460
4507	NC_007765	GAA	2	6	213581	213586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360460
4508	NC_007765	GGC	2	6	213596	213601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360460
4509	NC_007765	CGA	2	6	213611	213616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360460
4510	NC_007765	GGT	2	6	213626	213631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360460
4511	NC_007765	GAA	2	6	213665	213670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360460
4512	NC_007765	CGT	2	6	213698	213703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360460
4513	NC_007765	ATC	2	6	213758	213763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360460
4514	NC_007765	TGA	2	6	213793	213798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360460
4515	NC_007765	GTG	2	6	213861	213866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360460
4516	NC_007765	GCGA	2	8	213912	213919	25 %	0 %	50 %	25 %	86360460
4517	NC_007765	CGA	2	6	213931	213936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360460
4518	NC_007765	TCT	2	6	214083	214088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360460
4519	NC_007765	GGC	2	6	214178	214183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360460
4520	NC_007765	CCA	2	6	214190	214195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360460
4521	NC_007765	GGC	2	6	214590	214595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360461
4522	NC_007765	CGA	2	6	214597	214602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360461
4523	NC_007765	GCG	2	6	214671	214676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360461
4524	NC_007765	GCA	2	6	214734	214739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360461
4525	NC_007765	CGC	2	6	214761	214766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360461
4526	NC_007765	GCT	2	6	215002	215007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360461
4527	NC_007765	GGA	2	6	215122	215127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360461
4528	NC_007765	GC	3	6	215147	215152	0 %	0 %	50 %	50 %	86360461
4529	NC_007765	TTC	2	6	215186	215191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360461
4530	NC_007765	CAA	2	6	215227	215232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360461
4531	NC_007765	CCA	2	6	215385	215390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360461
4532	NC_007765	CCGTT	2	10	215400	215409	0 %	40 %	20 %	40 %	86360461
4533	NC_007765	AGTG	2	8	215442	215449	25 %	25 %	50 %	0 %	86360461
4534	NC_007765	ATG	2	6	216701	216706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360462
4535	NC_007765	CG	3	6	216742	216747	0 %	0 %	50 %	50 %	86360462
4536	NC_007765	GGA	2	6	216765	216770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360462
4537	NC_007765	CGC	2	6	216773	216778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360462
4538	NC_007765	GCG	2	6	216795	216800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360462
4539	NC_007765	CGC	2	6	216874	216879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360462
4540	NC_007765	GCTG	2	8	216926	216933	0 %	25 %	50 %	25 %	86360462
4541	NC_007765	AGA	2	6	216953	216958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360462
4542	NC_007765	CGA	2	6	217059	217064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360462
4543	NC_007765	CCG	2	6	217083	217088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360462
4544	NC_007765	GC	3	6	217099	217104	0 %	0 %	50 %	50 %	86360462
4545	NC_007765	GCC	2	6	217123	217128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360462
4546	NC_007765	TCGACA	2	12	217160	217171	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	86360462
4547	NC_007765	CCA	2	6	217200	217205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360462
4548	NC_007765	TGC	2	6	217220	217225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360462
4549	NC_007765	CATC	2	8	217242	217249	25 %	25 %	0 %	50 %	86360462
4550	NC_007765	CCG	2	6	217257	217262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360462
4551	NC_007765	CGG	2	6	217284	217289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360462
4552	NC_007765	GAA	2	6	217291	217296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360462
4553	NC_007765	TCC	2	6	217298	217303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360462
4554	NC_007765	CGC	2	6	217428	217433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360462
4555	NC_007765	TG	3	6	217435	217440	0 %	50 %	50 %	0 %	86360462
4556	NC_007765	CGG	2	6	217468	217473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360462
4557	NC_007765	GCGG	2	8	217505	217512	0 %	0 %	75 %	25 %	86360462
4558	NC_007765	GGC	2	6	217524	217529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360462
4559	NC_007765	TAAA	2	8	219173	219180	75 %	25 %	0 %	0 %	86360463
4560	NC_007765	GC	3	6	219189	219194	0 %	0 %	50 %	50 %	86360463
4561	NC_007765	CCAAA	2	10	219257	219266	60 %	0 %	0 %	40 %	86360463
4562	NC_007765	CG	3	6	219282	219287	0 %	0 %	50 %	50 %	86360463
4563	NC_007765	CGA	2	6	219313	219318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360463
4564	NC_007765	GTA	2	6	219393	219398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360463
4565	NC_007765	TAA	2	6	219437	219442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86360463
4566	NC_007765	CAA	2	6	219445	219450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360463
4567	NC_007765	CGA	2	6	219497	219502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360463
4568	NC_007765	GCC	2	6	219869	219874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360463
4569	NC_007765	GAA	3	9	219875	219883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360463
4570	NC_007765	AAT	2	6	219997	220002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86360463
4571	NC_007765	TCA	2	6	220053	220058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360463
4572	NC_007765	CGAA	2	8	220115	220122	50 %	0 %	25 %	25 %	86360463
4573	NC_007765	CTC	2	6	220162	220167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360463
4574	NC_007765	CCT	2	6	220216	220221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360463
4575	NC_007765	GC	3	6	220247	220252	0 %	0 %	50 %	50 %	86360463
4576	NC_007765	TGTC	2	8	220369	220376	0 %	50 %	25 %	25 %	86360463
4577	NC_007765	GGCA	2	8	220526	220533	25 %	0 %	50 %	25 %	86360463
4578	NC_007765	CGA	2	6	220625	220630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360463
4579	NC_007765	AGAT	2	8	220668	220675	50 %	25 %	25 %	0 %	86360463
4580	NC_007765	CGC	2	6	220720	220725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360463
4581	NC_007765	ACTTT	2	10	220752	220761	20 %	60 %	0 %	20 %	86360463
4582	NC_007765	TCG	2	6	220797	220802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360463
4583	NC_007765	GAG	2	6	220829	220834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360463
4584	NC_007765	CG	3	6	220864	220869	0 %	0 %	50 %	50 %	86360463
4585	NC_007765	ACT	2	6	220905	220910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360463
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4588	NC_007765	CCT	2	6	221208	221213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360463
4589	NC_007765	TTC	2	6	221357	221362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360463
4590	NC_007765	GGCC	2	8	221373	221380	0 %	0 %	50 %	50 %	86360463
4591	NC_007765	ACG	2	6	221419	221424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360463
4592	NC_007765	TGC	2	6	221466	221471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360463
4593	NC_007765	GCTATT	2	12	221484	221495	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	86360463
4594	NC_007765	AGC	2	6	221579	221584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360463
4595	NC_007765	AAG	2	6	221607	221612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360463
4596	NC_007765	GTT	2	6	221616	221621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360463
4597	NC_007765	A	6	6	221675	221680	100 %	0 %	0 %	0 %	86360463
4598	NC_007765	ACA	2	6	221710	221715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360463
4599	NC_007765	CG	3	6	221725	221730	0 %	0 %	50 %	50 %	86360463
4600	NC_007765	CAG	2	6	221748	221753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360463
4601	NC_007765	GCC	2	6	221772	221777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360463
4602	NC_007765	AAT	2	6	221794	221799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86360463
4603	NC_007765	CCG	2	6	222122	222127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360464
4604	NC_007765	TGC	2	6	222163	222168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360464
4605	NC_007765	CCGC	2	8	222182	222189	0 %	0 %	25 %	75 %	86360464
4606	NC_007765	GCCC	2	8	222190	222197	0 %	0 %	25 %	75 %	86360464
4607	NC_007765	CAA	2	6	222203	222208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360464
4608	NC_007765	ATG	2	6	222223	222228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360464
4609	NC_007765	ATA	2	6	222229	222234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86360464
4610	NC_007765	TAA	2	6	222247	222252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86360464
4611	NC_007765	CGTG	2	8	222266	222273	0 %	25 %	50 %	25 %	86360464
4612	NC_007765	GAT	2	6	222279	222284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360464
4613	NC_007765	GCTC	2	8	222296	222303	0 %	25 %	25 %	50 %	86360464
4614	NC_007765	GCCG	2	8	222308	222315	0 %	0 %	50 %	50 %	86360464
4615	NC_007765	TCG	2	6	222367	222372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360464
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4617	NC_007765	GC	3	6	222401	222406	0 %	0 %	50 %	50 %	86360464
4618	NC_007765	GCC	2	6	222432	222437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360464
4619	NC_007765	ATG	2	6	222489	222494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360464
4620	NC_007765	TCT	2	6	222512	222517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360464
4621	NC_007765	CCG	2	6	222545	222550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360464
4622	NC_007765	GCGG	2	8	222558	222565	0 %	0 %	75 %	25 %	86360464
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4624	NC_007765	TGT	2	6	222668	222673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360464
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4991	NC_007765	GCG	2	6	240037	240042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360479
4992	NC_007765	TAT	2	6	240057	240062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86360479
4993	NC_007765	CGG	3	9	240080	240088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360479
4994	NC_007765	GCC	2	6	240123	240128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360479
4995	NC_007765	CGCC	2	8	240146	240153	0 %	0 %	25 %	75 %	86360479
4996	NC_007765	CG	4	8	240183	240190	0 %	0 %	50 %	50 %	86360479
4997	NC_007765	CAG	2	6	240224	240229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360479
4998	NC_007765	CGC	2	6	240234	240239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360479
4999	NC_007765	TCG	2	6	240274	240279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360479
5000	NC_007765	TCG	2	6	240515	240520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360480

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