MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42c

Total Repeats: 401

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007764	GC	3	6	440	445	0 %	0 %	50 %	50 %	86360047
2	NC_007764	CG	3	6	1257	1262	0 %	0 %	50 %	50 %	86360048
3	NC_007764	GC	3	6	2045	2050	0 %	0 %	50 %	50 %	86360049
4	NC_007764	TC	3	6	2155	2160	0 %	50 %	0 %	50 %	86360049
5	NC_007764	GC	3	6	2939	2944	0 %	0 %	50 %	50 %	86360049
6	NC_007764	GC	3	6	4380	4385	0 %	0 %	50 %	50 %	86360050
7	NC_007764	CT	3	6	4913	4918	0 %	50 %	0 %	50 %	86360051
8	NC_007764	GC	3	6	5170	5175	0 %	0 %	50 %	50 %	86360052
9	NC_007764	GC	3	6	8670	8675	0 %	0 %	50 %	50 %	86360054
10	NC_007764	AT	3	6	8931	8936	50 %	50 %	0 %	0 %	86360055
11	NC_007764	TC	3	6	9217	9222	0 %	50 %	0 %	50 %	86360055
12	NC_007764	GC	3	6	10224	10229	0 %	0 %	50 %	50 %	86360056
13	NC_007764	GC	3	6	10503	10508	0 %	0 %	50 %	50 %	86360056
14	NC_007764	CG	3	6	11034	11039	0 %	0 %	50 %	50 %	86360057
15	NC_007764	GC	3	6	12957	12962	0 %	0 %	50 %	50 %	86360061
16	NC_007764	GC	4	8	13273	13280	0 %	0 %	50 %	50 %	86360061
17	NC_007764	GC	3	6	13343	13348	0 %	0 %	50 %	50 %	86360061
18	NC_007764	CG	3	6	13733	13738	0 %	0 %	50 %	50 %	86360062
19	NC_007764	TC	3	6	14340	14345	0 %	50 %	0 %	50 %	86360062
20	NC_007764	TG	3	6	14613	14618	0 %	50 %	50 %	0 %	86360063
21	NC_007764	GC	3	6	14731	14736	0 %	0 %	50 %	50 %	86360063
22	NC_007764	GC	4	8	14878	14885	0 %	0 %	50 %	50 %	86360063
23	NC_007764	GC	3	6	15668	15673	0 %	0 %	50 %	50 %	86360064
24	NC_007764	CG	3	6	16010	16015	0 %	0 %	50 %	50 %	86360064
25	NC_007764	CT	3	6	17332	17337	0 %	50 %	0 %	50 %	86360065
26	NC_007764	GC	3	6	17600	17605	0 %	0 %	50 %	50 %	86360065
27	NC_007764	CG	3	6	20040	20045	0 %	0 %	50 %	50 %	86360068
28	NC_007764	GC	3	6	20092	20097	0 %	0 %	50 %	50 %	86360068
29	NC_007764	CG	3	6	21556	21561	0 %	0 %	50 %	50 %	86360070
30	NC_007764	CG	4	8	21892	21899	0 %	0 %	50 %	50 %	86360070
31	NC_007764	GC	3	6	22518	22523	0 %	0 %	50 %	50 %	86360071
32	NC_007764	GC	3	6	23347	23352	0 %	0 %	50 %	50 %	86360071
33	NC_007764	GA	3	6	23424	23429	50 %	0 %	50 %	0 %	86360071
34	NC_007764	TC	3	6	24179	24184	0 %	50 %	0 %	50 %	86360072
35	NC_007764	GC	3	6	24196	24201	0 %	0 %	50 %	50 %	86360072
36	NC_007764	GC	3	6	25017	25022	0 %	0 %	50 %	50 %	86360073
37	NC_007764	CG	4	8	27921	27928	0 %	0 %	50 %	50 %	86360076
38	NC_007764	CG	3	6	28212	28217	0 %	0 %	50 %	50 %	86360077
39	NC_007764	GC	3	6	28352	28357	0 %	0 %	50 %	50 %	86360077
40	NC_007764	GC	3	6	28730	28735	0 %	0 %	50 %	50 %	86360077
41	NC_007764	CG	4	8	29396	29403	0 %	0 %	50 %	50 %	86360077
42	NC_007764	GC	3	6	30087	30092	0 %	0 %	50 %	50 %	86360078
43	NC_007764	AG	3	6	30351	30356	50 %	0 %	50 %	0 %	86360078
44	NC_007764	CG	3	6	30373	30378	0 %	0 %	50 %	50 %	86360078
45	NC_007764	CG	3	6	30935	30940	0 %	0 %	50 %	50 %	86360079
46	NC_007764	AG	3	6	30992	30997	50 %	0 %	50 %	0 %	86360079
47	NC_007764	CG	3	6	31109	31114	0 %	0 %	50 %	50 %	86360080
48	NC_007764	TC	3	6	31416	31421	0 %	50 %	0 %	50 %	86360080
49	NC_007764	GC	3	6	31569	31574	0 %	0 %	50 %	50 %	86360081
50	NC_007764	GC	3	6	32031	32036	0 %	0 %	50 %	50 %	86360081
51	NC_007764	CG	3	6	32807	32812	0 %	0 %	50 %	50 %	86360082
52	NC_007764	GA	3	6	32854	32859	50 %	0 %	50 %	0 %	86360082
53	NC_007764	CG	3	6	33113	33118	0 %	0 %	50 %	50 %	86360082
54	NC_007764	GA	3	6	34038	34043	50 %	0 %	50 %	0 %	86360083
55	NC_007764	AG	3	6	34066	34071	50 %	0 %	50 %	0 %	86360083
56	NC_007764	AG	4	8	35238	35245	50 %	0 %	50 %	0 %	86360084
57	NC_007764	GC	3	6	36858	36863	0 %	0 %	50 %	50 %	86360085
58	NC_007764	CG	3	6	37088	37093	0 %	0 %	50 %	50 %	86360085
59	NC_007764	TC	3	6	37819	37824	0 %	50 %	0 %	50 %	86360085
60	NC_007764	GC	3	6	37833	37838	0 %	0 %	50 %	50 %	86360085
61	NC_007764	CG	3	6	38205	38210	0 %	0 %	50 %	50 %	86360086
62	NC_007764	GC	3	6	38211	38216	0 %	0 %	50 %	50 %	86360086
63	NC_007764	GC	3	6	38352	38357	0 %	0 %	50 %	50 %	86360086
64	NC_007764	CG	3	6	38779	38784	0 %	0 %	50 %	50 %	86360086
65	NC_007764	CG	3	6	42016	42021	0 %	0 %	50 %	50 %	86360089
66	NC_007764	GC	3	6	42067	42072	0 %	0 %	50 %	50 %	86360089
67	NC_007764	CG	3	6	42912	42917	0 %	0 %	50 %	50 %	86360089
68	NC_007764	CG	3	6	43260	43265	0 %	0 %	50 %	50 %	86360090
69	NC_007764	GC	3	6	43412	43417	0 %	0 %	50 %	50 %	86360090
70	NC_007764	GC	3	6	43465	43470	0 %	0 %	50 %	50 %	86360090
71	NC_007764	CG	3	6	43527	43532	0 %	0 %	50 %	50 %	86360090
72	NC_007764	GC	3	6	43936	43941	0 %	0 %	50 %	50 %	86360090
73	NC_007764	CG	3	6	44569	44574	0 %	0 %	50 %	50 %	86360091
74	NC_007764	CG	3	6	45505	45510	0 %	0 %	50 %	50 %	86360092
75	NC_007764	CT	3	6	45581	45586	0 %	50 %	0 %	50 %	86360093
76	NC_007764	GC	3	6	45776	45781	0 %	0 %	50 %	50 %	86360093
77	NC_007764	GC	3	6	46182	46187	0 %	0 %	50 %	50 %	86360093
78	NC_007764	GC	3	6	46433	46438	0 %	0 %	50 %	50 %	86360094
79	NC_007764	GC	4	8	47557	47564	0 %	0 %	50 %	50 %	86360096
80	NC_007764	GC	3	6	48602	48607	0 %	0 %	50 %	50 %	86360097
81	NC_007764	GC	3	6	49244	49249	0 %	0 %	50 %	50 %	86360098
82	NC_007764	GC	3	6	49612	49617	0 %	0 %	50 %	50 %	86360098
83	NC_007764	GC	3	6	49647	49652	0 %	0 %	50 %	50 %	86360098
84	NC_007764	GC	5	10	50050	50059	0 %	0 %	50 %	50 %	86360099
85	NC_007764	GC	3	6	50371	50376	0 %	0 %	50 %	50 %	86360099
86	NC_007764	CG	4	8	50510	50517	0 %	0 %	50 %	50 %	86360099
87	NC_007764	GC	3	6	52174	52179	0 %	0 %	50 %	50 %	86360100
88	NC_007764	TA	3	6	52774	52779	50 %	50 %	0 %	0 %	86360100
89	NC_007764	GC	3	6	52858	52863	0 %	0 %	50 %	50 %	86360100
90	NC_007764	AG	3	6	54324	54329	50 %	0 %	50 %	0 %	86360101
91	NC_007764	GC	3	6	54959	54964	0 %	0 %	50 %	50 %	86360101
92	NC_007764	AG	3	6	55249	55254	50 %	0 %	50 %	0 %	86360101
93	NC_007764	GC	3	6	56868	56873	0 %	0 %	50 %	50 %	86360103
94	NC_007764	GC	3	6	57269	57274	0 %	0 %	50 %	50 %	86360103
95	NC_007764	CG	3	6	57393	57398	0 %	0 %	50 %	50 %	86360103
96	NC_007764	CA	3	6	58138	58143	50 %	0 %	0 %	50 %	86360104
97	NC_007764	GC	3	6	58875	58880	0 %	0 %	50 %	50 %	86360104
98	NC_007764	GC	3	6	59631	59636	0 %	0 %	50 %	50 %	86360105
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100	NC_007764	GC	5	10	60890	60899	0 %	0 %	50 %	50 %	86360107
101	NC_007764	AT	3	6	61805	61810	50 %	50 %	0 %	0 %	86360107
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103	NC_007764	CG	3	6	62634	62639	0 %	0 %	50 %	50 %	86360108
104	NC_007764	GC	3	6	62970	62975	0 %	0 %	50 %	50 %	86360108
105	NC_007764	CG	3	6	63858	63863	0 %	0 %	50 %	50 %	86360108
106	NC_007764	CG	3	6	63894	63899	0 %	0 %	50 %	50 %	86360108
107	NC_007764	GC	4	8	64279	64286	0 %	0 %	50 %	50 %	86360109
108	NC_007764	GC	3	6	64438	64443	0 %	0 %	50 %	50 %	86360109
109	NC_007764	CT	3	6	64736	64741	0 %	50 %	0 %	50 %	86360109
110	NC_007764	GC	3	6	64933	64938	0 %	0 %	50 %	50 %	86360109
111	NC_007764	GC	3	6	66474	66479	0 %	0 %	50 %	50 %	86360111
112	NC_007764	GC	4	8	66799	66806	0 %	0 %	50 %	50 %	86360111
113	NC_007764	GC	3	6	67210	67215	0 %	0 %	50 %	50 %	86360112
114	NC_007764	GC	4	8	67904	67911	0 %	0 %	50 %	50 %	86360112
115	NC_007764	CG	3	6	68460	68465	0 %	0 %	50 %	50 %	86360113
116	NC_007764	GC	3	6	68826	68831	0 %	0 %	50 %	50 %	86360113
117	NC_007764	TG	3	6	69418	69423	0 %	50 %	50 %	0 %	86360114
118	NC_007764	AC	3	6	69701	69706	50 %	0 %	0 %	50 %	86360114
119	NC_007764	GC	3	6	71862	71867	0 %	0 %	50 %	50 %	86360116
120	NC_007764	GC	3	6	73253	73258	0 %	0 %	50 %	50 %	86360117
121	NC_007764	GC	3	6	73473	73478	0 %	0 %	50 %	50 %	86360117
122	NC_007764	GC	5	10	74925	74934	0 %	0 %	50 %	50 %	86360118
123	NC_007764	GC	3	6	75123	75128	0 %	0 %	50 %	50 %	86360118
124	NC_007764	AG	3	6	75735	75740	50 %	0 %	50 %	0 %	86360119
125	NC_007764	CG	3	6	76653	76658	0 %	0 %	50 %	50 %	86360120
126	NC_007764	CG	3	6	78006	78011	0 %	0 %	50 %	50 %	86360121
127	NC_007764	GC	3	6	79602	79607	0 %	0 %	50 %	50 %	86360122
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131	NC_007764	GC	3	6	83031	83036	0 %	0 %	50 %	50 %	86360125
132	NC_007764	CG	3	6	83741	83746	0 %	0 %	50 %	50 %	86360126
133	NC_007764	CG	3	6	84894	84899	0 %	0 %	50 %	50 %	86360127
134	NC_007764	GA	3	6	85013	85018	50 %	0 %	50 %	0 %	86360127
135	NC_007764	GC	3	6	85115	85120	0 %	0 %	50 %	50 %	86360127
136	NC_007764	TC	3	6	85205	85210	0 %	50 %	0 %	50 %	86360127
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141	NC_007764	CG	3	6	89015	89020	0 %	0 %	50 %	50 %	86360132
142	NC_007764	GC	3	6	89635	89640	0 %	0 %	50 %	50 %	86360132
143	NC_007764	GC	3	6	89778	89783	0 %	0 %	50 %	50 %	86360132
144	NC_007764	CG	3	6	89804	89809	0 %	0 %	50 %	50 %	86360132
145	NC_007764	GC	3	6	90226	90231	0 %	0 %	50 %	50 %	86360132
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.