MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42c

Total Repeats: 5385

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007764	GGC	2	6	141048	141053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360176
3002	NC_007764	ACA	2	6	141064	141069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360176
3003	NC_007764	ATC	2	6	141078	141083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360176
3004	NC_007764	TCG	3	9	141148	141156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360176
3005	NC_007764	GCT	2	6	141161	141166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360176
3006	NC_007764	AGGG	2	8	141187	141194	25 %	0 %	75 %	0 %	86360176
3007	NC_007764	CTT	2	6	141211	141216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360177
3008	NC_007764	CCG	2	6	141253	141258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360177
3009	NC_007764	GCC	2	6	141264	141269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360177
3010	NC_007764	TCG	2	6	141284	141289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360177
3011	NC_007764	ACG	2	6	141290	141295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360177
3012	NC_007764	AAG	2	6	141310	141315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360177
3013	NC_007764	CGA	2	6	141359	141364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360177
3014	NC_007764	CGG	2	6	141393	141398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360177
3015	NC_007764	CGG	2	6	141411	141416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360177
3016	NC_007764	CGG	2	6	141509	141514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360177
3017	NC_007764	GCC	2	6	141517	141522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360177
3018	NC_007764	GAGG	2	8	141588	141595	25 %	0 %	75 %	0 %	86360177
3019	NC_007764	GC	3	6	141598	141603	0 %	0 %	50 %	50 %	86360177
3020	NC_007764	GC	3	6	141699	141704	0 %	0 %	50 %	50 %	86360177
3021	NC_007764	CGA	2	6	141750	141755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360177
3022	NC_007764	CAC	2	6	141777	141782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360177
3023	NC_007764	GGC	2	6	141798	141803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360177
3024	NC_007764	GAG	2	6	141820	141825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360177
3025	NC_007764	GCC	2	6	141835	141840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360177
3026	NC_007764	CGT	2	6	141864	141869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360177
3027	NC_007764	CGA	2	6	141882	141887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360177
3028	NC_007764	CAT	2	6	141888	141893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360177
3029	NC_007764	CAG	2	6	141934	141939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360177
3030	NC_007764	ATC	2	6	141940	141945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360177
3031	NC_007764	CG	3	6	141953	141958	0 %	0 %	50 %	50 %	86360177
3032	NC_007764	CAGG	2	8	141987	141994	25 %	0 %	50 %	25 %	86360177
3033	NC_007764	GCC	2	6	142009	142014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360177
3034	NC_007764	TGC	2	6	142079	142084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360177
3035	NC_007764	CGT	2	6	142125	142130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360177
3036	NC_007764	CCT	2	6	142179	142184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360177
3037	NC_007764	GCC	2	6	142185	142190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360177
3038	NC_007764	AGC	2	6	142192	142197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360177
3039	NC_007764	CGG	2	6	142212	142217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360177
3040	NC_007764	GAA	2	6	142239	142244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360177
3041	NC_007764	ACG	2	6	142253	142258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360177
3042	NC_007764	CAT	2	6	142329	142334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360177
3043	NC_007764	CCGT	2	8	142338	142345	0 %	25 %	25 %	50 %	86360177
3044	NC_007764	TAT	2	6	142354	142359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86360177
3045	NC_007764	CGG	2	6	142458	142463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360177
3046	NC_007764	AGC	2	6	142469	142474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360177
3047	NC_007764	GCC	2	6	142498	142503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360177
3048	NC_007764	CGA	2	6	142524	142529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360177
3049	NC_007764	TGG	2	6	142553	142558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360177
3050	NC_007764	GCT	3	9	142575	142583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360177
3051	NC_007764	GCA	2	6	142590	142595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360177
3052	NC_007764	GGA	2	6	142596	142601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360177
3053	NC_007764	TCA	2	6	142619	142624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360177
3054	NC_007764	GAT	2	6	142732	142737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360177
3055	NC_007764	CTG	2	6	142747	142752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360177
3056	NC_007764	TGGC	2	8	142779	142786	0 %	25 %	50 %	25 %	86360177
3057	NC_007764	GAC	2	6	142800	142805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360177
3058	NC_007764	GGAT	2	8	142926	142933	25 %	25 %	50 %	0 %	86360178
3059	NC_007764	GCC	2	6	143036	143041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360178
3060	NC_007764	GTC	2	6	143095	143100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360178
3061	NC_007764	AGG	2	6	143137	143142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360178
3062	NC_007764	CGA	2	6	143171	143176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360178
3063	NC_007764	GAT	2	6	143357	143362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360178
3064	NC_007764	TTGA	2	8	143436	143443	25 %	50 %	25 %	0 %	86360178
3065	NC_007764	GC	3	6	143532	143537	0 %	0 %	50 %	50 %	86360178
3066	NC_007764	AT	3	6	143572	143577	50 %	50 %	0 %	0 %	86360178
3067	NC_007764	TGC	2	6	143587	143592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360178
3068	NC_007764	ATCG	2	8	143601	143608	25 %	25 %	25 %	25 %	86360178
3069	NC_007764	CG	3	6	143607	143612	0 %	0 %	50 %	50 %	86360178
3070	NC_007764	GCC	2	6	143840	143845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360179
3071	NC_007764	CG	3	6	143912	143917	0 %	0 %	50 %	50 %	86360179
3072	NC_007764	CG	3	6	143923	143928	0 %	0 %	50 %	50 %	86360179
3073	NC_007764	GAAGC	2	10	143929	143938	40 %	0 %	40 %	20 %	86360179
3074	NC_007764	GGT	2	6	143941	143946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360179
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3079	NC_007764	ACG	2	6	144167	144172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360179
3080	NC_007764	TCG	2	6	144197	144202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360179
3081	NC_007764	GAA	2	6	144277	144282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360179
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3087	NC_007764	CCGC	2	8	144533	144540	0 %	0 %	25 %	75 %	86360179
3088	NC_007764	CAA	2	6	144576	144581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360179
3089	NC_007764	TGC	2	6	144605	144610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360179
3090	NC_007764	ACCG	2	8	144618	144625	25 %	0 %	25 %	50 %	86360179
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3092	NC_007764	ACA	2	6	144695	144700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360179
3093	NC_007764	ATCG	2	8	144730	144737	25 %	25 %	25 %	25 %	86360179
3094	NC_007764	GGC	2	6	144763	144768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360179
3095	NC_007764	CCGA	2	8	144820	144827	25 %	0 %	25 %	50 %	86360179
3096	NC_007764	AGC	2	6	144833	144838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360179
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3098	NC_007764	GCG	2	6	144943	144948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360179
3099	NC_007764	GC	4	8	144965	144972	0 %	0 %	50 %	50 %	86360179
3100	NC_007764	AACA	2	8	145036	145043	75 %	0 %	0 %	25 %	86360179
3101	NC_007764	GTC	2	6	145070	145075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360179
3102	NC_007764	GCAA	2	8	145170	145177	50 %	0 %	25 %	25 %	86360179
3103	NC_007764	GAC	2	6	145240	145245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360179
3104	NC_007764	CAT	2	6	145278	145283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360179
3105	NC_007764	TGC	2	6	145298	145303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360179
3106	NC_007764	CGA	2	6	145314	145319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360179
3107	NC_007764	GT	3	6	145358	145363	0 %	50 %	50 %	0 %	86360179
3108	NC_007764	GGC	2	6	145464	145469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360180
3109	NC_007764	CGGGA	2	10	145543	145552	20 %	0 %	60 %	20 %	86360180
3110	NC_007764	CGC	3	9	145587	145595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360180
3111	NC_007764	GCG	2	6	145711	145716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360180
3112	NC_007764	ATG	2	6	145744	145749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360180
3113	NC_007764	GGC	2	6	145762	145767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360180
3114	NC_007764	CGC	2	6	145785	145790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360180
3115	NC_007764	GCC	2	6	145797	145802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360180
3116	NC_007764	GCG	2	6	145903	145908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360180
3117	NC_007764	C	6	6	145932	145937	0 %	0 %	0 %	100 %	86360180
3118	NC_007764	GGA	2	6	146010	146015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360180
3119	NC_007764	TGGC	2	8	146017	146024	0 %	25 %	50 %	25 %	86360180
3120	NC_007764	GCG	2	6	146031	146036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360180
3121	NC_007764	GAT	2	6	146038	146043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360180
3122	NC_007764	GGA	2	6	146067	146072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360180
3123	NC_007764	GAAGGC	2	12	146166	146177	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	86360180
3124	NC_007764	CG	3	6	146228	146233	0 %	0 %	50 %	50 %	86360180
3125	NC_007764	TGG	2	6	146260	146265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360180
3126	NC_007764	CG	3	6	146382	146387	0 %	0 %	50 %	50 %	86360180
3127	NC_007764	CGC	3	9	146399	146407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360180
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3130	NC_007764	GAT	2	6	146620	146625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360180
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3132	NC_007764	CTGCGG	2	12	146656	146667	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	86360180
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3135	NC_007764	TCG	2	6	146702	146707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360180
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3154	NC_007764	CG	4	8	147456	147463	0 %	0 %	50 %	50 %	86360181
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3156	NC_007764	TCC	2	6	147512	147517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360181
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3163	NC_007764	ATA	2	6	147691	147696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86360181
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3229	NC_007764	TCGA	2	8	150433	150440	25 %	25 %	25 %	25 %	86360183
3230	NC_007764	CAT	2	6	150456	150461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360183
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3235	NC_007764	CG	3	6	150716	150721	0 %	0 %	50 %	50 %	86360183
3236	NC_007764	CAA	2	6	150741	150746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360183
3237	NC_007764	GAT	2	6	150828	150833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360183
3238	NC_007764	GCC	2	6	150856	150861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360183
3239	NC_007764	CGGT	2	8	150971	150978	0 %	25 %	50 %	25 %	86360183
3240	NC_007764	CCA	2	6	150995	151000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360183
3241	NC_007764	CGC	2	6	151005	151010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360183
3242	NC_007764	CGC	2	6	151041	151046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360183
3243	NC_007764	G	6	6	151127	151132	0 %	0 %	100 %	0 %	86360183
3244	NC_007764	TCGT	2	8	151169	151176	0 %	50 %	25 %	25 %	86360183
3245	NC_007764	CAGC	2	8	151191	151198	25 %	0 %	25 %	50 %	86360183
3246	NC_007764	TGA	2	6	151514	151519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360184
3247	NC_007764	TC	3	6	151535	151540	0 %	50 %	0 %	50 %	86360184
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3249	NC_007764	CCG	2	6	151780	151785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360184
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3359	NC_007764	CG	3	6	156782	156787	0 %	0 %	50 %	50 %	86360189
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3493	NC_007764	CAT	2	6	162172	162177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360194
3494	NC_007764	CCG	2	6	162202	162207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360194
3495	NC_007764	ACG	2	6	162494	162499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360195
3496	NC_007764	ACC	2	6	162523	162528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360195
3497	NC_007764	GGA	2	6	162579	162584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360195
3498	NC_007764	GC	3	6	162599	162604	0 %	0 %	50 %	50 %	86360195
3499	NC_007764	CTCG	2	8	162651	162658	0 %	25 %	25 %	50 %	86360195
3500	NC_007764	ACC	3	9	162667	162675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360195

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