MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42c

Total Repeats: 5385

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007764	CGG	2	6	46919	46924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360095
1002	NC_007764	TCG	2	6	46943	46948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360095
1003	NC_007764	TGG	2	6	46972	46977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360095
1004	NC_007764	GGC	2	6	47074	47079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360095
1005	NC_007764	TAC	2	6	47080	47085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360095
1006	NC_007764	GTCC	2	8	47114	47121	0 %	25 %	25 %	50 %	86360095
1007	NC_007764	GAG	2	6	47140	47145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360095
1008	NC_007764	GCT	2	6	47157	47162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360095
1009	NC_007764	CAT	2	6	47319	47324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360096
1010	NC_007764	CAT	2	6	47367	47372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360096
1011	NC_007764	ACC	2	6	47378	47383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360096
1012	NC_007764	TCC	2	6	47447	47452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360096
1013	NC_007764	CGG	2	6	47468	47473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360096
1014	NC_007764	CTC	2	6	47497	47502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360096
1015	NC_007764	GCCCG	2	10	47539	47548	0 %	0 %	40 %	60 %	86360096
1016	NC_007764	GC	4	8	47557	47564	0 %	0 %	50 %	50 %	86360096
1017	NC_007764	GCAG	2	8	47613	47620	25 %	0 %	50 %	25 %	86360096
1018	NC_007764	GCG	2	6	47638	47643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360096
1019	NC_007764	ACA	2	6	47658	47663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360096
1020	NC_007764	CGC	2	6	47742	47747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360096
1021	NC_007764	AGC	2	6	47798	47803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360096
1022	NC_007764	CGAT	2	8	47830	47837	25 %	25 %	25 %	25 %	86360096
1023	NC_007764	GGC	2	6	47838	47843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360096
1024	NC_007764	CGG	2	6	47893	47898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360096
1025	NC_007764	TCA	2	6	48008	48013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360097
1026	NC_007764	CTG	2	6	48026	48031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360097
1027	NC_007764	CCG	2	6	48043	48048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360097
1028	NC_007764	GTG	2	6	48069	48074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360097
1029	NC_007764	CGG	2	6	48106	48111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360097
1030	NC_007764	TTG	2	6	48222	48227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360097
1031	NC_007764	GGT	2	6	48284	48289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360097
1032	NC_007764	CGA	2	6	48316	48321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360097
1033	NC_007764	GCG	2	6	48347	48352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360097
1034	NC_007764	GGGCA	2	10	48513	48522	20 %	0 %	60 %	20 %	86360097
1035	NC_007764	GGC	2	6	48598	48603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360097
1036	NC_007764	GC	3	6	48602	48607	0 %	0 %	50 %	50 %	86360097
1037	NC_007764	TCGCCA	2	12	48618	48629	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	86360097
1038	NC_007764	TGC	2	6	48714	48719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360097
1039	NC_007764	AGCGA	2	10	48785	48794	40 %	0 %	40 %	20 %	86360097
1040	NC_007764	GCG	2	6	48830	48835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360097
1041	NC_007764	GCG	3	9	48855	48863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360097
1042	NC_007764	GCC	2	6	48878	48883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360097
1043	NC_007764	GAT	3	9	48884	48892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360097
1044	NC_007764	AAT	2	6	49079	49084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86360098
1045	NC_007764	GAAC	2	8	49115	49122	50 %	0 %	25 %	25 %	86360098
1046	NC_007764	CGGC	2	8	49139	49146	0 %	0 %	50 %	50 %	86360098
1047	NC_007764	CCA	2	6	49147	49152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360098
1048	NC_007764	CGA	2	6	49219	49224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360098
1049	NC_007764	GC	3	6	49244	49249	0 %	0 %	50 %	50 %	86360098
1050	NC_007764	AGG	2	6	49291	49296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360098
1051	NC_007764	GGC	2	6	49316	49321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360098
1052	NC_007764	CAC	2	6	49339	49344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360098
1053	NC_007764	AAGC	2	8	49487	49494	50 %	0 %	25 %	25 %	86360098
1054	NC_007764	CCGGC	2	10	49507	49516	0 %	0 %	40 %	60 %	86360098
1055	NC_007764	CCGC	2	8	49597	49604	0 %	0 %	25 %	75 %	86360098
1056	NC_007764	GC	3	6	49612	49617	0 %	0 %	50 %	50 %	86360098
1057	NC_007764	ATT	2	6	49641	49646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86360098
1058	NC_007764	GC	3	6	49647	49652	0 %	0 %	50 %	50 %	86360098
1059	NC_007764	GAC	2	6	49674	49679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360098
1060	NC_007764	GCC	2	6	49912	49917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360099
1061	NC_007764	GCG	2	6	49955	49960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360099
1062	NC_007764	G	6	6	50001	50006	0 %	0 %	100 %	0 %	86360099
1063	NC_007764	GC	5	10	50050	50059	0 %	0 %	50 %	50 %	86360099
1064	NC_007764	CAG	2	6	50103	50108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360099
1065	NC_007764	TTC	2	6	50164	50169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360099
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1067	NC_007764	CGGG	3	12	50216	50227	0 %	0 %	75 %	25 %	86360099
1068	NC_007764	CTG	2	6	50238	50243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360099
1069	NC_007764	CTGC	2	8	50271	50278	0 %	25 %	25 %	50 %	86360099
1070	NC_007764	CCG	2	6	50305	50310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360099
1071	NC_007764	CGC	2	6	50315	50320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360099
1072	NC_007764	GC	3	6	50371	50376	0 %	0 %	50 %	50 %	86360099
1073	NC_007764	CGG	2	6	50384	50389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360099
1074	NC_007764	CGA	2	6	50469	50474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360099
1075	NC_007764	CG	4	8	50510	50517	0 %	0 %	50 %	50 %	86360099
1076	NC_007764	CGA	2	6	50532	50537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360099
1077	NC_007764	CCGCGC	2	12	50541	50552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360099
1078	NC_007764	GCC	2	6	50569	50574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360099
1079	NC_007764	CGGT	2	8	50596	50603	0 %	25 %	50 %	25 %	86360099
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1082	NC_007764	ACG	2	6	50632	50637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360099
1083	NC_007764	CCTCG	2	10	51152	51161	0 %	20 %	20 %	60 %	86360100
1084	NC_007764	CTC	2	6	51211	51216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360100
1085	NC_007764	GTC	2	6	51277	51282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360100
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1088	NC_007764	CAC	2	6	51349	51354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360100
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1092	NC_007764	CCA	2	6	51477	51482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360100
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1094	NC_007764	TTC	2	6	51548	51553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360100
1095	NC_007764	CAC	2	6	51556	51561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360100
1096	NC_007764	CGGC	2	8	51588	51595	0 %	0 %	50 %	50 %	86360100
1097	NC_007764	ACG	2	6	51617	51622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360100
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1099	NC_007764	GAAG	2	8	51681	51688	50 %	0 %	50 %	0 %	86360100
1100	NC_007764	ACG	2	6	51701	51706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360100
1101	NC_007764	CAA	2	6	51795	51800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360100
1102	NC_007764	CGG	2	6	51811	51816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360100
1103	NC_007764	TCGAT	2	10	51914	51923	20 %	40 %	20 %	20 %	86360100
1104	NC_007764	GCC	2	6	51940	51945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360100
1105	NC_007764	CGAT	2	8	51960	51967	25 %	25 %	25 %	25 %	86360100
1106	NC_007764	GTC	2	6	52015	52020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360100
1107	NC_007764	GAC	2	6	52051	52056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360100
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1109	NC_007764	TCG	2	6	52116	52121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360100
1110	NC_007764	GCG	2	6	52166	52171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360100
1111	NC_007764	GC	3	6	52174	52179	0 %	0 %	50 %	50 %	86360100
1112	NC_007764	GCC	2	6	52217	52222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360100
1113	NC_007764	CGT	2	6	52302	52307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360100
1114	NC_007764	GCC	4	12	52342	52353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360100
1115	NC_007764	GGA	2	6	52374	52379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360100
1116	NC_007764	TTGC	2	8	52417	52424	0 %	50 %	25 %	25 %	86360100
1117	NC_007764	TCG	2	6	52433	52438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360100
1118	NC_007764	GCA	2	6	52446	52451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360100
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1120	NC_007764	GCC	3	9	52501	52509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360100
1121	NC_007764	GAG	2	6	52511	52516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360100
1122	NC_007764	CGG	2	6	52527	52532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360100
1123	NC_007764	TGG	2	6	52608	52613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360100
1124	NC_007764	CGT	2	6	52650	52655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360100
1125	NC_007764	CAG	2	6	52681	52686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360100
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1127	NC_007764	GTC	2	6	52736	52741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360100
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1251	NC_007764	C	6	6	57900	57905	0 %	0 %	0 %	100 %	86360104
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