MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42c

Total Repeats: 5385

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007764	GGC	2	6	23781	23786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360071
502	NC_007764	CGA	2	6	23840	23845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360071
503	NC_007764	TGA	2	6	23866	23871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360071
504	NC_007764	GAA	2	6	23910	23915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360072
505	NC_007764	GTC	2	6	23941	23946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360072
506	NC_007764	GAA	2	6	23950	23955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360072
507	NC_007764	AGA	2	6	23969	23974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360072
508	NC_007764	CTT	2	6	24000	24005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360072
509	NC_007764	ATC	2	6	24031	24036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360072
510	NC_007764	GAC	2	6	24061	24066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360072
511	NC_007764	CGCGA	2	10	24067	24076	20 %	0 %	40 %	40 %	86360072
512	NC_007764	TC	3	6	24179	24184	0 %	50 %	0 %	50 %	86360072
513	NC_007764	GC	3	6	24196	24201	0 %	0 %	50 %	50 %	86360072
514	NC_007764	CGG	2	6	24276	24281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360073
515	NC_007764	TCT	2	6	24330	24335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360073
516	NC_007764	GGC	2	6	24370	24375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360073
517	NC_007764	CGT	2	6	24412	24417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360073
518	NC_007764	CGAC	2	8	24429	24436	25 %	0 %	25 %	50 %	86360073
519	NC_007764	GTC	2	6	24485	24490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360073
520	NC_007764	GCC	2	6	24509	24514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360073
521	NC_007764	ATT	2	6	24597	24602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86360073
522	NC_007764	TAT	2	6	24617	24622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86360073
523	NC_007764	ATGCCG	2	12	24642	24653	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	86360073
524	NC_007764	GCG	2	6	24752	24757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360073
525	NC_007764	TGCC	2	8	24774	24781	0 %	25 %	25 %	50 %	86360073
526	NC_007764	AAG	2	6	24818	24823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360073
527	NC_007764	TGG	2	6	24851	24856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360073
528	NC_007764	GCG	2	6	24861	24866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360073
529	NC_007764	GCA	2	6	24874	24879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360073
530	NC_007764	CCG	2	6	24891	24896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360073
531	NC_007764	GCG	2	6	24941	24946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360073
532	NC_007764	CCT	2	6	24966	24971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360073
533	NC_007764	CCG	3	9	24987	24995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360073
534	NC_007764	TCG	2	6	25002	25007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360073
535	NC_007764	GC	3	6	25017	25022	0 %	0 %	50 %	50 %	86360073
536	NC_007764	CAG	2	6	25169	25174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360073
537	NC_007764	ATT	2	6	25203	25208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86360073
538	NC_007764	TCT	2	6	25482	25487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360074
539	NC_007764	CTG	3	9	25508	25516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360074
540	NC_007764	CTG	3	9	25712	25720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360074
541	NC_007764	CTG	2	6	25736	25741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360074
542	NC_007764	TGC	3	9	25764	25772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360074
543	NC_007764	CGGAC	2	10	25775	25784	20 %	0 %	40 %	40 %	86360074
544	NC_007764	TCA	2	6	25785	25790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360074
545	NC_007764	GATC	2	8	25816	25823	25 %	25 %	25 %	25 %	86360074
546	NC_007764	CAA	2	6	25840	25845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360074
547	NC_007764	CAT	2	6	25876	25881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360074
548	NC_007764	TCA	2	6	25890	25895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360074
549	NC_007764	AAG	2	6	25919	25924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360074
550	NC_007764	GGC	2	6	25945	25950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360074
551	NC_007764	GCG	2	6	25959	25964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360074
552	NC_007764	CTG	2	6	25994	25999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360074
553	NC_007764	GGC	2	6	26020	26025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360074
554	NC_007764	CTT	2	6	26078	26083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360074
555	NC_007764	GGC	2	6	26084	26089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360074
556	NC_007764	ATG	2	6	26099	26104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360074
557	NC_007764	GCG	2	6	26157	26162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360074
558	NC_007764	CGG	2	6	26163	26168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360074
559	NC_007764	TGG	2	6	26181	26186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360074
560	NC_007764	TTC	2	6	26219	26224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360074
561	NC_007764	TGG	2	6	26280	26285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360075
562	NC_007764	CTG	2	6	26295	26300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360075
563	NC_007764	CTG	3	9	26328	26336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360075
564	NC_007764	CTC	2	6	26369	26374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360075
565	NC_007764	CCG	2	6	26391	26396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360075
566	NC_007764	CTGG	2	8	26398	26405	0 %	25 %	50 %	25 %	86360075
567	NC_007764	TGC	2	6	26503	26508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360075
568	NC_007764	GTTC	2	8	26542	26549	0 %	50 %	25 %	25 %	86360075
569	NC_007764	GTT	2	6	26573	26578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360075
570	NC_007764	GAT	2	6	26588	26593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360075
571	NC_007764	CTT	2	6	26630	26635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360075
572	NC_007764	GGC	2	6	26652	26657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360075
573	NC_007764	TCGA	2	8	26748	26755	25 %	25 %	25 %	25 %	86360075
574	NC_007764	GCG	2	6	26773	26778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360075
575	NC_007764	CCT	2	6	26863	26868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360075
576	NC_007764	GGT	3	9	26876	26884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360075
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578	NC_007764	ATC	2	6	27003	27008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360075
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580	NC_007764	ACG	2	6	27114	27119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360076
581	NC_007764	ACG	2	6	27185	27190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360076
582	NC_007764	GCT	2	6	27253	27258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360076
583	NC_007764	GGTG	2	8	27328	27335	0 %	25 %	75 %	0 %	86360076
584	NC_007764	TGC	2	6	27405	27410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360076
585	NC_007764	CAG	3	9	27467	27475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360076
586	NC_007764	CCG	2	6	27509	27514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360076
587	NC_007764	AAG	2	6	27551	27556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360076
588	NC_007764	CCG	2	6	27583	27588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360076
589	NC_007764	CCA	2	6	27592	27597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360076
590	NC_007764	CACG	2	8	27625	27632	25 %	0 %	25 %	50 %	86360076
591	NC_007764	TTCAT	2	10	27770	27779	20 %	60 %	0 %	20 %	86360076
592	NC_007764	GTC	2	6	27790	27795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360076
593	NC_007764	CCA	2	6	27810	27815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360076
594	NC_007764	CGG	3	9	27823	27831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360076
595	NC_007764	GCG	2	6	27884	27889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360076
596	NC_007764	CG	4	8	27921	27928	0 %	0 %	50 %	50 %	86360076
597	NC_007764	CGCAGG	2	12	27934	27945	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	86360076
598	NC_007764	CAA	2	6	27982	27987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360076
599	NC_007764	AGGCG	2	10	28015	28024	20 %	0 %	60 %	20 %	86360076
600	NC_007764	GTT	2	6	28160	28165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360077
601	NC_007764	CG	3	6	28212	28217	0 %	0 %	50 %	50 %	86360077
602	NC_007764	GCG	2	6	28278	28283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360077
603	NC_007764	GAA	2	6	28290	28295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360077
604	NC_007764	CGC	3	9	28301	28309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360077
605	NC_007764	GAA	2	6	28334	28339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360077
606	NC_007764	CCG	2	6	28342	28347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360077
607	NC_007764	GC	3	6	28352	28357	0 %	0 %	50 %	50 %	86360077
608	NC_007764	TGA	2	6	28384	28389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360077
609	NC_007764	CGA	2	6	28400	28405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360077
610	NC_007764	GAT	2	6	28412	28417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360077
611	NC_007764	GAG	2	6	28500	28505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360077
612	NC_007764	ACG	2	6	28508	28513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360077
613	NC_007764	TGC	2	6	28564	28569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360077
614	NC_007764	GCCG	2	8	28574	28581	0 %	0 %	50 %	50 %	86360077
615	NC_007764	GTG	2	6	28584	28589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360077
616	NC_007764	GCG	2	6	28590	28595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360077
617	NC_007764	GAT	2	6	28622	28627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360077
618	NC_007764	GCC	2	6	28653	28658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360077
619	NC_007764	CGT	2	6	28667	28672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360077
620	NC_007764	GC	3	6	28730	28735	0 %	0 %	50 %	50 %	86360077
621	NC_007764	CGG	2	6	28744	28749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360077
622	NC_007764	CTC	2	6	28752	28757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360077
623	NC_007764	CGG	2	6	28787	28792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360077
624	NC_007764	GCT	2	6	28856	28861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360077
625	NC_007764	CGA	2	6	28879	28884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360077
626	NC_007764	AAG	2	6	28887	28892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360077
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628	NC_007764	CGA	2	6	28934	28939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360077
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751	NC_007764	CCA	2	6	34509	34514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360084
752	NC_007764	TTC	2	6	34556	34561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360084
753	NC_007764	GCTG	2	8	34575	34582	0 %	25 %	50 %	25 %	86360084
754	NC_007764	GGGC	2	8	34599	34606	0 %	0 %	75 %	25 %	86360084
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