MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42c

Total Repeats: 5385

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_007764	AGC	2	6	231115	231120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360260
5002	NC_007764	GCCG	2	8	231134	231141	0 %	0 %	50 %	50 %	86360260
5003	NC_007764	CGT	2	6	231165	231170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360260
5004	NC_007764	G	6	6	231175	231180	0 %	0 %	100 %	0 %	86360260
5005	NC_007764	GCG	2	6	231274	231279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360260
5006	NC_007764	CGAAGC	2	12	231368	231379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360260
5007	NC_007764	CTGT	2	8	231400	231407	0 %	50 %	25 %	25 %	86360260
5008	NC_007764	GGC	2	6	231514	231519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360260
5009	NC_007764	GTT	2	6	231567	231572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360260
5010	NC_007764	CGA	2	6	231578	231583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360260
5011	NC_007764	AGG	2	6	231584	231589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360260
5012	NC_007764	TCG	2	6	231595	231600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360260
5013	NC_007764	GCG	2	6	231602	231607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360260
5014	NC_007764	TCG	2	6	231643	231648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360260
5015	NC_007764	GCGTG	2	10	231650	231659	0 %	20 %	60 %	20 %	86360260
5016	NC_007764	GCG	2	6	231677	231682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360260
5017	NC_007764	TCC	2	6	231733	231738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360260
5018	NC_007764	CGA	2	6	231756	231761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360260
5019	NC_007764	ATC	2	6	231796	231801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360260
5020	NC_007764	CGG	2	6	231808	231813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360260
5021	NC_007764	GAT	2	6	231849	231854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360260
5022	NC_007764	TGC	2	6	231869	231874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360260
5023	NC_007764	GCC	2	6	231875	231880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360260
5024	NC_007764	GGTTGA	2	12	231881	231892	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	86360260
5025	NC_007764	TTC	2	6	231922	231927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360260
5026	NC_007764	TCT	2	6	231953	231958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360260
5027	NC_007764	CGA	2	6	232013	232018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360260
5028	NC_007764	TCC	2	6	232030	232035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360260
5029	NC_007764	CCA	2	6	232055	232060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360260
5030	NC_007764	CGG	2	6	232284	232289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360261
5031	NC_007764	TGA	2	6	232299	232304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360261
5032	NC_007764	CCT	2	6	232366	232371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360261
5033	NC_007764	GGC	2	6	232434	232439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360261
5034	NC_007764	GCC	2	6	232507	232512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360261
5035	NC_007764	CGG	2	6	232515	232520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360261
5036	NC_007764	CGA	2	6	232539	232544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360261
5037	NC_007764	GGC	2	6	232590	232595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360261
5038	NC_007764	CGA	2	6	232687	232692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360261
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5040	NC_007764	CCG	2	6	232770	232775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360261
5041	NC_007764	GGT	2	6	232875	232880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360261
5042	NC_007764	CCG	2	6	232910	232915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360261
5043	NC_007764	TCC	2	6	232916	232921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360261
5044	NC_007764	CGA	3	9	233007	233015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360261
5045	NC_007764	CGG	2	6	233154	233159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360261
5046	NC_007764	CGCGCA	2	12	233160	233171	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	86360261
5047	NC_007764	GGCCG	2	10	233181	233190	0 %	0 %	60 %	40 %	86360261
5048	NC_007764	CGGCAG	2	12	233197	233208	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	86360261
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5050	NC_007764	GTC	2	6	233381	233386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360262
5051	NC_007764	CGG	2	6	233425	233430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360262
5052	NC_007764	CTT	2	6	233432	233437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360262
5053	NC_007764	CGA	2	6	233479	233484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360262
5054	NC_007764	CGA	2	6	233503	233508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360262
5055	NC_007764	TGC	2	6	233558	233563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360262
5056	NC_007764	GAT	2	6	233579	233584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360262
5057	NC_007764	CGC	2	6	233623	233628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360262
5058	NC_007764	GCC	2	6	233629	233634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360262
5059	NC_007764	CTGG	2	8	233639	233646	0 %	25 %	50 %	25 %	86360262
5060	NC_007764	TGA	2	6	233653	233658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360262
5061	NC_007764	GCC	2	6	233663	233668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360262
5062	NC_007764	TCA	2	6	233704	233709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360262
5063	NC_007764	GGC	2	6	233795	233800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360262
5064	NC_007764	TTG	2	6	233802	233807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360262
5065	NC_007764	CCG	2	6	233823	233828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360262
5066	NC_007764	CGG	3	9	233917	233925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360262
5067	NC_007764	TCG	2	6	233929	233934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360262
5068	NC_007764	TCGATA	2	12	233940	233951	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	86360262
5069	NC_007764	CCTT	2	8	233973	233980	0 %	50 %	0 %	50 %	86360262
5070	NC_007764	CG	4	8	234013	234020	0 %	0 %	50 %	50 %	86360262
5071	NC_007764	CCG	2	6	234021	234026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360262
5072	NC_007764	CGA	2	6	235864	235869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360263
5073	NC_007764	TGG	2	6	235888	235893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360263
5074	NC_007764	GCG	2	6	235960	235965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360263
5075	NC_007764	CG	3	6	235991	235996	0 %	0 %	50 %	50 %	86360263
5076	NC_007764	CGGC	2	8	236008	236015	0 %	0 %	50 %	50 %	86360263
5077	NC_007764	ATC	2	6	236016	236021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360263
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5080	NC_007764	TCGT	2	8	236134	236141	0 %	50 %	25 %	25 %	86360263
5081	NC_007764	CGGC	2	8	236191	236198	0 %	0 %	50 %	50 %	86360263
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5089	NC_007764	CTTC	2	8	236551	236558	0 %	50 %	0 %	50 %	86360263
5090	NC_007764	CCGGCG	2	12	236620	236631	0 %	0 %	50 %	50 %	86360263
5091	NC_007764	GCC	2	6	236659	236664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360263
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5094	NC_007764	GAG	2	6	236795	236800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360263
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5101	NC_007764	GAT	2	6	237062	237067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360264
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5105	NC_007764	GCAG	2	8	237131	237138	25 %	0 %	50 %	25 %	86360264
5106	NC_007764	CGA	2	6	237227	237232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360264
5107	NC_007764	CGC	2	6	237251	237256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360264
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5109	NC_007764	GAA	2	6	237366	237371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360264
5110	NC_007764	CCAT	2	8	237412	237419	25 %	25 %	0 %	50 %	86360264
5111	NC_007764	GGA	2	6	237446	237451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360264
5112	NC_007764	TCG	2	6	237475	237480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360264
5113	NC_007764	CGA	2	6	237560	237565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360264
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5115	NC_007764	GCC	2	6	237693	237698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360264
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5120	NC_007764	GC	3	6	237922	237927	0 %	0 %	50 %	50 %	86360264
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5123	NC_007764	ATTG	2	8	238013	238020	25 %	50 %	25 %	0 %	86360264
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5368	NC_007764	CGA	2	6	250042	250047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360277
5369	NC_007764	GCT	2	6	250072	250077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360277
5370	NC_007764	GAG	2	6	250088	250093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360277
5371	NC_007764	GGC	2	6	250105	250110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360277
5372	NC_007764	GCG	2	6	250196	250201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360277
5373	NC_007764	GAA	2	6	250205	250210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360277
5374	NC_007764	TGG	2	6	250257	250262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360277
5375	NC_007764	CGA	2	6	250281	250286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360277
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5385	NC_007764	GCCG	3	12	250924	250935	0 %	0 %	50 %	50 %	86360277

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.