MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42c

Total Repeats: 5385

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_007764	TGT	2	6	205781	205786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360238
4502	NC_007764	CGAA	2	8	205791	205798	50 %	0 %	25 %	25 %	86360238
4503	NC_007764	GCG	2	6	205808	205813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360238
4504	NC_007764	GC	3	6	205827	205832	0 %	0 %	50 %	50 %	86360238
4505	NC_007764	GAT	2	6	206001	206006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360238
4506	NC_007764	GAAGG	2	10	206049	206058	40 %	0 %	60 %	0 %	86360238
4507	NC_007764	AGCCGT	2	12	206099	206110	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	86360238
4508	NC_007764	CA	3	6	206206	206211	50 %	0 %	0 %	50 %	86360238
4509	NC_007764	CGGC	2	8	206306	206313	0 %	0 %	50 %	50 %	86360238
4510	NC_007764	ACA	2	6	206410	206415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360238
4511	NC_007764	TCG	2	6	206425	206430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360238
4512	NC_007764	GAC	2	6	206461	206466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360238
4513	NC_007764	CAAG	2	8	206752	206759	50 %	0 %	25 %	25 %	86360239
4514	NC_007764	CGAT	2	8	206769	206776	25 %	25 %	25 %	25 %	86360239
4515	NC_007764	AAG	2	6	206783	206788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360239
4516	NC_007764	GGC	2	6	206801	206806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360239
4517	NC_007764	TCG	2	6	206826	206831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360239
4518	NC_007764	GC	3	6	206849	206854	0 %	0 %	50 %	50 %	86360239
4519	NC_007764	AAGG	2	8	206885	206892	50 %	0 %	50 %	0 %	86360239
4520	NC_007764	CAGG	2	8	206909	206916	25 %	0 %	50 %	25 %	86360239
4521	NC_007764	TCC	3	9	206949	206957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360239
4522	NC_007764	GCT	2	6	206984	206989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360239
4523	NC_007764	TAG	2	6	207132	207137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360239
4524	NC_007764	TCC	2	6	207300	207305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360239
4525	NC_007764	GC	3	6	207338	207343	0 %	0 %	50 %	50 %	86360239
4526	NC_007764	GTA	2	6	207452	207457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360239
4527	NC_007764	GGA	2	6	207469	207474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360239
4528	NC_007764	CT	3	6	207495	207500	0 %	50 %	0 %	50 %	86360239
4529	NC_007764	TCC	2	6	207528	207533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360239
4530	NC_007764	GCA	2	6	207535	207540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360239
4531	NC_007764	CGA	2	6	207559	207564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360239
4532	NC_007764	CG	3	6	207621	207626	0 %	0 %	50 %	50 %	86360239
4533	NC_007764	GCTG	2	8	207644	207651	0 %	25 %	50 %	25 %	86360239
4534	NC_007764	TCAA	2	8	207654	207661	50 %	25 %	0 %	25 %	86360239
4535	NC_007764	TGCC	2	8	207685	207692	0 %	25 %	25 %	50 %	86360239
4536	NC_007764	TGA	2	6	207829	207834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360239
4537	NC_007764	GAA	2	6	207857	207862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360239
4538	NC_007764	TTG	2	6	207918	207923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360239
4539	NC_007764	GT	4	8	207934	207941	0 %	50 %	50 %	0 %	86360239
4540	NC_007764	AT	3	6	208018	208023	50 %	50 %	0 %	0 %	86360239
4541	NC_007764	TTG	2	6	208068	208073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360239
4542	NC_007764	GCC	2	6	208092	208097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360239
4543	NC_007764	CCG	2	6	208110	208115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360239
4544	NC_007764	TCG	2	6	208176	208181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360239
4545	NC_007764	CAGCG	2	10	208279	208288	20 %	0 %	40 %	40 %	86360239
4546	NC_007764	CAG	2	6	208369	208374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360239
4547	NC_007764	AGG	2	6	208437	208442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360239
4548	NC_007764	GCC	2	6	208476	208481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360239
4549	NC_007764	CAA	2	6	208492	208497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360239
4550	NC_007764	CTG	2	6	208746	208751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360240
4551	NC_007764	CCG	2	6	208816	208821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360240
4552	NC_007764	CG	3	6	208820	208825	0 %	0 %	50 %	50 %	86360240
4553	NC_007764	GCT	2	6	208843	208848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360240
4554	NC_007764	TCG	2	6	208852	208857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360240
4555	NC_007764	GGC	2	6	208863	208868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360240
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4557	NC_007764	ATC	2	6	208916	208921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360240
4558	NC_007764	TGA	2	6	208954	208959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360240
4559	NC_007764	CCG	2	6	208993	208998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360240
4560	NC_007764	ATC	2	6	209024	209029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360240
4561	NC_007764	CGC	2	6	209030	209035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360240
4562	NC_007764	CGC	2	6	209134	209139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360240
4563	NC_007764	CCG	2	6	209192	209197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360240
4564	NC_007764	ACGA	2	8	209207	209214	50 %	0 %	25 %	25 %	86360240
4565	NC_007764	ACG	2	6	209256	209261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360240
4566	NC_007764	AGC	2	6	209289	209294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360240
4567	NC_007764	CGA	2	6	209354	209359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360240
4568	NC_007764	AAT	2	6	209363	209368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86360240
4569	NC_007764	GCC	2	6	209384	209389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360240
4570	NC_007764	TCG	2	6	209424	209429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360240
4571	NC_007764	ATC	2	6	209445	209450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360240
4572	NC_007764	GCC	2	6	209459	209464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360240
4573	NC_007764	TTG	2	6	209478	209483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360240
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4575	NC_007764	GAT	2	6	209543	209548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360240
4576	NC_007764	ATG	3	9	209550	209558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360240
4577	NC_007764	CG	3	6	209581	209586	0 %	0 %	50 %	50 %	86360240
4578	NC_007764	GGC	2	6	209618	209623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360240
4579	NC_007764	TCT	2	6	209644	209649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360240
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4582	NC_007764	ATG	2	6	210077	210082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360241
4583	NC_007764	CGCGC	3	15	210100	210114	0 %	0 %	40 %	60 %	86360241
4584	NC_007764	TCGA	2	8	210220	210227	25 %	25 %	25 %	25 %	86360241
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4587	NC_007764	GC	4	8	210327	210334	0 %	0 %	50 %	50 %	86360241
4588	NC_007764	CAT	2	6	210387	210392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360241
4589	NC_007764	GCC	2	6	210556	210561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360241
4590	NC_007764	GC	3	6	210562	210567	0 %	0 %	50 %	50 %	86360241
4591	NC_007764	TGA	2	6	210578	210583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360241
4592	NC_007764	TGC	2	6	210584	210589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360241
4593	NC_007764	ATC	2	6	210634	210639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360241
4594	NC_007764	GTTG	2	8	210663	210670	0 %	50 %	50 %	0 %	86360241
4595	NC_007764	TCA	2	6	210675	210680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360241
4596	NC_007764	ATC	2	6	210691	210696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360241
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4598	NC_007764	GGCC	2	8	210809	210816	0 %	0 %	50 %	50 %	86360241
4599	NC_007764	ATG	2	6	211018	211023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360242
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4601	NC_007764	CGA	2	6	211088	211093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360242
4602	NC_007764	GTC	2	6	211104	211109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360242
4603	NC_007764	GCG	2	6	211121	211126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360242
4604	NC_007764	TCA	2	6	211145	211150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360242
4605	NC_007764	GCG	2	6	211169	211174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360242
4606	NC_007764	TCC	2	6	211189	211194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360242
4607	NC_007764	GCC	2	6	211219	211224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360242
4608	NC_007764	TCG	2	6	211238	211243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360242
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4610	NC_007764	CGA	2	6	211326	211331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360242
4611	NC_007764	TGC	2	6	211335	211340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360242
4612	NC_007764	ATG	2	6	211394	211399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360242
4613	NC_007764	TCT	2	6	211445	211450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360242
4614	NC_007764	AGG	2	6	211457	211462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360242
4615	NC_007764	GCC	2	6	211537	211542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360242
4616	NC_007764	GGC	2	6	211564	211569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360242
4617	NC_007764	GCA	2	6	211578	211583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360242
4618	NC_007764	GACAAG	2	12	211651	211662	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	86360242
4619	NC_007764	AGA	2	6	211688	211693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360242
4620	NC_007764	GCG	2	6	211738	211743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360242
4621	NC_007764	GTC	2	6	211975	211980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360242
4622	NC_007764	AAG	2	6	212014	212019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360242
4623	NC_007764	GC	3	6	212069	212074	0 %	0 %	50 %	50 %	86360242
4624	NC_007764	TGA	2	6	212090	212095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360242
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4626	NC_007764	CGA	2	6	212157	212162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360242
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4653	NC_007764	CGC	3	9	213308	213316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360244
4654	NC_007764	CTTC	2	8	213323	213330	0 %	50 %	0 %	50 %	86360244
4655	NC_007764	GTC	2	6	213348	213353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360244
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