MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42b

Total Repeats: 304

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007763	GC	3	6	2776	2781	0 %	0 %	50 %	50 %	86359883
2	NC_007763	GC	4	8	2863	2870	0 %	0 %	50 %	50 %	86359883
3	NC_007763	AG	3	6	3137	3142	50 %	0 %	50 %	0 %	86359884
4	NC_007763	GC	3	6	3656	3661	0 %	0 %	50 %	50 %	86359884
5	NC_007763	GC	3	6	4205	4210	0 %	0 %	50 %	50 %	86359884
6	NC_007763	CG	3	6	4971	4976	0 %	0 %	50 %	50 %	86359885
7	NC_007763	AG	3	6	5201	5206	50 %	0 %	50 %	0 %	86359885
8	NC_007763	GC	3	6	6090	6095	0 %	0 %	50 %	50 %	86359886
9	NC_007763	GC	3	6	6708	6713	0 %	0 %	50 %	50 %	86359887
10	NC_007763	GC	3	6	7070	7075	0 %	0 %	50 %	50 %	86359887
11	NC_007763	GC	3	6	7473	7478	0 %	0 %	50 %	50 %	86359888
12	NC_007763	GC	3	6	7565	7570	0 %	0 %	50 %	50 %	86359888
13	NC_007763	GA	3	6	7777	7782	50 %	0 %	50 %	0 %	86359888
14	NC_007763	GC	4	8	8741	8748	0 %	0 %	50 %	50 %	86359889
15	NC_007763	CT	3	6	9014	9019	0 %	50 %	0 %	50 %	86359889
16	NC_007763	CG	3	6	9501	9506	0 %	0 %	50 %	50 %	86359890
17	NC_007763	GC	3	6	11154	11159	0 %	0 %	50 %	50 %	86359891
18	NC_007763	GC	3	6	11521	11526	0 %	0 %	50 %	50 %	86359891
19	NC_007763	GA	3	6	11937	11942	50 %	0 %	50 %	0 %	86359891
20	NC_007763	CG	3	6	12103	12108	0 %	0 %	50 %	50 %	86359892
21	NC_007763	GC	3	6	13029	13034	0 %	0 %	50 %	50 %	86359893
22	NC_007763	GC	4	8	13388	13395	0 %	0 %	50 %	50 %	86359893
23	NC_007763	GC	3	6	14135	14140	0 %	0 %	50 %	50 %	86359893
24	NC_007763	GC	3	6	16871	16876	0 %	0 %	50 %	50 %	86359897
25	NC_007763	CG	3	6	16948	16953	0 %	0 %	50 %	50 %	86359897
26	NC_007763	GC	3	6	17095	17100	0 %	0 %	50 %	50 %	86359897
27	NC_007763	AG	3	6	17236	17241	50 %	0 %	50 %	0 %	86359897
28	NC_007763	CG	3	6	17392	17397	0 %	0 %	50 %	50 %	86359897
29	NC_007763	GC	3	6	18290	18295	0 %	0 %	50 %	50 %	86359898
30	NC_007763	GC	4	8	18403	18410	0 %	0 %	50 %	50 %	86359898
31	NC_007763	GC	3	6	19199	19204	0 %	0 %	50 %	50 %	86359899
32	NC_007763	CG	4	8	19618	19625	0 %	0 %	50 %	50 %	86359900
33	NC_007763	CG	3	6	20568	20573	0 %	0 %	50 %	50 %	86359900
34	NC_007763	CG	3	6	21544	21549	0 %	0 %	50 %	50 %	86359901
35	NC_007763	GC	3	6	21994	21999	0 %	0 %	50 %	50 %	86359901
36	NC_007763	GC	3	6	23151	23156	0 %	0 %	50 %	50 %	86359902
37	NC_007763	GC	3	6	24928	24933	0 %	0 %	50 %	50 %	86359904
38	NC_007763	GC	3	6	26245	26250	0 %	0 %	50 %	50 %	86359906
39	NC_007763	CG	3	6	26701	26706	0 %	0 %	50 %	50 %	86359906
40	NC_007763	CG	3	6	27532	27537	0 %	0 %	50 %	50 %	86359907
41	NC_007763	GC	3	6	28289	28294	0 %	0 %	50 %	50 %	86359907
42	NC_007763	GA	3	6	28861	28866	50 %	0 %	50 %	0 %	86359908
43	NC_007763	AG	3	6	29552	29557	50 %	0 %	50 %	0 %	86359908
44	NC_007763	GC	3	6	30722	30727	0 %	0 %	50 %	50 %	86359909
45	NC_007763	GC	4	8	31316	31323	0 %	0 %	50 %	50 %	86359910
46	NC_007763	GC	3	6	31587	31592	0 %	0 %	50 %	50 %	86359910
47	NC_007763	GC	3	6	31885	31890	0 %	0 %	50 %	50 %	86359910
48	NC_007763	GC	3	6	32403	32408	0 %	0 %	50 %	50 %	86359911
49	NC_007763	CG	4	8	32591	32598	0 %	0 %	50 %	50 %	86359911
50	NC_007763	TC	3	6	32647	32652	0 %	50 %	0 %	50 %	86359911
51	NC_007763	AG	3	6	32680	32685	50 %	0 %	50 %	0 %	86359911
52	NC_007763	CG	3	6	32974	32979	0 %	0 %	50 %	50 %	86359911
53	NC_007763	TC	3	6	33351	33356	0 %	50 %	0 %	50 %	86359911
54	NC_007763	CG	4	8	33627	33634	0 %	0 %	50 %	50 %	86359912
55	NC_007763	CG	3	6	33761	33766	0 %	0 %	50 %	50 %	86359912
56	NC_007763	GC	3	6	35179	35184	0 %	0 %	50 %	50 %	86359913
57	NC_007763	CG	3	6	35364	35369	0 %	0 %	50 %	50 %	86359913
58	NC_007763	CG	3	6	35696	35701	0 %	0 %	50 %	50 %	86359913
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60	NC_007763	CG	3	6	37461	37466	0 %	0 %	50 %	50 %	86359914
61	NC_007763	CG	3	6	37686	37691	0 %	0 %	50 %	50 %	86359915
62	NC_007763	GC	3	6	37978	37983	0 %	0 %	50 %	50 %	86359915
63	NC_007763	GC	3	6	38091	38096	0 %	0 %	50 %	50 %	86359915
64	NC_007763	GC	3	6	39068	39073	0 %	0 %	50 %	50 %	86359916
65	NC_007763	CG	3	6	39220	39225	0 %	0 %	50 %	50 %	86359916
66	NC_007763	CG	3	6	39533	39538	0 %	0 %	50 %	50 %	86359917
67	NC_007763	CG	4	8	40610	40617	0 %	0 %	50 %	50 %	86359918
68	NC_007763	CG	3	6	40882	40887	0 %	0 %	50 %	50 %	86359918
69	NC_007763	GC	3	6	40978	40983	0 %	0 %	50 %	50 %	86359918
70	NC_007763	GC	3	6	41749	41754	0 %	0 %	50 %	50 %	86359919
71	NC_007763	GC	3	6	41807	41812	0 %	0 %	50 %	50 %	86359919
72	NC_007763	CT	3	6	42127	42132	0 %	50 %	0 %	50 %	86359919
73	NC_007763	CG	3	6	44570	44575	0 %	0 %	50 %	50 %	86359922
74	NC_007763	CG	3	6	45310	45315	0 %	0 %	50 %	50 %	86359922
75	NC_007763	GC	3	6	45536	45541	0 %	0 %	50 %	50 %	86359923
76	NC_007763	CT	3	6	46417	46422	0 %	50 %	0 %	50 %	86359923
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79	NC_007763	GC	3	6	52202	52207	0 %	0 %	50 %	50 %	86359929
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81	NC_007763	GC	3	6	52745	52750	0 %	0 %	50 %	50 %	86359930
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88	NC_007763	GA	3	6	57307	57312	50 %	0 %	50 %	0 %	86359934
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90	NC_007763	CG	4	8	57944	57951	0 %	0 %	50 %	50 %	86359934
91	NC_007763	CG	3	6	58296	58301	0 %	0 %	50 %	50 %	86359934
92	NC_007763	GC	3	6	58532	58537	0 %	0 %	50 %	50 %	86359934
93	NC_007763	CG	3	6	58975	58980	0 %	0 %	50 %	50 %	86359935
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96	NC_007763	CG	3	6	61720	61725	0 %	0 %	50 %	50 %	86359937
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99	NC_007763	AC	3	6	61955	61960	50 %	0 %	0 %	50 %	86359937
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102	NC_007763	GC	3	6	62657	62662	0 %	0 %	50 %	50 %	86359938
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104	NC_007763	CG	3	6	64019	64024	0 %	0 %	50 %	50 %	86359939
105	NC_007763	GA	3	6	64277	64282	50 %	0 %	50 %	0 %	86359940
106	NC_007763	TC	3	6	65315	65320	0 %	50 %	0 %	50 %	86359941
107	NC_007763	GC	4	8	65433	65440	0 %	0 %	50 %	50 %	86359941
108	NC_007763	GA	3	6	66095	66100	50 %	0 %	50 %	0 %	86359942
109	NC_007763	TA	3	6	66411	66416	50 %	50 %	0 %	0 %	86359943
110	NC_007763	CG	3	6	67558	67563	0 %	0 %	50 %	50 %	86359944
111	NC_007763	CG	3	6	68089	68094	0 %	0 %	50 %	50 %	86359945
112	NC_007763	GA	3	6	68787	68792	50 %	0 %	50 %	0 %	86359945
113	NC_007763	CG	3	6	78639	78644	0 %	0 %	50 %	50 %	86359949
114	NC_007763	CG	3	6	79022	79027	0 %	0 %	50 %	50 %	86359949
115	NC_007763	GC	3	6	79834	79839	0 %	0 %	50 %	50 %	86359950
116	NC_007763	CG	3	6	81198	81203	0 %	0 %	50 %	50 %	86359951
117	NC_007763	CG	3	6	81333	81338	0 %	0 %	50 %	50 %	86359951
118	NC_007763	CG	3	6	82355	82360	0 %	0 %	50 %	50 %	86359952
119	NC_007763	GC	3	6	83030	83035	0 %	0 %	50 %	50 %	86359952
120	NC_007763	CG	3	6	83598	83603	0 %	0 %	50 %	50 %	86359953
121	NC_007763	AT	3	6	83943	83948	50 %	50 %	0 %	0 %	86359953
122	NC_007763	CG	3	6	83987	83992	0 %	0 %	50 %	50 %	86359953
123	NC_007763	GC	3	6	84514	84519	0 %	0 %	50 %	50 %	86359954
124	NC_007763	CG	3	6	84843	84848	0 %	0 %	50 %	50 %	86359954
125	NC_007763	CA	3	6	85009	85014	50 %	0 %	0 %	50 %	86359954
126	NC_007763	CG	3	6	85210	85215	0 %	0 %	50 %	50 %	86359954
127	NC_007763	CG	3	6	85440	85445	0 %	0 %	50 %	50 %	86359954
128	NC_007763	CG	3	6	86738	86743	0 %	0 %	50 %	50 %	86359956
129	NC_007763	CG	3	6	86901	86906	0 %	0 %	50 %	50 %	86359956
130	NC_007763	CG	3	6	89952	89957	0 %	0 %	50 %	50 %	86359959
131	NC_007763	CG	3	6	90414	90419	0 %	0 %	50 %	50 %	86359959
132	NC_007763	CG	3	6	90577	90582	0 %	0 %	50 %	50 %	86359959
133	NC_007763	CG	3	6	90917	90922	0 %	0 %	50 %	50 %	86359960
134	NC_007763	CG	3	6	91188	91193	0 %	0 %	50 %	50 %	86359960
135	NC_007763	GC	3	6	92157	92162	0 %	0 %	50 %	50 %	86359961
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144	NC_007763	GC	3	6	97104	97109	0 %	0 %	50 %	50 %	86359963
145	NC_007763	GC	4	8	97308	97315	0 %	0 %	50 %	50 %	86359963
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.