MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42b

Total Repeats: 3889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007763	GGC	2	6	24827	24832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359904
502	NC_007763	GCC	2	6	24870	24875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359904
503	NC_007763	CAT	2	6	24917	24922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359904
504	NC_007763	GC	3	6	24928	24933	0 %	0 %	50 %	50 %	86359904
505	NC_007763	GAG	2	6	24991	24996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359904
506	NC_007763	TTC	2	6	25047	25052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359905
507	NC_007763	T	7	7	25095	25101	0 %	100 %	0 %	0 %	86359905
508	NC_007763	CGC	2	6	25114	25119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359905
509	NC_007763	TGC	2	6	25129	25134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359905
510	NC_007763	ACC	2	6	25143	25148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86359905
511	NC_007763	GCT	2	6	25172	25177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359905
512	NC_007763	TTCA	2	8	25188	25195	25 %	50 %	0 %	25 %	86359905
513	NC_007763	TGG	2	6	25230	25235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359905
514	NC_007763	TAT	2	6	25362	25367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86359906
515	NC_007763	GAC	3	9	25383	25391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359906
516	NC_007763	CTG	3	9	25399	25407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359906
517	NC_007763	AGGAAA	2	12	25502	25513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359906
518	NC_007763	TCG	2	6	25523	25528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359906
519	NC_007763	GGT	2	6	25563	25568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359906
520	NC_007763	CAC	2	6	25581	25586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86359906
521	NC_007763	CAG	2	6	25771	25776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359906
522	NC_007763	TCGATG	2	12	25835	25846	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	86359906
523	NC_007763	CAG	2	6	25906	25911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359906
524	NC_007763	GAA	2	6	25956	25961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359906
525	NC_007763	TTC	2	6	26041	26046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359906
526	NC_007763	AAG	2	6	26068	26073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359906
527	NC_007763	AAG	2	6	26098	26103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359906
528	NC_007763	CGA	2	6	26190	26195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359906
529	NC_007763	GC	3	6	26245	26250	0 %	0 %	50 %	50 %	86359906
530	NC_007763	GGC	2	6	26251	26256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359906
531	NC_007763	CGGCC	2	10	26265	26274	0 %	0 %	40 %	60 %	86359906
532	NC_007763	TCCA	2	8	26284	26291	25 %	25 %	0 %	50 %	86359906
533	NC_007763	CTGGA	2	10	26299	26308	20 %	20 %	40 %	20 %	86359906
534	NC_007763	CAG	2	6	26389	26394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359906
535	NC_007763	CCG	2	6	26417	26422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359906
536	NC_007763	AAGG	2	8	26431	26438	50 %	0 %	50 %	0 %	86359906
537	NC_007763	GTC	2	6	26446	26451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359906
538	NC_007763	TGA	2	6	26555	26560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359906
539	NC_007763	GGC	2	6	26586	26591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359906
540	NC_007763	GAA	2	6	26634	26639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359906
541	NC_007763	ACCG	2	8	26695	26702	25 %	0 %	25 %	50 %	86359906
542	NC_007763	CG	3	6	26701	26706	0 %	0 %	50 %	50 %	86359906
543	NC_007763	CGG	2	6	26715	26720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359906
544	NC_007763	TGG	2	6	26809	26814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359906
545	NC_007763	TCC	2	6	26833	26838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359906
546	NC_007763	TGC	2	6	26894	26899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359906
547	NC_007763	GAA	2	6	26988	26993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359906
548	NC_007763	ACG	2	6	27056	27061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359906
549	NC_007763	AGA	2	6	27080	27085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359906
550	NC_007763	ACG	2	6	27274	27279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359907
551	NC_007763	ATC	2	6	27292	27297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359907
552	NC_007763	TGC	2	6	27381	27386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359907
553	NC_007763	CGT	2	6	27402	27407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359907
554	NC_007763	GCC	2	6	27448	27453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359907
555	NC_007763	ACCA	2	8	27475	27482	50 %	0 %	0 %	50 %	86359907
556	NC_007763	GTC	2	6	27496	27501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359907
557	NC_007763	CG	3	6	27532	27537	0 %	0 %	50 %	50 %	86359907
558	NC_007763	CGG	2	6	27560	27565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359907
559	NC_007763	CTG	2	6	27625	27630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359907
560	NC_007763	GCTG	2	8	27662	27669	0 %	25 %	50 %	25 %	86359907
561	NC_007763	GGCG	2	8	27705	27712	0 %	0 %	75 %	25 %	86359907
562	NC_007763	CGG	2	6	27759	27764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359907
563	NC_007763	GCC	2	6	27868	27873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359907
564	NC_007763	GAT	2	6	27901	27906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359907
565	NC_007763	CGA	2	6	27918	27923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359907
566	NC_007763	CAG	2	6	27970	27975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359907
567	NC_007763	GCG	3	9	27976	27984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359907
568	NC_007763	ATG	2	6	28012	28017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359907
569	NC_007763	GCT	2	6	28037	28042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359907
570	NC_007763	TCC	2	6	28075	28080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359907
571	NC_007763	GAC	2	6	28095	28100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359907
572	NC_007763	GCC	2	6	28109	28114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359907
573	NC_007763	GAC	2	6	28125	28130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359907
574	NC_007763	GCC	2	6	28165	28170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359907
575	NC_007763	GCA	2	6	28251	28256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359907
576	NC_007763	GC	3	6	28289	28294	0 %	0 %	50 %	50 %	86359907
577	NC_007763	GTG	2	6	28316	28321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359907
578	NC_007763	CGG	2	6	28352	28357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359907
579	NC_007763	GGC	2	6	28468	28473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359907
580	NC_007763	GGC	2	6	28476	28481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359907
581	NC_007763	GAC	2	6	28551	28556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359907
582	NC_007763	GCC	2	6	28567	28572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359907
583	NC_007763	ATC	2	6	28687	28692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359907
584	NC_007763	GAA	2	6	28698	28703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359907
585	NC_007763	GAT	2	6	28716	28721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359907
586	NC_007763	CGG	2	6	28733	28738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359907
587	NC_007763	GAT	2	6	28842	28847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359908
588	NC_007763	GA	3	6	28861	28866	50 %	0 %	50 %	0 %	86359908
589	NC_007763	ACC	2	6	28886	28891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86359908
590	NC_007763	GAA	2	6	28974	28979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359908
591	NC_007763	GCC	2	6	28995	29000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359908
592	NC_007763	GCG	2	6	29013	29018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359908
593	NC_007763	TCA	2	6	29084	29089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359908
594	NC_007763	CCG	2	6	29117	29122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359908
595	NC_007763	GCG	2	6	29123	29128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359908
596	NC_007763	TGC	2	6	29252	29257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359908
597	NC_007763	TCGGCA	2	12	29275	29286	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	86359908
598	NC_007763	GCG	2	6	29312	29317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359908
599	NC_007763	GGA	2	6	29456	29461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359908
600	NC_007763	TCG	2	6	29482	29487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359908
601	NC_007763	GCAG	2	8	29501	29508	25 %	0 %	50 %	25 %	86359908
602	NC_007763	AAG	2	6	29537	29542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359908
603	NC_007763	AG	3	6	29552	29557	50 %	0 %	50 %	0 %	86359908
604	NC_007763	TGC	2	6	29566	29571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359908
605	NC_007763	CCG	2	6	29890	29895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359909
606	NC_007763	TGCCGG	2	12	29958	29969	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	86359909
607	NC_007763	CGAG	2	8	30021	30028	25 %	0 %	50 %	25 %	86359909
608	NC_007763	CCG	2	6	30036	30041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359909
609	NC_007763	CGA	2	6	30051	30056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359909
610	NC_007763	CGG	2	6	30141	30146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359909
611	NC_007763	CGA	2	6	30156	30161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359909
612	NC_007763	CCG	2	6	30192	30197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359909
613	NC_007763	CGC	2	6	30240	30245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359909
614	NC_007763	GGCC	2	8	30309	30316	0 %	0 %	50 %	50 %	86359909
615	NC_007763	ATGG	2	8	30388	30395	25 %	25 %	50 %	0 %	86359909
616	NC_007763	AGC	2	6	30416	30421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359909
617	NC_007763	AGC	2	6	30455	30460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359909
618	NC_007763	CAT	2	6	30471	30476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359909
619	NC_007763	CCT	2	6	30501	30506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359909
620	NC_007763	GTC	2	6	30664	30669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359909
621	NC_007763	GGC	2	6	30673	30678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359909
622	NC_007763	GC	3	6	30722	30727	0 %	0 %	50 %	50 %	86359909
623	NC_007763	CGA	2	6	30747	30752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359909
624	NC_007763	CTC	2	6	30769	30774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359909
625	NC_007763	CGG	2	6	30822	30827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359909
626	NC_007763	CAT	2	6	30865	30870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359909
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