MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42a

Total Repeats: 3114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_007762	GCC	2	6	162456	162461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359846
2502	NC_007762	CGC	2	6	162479	162484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359846
2503	NC_007762	GGC	2	6	162518	162523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359846
2504	NC_007762	AGC	2	6	162592	162597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359846
2505	NC_007762	GCC	2	6	162621	162626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359846
2506	NC_007762	AAC	2	6	162968	162973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359847
2507	NC_007762	TGC	2	6	163127	163132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359847
2508	NC_007762	TGC	2	6	163209	163214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359847
2509	NC_007762	GTC	2	6	163243	163248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359847
2510	NC_007762	GGC	2	6	163288	163293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359847
2511	NC_007762	TTCCT	2	10	163310	163319	0 %	60 %	0 %	40 %	86359847
2512	NC_007762	CCGG	2	8	163380	163387	0 %	0 %	50 %	50 %	86359847
2513	NC_007762	GCCG	2	8	163488	163495	0 %	0 %	50 %	50 %	86359847
2514	NC_007762	CAT	2	6	163500	163505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359847
2515	NC_007762	GCC	2	6	163512	163517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359847
2516	NC_007762	CGGCGC	2	12	163583	163594	0 %	0 %	50 %	50 %	86359847
2517	NC_007762	GCT	2	6	163676	163681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359847
2518	NC_007762	GCCCC	2	10	163719	163728	0 %	0 %	20 %	80 %	86359847
2519	NC_007762	CGA	2	6	163770	163775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359847
2520	NC_007762	CT	3	6	163784	163789	0 %	50 %	0 %	50 %	86359847
2521	NC_007762	GGC	3	9	163794	163802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359847
2522	NC_007762	GAC	2	6	163855	163860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359847
2523	NC_007762	CGGT	2	8	163990	163997	0 %	25 %	50 %	25 %	86359848
2524	NC_007762	CGA	2	6	164027	164032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359848
2525	NC_007762	GCT	2	6	164045	164050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359848
2526	NC_007762	TCC	2	6	164061	164066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359848
2527	NC_007762	CGA	2	6	164070	164075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359848
2528	NC_007762	ACG	2	6	164085	164090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359848
2529	NC_007762	CAACG	2	10	164108	164117	40 %	0 %	20 %	40 %	86359848
2530	NC_007762	GCG	2	6	164165	164170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359848
2531	NC_007762	GGCA	2	8	164192	164199	25 %	0 %	50 %	25 %	86359848
2532	NC_007762	GGC	2	6	164233	164238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359848
2533	NC_007762	TCC	2	6	164307	164312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359848
2534	NC_007762	TTC	2	6	164333	164338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359848
2535	NC_007762	GGC	3	9	164343	164351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359848
2536	NC_007762	GCC	2	6	164352	164357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359848
2537	NC_007762	CG	3	6	164364	164369	0 %	0 %	50 %	50 %	86359848
2538	NC_007762	CAA	2	6	164371	164376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359848
2539	NC_007762	GCC	2	6	164388	164393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359848
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2541	NC_007762	CGA	2	6	164747	164752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359849
2542	NC_007762	CTCCG	2	10	165030	165039	0 %	20 %	20 %	60 %	86359850
2543	NC_007762	CAA	2	6	165053	165058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359850
2544	NC_007762	C	6	6	165067	165072	0 %	0 %	0 %	100 %	86359850
2545	NC_007762	CCG	2	6	165084	165089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359850
2546	NC_007762	CCCGC	2	10	165124	165133	0 %	0 %	20 %	80 %	86359850
2547	NC_007762	CGTCT	2	10	165134	165143	0 %	40 %	20 %	40 %	86359850
2548	NC_007762	CGC	2	6	165225	165230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359850
2549	NC_007762	GCG	2	6	165234	165239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359850
2550	NC_007762	AGCCG	2	10	165315	165324	20 %	0 %	40 %	40 %	86359850
2551	NC_007762	CAT	2	6	165666	165671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359851
2552	NC_007762	TCG	2	6	165722	165727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359851
2553	NC_007762	GCA	2	6	165802	165807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359851
2554	NC_007762	GC	4	8	165813	165820	0 %	0 %	50 %	50 %	86359851
2555	NC_007762	GAC	2	6	165859	165864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359851
2556	NC_007762	GATG	2	8	165927	165934	25 %	25 %	50 %	0 %	86359851
2557	NC_007762	CGG	2	6	165975	165980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359851
2558	NC_007762	CGG	2	6	166001	166006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359851
2559	NC_007762	AATC	2	8	166160	166167	50 %	25 %	0 %	25 %	86359851
2560	NC_007762	CTT	3	9	166778	166786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359852
2561	NC_007762	ATG	2	6	166797	166802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359852
2562	NC_007762	GCAG	2	8	166847	166854	25 %	0 %	50 %	25 %	86359852
2563	NC_007762	TCGA	2	8	166876	166883	25 %	25 %	25 %	25 %	86359852
2564	NC_007762	ATA	2	6	166890	166895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86359852
2565	NC_007762	GC	3	6	166896	166901	0 %	0 %	50 %	50 %	86359852
2566	NC_007762	CCGA	2	8	167222	167229	25 %	0 %	25 %	50 %	86359853
2567	NC_007762	TCG	2	6	167276	167281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359853
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2569	NC_007762	CAG	2	6	167326	167331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359853
2570	NC_007762	CGA	2	6	167451	167456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359853
2571	NC_007762	GC	4	8	167467	167474	0 %	0 %	50 %	50 %	86359853
2572	NC_007762	GCC	2	6	167498	167503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359853
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2574	NC_007762	AG	3	6	167545	167550	50 %	0 %	50 %	0 %	86359853
2575	NC_007762	CGC	3	9	167553	167561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359853
2576	NC_007762	CAG	2	6	167580	167585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359853
2577	NC_007762	ATG	2	6	167591	167596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359853
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2580	NC_007762	GC	3	6	168010	168015	0 %	0 %	50 %	50 %	86359854
2581	NC_007762	GCG	2	6	168126	168131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359854
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2583	NC_007762	GC	3	6	168164	168169	0 %	0 %	50 %	50 %	86359854
2584	NC_007762	CG	3	6	168203	168208	0 %	0 %	50 %	50 %	86359854
2585	NC_007762	GCT	2	6	168213	168218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359854
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2589	NC_007762	GCC	2	6	168388	168393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359854
2590	NC_007762	ATG	2	6	168431	168436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359854
2591	NC_007762	CGGC	2	8	168455	168462	0 %	0 %	50 %	50 %	86359854
2592	NC_007762	AGCCG	2	10	168492	168501	20 %	0 %	40 %	40 %	86359854
2593	NC_007762	TCG	2	6	168509	168514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359854
2594	NC_007762	GAT	2	6	168580	168585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359854
2595	NC_007762	CG	3	6	168588	168593	0 %	0 %	50 %	50 %	86359854
2596	NC_007762	TGA	2	6	168633	168638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359854
2597	NC_007762	CGGCTC	2	12	168859	168870	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	86359854
2598	NC_007762	GA	3	6	168872	168877	50 %	0 %	50 %	0 %	86359854
2599	NC_007762	TTTC	2	8	168906	168913	0 %	75 %	0 %	25 %	86359854
2600	NC_007762	ATC	2	6	168944	168949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359854
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2602	NC_007762	GAA	2	6	168979	168984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359854
2603	NC_007762	ATC	2	6	168985	168990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359854
2604	NC_007762	CG	3	6	168999	169004	0 %	0 %	50 %	50 %	86359854
2605	NC_007762	GCC	2	6	169006	169011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359854
2606	NC_007762	TCC	3	9	169049	169057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359854
2607	NC_007762	GCC	2	6	169063	169068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359854
2608	NC_007762	TCCAG	2	10	169080	169089	20 %	20 %	20 %	40 %	86359854
2609	NC_007762	CGT	2	6	169246	169251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359854
2610	NC_007762	CCG	2	6	169259	169264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359854
2611	NC_007762	CGA	2	6	169288	169293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359854
2612	NC_007762	AGCAG	2	10	169311	169320	40 %	0 %	40 %	20 %	86359854
2613	NC_007762	GCC	2	6	169330	169335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359854
2614	NC_007762	TCG	2	6	169355	169360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359854
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2620	NC_007762	GGC	2	6	169687	169692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359854
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2622	NC_007762	CCG	2	6	169712	169717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359854
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2624	NC_007762	CGATCA	2	12	169902	169913	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	86359854
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2992	NC_007762	CAT	2	6	187951	187956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359874
2993	NC_007762	CGA	2	6	187968	187973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359874
2994	NC_007762	GAC	2	6	188020	188025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359874
2995	NC_007762	AGG	2	6	188087	188092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359874
2996	NC_007762	GTTGC	2	10	188122	188131	0 %	40 %	40 %	20 %	86359874
2997	NC_007762	CCCCT	2	10	188159	188168	0 %	20 %	0 %	80 %	86359875
2998	NC_007762	GGT	2	6	188189	188194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359875
2999	NC_007762	CGA	2	6	188242	188247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359875
3000	NC_007762	TGG	2	6	188251	188256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359875

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