MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42a

Total Repeats: 3114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_007762	TCG	2	6	99246	99251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359788
1502	NC_007762	GGGGTG	2	12	100317	100328	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	86359789
1503	NC_007762	CTATT	2	10	100361	100370	20 %	60 %	0 %	20 %	86359789
1504	NC_007762	ATG	2	6	100628	100633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359789
1505	NC_007762	CTGG	2	8	101185	101192	0 %	25 %	50 %	25 %	86359790
1506	NC_007762	AGA	2	6	101203	101208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359790
1507	NC_007762	TGA	2	6	101264	101269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359790
1508	NC_007762	GAA	2	6	101333	101338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359790
1509	NC_007762	A	6	6	101337	101342	100 %	0 %	0 %	0 %	86359790
1510	NC_007762	TGC	2	6	101353	101358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359790
1511	NC_007762	GAA	2	6	101408	101413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359790
1512	NC_007762	TCG	2	6	101416	101421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359790
1513	NC_007762	CCG	2	6	101462	101467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359790
1514	NC_007762	TGC	2	6	101513	101518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359791
1515	NC_007762	TCGA	2	8	101562	101569	25 %	25 %	25 %	25 %	86359791
1516	NC_007762	CAC	2	6	101576	101581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86359791
1517	NC_007762	CGT	2	6	101618	101623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359791
1518	NC_007762	CGC	2	6	101663	101668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359791
1519	NC_007762	ACG	2	6	101823	101828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359791
1520	NC_007762	GGT	2	6	101890	101895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359791
1521	NC_007762	CG	3	6	102039	102044	0 %	0 %	50 %	50 %	86359791
1522	NC_007762	GGA	2	6	102205	102210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359791
1523	NC_007762	TAC	2	6	102221	102226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359791
1524	NC_007762	CAA	2	6	102256	102261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359791
1525	NC_007762	TCGC	2	8	102566	102573	0 %	25 %	25 %	50 %	86359792
1526	NC_007762	CGT	2	6	102661	102666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359792
1527	NC_007762	GGCG	2	8	102667	102674	0 %	0 %	75 %	25 %	86359792
1528	NC_007762	GAC	2	6	102681	102686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359792
1529	NC_007762	CCG	2	6	102766	102771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359792
1530	NC_007762	GC	3	6	102804	102809	0 %	0 %	50 %	50 %	86359792
1531	NC_007762	GGC	2	6	102849	102854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359792
1532	NC_007762	GCG	2	6	102929	102934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359792
1533	NC_007762	ATG	2	6	102947	102952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359792
1534	NC_007762	AAG	2	6	102958	102963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359792
1535	NC_007762	TGC	2	6	103029	103034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359792
1536	NC_007762	CCG	3	9	103080	103088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359792
1537	NC_007762	TGG	2	6	103119	103124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359792
1538	NC_007762	TCG	2	6	103214	103219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359792
1539	NC_007762	GTG	2	6	103237	103242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359792
1540	NC_007762	GCC	2	6	103271	103276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359792
1541	NC_007762	ATCG	2	8	103299	103306	25 %	25 %	25 %	25 %	86359792
1542	NC_007762	GTG	2	6	103439	103444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359793
1543	NC_007762	ATC	2	6	103529	103534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359793
1544	NC_007762	AGC	2	6	103605	103610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359793
1545	NC_007762	CGA	2	6	103618	103623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359793
1546	NC_007762	GACG	2	8	103624	103631	25 %	0 %	50 %	25 %	86359793
1547	NC_007762	TCG	2	6	103638	103643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359793
1548	NC_007762	GCG	2	6	103670	103675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359793
1549	NC_007762	TCG	2	6	103708	103713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359793
1550	NC_007762	CGT	2	6	103774	103779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359793
1551	NC_007762	ATG	2	6	103782	103787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359793
1552	NC_007762	TGC	2	6	103847	103852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359793
1553	NC_007762	CGG	2	6	103990	103995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359793
1554	NC_007762	CAAC	2	8	104023	104030	50 %	0 %	0 %	50 %	86359793
1555	NC_007762	CGT	2	6	104134	104139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359793
1556	NC_007762	GCC	2	6	104183	104188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359793
1557	NC_007762	GGC	2	6	104293	104298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359793
1558	NC_007762	GTC	2	6	104345	104350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359793
1559	NC_007762	GTCT	2	8	104392	104399	0 %	50 %	25 %	25 %	86359793
1560	NC_007762	CTG	2	6	104502	104507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359794
1561	NC_007762	CGG	2	6	104533	104538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359794
1562	NC_007762	GAT	2	6	104541	104546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359794
1563	NC_007762	ACCG	2	8	104555	104562	25 %	0 %	25 %	50 %	86359794
1564	NC_007762	CGC	2	6	104637	104642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359794
1565	NC_007762	GGGA	2	8	104663	104670	25 %	0 %	75 %	0 %	86359794
1566	NC_007762	GTG	2	6	104702	104707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359794
1567	NC_007762	GAC	2	6	104712	104717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359794
1568	NC_007762	CGC	2	6	104718	104723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359794
1569	NC_007762	GATC	2	8	104792	104799	25 %	25 %	25 %	25 %	86359794
1570	NC_007762	AGC	2	6	104818	104823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359794
1571	NC_007762	GAT	2	6	104874	104879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359795
1572	NC_007762	CGC	2	6	104882	104887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359795
1573	NC_007762	TTGC	2	8	104939	104946	0 %	50 %	25 %	25 %	86359795
1574	NC_007762	TTC	2	6	104949	104954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359795
1575	NC_007762	TTGC	2	8	105063	105070	0 %	50 %	25 %	25 %	86359795
1576	NC_007762	CGT	2	6	105083	105088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359795
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1578	NC_007762	TGGC	2	8	105221	105228	0 %	25 %	50 %	25 %	86359795
1579	NC_007762	GTC	2	6	105237	105242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359795
1580	NC_007762	GAC	2	6	105261	105266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359795
1581	NC_007762	CGA	2	6	105306	105311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359795
1582	NC_007762	AGT	2	6	105634	105639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359796
1583	NC_007762	CCG	2	6	105671	105676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359796
1584	NC_007762	ACG	2	6	105741	105746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359796
1585	NC_007762	AGCAA	2	10	105823	105832	60 %	0 %	20 %	20 %	86359796
1586	NC_007762	CAT	2	6	105837	105842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359796
1587	NC_007762	CGA	2	6	105882	105887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359796
1588	NC_007762	GAC	2	6	106031	106036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359796
1589	NC_007762	TGG	2	6	106142	106147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359796
1590	NC_007762	CGGG	2	8	106148	106155	0 %	0 %	75 %	25 %	86359796
1591	NC_007762	CAT	2	6	106237	106242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359796
1592	NC_007762	GCA	2	6	106252	106257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359796
1593	NC_007762	TAA	2	6	106367	106372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86359796
1594	NC_007762	TCCA	2	8	106387	106394	25 %	25 %	0 %	50 %	86359796
1595	NC_007762	AGC	2	6	106443	106448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359796
1596	NC_007762	CGAG	2	8	106515	106522	25 %	0 %	50 %	25 %	86359796
1597	NC_007762	AG	3	6	106528	106533	50 %	0 %	50 %	0 %	86359796
1598	NC_007762	TCATC	2	10	107135	107144	20 %	40 %	0 %	40 %	86359797
1599	NC_007762	ATG	2	6	107149	107154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359797
1600	NC_007762	ATT	2	6	107161	107166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86359797
1601	NC_007762	TG	3	6	107179	107184	0 %	50 %	50 %	0 %	86359797
1602	NC_007762	CCG	2	6	107206	107211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359797
1603	NC_007762	TTC	2	6	107247	107252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359797
1604	NC_007762	TGT	2	6	107327	107332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86359797
1605	NC_007762	CTT	2	6	107348	107353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359797
1606	NC_007762	GT	3	6	107399	107404	0 %	50 %	50 %	0 %	86359797
1607	NC_007762	GC	3	6	107418	107423	0 %	0 %	50 %	50 %	86359797
1608	NC_007762	GGC	2	6	107429	107434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359798
1609	NC_007762	AGG	2	6	107472	107477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359798
1610	NC_007762	GAT	2	6	107570	107575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359798
1611	NC_007762	CGC	2	6	107599	107604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359798
1612	NC_007762	TTC	2	6	107631	107636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359798
1613	NC_007762	TTCCAA	2	12	107638	107649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359798
1614	NC_007762	TGT	3	9	107674	107682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86359798
1615	NC_007762	TCG	2	6	107700	107705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359798
1616	NC_007762	ATCGC	2	10	107743	107752	20 %	20 %	20 %	40 %	86359798
1617	NC_007762	AG	3	6	107899	107904	50 %	0 %	50 %	0 %	86359798
1618	NC_007762	CAT	2	6	107959	107964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359798
1619	NC_007762	GCG	2	6	107972	107977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359798
1620	NC_007762	GGC	2	6	107993	107998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359798
1621	NC_007762	CTT	2	6	108023	108028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359798
1622	NC_007762	GCAT	2	8	108048	108055	25 %	25 %	25 %	25 %	86359798
1623	NC_007762	CGC	2	6	108058	108063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359798
1624	NC_007762	GTA	2	6	108113	108118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359798
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1627	NC_007762	GTAT	2	8	108240	108247	25 %	50 %	25 %	0 %	86359798
1628	NC_007762	GCG	2	6	108258	108263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359798
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1988	NC_007762	CTT	2	6	131646	131651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359822
1989	NC_007762	CGT	2	6	131659	131664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359822
1990	NC_007762	AGTG	2	8	131681	131688	25 %	25 %	50 %	0 %	86359822
1991	NC_007762	GTT	2	6	131689	131694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86359822
1992	NC_007762	GCA	2	6	131796	131801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359822
1993	NC_007762	GA	3	6	131825	131830	50 %	0 %	50 %	0 %	86359822
1994	NC_007762	CGC	2	6	131906	131911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359822
1995	NC_007762	GGA	2	6	131928	131933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359822
1996	NC_007762	TCG	2	6	131972	131977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359822
1997	NC_007762	TGCC	2	8	131997	132004	0 %	25 %	25 %	50 %	86359822
1998	NC_007762	ATG	2	6	132023	132028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359823
1999	NC_007762	CGC	2	6	132042	132047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359823
2000	NC_007762	ATC	2	6	132048	132053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359823

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