MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42a

Total Repeats: 3114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007762	AAT	2	6	58542	58547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86359759
1002	NC_007762	GCA	2	6	58561	58566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359759
1003	NC_007762	CGCTT	2	10	58570	58579	0 %	40 %	20 %	40 %	86359759
1004	NC_007762	CAAT	2	8	58636	58643	50 %	25 %	0 %	25 %	86359760
1005	NC_007762	TCC	2	6	58662	58667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359760
1006	NC_007762	CAA	2	6	58724	58729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359760
1007	NC_007762	CG	3	6	58829	58834	0 %	0 %	50 %	50 %	86359760
1008	NC_007762	ATG	2	6	59004	59009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359760
1009	NC_007762	GTT	2	6	59012	59017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86359760
1010	NC_007762	TCC	2	6	59030	59035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359760
1011	NC_007762	CGG	2	6	59113	59118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359760
1012	NC_007762	GCA	2	6	59129	59134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359760
1013	NC_007762	TTCC	2	8	59165	59172	0 %	50 %	0 %	50 %	86359760
1014	NC_007762	TCG	2	6	59193	59198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359760
1015	NC_007762	AG	3	6	59206	59211	50 %	0 %	50 %	0 %	86359760
1016	NC_007762	CGT	2	6	59224	59229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359760
1017	NC_007762	CCT	2	6	59277	59282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359760
1018	NC_007762	T	6	6	59311	59316	0 %	100 %	0 %	0 %	86359760
1019	NC_007762	TGCC	2	8	60300	60307	0 %	25 %	25 %	50 %	86359761
1020	NC_007762	GCA	2	6	60334	60339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359761
1021	NC_007762	GCT	2	6	60365	60370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359761
1022	NC_007762	ACG	2	6	60381	60386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359761
1023	NC_007762	GAT	2	6	60401	60406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359761
1024	NC_007762	GCGA	2	8	60458	60465	25 %	0 %	50 %	25 %	86359761
1025	NC_007762	CAT	2	6	60489	60494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359761
1026	NC_007762	AAG	2	6	60612	60617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359761
1027	NC_007762	GTC	2	6	60642	60647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359761
1028	NC_007762	GC	3	6	60709	60714	0 %	0 %	50 %	50 %	86359761
1029	NC_007762	AGT	2	6	60943	60948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359761
1030	NC_007762	GC	3	6	62597	62602	0 %	0 %	50 %	50 %	86359762
1031	NC_007762	CGG	3	9	62605	62613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359762
1032	NC_007762	AGA	2	6	62626	62631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359762
1033	NC_007762	CAC	2	6	62711	62716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86359762
1034	NC_007762	TGTC	2	8	62777	62784	0 %	50 %	25 %	25 %	86359762
1035	NC_007762	GTT	2	6	62812	62817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86359762
1036	NC_007762	ACC	2	6	62830	62835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86359762
1037	NC_007762	GATCC	2	10	62837	62846	20 %	20 %	20 %	40 %	86359762
1038	NC_007762	CGC	2	6	63028	63033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359762
1039	NC_007762	ATC	2	6	63041	63046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359762
1040	NC_007762	CGG	2	6	63054	63059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359762
1041	NC_007762	CGA	2	6	63093	63098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359762
1042	NC_007762	TCG	2	6	63349	63354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359763
1043	NC_007762	GC	3	6	63403	63408	0 %	0 %	50 %	50 %	86359763
1044	NC_007762	CGGT	2	8	63426	63433	0 %	25 %	50 %	25 %	86359763
1045	NC_007762	T	6	6	63456	63461	0 %	100 %	0 %	0 %	86359763
1046	NC_007762	CCAC	2	8	63468	63475	25 %	0 %	0 %	75 %	86359763
1047	NC_007762	TCG	2	6	63574	63579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359763
1048	NC_007762	GTC	2	6	63623	63628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359763
1049	NC_007762	GCCGA	2	10	63725	63734	20 %	0 %	40 %	40 %	86359763
1050	NC_007762	ATC	2	6	63774	63779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359763
1051	NC_007762	CAT	2	6	63795	63800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359763
1052	NC_007762	GAG	2	6	64378	64383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359764
1053	NC_007762	CA	3	6	64396	64401	50 %	0 %	0 %	50 %	86359764
1054	NC_007762	ATCA	2	8	64414	64421	50 %	25 %	0 %	25 %	86359764
1055	NC_007762	TCC	2	6	64478	64483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359764
1056	NC_007762	AGGA	2	8	64512	64519	50 %	0 %	50 %	0 %	86359764
1057	NC_007762	TGT	2	6	64596	64601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86359765
1058	NC_007762	AGGA	2	8	64621	64628	50 %	0 %	50 %	0 %	86359765
1059	NC_007762	CGA	2	6	64740	64745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359765
1060	NC_007762	CCA	2	6	64943	64948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86359765
1061	NC_007762	GCC	2	6	64970	64975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359765
1062	NC_007762	ATT	2	6	64997	65002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86359765
1063	NC_007762	CGG	2	6	65039	65044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359765
1064	NC_007762	AT	3	6	65159	65164	50 %	50 %	0 %	0 %	86359765
1065	NC_007762	TACA	2	8	65227	65234	50 %	25 %	0 %	25 %	86359765
1066	NC_007762	GGCT	2	8	65286	65293	0 %	25 %	50 %	25 %	86359765
1067	NC_007762	ATA	2	6	65401	65406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86359765
1068	NC_007762	CATG	2	8	65460	65467	25 %	25 %	25 %	25 %	86359765
1069	NC_007762	GA	3	6	65531	65536	50 %	0 %	50 %	0 %	86359765
1070	NC_007762	CAA	2	6	65547	65552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359765
1071	NC_007762	GGA	2	6	65602	65607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359765
1072	NC_007762	TGA	2	6	65789	65794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359765
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1074	NC_007762	TTG	2	6	65882	65887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86359765
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1076	NC_007762	CAA	2	6	65938	65943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359765
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1082	NC_007762	GTCC	2	8	66106	66113	0 %	25 %	25 %	50 %	86359765
1083	NC_007762	A	6	6	66275	66280	100 %	0 %	0 %	0 %	86359766
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1088	NC_007762	AGC	2	6	66499	66504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359766
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1093	NC_007762	GAG	2	6	66804	66809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359766
1094	NC_007762	GAC	2	6	66900	66905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359766
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1098	NC_007762	AAGG	2	8	67047	67054	50 %	0 %	50 %	0 %	86359766
1099	NC_007762	CAA	2	6	67097	67102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359766
1100	NC_007762	AC	3	6	67151	67156	50 %	0 %	0 %	50 %	86359766
1101	NC_007762	AAAG	2	8	67205	67212	75 %	0 %	25 %	0 %	86359766
1102	NC_007762	A	6	6	67217	67222	100 %	0 %	0 %	0 %	86359766
1103	NC_007762	TCG	2	6	67241	67246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359766
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1105	NC_007762	GGA	2	6	67364	67369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359766
1106	NC_007762	CCGGA	2	10	67395	67404	20 %	0 %	40 %	40 %	86359766
1107	NC_007762	GTG	2	6	67426	67431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359766
1108	NC_007762	C	6	6	67495	67500	0 %	0 %	0 %	100 %	86359766
1109	NC_007762	AGC	2	6	67522	67527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359766
1110	NC_007762	GTTTG	2	10	67529	67538	0 %	60 %	40 %	0 %	86359766
1111	NC_007762	CGT	2	6	67552	67557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359766
1112	NC_007762	CAG	2	6	67558	67563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359766
1113	NC_007762	TCG	2	6	67634	67639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359766
1114	NC_007762	GAA	2	6	67665	67670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359766
1115	NC_007762	CGC	2	6	67741	67746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359766
1116	NC_007762	CCA	2	6	67779	67784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86359766
1117	NC_007762	CTT	2	6	67846	67851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359766
1118	NC_007762	GTCA	2	8	67857	67864	25 %	25 %	25 %	25 %	86359766
1119	NC_007762	T	6	6	67895	67900	0 %	100 %	0 %	0 %	86359766
1120	NC_007762	TGC	2	6	67964	67969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359766
1121	NC_007762	CGAT	2	8	68151	68158	25 %	25 %	25 %	25 %	86359766
1122	NC_007762	AGG	2	6	68198	68203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359766
1123	NC_007762	TGT	2	6	69107	69112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86359767
1124	NC_007762	GCC	2	6	69279	69284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359767
1125	NC_007762	CGC	2	6	69319	69324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359767
1126	NC_007762	ATTGCC	2	12	69427	69438	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	86359767
1127	NC_007762	GTC	2	6	69440	69445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359767
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