MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42a

Total Repeats: 3114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007762	CG	3	6	30055	30060	0 %	0 %	50 %	50 %	86359731
502	NC_007762	GC	3	6	30134	30139	0 %	0 %	50 %	50 %	86359731
503	NC_007762	GGT	2	6	30254	30259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359732
504	NC_007762	GGC	3	9	30354	30362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359732
505	NC_007762	ATGG	2	8	30393	30400	25 %	25 %	50 %	0 %	86359732
506	NC_007762	CGAGGT	2	12	30404	30415	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	86359732
507	NC_007762	GC	3	6	30494	30499	0 %	0 %	50 %	50 %	86359732
508	NC_007762	GAC	2	6	30528	30533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359732
509	NC_007762	GATC	2	8	30560	30567	25 %	25 %	25 %	25 %	86359732
510	NC_007762	ACCA	2	8	30663	30670	50 %	0 %	0 %	50 %	86359732
511	NC_007762	CAT	2	6	30686	30691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359732
512	NC_007762	TGC	2	6	30764	30769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359732
513	NC_007762	AGAT	2	8	30871	30878	50 %	25 %	25 %	0 %	86359732
514	NC_007762	A	7	7	30884	30890	100 %	0 %	0 %	0 %	86359732
515	NC_007762	GGA	2	6	30939	30944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359732
516	NC_007762	GTG	2	6	30979	30984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359732
517	NC_007762	CGAA	2	8	31049	31056	50 %	0 %	25 %	25 %	86359732
518	NC_007762	TGGCG	2	10	31145	31154	0 %	20 %	60 %	20 %	86359732
519	NC_007762	GAG	2	6	31182	31187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359732
520	NC_007762	CAA	2	6	31253	31258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359732
521	NC_007762	CG	3	6	31263	31268	0 %	0 %	50 %	50 %	86359732
522	NC_007762	TCT	2	6	31306	31311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359732
523	NC_007762	GCC	2	6	31335	31340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359732
524	NC_007762	GGCGC	2	10	31341	31350	0 %	0 %	60 %	40 %	86359732
525	NC_007762	CAA	2	6	31387	31392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359732
526	NC_007762	TCA	2	6	31399	31404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359732
527	NC_007762	GTCG	2	8	31565	31572	0 %	25 %	50 %	25 %	86359732
528	NC_007762	CGC	2	6	31640	31645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359732
529	NC_007762	CGT	2	6	31667	31672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359732
530	NC_007762	CGG	2	6	31733	31738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359732
531	NC_007762	TC	3	6	31787	31792	0 %	50 %	0 %	50 %	86359732
532	NC_007762	CGA	2	6	31796	31801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359732
533	NC_007762	CAT	2	6	31871	31876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359732
534	NC_007762	CGG	2	6	31892	31897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359732
535	NC_007762	AGC	2	6	31970	31975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359732
536	NC_007762	TGA	2	6	32068	32073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359732
537	NC_007762	TGG	2	6	32083	32088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359732
538	NC_007762	GC	3	6	32103	32108	0 %	0 %	50 %	50 %	86359732
539	NC_007762	GGA	2	6	32120	32125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359732
540	NC_007762	CCG	2	6	32161	32166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359732
541	NC_007762	GCC	3	9	32175	32183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359732
542	NC_007762	GC	4	8	32202	32209	0 %	0 %	50 %	50 %	86359732
543	NC_007762	CGG	2	6	32237	32242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359732
544	NC_007762	CGC	2	6	32249	32254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359732
545	NC_007762	GAT	2	6	32255	32260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359732
546	NC_007762	CATC	2	8	32484	32491	25 %	25 %	0 %	50 %	86359733
547	NC_007762	GTC	2	6	32581	32586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359733
548	NC_007762	GCT	2	6	32634	32639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359733
549	NC_007762	GGC	2	6	32688	32693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359733
550	NC_007762	GCCGC	2	10	32720	32729	0 %	0 %	40 %	60 %	86359733
551	NC_007762	CGG	2	6	32759	32764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359733
552	NC_007762	GAGC	2	8	32841	32848	25 %	0 %	50 %	25 %	86359733
553	NC_007762	TTA	2	6	32870	32875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86359733
554	NC_007762	CGA	2	6	32891	32896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359733
555	NC_007762	CTT	2	6	32933	32938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359733
556	NC_007762	GT	3	6	33019	33024	0 %	50 %	50 %	0 %	86359733
557	NC_007762	CGG	2	6	33068	33073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359733
558	NC_007762	CGG	3	9	33128	33136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359733
559	NC_007762	GAA	2	6	33659	33664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359734
560	NC_007762	CTGC	2	8	33666	33673	0 %	25 %	25 %	50 %	86359734
561	NC_007762	CGA	2	6	33694	33699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359734
562	NC_007762	AGC	2	6	33718	33723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359734
563	NC_007762	GTC	2	6	33760	33765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359734
564	NC_007762	GAA	2	6	33781	33786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359734
565	NC_007762	AGC	2	6	33816	33821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359734
566	NC_007762	GAC	2	6	33844	33849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359734
567	NC_007762	GCA	2	6	33935	33940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359734
568	NC_007762	CGA	2	6	34124	34129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359735
569	NC_007762	GGCT	2	8	34147	34154	0 %	25 %	50 %	25 %	86359735
570	NC_007762	CG	3	6	34180	34185	0 %	0 %	50 %	50 %	86359735
571	NC_007762	TGG	2	6	34196	34201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359735
572	NC_007762	TGT	2	6	34232	34237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86359735
573	NC_007762	CTG	2	6	34239	34244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359735
574	NC_007762	TCCA	2	8	34257	34264	25 %	25 %	0 %	50 %	86359735
575	NC_007762	TGC	2	6	34281	34286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359735
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577	NC_007762	C	6	6	34390	34395	0 %	0 %	0 %	100 %	86359735
578	NC_007762	TTG	2	6	34411	34416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86359735
579	NC_007762	GGAA	2	8	34420	34427	50 %	0 %	50 %	0 %	86359735
580	NC_007762	GCC	2	6	34464	34469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359735
581	NC_007762	GAT	2	6	34473	34478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359735
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583	NC_007762	CCA	2	6	34547	34552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86359735
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585	NC_007762	AGG	2	6	34644	34649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359735
586	NC_007762	GC	3	6	34655	34660	0 %	0 %	50 %	50 %	86359735
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589	NC_007762	GCC	2	6	34935	34940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359736
590	NC_007762	TTGC	2	8	34966	34973	0 %	50 %	25 %	25 %	86359736
591	NC_007762	CGG	2	6	35005	35010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359736
592	NC_007762	TGA	2	6	35073	35078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359736
593	NC_007762	TCG	2	6	35085	35090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359736
594	NC_007762	TCG	2	6	35219	35224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359736
595	NC_007762	CAC	2	6	35269	35274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86359736
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597	NC_007762	GTT	2	6	35413	35418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86359737
598	NC_007762	TGG	2	6	35528	35533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359737
599	NC_007762	CGT	3	9	35605	35613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359737
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601	NC_007762	GGA	2	6	35782	35787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359737
602	NC_007762	CAG	3	9	35973	35981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359738
603	NC_007762	CAA	2	6	35985	35990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359738
604	NC_007762	TCG	2	6	35997	36002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359738
605	NC_007762	GTT	2	6	36029	36034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86359738
606	NC_007762	CG	3	6	36109	36114	0 %	0 %	50 %	50 %	86359738
607	NC_007762	TGC	2	6	36119	36124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359738
608	NC_007762	CGAC	2	8	36188	36195	25 %	0 %	25 %	50 %	86359738
609	NC_007762	CGGC	2	8	36203	36210	0 %	0 %	50 %	50 %	86359738
610	NC_007762	CGGG	2	8	36300	36307	0 %	0 %	75 %	25 %	86359738
611	NC_007762	GTT	2	6	36321	36326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86359738
612	NC_007762	CGGCT	2	10	36347	36356	0 %	20 %	40 %	40 %	86359738
613	NC_007762	CAT	2	6	36439	36444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359738
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615	NC_007762	GAT	2	6	36519	36524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359738
616	NC_007762	GAG	2	6	36652	36657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359738
617	NC_007762	T	6	6	36666	36671	0 %	100 %	0 %	0 %	86359738
618	NC_007762	TCA	2	6	36688	36693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359738
619	NC_007762	TGC	2	6	36773	36778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359738
620	NC_007762	GCT	2	6	36785	36790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359738
621	NC_007762	ATG	2	6	36846	36851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359738
622	NC_007762	CGG	2	6	36881	36886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359738
623	NC_007762	ACG	2	6	36937	36942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359738
624	NC_007762	CGT	2	6	36956	36961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359738
625	NC_007762	ACT	2	6	37017	37022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359738
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627	NC_007762	GAT	2	6	37165	37170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359738
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629	NC_007762	TCGGT	2	10	37284	37293	0 %	40 %	40 %	20 %	86359739
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