MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 chromosome

Total Repeats: 90379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007761	TCG	2	6	148351	148356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355799
3002	NC_007761	GAC	2	6	148359	148364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355799
3003	NC_007761	TGC	2	6	148389	148394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355799
3004	NC_007761	CCG	2	6	148403	148408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355799
3005	NC_007761	CGG	2	6	148428	148433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355799
3006	NC_007761	CGAAG	2	10	148452	148461	40 %	0 %	40 %	20 %	86355799
3007	NC_007761	GCCT	2	8	148533	148540	0 %	25 %	25 %	50 %	86355800
3008	NC_007761	CGT	2	6	148588	148593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355800
3009	NC_007761	AGC	3	9	148596	148604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355800
3010	NC_007761	CGCCGG	2	12	148621	148632	0 %	0 %	50 %	50 %	86355800
3011	NC_007761	TGA	2	6	148633	148638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355800
3012	NC_007761	CAT	2	6	148658	148663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355800
3013	NC_007761	GC	3	6	148684	148689	0 %	0 %	50 %	50 %	86355800
3014	NC_007761	CGG	2	6	148730	148735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355800
3015	NC_007761	TGGGT	2	10	148763	148772	0 %	40 %	60 %	0 %	86355800
3016	NC_007761	CGT	2	6	148777	148782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355800
3017	NC_007761	CGAC	2	8	148827	148834	25 %	0 %	25 %	50 %	86355800
3018	NC_007761	TCC	2	6	148863	148868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86355800
3019	NC_007761	GGC	2	6	149021	149026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355800
3020	NC_007761	GTC	3	9	149102	149110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355800
3021	NC_007761	CGG	3	9	149134	149142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355800
3022	NC_007761	CCG	2	6	149172	149177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355800
3023	NC_007761	GGC	2	6	149198	149203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355800
3024	NC_007761	CTG	2	6	149213	149218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355800
3025	NC_007761	GCC	2	6	149225	149230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355800
3026	NC_007761	TCCG	2	8	149356	149363	0 %	25 %	25 %	50 %	86355801
3027	NC_007761	ACC	2	6	149437	149442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86355801
3028	NC_007761	GAT	2	6	149452	149457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355801
3029	NC_007761	GCGCG	2	10	149466	149475	0 %	0 %	60 %	40 %	86355801
3030	NC_007761	TCG	2	6	149483	149488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355801
3031	NC_007761	GCG	2	6	149495	149500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355801
3032	NC_007761	TCG	2	6	149504	149509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355801
3033	NC_007761	AGC	2	6	149510	149515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355801
3034	NC_007761	GC	3	6	149551	149556	0 %	0 %	50 %	50 %	86355801
3035	NC_007761	AGC	2	6	149579	149584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355801
3036	NC_007761	CGC	2	6	149611	149616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355801
3037	NC_007761	GAC	2	6	149641	149646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355801
3038	NC_007761	TTC	2	6	149824	149829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355801
3039	NC_007761	GGCG	2	8	149862	149869	0 %	0 %	75 %	25 %	86355801
3040	NC_007761	CGT	2	6	149940	149945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355801
3041	NC_007761	CAG	2	6	149947	149952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355801
3042	NC_007761	TTG	2	6	149954	149959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86355801
3043	NC_007761	GC	3	6	149972	149977	0 %	0 %	50 %	50 %	86355801
3044	NC_007761	GCG	2	6	149992	149997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355801
3045	NC_007761	CGG	2	6	150044	150049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355801
3046	NC_007761	GGA	2	6	150052	150057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86355801
3047	NC_007761	CATC	2	8	150075	150082	25 %	25 %	0 %	50 %	86355801
3048	NC_007761	AGA	2	6	150098	150103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86355801
3049	NC_007761	TCG	2	6	150122	150127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355801
3050	NC_007761	CGG	2	6	150161	150166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355801
3051	NC_007761	GCC	2	6	150250	150255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355801
3052	NC_007761	GGC	2	6	150286	150291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355801
3053	NC_007761	AGC	2	6	150317	150322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355801
3054	NC_007761	TTG	2	6	150870	150875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86355802
3055	NC_007761	TCG	2	6	150904	150909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355802
3056	NC_007761	GACT	2	8	150942	150949	25 %	25 %	25 %	25 %	86355802
3057	NC_007761	CAG	2	6	150953	150958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355802
3058	NC_007761	GAAC	2	8	150978	150985	50 %	0 %	25 %	25 %	86355802
3059	NC_007761	CAGC	2	8	150993	151000	25 %	0 %	25 %	50 %	86355802
3060	NC_007761	AT	3	6	151062	151067	50 %	50 %	0 %	0 %	86355802
3061	NC_007761	CGG	2	6	151075	151080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355802
3062	NC_007761	GCG	2	6	151185	151190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355802
3063	NC_007761	GCC	2	6	151205	151210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355802
3064	NC_007761	CAG	2	6	151365	151370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355803
3065	NC_007761	GTC	2	6	151371	151376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355803
3066	NC_007761	CTG	2	6	151434	151439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355803
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3069	NC_007761	CAT	2	6	151707	151712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355803
3070	NC_007761	GAA	2	6	151884	151889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86355804
3071	NC_007761	GAA	2	6	151939	151944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86355804
3072	NC_007761	AGT	2	6	151963	151968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355804
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3078	NC_007761	GTC	2	6	152170	152175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355804
3079	NC_007761	GCCG	2	8	152262	152269	0 %	0 %	50 %	50 %	86355804
3080	NC_007761	CCG	2	6	152272	152277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355804
3081	NC_007761	TCGCCC	2	12	152290	152301	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	86355804
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3083	NC_007761	TCGA	2	8	152449	152456	25 %	25 %	25 %	25 %	86355804
3084	NC_007761	GAA	2	6	152457	152462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86355804
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3089	NC_007761	CAT	2	6	152694	152699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355804
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3091	NC_007761	GCC	3	9	152733	152741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355804
3092	NC_007761	GCC	3	9	152748	152756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355804
3093	NC_007761	CCG	2	6	152758	152763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355804
3094	NC_007761	GCC	2	6	152769	152774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355804
3095	NC_007761	GCC	2	6	152809	152814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355804
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3100	NC_007761	GTC	3	9	153106	153114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355805
3101	NC_007761	CGA	2	6	153138	153143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355805
3102	NC_007761	CGC	2	6	153150	153155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355805
3103	NC_007761	GCA	2	6	153173	153178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355805
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3105	NC_007761	CTG	2	6	153193	153198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355805
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3107	NC_007761	GCGGT	2	10	153329	153338	0 %	20 %	60 %	20 %	86355805
3108	NC_007761	GTGGA	2	10	153383	153392	20 %	20 %	60 %	0 %	86355805
3109	NC_007761	CTT	2	6	153436	153441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355805
3110	NC_007761	GCA	2	6	153449	153454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355805
3111	NC_007761	GCC	2	6	153502	153507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355805
3112	NC_007761	CTG	2	6	153526	153531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355805
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3118	NC_007761	CTG	2	6	153718	153723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355805
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3120	NC_007761	TCG	2	6	153768	153773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355805
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3122	NC_007761	GGC	2	6	153892	153897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355805
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3228	NC_007761	ATCCCG	2	12	158391	158402	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	86355807
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3230	NC_007761	TAA	2	6	158419	158424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86355807
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3235	NC_007761	CGG	2	6	158681	158686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355807
3236	NC_007761	GACGGC	2	12	158691	158702	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	86355807
3237	NC_007761	GC	3	6	158725	158730	0 %	0 %	50 %	50 %	86355807
3238	NC_007761	CGG	2	6	158759	158764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355807
3239	NC_007761	AGC	2	6	158791	158796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355807
3240	NC_007761	CTC	2	6	158840	158845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86355807
3241	NC_007761	TTTC	2	8	158951	158958	0 %	75 %	0 %	25 %	86355807
3242	NC_007761	G	6	6	158998	159003	0 %	0 %	100 %	0 %	86355807
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3244	NC_007761	CGA	2	6	159346	159351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355808
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3352	NC_007761	GCT	2	6	164707	164712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355811
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3354	NC_007761	CTCGAT	2	12	164822	164833	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	86355811
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3357	NC_007761	CGG	2	6	164961	164966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355811
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3359	NC_007761	GAGCCG	2	12	165020	165031	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	86355811
3360	NC_007761	CGG	2	6	165037	165042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355811
3361	NC_007761	CGCC	2	8	165120	165127	0 %	0 %	25 %	75 %	86355811
3362	NC_007761	GC	3	6	165233	165238	0 %	0 %	50 %	50 %	86355811
3363	NC_007761	GATGC	2	10	165281	165290	20 %	20 %	40 %	20 %	86355811
3364	NC_007761	GCC	2	6	165362	165367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355811
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3488	NC_007761	CGA	2	6	170638	170643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355814
3489	NC_007761	ATG	2	6	170652	170657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355814
3490	NC_007761	TCG	2	6	170807	170812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355815
3491	NC_007761	TCG	2	6	170882	170887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355815
3492	NC_007761	TGCA	2	8	170902	170909	25 %	25 %	25 %	25 %	86355815
3493	NC_007761	GGA	2	6	170932	170937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86355815
3494	NC_007761	GCG	2	6	170975	170980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355815
3495	NC_007761	GC	3	6	171018	171023	0 %	0 %	50 %	50 %	86355815
3496	NC_007761	GGC	2	6	171061	171066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355815
3497	NC_007761	TCG	2	6	171116	171121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355815
3498	NC_007761	GA	3	6	171126	171131	50 %	0 %	50 %	0 %	86355815
3499	NC_007761	CGT	2	6	171138	171143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355815
3500	NC_007761	CGA	2	6	171240	171245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355815

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