MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 chromosome

Total Repeats: 90379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_007761	G	6	6	215312	215317	0 %	0 %	100 %	0 %	86355861
4502	NC_007761	GAT	2	6	215358	215363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355861
4503	NC_007761	GCC	2	6	215364	215369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355861
4504	NC_007761	CGA	2	6	215383	215388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355861
4505	NC_007761	ACC	2	6	215394	215399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86355861
4506	NC_007761	GGC	2	6	215576	215581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355862
4507	NC_007761	TTG	2	6	215632	215637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86355862
4508	NC_007761	T	6	6	215661	215666	0 %	100 %	0 %	0 %	86355862
4509	NC_007761	GCC	2	6	215700	215705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355862
4510	NC_007761	GCG	2	6	215758	215763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355862
4511	NC_007761	TGA	2	6	215827	215832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355862
4512	NC_007761	CGG	2	6	215849	215854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355862
4513	NC_007761	CCT	2	6	215855	215860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86355862
4514	NC_007761	CTG	2	6	215874	215879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355862
4515	NC_007761	TGC	2	6	215935	215940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355862
4516	NC_007761	AAG	2	6	215946	215951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86355862
4517	NC_007761	CATCGC	2	12	215963	215974	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	86355862
4518	NC_007761	CGC	2	6	216004	216009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355862
4519	NC_007761	CGCTG	2	10	216017	216026	0 %	20 %	40 %	40 %	86355862
4520	NC_007761	GTG	2	6	216188	216193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86355863
4521	NC_007761	CGT	2	6	216244	216249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355863
4522	NC_007761	AAGA	2	8	216272	216279	75 %	0 %	25 %	0 %	86355863
4523	NC_007761	TCTCG	2	10	216295	216304	0 %	40 %	20 %	40 %	86355863
4524	NC_007761	CGA	2	6	216337	216342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355863
4525	NC_007761	TGGCC	2	10	216357	216366	0 %	20 %	40 %	40 %	86355863
4526	NC_007761	AGG	2	6	216369	216374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86355863
4527	NC_007761	CGT	2	6	216376	216381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355863
4528	NC_007761	TCA	2	6	216390	216395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355863
4529	NC_007761	CGT	2	6	216439	216444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355863
4530	NC_007761	CAG	2	6	216499	216504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355863
4531	NC_007761	GCCG	2	8	216526	216533	0 %	0 %	50 %	50 %	86355863
4532	NC_007761	CGG	2	6	216577	216582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355863
4533	NC_007761	TCA	2	6	216612	216617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355863
4534	NC_007761	CAA	2	6	216640	216645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86355863
4535	NC_007761	TCA	2	6	216648	216653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355863
4536	NC_007761	CAG	2	6	216695	216700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355863
4537	NC_007761	CAG	2	6	216794	216799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355863
4538	NC_007761	TCGC	2	8	216815	216822	0 %	25 %	25 %	50 %	86355863
4539	NC_007761	GCAGGA	2	12	216844	216855	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	86355863
4540	NC_007761	GCG	2	6	216863	216868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355863
4541	NC_007761	CTG	2	6	216875	216880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355863
4542	NC_007761	GCG	2	6	216882	216887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355863
4543	NC_007761	TCA	2	6	216912	216917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355863
4544	NC_007761	GC	3	6	216997	217002	0 %	0 %	50 %	50 %	86355864
4545	NC_007761	CGT	3	9	217177	217185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355864
4546	NC_007761	GGA	2	6	217195	217200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86355864
4547	NC_007761	CCGAC	2	10	217221	217230	20 %	0 %	20 %	60 %	86355864
4548	NC_007761	AAG	2	6	217280	217285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86355864
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4550	NC_007761	GTC	2	6	217331	217336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355864
4551	NC_007761	CCG	2	6	217387	217392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355864
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4553	NC_007761	GGC	2	6	217483	217488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355864
4554	NC_007761	GCG	2	6	217515	217520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355864
4555	NC_007761	CGA	3	9	217524	217532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355864
4556	NC_007761	CGG	2	6	217555	217560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355864
4557	NC_007761	GCC	2	6	217590	217595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355864
4558	NC_007761	GTC	2	6	217607	217612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355864
4559	NC_007761	CCT	2	6	217615	217620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86355864
4560	NC_007761	CGC	2	6	217673	217678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355864
4561	NC_007761	AGC	2	6	217689	217694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355864
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4563	NC_007761	CGG	3	9	217783	217791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355864
4564	NC_007761	GGC	2	6	217795	217800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355864
4565	NC_007761	GGT	2	6	217867	217872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86355864
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4568	NC_007761	CAG	2	6	217940	217945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355864
4569	NC_007761	CGA	2	6	217953	217958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355864
4570	NC_007761	GTC	2	6	218032	218037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355864
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4573	NC_007761	GGCC	2	8	218164	218171	0 %	0 %	50 %	50 %	86355864
4574	NC_007761	GGC	2	6	218201	218206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355864
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4578	NC_007761	CTT	2	6	218380	218385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355864
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4580	NC_007761	CGA	2	6	218537	218542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355865
4581	NC_007761	GTC	2	6	218581	218586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355865
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4583	NC_007761	GAC	2	6	218653	218658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355865
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4586	NC_007761	CGAC	2	8	218723	218730	25 %	0 %	25 %	50 %	86355865
4587	NC_007761	CGC	2	6	218731	218736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355865
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4590	NC_007761	GAC	2	6	218883	218888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355865
4591	NC_007761	ATC	2	6	218911	218916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355865
4592	NC_007761	GCCGGC	2	12	218935	218946	0 %	0 %	50 %	50 %	86355865
4593	NC_007761	TGC	2	6	218949	218954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355865
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4599	NC_007761	CGAT	2	8	219137	219144	25 %	25 %	25 %	25 %	86355865
4600	NC_007761	GCG	2	6	219150	219155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355865
4601	NC_007761	CAA	2	6	219156	219161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86355865
4602	NC_007761	GAC	3	9	219180	219188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355865
4603	NC_007761	CGA	2	6	219191	219196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355865
4604	NC_007761	CAG	2	6	219219	219224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355865
4605	NC_007761	GCA	2	6	219383	219388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355866
4606	NC_007761	GCG	2	6	219448	219453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355866
4607	NC_007761	GCC	2	6	219465	219470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355866
4608	NC_007761	CGC	2	6	219479	219484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355866
4609	NC_007761	ATC	2	6	219504	219509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355866
4610	NC_007761	CGC	2	6	219560	219565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355866
4611	NC_007761	TCG	2	6	219595	219600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355866
4612	NC_007761	CTA	2	6	219602	219607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355866
4613	NC_007761	AT	3	6	219656	219661	50 %	50 %	0 %	0 %	86355866
4614	NC_007761	AGCCG	2	10	219725	219734	20 %	0 %	40 %	40 %	86355866
4615	NC_007761	GCA	2	6	219742	219747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355866
4616	NC_007761	CGA	2	6	219941	219946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355866
4617	NC_007761	CTG	2	6	219963	219968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355866
4618	NC_007761	GCAGC	2	10	220070	220079	20 %	0 %	40 %	40 %	86355866
4619	NC_007761	GC	3	6	220078	220083	0 %	0 %	50 %	50 %	86355866
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4621	NC_007761	GGT	2	6	220154	220159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86355866
4622	NC_007761	CGG	2	6	220165	220170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355866
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4849	NC_007761	TCG	2	6	229855	229860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355877
4850	NC_007761	GAT	2	6	229898	229903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355877
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4852	NC_007761	CGC	2	6	230061	230066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355877
4853	NC_007761	GGCG	2	8	230098	230105	0 %	0 %	75 %	25 %	86355877
4854	NC_007761	CG	4	8	230135	230142	0 %	0 %	50 %	50 %	86355877
4855	NC_007761	CGC	2	6	230195	230200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355877
4856	NC_007761	TCA	2	6	230223	230228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355877
4857	NC_007761	ATCC	2	8	230297	230304	25 %	25 %	0 %	50 %	86355877
4858	NC_007761	GGC	2	6	230319	230324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355877
4859	NC_007761	ATA	2	6	230423	230428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86355877
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4861	NC_007761	GCG	2	6	230559	230564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355877
4862	NC_007761	CCG	2	6	230577	230582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355877
4863	NC_007761	GGA	2	6	230639	230644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86355877
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