MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 chromosome

Total Repeats: 73181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007643	TCG	2	6	237	242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591341
2	NC_007643	CTT	2	6	326	331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83591341
3	NC_007643	CGG	2	6	391	396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591341
4	NC_007643	TGA	2	6	448	453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591341
5	NC_007643	GGC	2	6	485	490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591341
6	NC_007643	TCG	2	6	498	503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591341
7	NC_007643	TCG	2	6	523	528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591341
8	NC_007643	CGG	3	9	601	609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591341
9	NC_007643	CGC	2	6	644	649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591341
10	NC_007643	GGC	2	6	677	682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591341
11	NC_007643	GAC	2	6	726	731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591341
12	NC_007643	GCG	2	6	807	812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591341
13	NC_007643	GGC	2	6	867	872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591341
14	NC_007643	CGC	2	6	931	936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591341
15	NC_007643	TCA	2	6	1069	1074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591341
16	NC_007643	GAA	2	6	1095	1100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83591341
17	NC_007643	TTC	2	6	1101	1106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83591341
18	NC_007643	CAC	2	6	1241	1246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591341
19	NC_007643	CTG	2	6	1449	1454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591341
20	NC_007643	CGA	2	6	1481	1486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591341
21	NC_007643	AAG	2	6	1494	1499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83591341
22	NC_007643	CGC	2	6	1545	1550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591341
23	NC_007643	AGC	2	6	1597	1602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591341
24	NC_007643	CTG	2	6	1731	1736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591341
25	NC_007643	CGT	2	6	2048	2053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591342
26	NC_007643	GCG	2	6	2057	2062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591342
27	NC_007643	TCG	2	6	2149	2154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591342
28	NC_007643	ACC	2	6	2169	2174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591342
29	NC_007643	ACG	2	6	2272	2277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591342
30	NC_007643	CTA	2	6	2450	2455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591342
31	NC_007643	GCC	2	6	2568	2573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591342
32	NC_007643	AGA	2	6	2671	2676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83591342
33	NC_007643	CGA	2	6	2690	2695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591342
34	NC_007643	GCC	2	6	2805	2810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591342
35	NC_007643	GAG	2	6	2919	2924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591342
36	NC_007643	GGC	2	6	2930	2935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591342
37	NC_007643	CGC	2	6	3035	3040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591342
38	NC_007643	GAC	2	6	3109	3114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591342
39	NC_007643	CGT	2	6	3166	3171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591343
40	NC_007643	GCT	2	6	3201	3206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591343
41	NC_007643	CTG	2	6	3281	3286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591343
42	NC_007643	GGC	2	6	3328	3333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591343
43	NC_007643	GCC	2	6	3348	3353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591343
44	NC_007643	CGC	2	6	3367	3372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591343
45	NC_007643	CGG	2	6	3375	3380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591343
46	NC_007643	GCC	2	6	3398	3403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591343
47	NC_007643	CGG	2	6	3417	3422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591343
48	NC_007643	GCG	2	6	3441	3446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591343
49	NC_007643	CGG	2	6	3477	3482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591343
50	NC_007643	GGC	2	6	3526	3531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591343
51	NC_007643	GTT	2	6	3580	3585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83591343
52	NC_007643	CGG	2	6	3589	3594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591343
53	NC_007643	CCG	2	6	3663	3668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591343
54	NC_007643	TGC	2	6	3702	3707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591343
55	NC_007643	TCG	2	6	3777	3782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591343
56	NC_007643	GCG	2	6	3815	3820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591343
57	NC_007643	GCC	2	6	3890	3895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591343
58	NC_007643	GCC	2	6	3908	3913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591343
59	NC_007643	GAT	2	6	3983	3988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591343
60	NC_007643	CCG	2	6	4020	4025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591343
61	NC_007643	AGG	2	6	4092	4097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591343
62	NC_007643	GCT	2	6	4117	4122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591343
63	NC_007643	CGA	2	6	4129	4134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591343
64	NC_007643	CAG	2	6	4368	4373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591344
65	NC_007643	CGA	2	6	4454	4459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591344
66	NC_007643	CAC	2	6	4473	4478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591344
67	NC_007643	GGT	2	6	4490	4495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591344
68	NC_007643	CGA	2	6	4508	4513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591344
69	NC_007643	GAG	2	6	4617	4622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591344
70	NC_007643	GCC	2	6	4632	4637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591344
71	NC_007643	CGG	2	6	4664	4669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591344
72	NC_007643	GGT	2	6	4727	4732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591344
73	NC_007643	GGT	2	6	4811	4816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591344
74	NC_007643	GGT	2	6	4829	4834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591344
75	NC_007643	GCG	2	6	4843	4848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591344
76	NC_007643	CAC	2	6	4901	4906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591344
77	NC_007643	GCT	2	6	4970	4975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591344
78	NC_007643	CAC	2	6	5006	5011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591344
79	NC_007643	ACG	2	6	5023	5028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591344
80	NC_007643	CCG	2	6	5085	5090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591344
81	NC_007643	CAA	2	6	5180	5185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83591344
82	NC_007643	GGC	2	6	5202	5207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591344
83	NC_007643	CGG	2	6	5228	5233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591344
84	NC_007643	TGA	2	6	5275	5280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591344
85	NC_007643	GGT	2	6	5411	5416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591344
86	NC_007643	GTC	2	6	5427	5432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591344
87	NC_007643	GGA	2	6	5453	5458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591344
88	NC_007643	AGG	2	6	5467	5472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591344
89	NC_007643	ATC	2	6	5481	5486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591344
90	NC_007643	GGT	2	6	5492	5497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591344
91	NC_007643	GCC	4	12	5502	5513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591344
92	NC_007643	GCC	2	6	5520	5525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591344
93	NC_007643	CGC	2	6	5526	5531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591344
94	NC_007643	TCG	2	6	5635	5640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591344
95	NC_007643	CCG	2	6	5650	5655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591344
96	NC_007643	CGG	2	6	5761	5766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591344
97	NC_007643	CGC	2	6	5783	5788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591344
98	NC_007643	GAT	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591344
99	NC_007643	ATC	3	9	5847	5855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591344
100	NC_007643	CTG	2	6	5895	5900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591344
101	NC_007643	CTT	3	9	5906	5914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83591344
102	NC_007643	GTC	2	6	5931	5936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591344
103	NC_007643	GCC	2	6	5963	5968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591344
104	NC_007643	GAC	2	6	6012	6017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591344
105	NC_007643	CTG	2	6	6036	6041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591344
106	NC_007643	ACC	2	6	6069	6074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591344
107	NC_007643	GCC	2	6	6075	6080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591344
108	NC_007643	CGC	2	6	6149	6154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591344
109	NC_007643	GGC	2	6	6191	6196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591344
110	NC_007643	GAC	2	6	6231	6236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591344
111	NC_007643	GCC	2	6	6255	6260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591344
112	NC_007643	GCC	2	6	6324	6329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591344
113	NC_007643	GGC	2	6	6333	6338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591344
114	NC_007643	CCG	2	6	6416	6421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591344
115	NC_007643	GGC	2	6	6434	6439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591344
116	NC_007643	AGC	2	6	6460	6465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591344
117	NC_007643	ATC	2	6	6498	6503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591344
118	NC_007643	GCC	2	6	6537	6542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591344
119	NC_007643	AGC	2	6	6598	6603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591344
120	NC_007643	ACC	2	6	6612	6617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591344
121	NC_007643	GCC	2	6	6634	6639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591344
122	NC_007643	TGC	2	6	6640	6645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591344
123	NC_007643	TCG	2	6	6706	6711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591344
124	NC_007643	CGC	2	6	6717	6722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591344
125	NC_007643	GCT	2	6	7210	7215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591345
126	NC_007643	ACG	2	6	7226	7231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591345
127	NC_007643	CCG	2	6	7337	7342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591345
128	NC_007643	AGG	2	6	7367	7372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591345
129	NC_007643	GAT	2	6	7646	7651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591346
130	NC_007643	ATC	2	6	7659	7664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591346
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132	NC_007643	TGA	2	6	7883	7888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591346
133	NC_007643	TTC	2	6	7908	7913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83591346
134	NC_007643	CGG	2	6	7977	7982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591346
135	NC_007643	GAT	2	6	8286	8291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591346
136	NC_007643	TTC	2	6	8307	8312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83591346
137	NC_007643	CTG	2	6	8331	8336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591346
138	NC_007643	AAG	2	6	8343	8348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83591346
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153	NC_007643	ATC	2	6	9859	9864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591349
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165	NC_007643	CGG	2	6	10748	10753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591350
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