MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 chromosome

Total Repeats: 99932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007643	GCC	2	6	130199	130204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591451
3002	NC_007643	GCC	4	12	130234	130245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591451
3003	NC_007643	GGCCGT	2	12	130255	130266	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	83591451
3004	NC_007643	CGGG	2	8	130283	130290	0 %	0 %	75 %	25 %	83591451
3005	NC_007643	GGCGA	2	10	130328	130337	20 %	0 %	60 %	20 %	83591451
3006	NC_007643	C	6	6	130350	130355	0 %	0 %	0 %	100 %	83591451
3007	NC_007643	TGGC	2	8	130388	130395	0 %	25 %	50 %	25 %	83591451
3008	NC_007643	GCC	2	6	130442	130447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591451
3009	NC_007643	GCG	3	9	130460	130468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591451
3010	NC_007643	CG	3	6	130467	130472	0 %	0 %	50 %	50 %	83591451
3011	NC_007643	GCG	2	6	130478	130483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591451
3012	NC_007643	GCC	2	6	130505	130510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591451
3013	NC_007643	CTGG	2	8	130543	130550	0 %	25 %	50 %	25 %	83591451
3014	NC_007643	GCC	2	6	130556	130561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591451
3015	NC_007643	GGCG	2	8	130567	130574	0 %	0 %	75 %	25 %	83591451
3016	NC_007643	CGG	2	6	130579	130584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591451
3017	NC_007643	GCC	2	6	130598	130603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591451
3018	NC_007643	CGG	2	6	130632	130637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591451
3019	NC_007643	GC	3	6	130655	130660	0 %	0 %	50 %	50 %	83591451
3020	NC_007643	AGG	2	6	130686	130691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591451
3021	NC_007643	GC	3	6	130740	130745	0 %	0 %	50 %	50 %	83591452
3022	NC_007643	GGT	2	6	130770	130775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591452
3023	NC_007643	GCTGGT	2	12	130776	130787	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	83591452
3024	NC_007643	TGT	2	6	130793	130798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83591452
3025	NC_007643	GCG	2	6	130802	130807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591452
3026	NC_007643	CAG	2	6	130819	130824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591452
3027	NC_007643	CGG	2	6	130880	130885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591452
3028	NC_007643	CGA	2	6	130929	130934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591452
3029	NC_007643	GGC	2	6	130935	130940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591452
3030	NC_007643	CGG	2	6	130953	130958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591452
3031	NC_007643	CGATGG	2	12	130965	130976	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	83591452
3032	NC_007643	CCG	2	6	130994	130999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591452
3033	NC_007643	GCG	2	6	131014	131019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591452
3034	NC_007643	CGC	2	6	131022	131027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591452
3035	NC_007643	CGG	3	9	131093	131101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591452
3036	NC_007643	ACC	2	6	131113	131118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591452
3037	NC_007643	GCCC	2	8	131121	131128	0 %	0 %	25 %	75 %	83591452
3038	NC_007643	ATC	2	6	131152	131157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591452
3039	NC_007643	CGG	2	6	131177	131182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591452
3040	NC_007643	GCG	2	6	131233	131238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591452
3041	NC_007643	TGA	2	6	131309	131314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591452
3042	NC_007643	CCG	2	6	131339	131344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591452
3043	NC_007643	GTT	2	6	131406	131411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83591452
3044	NC_007643	AAGG	2	8	131513	131520	50 %	0 %	50 %	0 %	83591453
3045	NC_007643	GCGA	2	8	131558	131565	25 %	0 %	50 %	25 %	83591453
3046	NC_007643	CGC	3	9	131570	131578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591453
3047	NC_007643	GAG	2	6	131639	131644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591453
3048	NC_007643	CG	3	6	131661	131666	0 %	0 %	50 %	50 %	83591453
3049	NC_007643	G	6	6	131683	131688	0 %	0 %	100 %	0 %	83591453
3050	NC_007643	TGC	2	6	131706	131711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591453
3051	NC_007643	CGG	2	6	131732	131737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591453
3052	NC_007643	GCG	2	6	131742	131747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591453
3053	NC_007643	C	6	6	131748	131753	0 %	0 %	0 %	100 %	83591453
3054	NC_007643	CGA	2	6	131803	131808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591453
3055	NC_007643	CCA	2	6	131843	131848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591453
3056	NC_007643	CGA	2	6	131850	131855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591453
3057	NC_007643	CG	3	6	131857	131862	0 %	0 %	50 %	50 %	83591453
3058	NC_007643	CGC	3	9	131866	131874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591453
3059	NC_007643	GCC	2	6	131875	131880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591453
3060	NC_007643	GCT	2	6	131914	131919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591453
3061	NC_007643	CGG	2	6	131923	131928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591453
3062	NC_007643	TCA	2	6	132018	132023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591453
3063	NC_007643	AGC	2	6	132056	132061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591453
3064	NC_007643	CGC	2	6	132079	132084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591453
3065	NC_007643	CGG	2	6	132102	132107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591453
3066	NC_007643	GCT	2	6	132175	132180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591453
3067	NC_007643	TGG	2	6	132210	132215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591453
3068	NC_007643	CGA	2	6	132220	132225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591453
3069	NC_007643	GCC	2	6	132231	132236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591453
3070	NC_007643	GGT	2	6	132265	132270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591453
3071	NC_007643	GTC	2	6	132271	132276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591453
3072	NC_007643	ATCG	2	8	132299	132306	25 %	25 %	25 %	25 %	83591453
3073	NC_007643	TGC	2	6	132339	132344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591453
3074	NC_007643	CGGC	2	8	132366	132373	0 %	0 %	50 %	50 %	83591453
3075	NC_007643	GGT	2	6	132412	132417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591453
3076	NC_007643	CTG	2	6	132434	132439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591453
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3078	NC_007643	TGC	2	6	132714	132719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591453
3079	NC_007643	CTG	2	6	132797	132802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591453
3080	NC_007643	CCG	2	6	132805	132810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591453
3081	NC_007643	CTG	2	6	132821	132826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591453
3082	NC_007643	ACC	2	6	132857	132862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591453
3083	NC_007643	GGA	2	6	132919	132924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591453
3084	NC_007643	GCT	2	6	132946	132951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591453
3085	NC_007643	CTG	2	6	133010	133015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591453
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3087	NC_007643	GC	3	6	133081	133086	0 %	0 %	50 %	50 %	83591453
3088	NC_007643	GCT	2	6	133180	133185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591453
3089	NC_007643	GCC	2	6	133227	133232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591453
3090	NC_007643	GC	3	6	133325	133330	0 %	0 %	50 %	50 %	83591453
3091	NC_007643	CGA	2	6	133408	133413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591453
3092	NC_007643	GCGCC	2	10	133425	133434	0 %	0 %	40 %	60 %	83591453
3093	NC_007643	GGC	2	6	133528	133533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591453
3094	NC_007643	GC	3	6	133540	133545	0 %	0 %	50 %	50 %	83591453
3095	NC_007643	CCG	2	6	133558	133563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591453
3096	NC_007643	TGA	2	6	133571	133576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591453
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3098	NC_007643	CTG	2	6	133666	133671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591454
3099	NC_007643	GGC	2	6	133692	133697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591454
3100	NC_007643	CGG	2	6	133720	133725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591454
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3102	NC_007643	GCG	2	6	133758	133763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591454
3103	NC_007643	GTT	2	6	133794	133799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83591454
3104	NC_007643	GCT	2	6	133836	133841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591454
3105	NC_007643	TGA	2	6	133851	133856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591454
3106	NC_007643	GAT	2	6	133890	133895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591454
3107	NC_007643	GCG	2	6	133899	133904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591454
3108	NC_007643	GCG	2	6	133910	133915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591454
3109	NC_007643	GGC	2	6	133952	133957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591454
3110	NC_007643	GTG	2	6	133990	133995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591454
3111	NC_007643	GCG	2	6	134012	134017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591454
3112	NC_007643	GCG	2	6	134024	134029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591454
3113	NC_007643	GCG	2	6	134076	134081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591454
3114	NC_007643	TCG	2	6	134108	134113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591454
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3116	NC_007643	CGG	2	6	134184	134189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591454
3117	NC_007643	GCC	2	6	134205	134210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591454
3118	NC_007643	TCG	2	6	134246	134251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591454
3119	NC_007643	GCG	2	6	134310	134315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591454
3120	NC_007643	GCC	2	6	134329	134334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591454
3121	NC_007643	CCTTG	2	10	134355	134364	0 %	40 %	20 %	40 %	83591454
3122	NC_007643	TTC	2	6	134416	134421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83591454
3123	NC_007643	CG	4	8	134469	134476	0 %	0 %	50 %	50 %	83591454
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3493	NC_007643	TGA	2	6	148466	148471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591467
3494	NC_007643	GGC	2	6	148503	148508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591467
3495	NC_007643	GTT	2	6	148548	148553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83591467
3496	NC_007643	CGCC	2	8	148572	148579	0 %	0 %	25 %	75 %	83591467
3497	NC_007643	GCA	2	6	148653	148658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591468
3498	NC_007643	CGG	2	6	148728	148733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591468
3499	NC_007643	GC	3	6	148831	148836	0 %	0 %	50 %	50 %	83591468
3500	NC_007643	GCCA	2	8	148871	148878	25 %	0 %	25 %	50 %	83591468

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