MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 chromosome

Total Repeats: 99932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_007643	GCGCGT	2	12	45914	45925	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	83591383
1003	NC_007643	CCGG	2	8	46024	46031	0 %	0 %	50 %	50 %	83591383
1004	NC_007643	GC	3	6	46056	46061	0 %	0 %	50 %	50 %	83591383
1005	NC_007643	GGT	2	6	46079	46084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591383
1006	NC_007643	ATCG	2	8	46122	46129	25 %	25 %	25 %	25 %	83591383
1007	NC_007643	GAT	2	6	46140	46145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591383
1008	NC_007643	CGA	2	6	46172	46177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591383
1009	NC_007643	TGA	2	6	46183	46188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591383
1010	NC_007643	GGCC	2	8	46280	46287	0 %	0 %	50 %	50 %	83591383
1011	NC_007643	GCA	2	6	46354	46359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591383
1012	NC_007643	CGC	2	6	46366	46371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591383
1013	NC_007643	ATC	2	6	46578	46583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591384
1014	NC_007643	ATCG	2	8	46599	46606	25 %	25 %	25 %	25 %	83591384
1015	NC_007643	CG	3	6	46618	46623	0 %	0 %	50 %	50 %	83591384
1016	NC_007643	CGT	2	6	46627	46632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591384
1017	NC_007643	TCG	2	6	46663	46668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591384
1018	NC_007643	GGA	3	9	46685	46693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591384
1019	NC_007643	GAG	2	6	46785	46790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591384
1020	NC_007643	GCG	2	6	46948	46953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591385
1021	NC_007643	CGT	2	6	46954	46959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591385
1022	NC_007643	ACCG	2	8	47066	47073	25 %	0 %	25 %	50 %	83591385
1023	NC_007643	CGC	2	6	47089	47094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591385
1024	NC_007643	CGC	2	6	47179	47184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591385
1025	NC_007643	CGA	2	6	47218	47223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591385
1026	NC_007643	CAT	2	6	47248	47253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591385
1027	NC_007643	CCG	2	6	47296	47301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591385
1028	NC_007643	GCC	2	6	47329	47334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591385
1029	NC_007643	GCCACC	2	12	47432	47443	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	83591385
1030	NC_007643	CGG	2	6	47503	47508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591385
1031	NC_007643	CGT	2	6	47560	47565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591385
1032	NC_007643	GCG	2	6	47627	47632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591385
1033	NC_007643	CCAT	2	8	47679	47686	25 %	25 %	0 %	50 %	83591385
1034	NC_007643	CCG	2	6	47712	47717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591385
1035	NC_007643	GGC	2	6	47786	47791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591385
1036	NC_007643	TGA	2	6	47904	47909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591385
1037	NC_007643	CGA	2	6	47916	47921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591385
1038	NC_007643	TGG	2	6	47967	47972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591385
1039	NC_007643	CGA	2	6	47973	47978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591385
1040	NC_007643	GCG	2	6	48142	48147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591385
1041	NC_007643	TCG	2	6	48150	48155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591385
1042	NC_007643	C	6	6	48193	48198	0 %	0 %	0 %	100 %	83591386
1043	NC_007643	CTG	2	6	48219	48224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591386
1044	NC_007643	CTG	2	6	48273	48278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591386
1045	NC_007643	GGC	2	6	48298	48303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591386
1046	NC_007643	CTG	2	6	48450	48455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591386
1047	NC_007643	CGC	2	6	48462	48467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591386
1048	NC_007643	GCC	2	6	48468	48473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591386
1049	NC_007643	CCG	2	6	48595	48600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591386
1050	NC_007643	CTG	2	6	48603	48608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591386
1051	NC_007643	CGC	2	6	48609	48614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591386
1052	NC_007643	TCGCCC	2	12	48655	48666	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	83591386
1053	NC_007643	ATC	2	6	48769	48774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591387
1054	NC_007643	GCTCT	2	10	48780	48789	0 %	40 %	20 %	40 %	83591387
1055	NC_007643	CTT	2	6	48790	48795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83591387
1056	NC_007643	TCG	2	6	48846	48851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591387
1057	NC_007643	TGAC	2	8	48852	48859	25 %	25 %	25 %	25 %	83591387
1058	NC_007643	CAG	2	6	48863	48868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591387
1059	NC_007643	TGGT	2	8	48927	48934	0 %	50 %	50 %	0 %	83591387
1060	NC_007643	AAG	2	6	48950	48955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83591387
1061	NC_007643	GGT	2	6	48960	48965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591387
1062	NC_007643	CG	3	6	48995	49000	0 %	0 %	50 %	50 %	83591387
1063	NC_007643	GCC	2	6	49010	49015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591387
1064	NC_007643	GGC	2	6	49073	49078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591387
1065	NC_007643	ATT	2	6	49121	49126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	83591387
1066	NC_007643	CTG	2	6	49160	49165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591387
1067	NC_007643	GC	4	8	49210	49217	0 %	0 %	50 %	50 %	83591387
1068	NC_007643	AAG	2	6	49238	49243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83591387
1069	NC_007643	CAT	2	6	49336	49341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591387
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1071	NC_007643	CCA	2	6	49369	49374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591387
1072	NC_007643	GCG	2	6	49446	49451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591387
1073	NC_007643	CCT	2	6	49468	49473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83591387
1074	NC_007643	GCC	2	6	49505	49510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591387
1075	NC_007643	CGG	2	6	49596	49601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591387
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1078	NC_007643	CGC	2	6	49655	49660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591387
1079	NC_007643	CGG	2	6	49675	49680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591387
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1084	NC_007643	TCG	2	6	49879	49884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591387
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1088	NC_007643	CCG	2	6	49953	49958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591387
1089	NC_007643	CGGG	2	8	50025	50032	0 %	0 %	75 %	25 %	83591387
1090	NC_007643	GAC	2	6	50151	50156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591387
1091	NC_007643	CAGC	2	8	50168	50175	25 %	0 %	25 %	50 %	83591387
1092	NC_007643	GCA	2	6	50236	50241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591387
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1094	NC_007643	GC	3	6	50587	50592	0 %	0 %	50 %	50 %	83591388
1095	NC_007643	CGG	2	6	50669	50674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591388
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1098	NC_007643	GCC	2	6	50857	50862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591388
1099	NC_007643	CGC	2	6	50867	50872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591388
1100	NC_007643	GCG	2	6	50944	50949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591388
1101	NC_007643	AGA	2	6	50983	50988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83591388
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1104	NC_007643	TGC	2	6	51029	51034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591388
1105	NC_007643	CG	3	6	51037	51042	0 %	0 %	50 %	50 %	83591388
1106	NC_007643	TCATC	2	10	51143	51152	20 %	40 %	0 %	40 %	83591388
1107	NC_007643	GTTT	2	8	51218	51225	0 %	75 %	25 %	0 %	83591389
1108	NC_007643	CAG	2	6	51237	51242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591389
1109	NC_007643	GTG	2	6	51262	51267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591389
1110	NC_007643	CGACGG	2	12	51269	51280	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	83591389
1111	NC_007643	TGACC	2	10	51290	51299	20 %	20 %	20 %	40 %	83591389
1112	NC_007643	GGC	2	6	51309	51314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591389
1113	NC_007643	TTCATC	2	12	51325	51336	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	83591389
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1116	NC_007643	ACC	2	6	51424	51429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591389
1117	NC_007643	GCG	2	6	51457	51462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591389
1118	NC_007643	G	6	6	51468	51473	0 %	0 %	100 %	0 %	83591389
1119	NC_007643	CGGG	2	8	51483	51490	0 %	0 %	75 %	25 %	83591389
1120	NC_007643	GCGG	2	8	51502	51509	0 %	0 %	75 %	25 %	83591389
1121	NC_007643	GCGCTC	2	12	51514	51525	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	83591389
1122	NC_007643	G	6	6	51539	51544	0 %	0 %	100 %	0 %	83591389
1123	NC_007643	CGT	2	6	51584	51589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591389
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