MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 chromosome

Total Repeats: 99932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007643	GTGG	2	8	22561	22568	0 %	25 %	75 %	0 %	83591359
502	NC_007643	GTC	2	6	22607	22612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591359
503	NC_007643	GGA	2	6	22675	22680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591359
504	NC_007643	GAC	2	6	22742	22747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591359
505	NC_007643	GTC	2	6	22765	22770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591359
506	NC_007643	CAC	2	6	22787	22792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591359
507	NC_007643	TTC	2	6	22793	22798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83591359
508	NC_007643	TCAG	2	8	22809	22816	25 %	25 %	25 %	25 %	83591359
509	NC_007643	CCG	2	6	22826	22831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591359
510	NC_007643	TGA	2	6	22857	22862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591359
511	NC_007643	CGA	2	6	22900	22905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591359
512	NC_007643	GCCA	2	8	22910	22917	25 %	0 %	25 %	50 %	83591359
513	NC_007643	ACC	2	6	22952	22957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591359
514	NC_007643	GCA	2	6	23068	23073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591359
515	NC_007643	GAG	2	6	23081	23086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591359
516	NC_007643	GCG	2	6	23094	23099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591359
517	NC_007643	GAT	2	6	23158	23163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591359
518	NC_007643	GCC	2	6	23168	23173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591359
519	NC_007643	TGCGC	2	10	23232	23241	0 %	20 %	40 %	40 %	83591359
520	NC_007643	CCA	2	6	23289	23294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591359
521	NC_007643	CTGG	2	8	23305	23312	0 %	25 %	50 %	25 %	83591359
522	NC_007643	CGA	2	6	23353	23358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591359
523	NC_007643	GGC	2	6	23374	23379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591359
524	NC_007643	AAG	2	6	23393	23398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83591359
525	NC_007643	CGG	2	6	23464	23469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591359
526	NC_007643	CGCT	2	8	23498	23505	0 %	25 %	25 %	50 %	83591359
527	NC_007643	CTGG	2	8	23555	23562	0 %	25 %	50 %	25 %	83591359
528	NC_007643	AGA	2	6	23568	23573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83591359
529	NC_007643	CGGCG	2	10	23602	23611	0 %	0 %	60 %	40 %	83591359
530	NC_007643	GTG	2	6	23615	23620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591359
531	NC_007643	CGG	2	6	23629	23634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591359
532	NC_007643	GCG	2	6	23658	23663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591359
533	NC_007643	GCA	2	6	23701	23706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591359
534	NC_007643	CGAC	2	8	23715	23722	25 %	0 %	25 %	50 %	83591359
535	NC_007643	CCG	2	6	23748	23753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591359
536	NC_007643	GCC	2	6	23767	23772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591359
537	NC_007643	CAC	2	6	23809	23814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591359
538	NC_007643	TCGA	2	8	23822	23829	25 %	25 %	25 %	25 %	83591359
539	NC_007643	CCG	3	9	23854	23862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591359
540	NC_007643	GCG	2	6	23958	23963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591359
541	NC_007643	GCG	2	6	23967	23972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591359
542	NC_007643	CGC	2	6	23995	24000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591359
543	NC_007643	CCG	2	6	24060	24065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591359
544	NC_007643	GGGC	2	8	24127	24134	0 %	0 %	75 %	25 %	83591359
545	NC_007643	GAT	2	6	24160	24165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591359
546	NC_007643	CCG	2	6	24209	24214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591359
547	NC_007643	CAC	2	6	24218	24223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591359
548	NC_007643	TCGA	2	8	24233	24240	25 %	25 %	25 %	25 %	83591359
549	NC_007643	CG	3	6	24282	24287	0 %	0 %	50 %	50 %	83591359
550	NC_007643	CGC	2	6	24334	24339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591359
551	NC_007643	TGATCT	2	12	24366	24377	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	83591359
552	NC_007643	GGC	2	6	24389	24394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591359
553	NC_007643	CGG	2	6	24517	24522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591359
554	NC_007643	GTG	2	6	24542	24547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591359
555	NC_007643	CGC	2	6	24550	24555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591359
556	NC_007643	CAC	2	6	24586	24591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591359
557	NC_007643	TGG	2	6	24597	24602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591359
558	NC_007643	CAT	2	6	24613	24618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591359
559	NC_007643	GAC	2	6	24668	24673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591359
560	NC_007643	GC	3	6	24679	24684	0 %	0 %	50 %	50 %	83591359
561	NC_007643	CCG	2	6	24699	24704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591359
562	NC_007643	GGT	2	6	24709	24714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591359
563	NC_007643	GCTC	2	8	24774	24781	0 %	25 %	25 %	50 %	83591359
564	NC_007643	GGT	2	6	24787	24792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591359
565	NC_007643	CAG	2	6	24812	24817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591359
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567	NC_007643	GAT	2	6	24949	24954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591359
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570	NC_007643	TCG	2	6	25221	25226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591359
571	NC_007643	CGG	2	6	25233	25238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591359
572	NC_007643	CAT	2	6	25270	25275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591359
573	NC_007643	CGC	2	6	25318	25323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591359
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578	NC_007643	GC	3	6	25898	25903	0 %	0 %	50 %	50 %	83591360
579	NC_007643	CAG	2	6	26002	26007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591360
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581	NC_007643	CAG	2	6	26272	26277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591360
582	NC_007643	GTG	2	6	26324	26329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591360
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587	NC_007643	CG	3	6	26456	26461	0 %	0 %	50 %	50 %	83591361
588	NC_007643	GC	3	6	26499	26504	0 %	0 %	50 %	50 %	83591361
589	NC_007643	CGG	3	9	26572	26580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591361
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592	NC_007643	CAT	2	6	26694	26699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591361
593	NC_007643	AGC	2	6	26737	26742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591361
594	NC_007643	TCA	2	6	26759	26764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591361
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598	NC_007643	TCCT	2	8	27215	27222	0 %	50 %	0 %	50 %	83591362
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600	NC_007643	GC	3	6	27358	27363	0 %	0 %	50 %	50 %	83591362
601	NC_007643	GCG	2	6	27370	27375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591362
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605	NC_007643	CGGG	2	8	27493	27500	0 %	0 %	75 %	25 %	83591362
606	NC_007643	CCG	2	6	27544	27549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591362
607	NC_007643	GCTG	2	8	27552	27559	0 %	25 %	50 %	25 %	83591362
608	NC_007643	CGG	2	6	27591	27596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591362
609	NC_007643	GCT	2	6	27703	27708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591362
610	NC_007643	C	8	8	27733	27740	0 %	0 %	0 %	100 %	83591362
611	NC_007643	C	6	6	27958	27963	0 %	0 %	0 %	100 %	83591363
612	NC_007643	ATG	2	6	28033	28038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591363
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615	NC_007643	CGC	2	6	28155	28160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591363
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617	NC_007643	GCG	2	6	28188	28193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591363
618	NC_007643	ATC	2	6	28211	28216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591363
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621	NC_007643	GCGGT	2	10	28465	28474	0 %	20 %	60 %	20 %	83591364
622	NC_007643	CGA	2	6	28512	28517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591364
623	NC_007643	CCGG	2	8	28523	28530	0 %	0 %	50 %	50 %	83591364
624	NC_007643	GCC	2	6	28537	28542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591364
625	NC_007643	GCC	3	9	28550	28558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591364
626	NC_007643	GAG	2	6	28610	28615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591364
627	NC_007643	CGG	2	6	28656	28661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591364
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629	NC_007643	TTC	2	6	28736	28741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83591364
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