MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 chromosome

Total Repeats: 99932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_007643	CGGCG	2	10	247743	247752	0 %	0 %	60 %	40 %	83591538
5502	NC_007643	C	6	6	247817	247822	0 %	0 %	0 %	100 %	83591538
5503	NC_007643	CGG	2	6	247865	247870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591538
5504	NC_007643	CGC	2	6	247872	247877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591538
5505	NC_007643	CGC	2	6	247895	247900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591538
5506	NC_007643	GCC	2	6	247930	247935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591538
5507	NC_007643	CTC	2	6	247948	247953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83591538
5508	NC_007643	CTG	2	6	247984	247989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591538
5509	NC_007643	CCG	2	6	247997	248002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591538
5510	NC_007643	CGCC	2	8	248084	248091	0 %	0 %	25 %	75 %	83591538
5511	NC_007643	TTC	2	6	248118	248123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83591538
5512	NC_007643	GC	3	6	248158	248163	0 %	0 %	50 %	50 %	83591539
5513	NC_007643	GT	3	6	248178	248183	0 %	50 %	50 %	0 %	83591539
5514	NC_007643	GTT	2	6	248230	248235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83591539
5515	NC_007643	AAG	2	6	248245	248250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83591539
5516	NC_007643	TCG	2	6	248270	248275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591539
5517	NC_007643	CGGT	2	8	248279	248286	0 %	25 %	50 %	25 %	83591539
5518	NC_007643	ACG	2	6	248476	248481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591540
5519	NC_007643	GGC	2	6	248570	248575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591540
5520	NC_007643	AGC	2	6	248642	248647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591540
5521	NC_007643	CG	3	6	248741	248746	0 %	0 %	50 %	50 %	83591540
5522	NC_007643	GATCG	2	10	248763	248772	20 %	20 %	40 %	20 %	83591540
5523	NC_007643	CAG	2	6	248868	248873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591540
5524	NC_007643	GAG	2	6	248892	248897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591540
5525	NC_007643	ATG	2	6	249022	249027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591540
5526	NC_007643	A	7	7	249092	249098	100 %	0 %	0 %	0 %	83591540
5527	NC_007643	CTG	2	6	249127	249132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591540
5528	NC_007643	GCA	2	6	249135	249140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591540
5529	NC_007643	ACA	2	6	249189	249194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83591540
5530	NC_007643	TACC	2	8	249201	249208	25 %	25 %	0 %	50 %	83591540
5531	NC_007643	ACG	2	6	249265	249270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591540
5532	NC_007643	ATT	2	6	249303	249308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	83591540
5533	NC_007643	CAG	2	6	249337	249342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591540
5534	NC_007643	TCG	2	6	249366	249371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591540
5535	NC_007643	TCA	2	6	249412	249417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591540
5536	NC_007643	AGG	2	6	249505	249510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591540
5537	NC_007643	CG	3	6	249573	249578	0 %	0 %	50 %	50 %	83591540
5538	NC_007643	CGGT	2	8	249582	249589	0 %	25 %	50 %	25 %	83591540
5539	NC_007643	CGA	2	6	249871	249876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591541
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5542	NC_007643	GCCTTG	2	12	249908	249919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591541
5543	NC_007643	GGC	2	6	249943	249948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591541
5544	NC_007643	G	6	6	249949	249954	0 %	0 %	100 %	0 %	83591541
5545	NC_007643	CAG	2	6	249965	249970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591541
5546	NC_007643	CAGC	2	8	249992	249999	25 %	0 %	25 %	50 %	83591541
5547	NC_007643	GCG	2	6	250010	250015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591541
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5551	NC_007643	GGTG	2	8	250207	250214	0 %	25 %	75 %	0 %	83591541
5552	NC_007643	GCCG	2	8	250232	250239	0 %	0 %	50 %	50 %	83591541
5553	NC_007643	GCG	2	6	250308	250313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591541
5554	NC_007643	ACC	2	6	250314	250319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591541
5555	NC_007643	GCC	2	6	250352	250357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591541
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5557	NC_007643	GGC	2	6	250444	250449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591541
5558	NC_007643	CGG	3	9	250524	250532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591541
5559	NC_007643	CAG	2	6	250560	250565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591541
5560	NC_007643	ACG	2	6	250566	250571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591541
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5562	NC_007643	CCG	2	6	250653	250658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591542
5563	NC_007643	GGCG	2	8	250659	250666	0 %	0 %	75 %	25 %	83591542
5564	NC_007643	CGG	2	6	250704	250709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591542
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5594	NC_007643	GCA	2	6	251574	251579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591542
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5599	NC_007643	ATC	2	6	251831	251836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591542
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5605	NC_007643	GTC	2	6	252016	252021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591542
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5613	NC_007643	CGGC	2	8	252327	252334	0 %	0 %	50 %	50 %	83591542
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5616	NC_007643	CGG	2	6	252366	252371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591542
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5995	NC_007643	GC	3	6	267808	267813	0 %	0 %	50 %	50 %	83591555
5996	NC_007643	GGC	2	6	267814	267819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591555
5997	NC_007643	GCT	2	6	267867	267872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591555
5998	NC_007643	CGC	2	6	267885	267890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591555
5999	NC_007643	GCG	2	6	267899	267904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591555
6000	NC_007643	TCA	2	6	267926	267931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591555

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