MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 chromosome

Total Repeats: 99932

< Previous12...678910111213141516...199200Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_007643	GGT	2	6	223726	223731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591525
5002	NC_007643	ATC	2	6	223741	223746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591525
5003	NC_007643	ACC	2	6	223751	223756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591525
5004	NC_007643	GC	3	6	223763	223768	0 %	0 %	50 %	50 %	83591525
5005	NC_007643	ATC	2	6	223810	223815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591525
5006	NC_007643	TTGC	2	8	223897	223904	0 %	50 %	25 %	25 %	83591525
5007	NC_007643	GGCCG	2	10	223932	223941	0 %	0 %	60 %	40 %	83591525
5008	NC_007643	CGTGG	2	10	223951	223960	0 %	20 %	60 %	20 %	83591525
5009	NC_007643	TGG	2	6	224003	224008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591525
5010	NC_007643	GCG	2	6	224024	224029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591525
5011	NC_007643	TCC	2	6	224041	224046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83591526
5012	NC_007643	GTT	2	6	224081	224086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83591526
5013	NC_007643	GAGGC	2	10	224158	224167	20 %	0 %	60 %	20 %	83591526
5014	NC_007643	AGC	2	6	224173	224178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591526
5015	NC_007643	T	6	6	224189	224194	0 %	100 %	0 %	0 %	83591526
5016	NC_007643	CGC	2	6	224229	224234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591526
5017	NC_007643	GCC	2	6	224304	224309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591526
5018	NC_007643	T	6	6	224497	224502	0 %	100 %	0 %	0 %	83591526
5019	NC_007643	GAC	2	6	224532	224537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591526
5020	NC_007643	GATG	2	8	224540	224547	25 %	25 %	50 %	0 %	83591526
5021	NC_007643	AGA	2	6	224564	224569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83591526
5022	NC_007643	TCG	2	6	224599	224604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591526
5023	NC_007643	TTCA	2	8	224622	224629	25 %	50 %	0 %	25 %	83591526
5024	NC_007643	GAT	2	6	224676	224681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591526
5025	NC_007643	TCG	2	6	224683	224688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591526
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5027	NC_007643	CAGGCG	2	12	224709	224720	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	83591526
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5030	NC_007643	GAAG	2	8	224831	224838	50 %	0 %	50 %	0 %	83591526
5031	NC_007643	CCT	2	6	224891	224896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83591526
5032	NC_007643	TTG	2	6	224995	225000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83591526
5033	NC_007643	CTGG	2	8	225018	225025	0 %	25 %	50 %	25 %	83591526
5034	NC_007643	AGTG	2	8	225053	225060	25 %	25 %	50 %	0 %	83591526
5035	NC_007643	TC	3	6	225086	225091	0 %	50 %	0 %	50 %	83591526
5036	NC_007643	GGGA	2	8	225181	225188	25 %	0 %	75 %	0 %	83591526
5037	NC_007643	CGC	2	6	225216	225221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591526
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5039	NC_007643	G	7	7	225285	225291	0 %	0 %	100 %	0 %	83591526
5040	NC_007643	GCG	2	6	225330	225335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591526
5041	NC_007643	CCG	2	6	225464	225469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591526
5042	NC_007643	CGC	3	9	225527	225535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591526
5043	NC_007643	CAGCAA	2	12	225579	225590	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	83591526
5044	NC_007643	GCC	3	9	225591	225599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591526
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5047	NC_007643	CGG	2	6	226373	226378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591527
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5049	NC_007643	AGG	2	6	226470	226475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591527
5050	NC_007643	CCTG	2	8	226479	226486	0 %	25 %	25 %	50 %	83591527
5051	NC_007643	CG	3	6	226560	226565	0 %	0 %	50 %	50 %	83591527
5052	NC_007643	GTAA	2	8	226588	226595	50 %	25 %	25 %	0 %	83591527
5053	NC_007643	GTCC	2	8	227106	227113	0 %	25 %	25 %	50 %	83591528
5054	NC_007643	GAC	2	6	227169	227174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591528
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5058	NC_007643	GCC	2	6	227287	227292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591528
5059	NC_007643	TCG	2	6	227323	227328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591528
5060	NC_007643	CAG	2	6	227352	227357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591528
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5062	NC_007643	GTT	2	6	227378	227383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83591528
5063	NC_007643	GCG	2	6	227479	227484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591528
5064	NC_007643	CCA	2	6	227486	227491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591528
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5071	NC_007643	CGT	2	6	227721	227726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591528
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5090	NC_007643	ACGGC	2	10	228710	228719	20 %	0 %	40 %	40 %	83591528
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5100	NC_007643	TGA	2	6	229039	229044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591529
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5123	NC_007643	GTC	2	6	229919	229924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591529
5124	NC_007643	TCGT	2	8	229927	229934	0 %	50 %	25 %	25 %	83591529
5125	NC_007643	TGA	2	6	229975	229980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591529
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5129	NC_007643	GCCC	2	8	230156	230163	0 %	0 %	25 %	75 %	83591529
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5143	NC_007643	GGTC	2	8	230970	230977	0 %	25 %	50 %	25 %	83591530
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5154	NC_007643	GGT	2	6	231691	231696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591530
5155	NC_007643	CGT	2	6	231705	231710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591530
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5205	NC_007643	TCGC	2	8	234549	234556	0 %	25 %	25 %	50 %	83591532
5206	NC_007643	GGT	2	6	234629	234634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591532
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5222	NC_007643	GTGCT	2	10	235071	235080	0 %	40 %	40 %	20 %	83591532
5223	NC_007643	TGG	2	6	235119	235124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591532
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5229	NC_007643	G	8	8	236007	236014	0 %	0 %	100 %	0 %	83591533
5230	NC_007643	CGC	2	6	236017	236022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591533
5231	NC_007643	CGG	2	6	236077	236082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591533
5232	NC_007643	TCA	2	6	236235	236240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591533
5233	NC_007643	CGGTGC	2	12	236241	236252	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	83591533
5234	NC_007643	GGC	2	6	236305	236310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591533
5235	NC_007643	GCGG	2	8	236320	236327	0 %	0 %	75 %	25 %	83591533
5236	NC_007643	TGGC	2	8	236354	236361	0 %	25 %	50 %	25 %	83591533
5237	NC_007643	CGA	2	6	236365	236370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591533
5238	NC_007643	CG	3	6	236402	236407	0 %	0 %	50 %	50 %	83591533
5239	NC_007643	CG	3	6	236409	236414	0 %	0 %	50 %	50 %	83591533
5240	NC_007643	GGC	2	6	236496	236501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591533
5241	NC_007643	ACC	2	6	236516	236521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591533
5242	NC_007643	GCC	2	6	236572	236577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591533
5243	NC_007643	CAT	2	6	236611	236616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591533
5244	NC_007643	TGGC	2	8	236636	236643	0 %	25 %	50 %	25 %	83591533
5245	NC_007643	GGA	2	6	236644	236649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591533
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5247	NC_007643	GCCG	2	8	236713	236720	0 %	0 %	50 %	50 %	83591533
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5252	NC_007643	CTG	2	6	236938	236943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591533
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5371	NC_007643	CGCC	2	8	242059	242066	0 %	0 %	25 %	75 %	83591535
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5491	NC_007643	CGG	2	6	247488	247493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591538
5492	NC_007643	CGG	2	6	247545	247550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591538
5493	NC_007643	TGG	2	6	247598	247603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591538
5494	NC_007643	GGC	2	6	247605	247610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591538
5495	NC_007643	GCC	2	6	247642	247647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591538
5496	NC_007643	GCG	2	6	247651	247656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591538
5497	NC_007643	GCG	3	9	247687	247695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591538
5498	NC_007643	GGC	2	6	247699	247704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591538
5499	NC_007643	GC	3	6	247703	247708	0 %	0 %	50 %	50 %	83591538
5500	NC_007643	C	6	6	247708	247713	0 %	0 %	0 %	100 %	83591538

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