MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 plasmid unnamed

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007641	ACGATA	2	12	4527	4538	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	83582735
2	NC_007641	CAACGA	2	12	7874	7885	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	83582737
3	NC_007641	AGAGCA	2	12	8995	9006	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	83582737
4	NC_007641	GCCGAT	2	12	10600	10611	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	83582738
5	NC_007641	ATCGGC	2	12	15245	15256	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	83582745
6	NC_007641	GGAAGC	2	12	16683	16694	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	83582747
7	NC_007641	CGTTTC	2	12	17034	17045	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	83582747
8	NC_007641	GGCGTT	2	12	17079	17090	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	83582747
9	NC_007641	TCGGGA	2	12	17972	17983	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	83582748
10	NC_007641	CCGTGC	2	12	19261	19272	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	83582750
11	NC_007641	GGCGCG	2	12	19296	19307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582750
12	NC_007641	ATCGGC	2	12	20058	20069	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	83582750
13	NC_007641	CGATTT	2	12	23131	23142	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	83582754
14	NC_007641	GGGATC	2	12	23702	23713	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	83582754
15	NC_007641	GGGCCT	2	12	26162	26173	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	83582757
16	NC_007641	CCAGGG	2	12	29144	29155	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	83582760
17	NC_007641	AAGGCC	2	12	31428	31439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83582761
18	NC_007641	CGTCGG	2	12	32684	32695	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	83582763
19	NC_007641	GCGCTG	2	12	32907	32918	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	83582763
20	NC_007641	AGCACA	2	12	35512	35523	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	83582767
21	NC_007641	CCCGCA	2	12	35893	35904	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	83582767
22	NC_007641	CGGTGA	2	12	36119	36130	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	83582767
23	NC_007641	TCGGCG	2	12	40411	40422	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	83582769
24	NC_007641	GCCAGC	2	12	40441	40452	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	83582769
25	NC_007641	GTGCTC	2	12	40635	40646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582769
26	NC_007641	CTCCAC	2	12	43111	43122	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	83582772
27	NC_007641	GCCACC	2	12	43802	43813	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	83582773
28	NC_007641	ATCGGC	2	12	44318	44329	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	83582773
29	NC_007641	CGACGG	2	12	47427	47438	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	83582775
30	NC_007641	GTGGCG	2	12	48449	48460	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	83582776
31	NC_007641	GGCTAT	2	12	48629	48640	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	83582776
32	NC_007641	CGTGGC	2	12	49111	49122	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	83582776
33	NC_007641	CTGGCC	2	12	52928	52939	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	83582780

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.