MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 plasmid unnamed

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007641	CCGG	2	8	692	699	0 %	0 %	50 %	50 %	83582731
2	NC_007641	CCCT	2	8	1002	1009	0 %	25 %	0 %	75 %	83582732
3	NC_007641	TGGG	2	8	1033	1040	0 %	25 %	75 %	0 %	83582732
4	NC_007641	TTTC	2	8	1374	1381	0 %	75 %	0 %	25 %	83582733
5	NC_007641	TTGG	2	8	1544	1551	0 %	50 %	50 %	0 %	83582733
6	NC_007641	AGAA	2	8	1552	1559	75 %	0 %	25 %	0 %	83582733
7	NC_007641	TTGG	2	8	1858	1865	0 %	50 %	50 %	0 %	83582733
8	NC_007641	TGGC	2	8	2528	2535	0 %	25 %	50 %	25 %	83582734
9	NC_007641	GATA	2	8	2561	2568	50 %	25 %	25 %	0 %	83582734
10	NC_007641	AGCG	2	8	2724	2731	25 %	0 %	50 %	25 %	83582734
11	NC_007641	CATC	2	8	3271	3278	25 %	25 %	0 %	50 %	83582735
12	NC_007641	CGCT	2	8	3599	3606	0 %	25 %	25 %	50 %	83582735
13	NC_007641	TCCC	2	8	3968	3975	0 %	25 %	0 %	75 %	83582735
14	NC_007641	GAAA	2	8	4066	4073	75 %	0 %	25 %	0 %	83582735
15	NC_007641	GCCT	2	8	4107	4114	0 %	25 %	25 %	50 %	83582735
16	NC_007641	TGAC	2	8	4237	4244	25 %	25 %	25 %	25 %	83582735
17	NC_007641	GCTC	2	8	4575	4582	0 %	25 %	25 %	50 %	83582735
18	NC_007641	CAAG	2	8	5357	5364	50 %	0 %	25 %	25 %	83582736
19	NC_007641	GCCA	2	8	5637	5644	25 %	0 %	25 %	50 %	83582736
20	NC_007641	ATCC	2	8	5739	5746	25 %	25 %	0 %	50 %	83582736
21	NC_007641	GAAA	2	8	6294	6301	75 %	0 %	25 %	0 %	83582737
22	NC_007641	CTTT	2	8	6429	6436	0 %	75 %	0 %	25 %	83582737
23	NC_007641	CTTT	2	8	6623	6630	0 %	75 %	0 %	25 %	83582737
24	NC_007641	ATTT	2	8	6668	6675	25 %	75 %	0 %	0 %	83582737
25	NC_007641	ACCA	2	8	6720	6727	50 %	0 %	0 %	50 %	83582737
26	NC_007641	TGCC	2	8	7514	7521	0 %	25 %	25 %	50 %	83582737
27	NC_007641	AAGC	2	8	7552	7559	50 %	0 %	25 %	25 %	83582737
28	NC_007641	GCTC	2	8	7688	7695	0 %	25 %	25 %	50 %	83582737
29	NC_007641	CCCG	2	8	7699	7706	0 %	0 %	25 %	75 %	83582737
30	NC_007641	AGGC	2	8	7932	7939	25 %	0 %	50 %	25 %	83582737
31	NC_007641	AGGA	2	8	7974	7981	50 %	0 %	50 %	0 %	83582737
32	NC_007641	GCTG	2	8	8206	8213	0 %	25 %	50 %	25 %	83582737
33	NC_007641	CGAA	2	8	8316	8323	50 %	0 %	25 %	25 %	83582737
34	NC_007641	GGAC	2	8	8840	8847	25 %	0 %	50 %	25 %	83582737
35	NC_007641	CCGC	2	8	11001	11008	0 %	0 %	25 %	75 %	83582739
36	NC_007641	CCGC	2	8	11512	11519	0 %	0 %	25 %	75 %	83582739
37	NC_007641	CCGG	2	8	12731	12738	0 %	0 %	50 %	50 %	83582740
38	NC_007641	CTTG	2	8	12787	12794	0 %	50 %	25 %	25 %	83582740
39	NC_007641	GACC	2	8	12827	12834	25 %	0 %	25 %	50 %	83582740
40	NC_007641	CCGC	2	8	12916	12923	0 %	0 %	25 %	75 %	83582740
41	NC_007641	GTCA	2	8	13048	13055	25 %	25 %	25 %	25 %	83582741
42	NC_007641	GGCA	2	8	13088	13095	25 %	0 %	50 %	25 %	83582741
43	NC_007641	TCGG	2	8	13586	13593	0 %	25 %	50 %	25 %	83582742
44	NC_007641	GGGC	2	8	14335	14342	0 %	0 %	75 %	25 %	83582744
45	NC_007641	GCGG	2	8	14848	14855	0 %	0 %	75 %	25 %	83582744
46	NC_007641	ATCG	2	8	15534	15541	25 %	25 %	25 %	25 %	83582746
47	NC_007641	ATCC	2	8	15882	15889	25 %	25 %	0 %	50 %	83582746
48	NC_007641	TGGA	2	8	16031	16038	25 %	25 %	50 %	0 %	83582746
49	NC_007641	TGCA	2	8	16075	16082	25 %	25 %	25 %	25 %	83582746
50	NC_007641	GCCG	2	8	16615	16622	0 %	0 %	50 %	50 %	83582747
51	NC_007641	TGCG	2	8	17317	17324	0 %	25 %	50 %	25 %	83582747
52	NC_007641	TCCC	2	8	17451	17458	0 %	25 %	0 %	75 %	83582748
53	NC_007641	CGGC	2	8	17481	17488	0 %	0 %	50 %	50 %	83582748
54	NC_007641	GCTG	2	8	17951	17958	0 %	25 %	50 %	25 %	83582748
55	NC_007641	CGGT	2	8	18317	18324	0 %	25 %	50 %	25 %	83582749
56	NC_007641	GCCC	2	8	18416	18423	0 %	0 %	25 %	75 %	83582749
57	NC_007641	GCGA	2	8	18652	18659	25 %	0 %	50 %	25 %	83582749
58	NC_007641	GGAC	2	8	18707	18714	25 %	0 %	50 %	25 %	83582749
59	NC_007641	CCCG	2	8	18981	18988	0 %	0 %	25 %	75 %	83582750
60	NC_007641	CCGG	2	8	19161	19168	0 %	0 %	50 %	50 %	83582750
61	NC_007641	GGCC	2	8	19277	19284	0 %	0 %	50 %	50 %	83582750
62	NC_007641	TGGC	2	8	19518	19525	0 %	25 %	50 %	25 %	83582750
63	NC_007641	CAGG	2	8	20127	20134	25 %	0 %	50 %	25 %	83582750
64	NC_007641	CGGT	2	8	20271	20278	0 %	25 %	50 %	25 %	83582750
65	NC_007641	CACC	2	8	21266	21273	25 %	0 %	0 %	75 %	83582751
66	NC_007641	GTCG	2	8	21510	21517	0 %	25 %	50 %	25 %	83582752
67	NC_007641	CATC	2	8	22313	22320	25 %	25 %	0 %	50 %	83582753
68	NC_007641	GCCC	2	8	22823	22830	0 %	0 %	25 %	75 %	83582754
69	NC_007641	CAGG	2	8	22888	22895	25 %	0 %	50 %	25 %	83582754
70	NC_007641	TAAA	2	8	23028	23035	75 %	25 %	0 %	0 %	83582754
71	NC_007641	GTGG	2	8	23264	23271	0 %	25 %	75 %	0 %	83582754
72	NC_007641	CAAG	2	8	23282	23289	50 %	0 %	25 %	25 %	83582754
73	NC_007641	TTGC	2	8	23309	23316	0 %	50 %	25 %	25 %	83582754
74	NC_007641	CGCC	2	8	23396	23403	0 %	0 %	25 %	75 %	83582754
75	NC_007641	GAGG	2	8	23718	23725	25 %	0 %	75 %	0 %	83582754
76	NC_007641	TTGG	2	8	24563	24570	0 %	50 %	50 %	0 %	83582756
77	NC_007641	CCTT	2	8	24609	24616	0 %	50 %	0 %	50 %	83582756
78	NC_007641	AAAC	2	8	25001	25008	75 %	0 %	0 %	25 %	83582756
79	NC_007641	TTGG	2	8	25072	25079	0 %	50 %	50 %	0 %	83582756
80	NC_007641	CGGG	2	8	25088	25095	0 %	0 %	75 %	25 %	83582756
81	NC_007641	CCGC	2	8	25194	25201	0 %	0 %	25 %	75 %	83582756
82	NC_007641	CGTT	2	8	25591	25598	0 %	50 %	25 %	25 %	83582757
83	NC_007641	GGCA	2	8	26502	26509	25 %	0 %	50 %	25 %	83582758
84	NC_007641	GGGC	2	8	27925	27932	0 %	0 %	75 %	25 %	83582759
85	NC_007641	AGCC	2	8	27974	27981	25 %	0 %	25 %	50 %	83582759
86	NC_007641	GAAG	2	8	29625	29632	50 %	0 %	50 %	0 %	83582760
87	NC_007641	GGTC	2	8	30970	30977	0 %	25 %	50 %	25 %	83582761
88	NC_007641	GGCG	2	8	31741	31748	0 %	0 %	75 %	25 %	83582761
89	NC_007641	TCCG	2	8	31973	31980	0 %	25 %	25 %	50 %	83582761
90	NC_007641	CGGC	2	8	32327	32334	0 %	0 %	50 %	50 %	83582762
91	NC_007641	CGGC	2	8	32511	32518	0 %	0 %	50 %	50 %	83582763
92	NC_007641	TGGT	2	8	33010	33017	0 %	50 %	50 %	0 %	83582763
93	NC_007641	CCAG	2	8	33068	33075	25 %	0 %	25 %	50 %	83582763
94	NC_007641	CGGC	2	8	33341	33348	0 %	0 %	50 %	50 %	83582764
95	NC_007641	GCGG	2	8	34009	34016	0 %	0 %	75 %	25 %	83582766
96	NC_007641	GGCC	2	8	34392	34399	0 %	0 %	50 %	50 %	83582766
97	NC_007641	GGCG	2	8	35055	35062	0 %	0 %	75 %	25 %	83582766
98	NC_007641	CTGG	2	8	35397	35404	0 %	25 %	50 %	25 %	83582767
99	NC_007641	GATC	2	8	35876	35883	25 %	25 %	25 %	25 %	83582767
100	NC_007641	AAGC	2	8	36740	36747	50 %	0 %	25 %	25 %	83582767
101	NC_007641	ATCG	2	8	36999	37006	25 %	25 %	25 %	25 %	83582767
102	NC_007641	GTCG	2	8	37125	37132	0 %	25 %	50 %	25 %	83582767
103	NC_007641	TCGA	2	8	37309	37316	25 %	25 %	25 %	25 %	83582767
104	NC_007641	CCGG	2	8	38665	38672	0 %	0 %	50 %	50 %	83582768
105	NC_007641	CGCC	2	8	38835	38842	0 %	0 %	25 %	75 %	83582768
106	NC_007641	GAGC	2	8	39689	39696	25 %	0 %	50 %	25 %	83582769
107	NC_007641	GCGG	2	8	40568	40575	0 %	0 %	75 %	25 %	83582769
108	NC_007641	GGGC	2	8	40649	40656	0 %	0 %	75 %	25 %	83582769
109	NC_007641	GCCA	2	8	40719	40726	25 %	0 %	25 %	50 %	83582769
110	NC_007641	GGGC	2	8	40990	40997	0 %	0 %	75 %	25 %	83582770
111	NC_007641	AAGG	2	8	41154	41161	50 %	0 %	50 %	0 %	83582770
112	NC_007641	TCGA	2	8	41403	41410	25 %	25 %	25 %	25 %	83582770
113	NC_007641	GCAG	2	8	41813	41820	25 %	0 %	50 %	25 %	83582770
114	NC_007641	GTTG	2	8	42463	42470	0 %	50 %	50 %	0 %	83582771
115	NC_007641	GATC	2	8	42692	42699	25 %	25 %	25 %	25 %	83582771
116	NC_007641	GATC	2	8	43041	43048	25 %	25 %	25 %	25 %	83582772
117	NC_007641	AGCC	2	8	43060	43067	25 %	0 %	25 %	50 %	83582772
118	NC_007641	GACG	2	8	43260	43267	25 %	0 %	50 %	25 %	83582772
119	NC_007641	TCCT	2	8	43363	43370	0 %	50 %	0 %	50 %	83582772
120	NC_007641	CCAG	2	8	43455	43462	25 %	0 %	25 %	50 %	83582772
121	NC_007641	CGGC	2	8	43857	43864	0 %	0 %	50 %	50 %	83582773
122	NC_007641	ACGG	2	8	44267	44274	25 %	0 %	50 %	25 %	83582773
123	NC_007641	GGGC	2	8	45349	45356	0 %	0 %	75 %	25 %	83582774
124	NC_007641	GCTG	2	8	45598	45605	0 %	25 %	50 %	25 %	83582774
125	NC_007641	ACCG	2	8	46034	46041	25 %	0 %	25 %	50 %	83582774
126	NC_007641	GCCG	2	8	46140	46147	0 %	0 %	50 %	50 %	83582774
127	NC_007641	TTTC	2	8	46616	46623	0 %	75 %	0 %	25 %	83582774
128	NC_007641	CCAT	2	8	46729	46736	25 %	25 %	0 %	50 %	83582775
129	NC_007641	AGCC	2	8	47559	47566	25 %	0 %	25 %	50 %	83582775
130	NC_007641	GACC	2	8	48018	48025	25 %	0 %	25 %	50 %	83582775
131	NC_007641	GACG	2	8	49150	49157	25 %	0 %	50 %	25 %	83582776
132	NC_007641	TGAT	2	8	49170	49177	25 %	50 %	25 %	0 %	83582776
133	NC_007641	ATCG	2	8	49289	49296	25 %	25 %	25 %	25 %	83582776
134	NC_007641	CGGC	2	8	50457	50464	0 %	0 %	50 %	50 %	83582777
135	NC_007641	AATA	2	8	50750	50757	75 %	25 %	0 %	0 %	83582778
136	NC_007641	CCGG	2	8	52717	52724	0 %	0 %	50 %	50 %	83582780
137	NC_007641	CGAG	2	8	53164	53171	25 %	0 %	50 %	25 %	83582780
138	NC_007641	GGTT	2	8	53284	53291	0 %	50 %	50 %	0 %	83582780
139	NC_007641	ATCG	2	8	53312	53319	25 %	25 %	25 %	25 %	83582780

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.