MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 plasmid unnamed

Total Repeats: 718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007641	ACC	2	6	296	301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83582731
2	NC_007641	TGC	2	6	348	353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582731
3	NC_007641	CAG	2	6	464	469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83582731
4	NC_007641	ATC	2	6	503	508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83582731
5	NC_007641	GCG	2	6	605	610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582731
6	NC_007641	GCC	2	6	621	626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582731
7	NC_007641	CGC	2	6	715	720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582731
8	NC_007641	GCT	2	6	724	729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582731
9	NC_007641	CGC	2	6	793	798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582731
10	NC_007641	GGC	2	6	799	804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582731
11	NC_007641	GCG	2	6	855	860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582731
12	NC_007641	GAG	2	6	1175	1180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83582732
13	NC_007641	GCC	2	6	1192	1197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582732
14	NC_007641	TTC	3	9	1315	1323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83582733
15	NC_007641	ATG	2	6	1333	1338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83582733
16	NC_007641	CTT	2	6	1581	1586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83582733
17	NC_007641	TGG	2	6	1618	1623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83582733
18	NC_007641	CGA	2	6	1628	1633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83582733
19	NC_007641	CGT	2	6	1784	1789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582733
20	NC_007641	ACC	2	6	1812	1817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83582733
21	NC_007641	AGG	2	6	1934	1939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83582733
22	NC_007641	GGA	2	6	2012	2017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83582733
23	NC_007641	TTA	2	6	2031	2036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	83582733
24	NC_007641	CAT	2	6	2054	2059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83582733
25	NC_007641	GGC	2	6	2120	2125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582733
26	NC_007641	ACC	2	6	2205	2210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83582733
27	NC_007641	GAA	2	6	2211	2216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83582733
28	NC_007641	GAA	2	6	2295	2300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83582733
29	NC_007641	TTC	2	6	2423	2428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83582734
30	NC_007641	GAA	2	6	2591	2596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83582734
31	NC_007641	CCT	2	6	2660	2665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83582734
32	NC_007641	TTC	2	6	2736	2741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83582734
33	NC_007641	CGT	2	6	2745	2750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582734
34	NC_007641	AGA	2	6	2794	2799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83582734
35	NC_007641	AGG	2	6	2829	2834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83582734
36	NC_007641	CTC	3	9	2874	2882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83582734
37	NC_007641	ATG	2	6	2904	2909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83582734
38	NC_007641	AAG	2	6	3090	3095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83582735
39	NC_007641	TCT	2	6	3209	3214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83582735
40	NC_007641	GTC	2	6	3236	3241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582735
41	NC_007641	TCG	2	6	3250	3255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582735
42	NC_007641	CCT	2	6	3374	3379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83582735
43	NC_007641	TCC	2	6	3455	3460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83582735
44	NC_007641	ACG	2	6	3488	3493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83582735
45	NC_007641	CAT	2	6	3524	3529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83582735
46	NC_007641	CGG	2	6	3547	3552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582735
47	NC_007641	GAC	2	6	3618	3623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83582735
48	NC_007641	CAA	2	6	3744	3749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83582735
49	NC_007641	CGA	2	6	3767	3772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83582735
50	NC_007641	ACG	2	6	3783	3788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83582735
51	NC_007641	AAG	2	6	3893	3898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83582735
52	NC_007641	TAA	2	6	3908	3913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	83582735
53	NC_007641	CGT	2	6	4092	4097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582735
54	NC_007641	AGA	2	6	4140	4145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83582735
55	NC_007641	TGA	2	6	4151	4156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83582735
56	NC_007641	ACG	2	6	4176	4181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83582735
57	NC_007641	GGC	2	6	4256	4261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582735
58	NC_007641	GTT	2	6	4283	4288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83582735
59	NC_007641	AGC	2	6	4311	4316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83582735
60	NC_007641	TTC	2	6	4476	4481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83582735
61	NC_007641	AGA	2	6	4699	4704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83582735
62	NC_007641	GAT	2	6	4705	4710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83582735
63	NC_007641	GCC	2	6	4760	4765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582735
64	NC_007641	CAT	2	6	4793	4798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83582735
65	NC_007641	TCG	2	6	4949	4954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582735
66	NC_007641	TTG	2	6	4966	4971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83582735
67	NC_007641	TGC	2	6	5026	5031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582735
68	NC_007641	ATG	2	6	5074	5079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83582735
69	NC_007641	AAC	2	6	5160	5165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83582735
70	NC_007641	ATC	2	6	5304	5309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83582736
71	NC_007641	ATG	2	6	5526	5531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83582736
72	NC_007641	CGC	2	6	5667	5672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582736
73	NC_007641	CTG	2	6	5676	5681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582736
74	NC_007641	GCC	2	6	5871	5876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582736
75	NC_007641	CTT	2	6	5898	5903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83582736
76	NC_007641	ATC	2	6	5952	5957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83582736
77	NC_007641	ATC	2	6	5973	5978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83582736
78	NC_007641	GAC	2	6	6066	6071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83582736
79	NC_007641	AGG	2	6	6108	6113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83582736
80	NC_007641	GGC	2	6	6114	6119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582736
81	NC_007641	CCG	2	6	6147	6152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582736
82	NC_007641	TCA	2	6	6215	6220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83582736
83	NC_007641	AGC	2	6	6328	6333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83582737
84	NC_007641	GCA	2	6	6347	6352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83582737
85	NC_007641	TCC	2	6	6388	6393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83582737
86	NC_007641	TTC	2	6	6558	6563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83582737
87	NC_007641	TTC	2	6	6831	6836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83582737
88	NC_007641	AAG	2	6	6850	6855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83582737
89	NC_007641	TCA	2	6	6868	6873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83582737
90	NC_007641	ATA	2	6	6948	6953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	83582737
91	NC_007641	CCT	2	6	7143	7148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83582737
92	NC_007641	CGT	2	6	7227	7232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582737
93	NC_007641	TTC	2	6	7233	7238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83582737
94	NC_007641	GTC	2	6	7434	7439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582737
95	NC_007641	CGT	2	6	7470	7475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582737
96	NC_007641	AGA	2	6	7630	7635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83582737
97	NC_007641	GAT	2	6	8009	8014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83582737
98	NC_007641	ATG	2	6	8058	8063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83582737
99	NC_007641	ACA	2	6	8134	8139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83582737
100	NC_007641	TCT	2	6	8332	8337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83582737
101	NC_007641	GGA	3	9	8426	8434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83582737
102	NC_007641	AAC	2	6	8436	8441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83582737
103	NC_007641	GAC	2	6	8480	8485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83582737
104	NC_007641	CCT	2	6	8510	8515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83582737
105	NC_007641	CGG	2	6	8578	8583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582737
106	NC_007641	TCA	2	6	8707	8712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83582737
107	NC_007641	AAG	2	6	8713	8718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83582737
108	NC_007641	CAA	2	6	8780	8785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83582737
109	NC_007641	CTC	2	6	8859	8864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83582737
110	NC_007641	CCG	2	6	8938	8943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582737
111	NC_007641	GAT	2	6	9104	9109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83582737
112	NC_007641	TGG	2	6	9122	9127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83582737
113	NC_007641	CGG	2	6	9233	9238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582737
114	NC_007641	AGA	2	6	9490	9495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83582737
115	NC_007641	ATA	2	6	9615	9620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	83582737
116	NC_007641	CGC	2	6	9820	9825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582737
117	NC_007641	CGA	2	6	10550	10555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83582738
118	NC_007641	GCT	2	6	10584	10589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582738
119	NC_007641	CTG	2	6	10612	10617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582738
120	NC_007641	GAT	2	6	10623	10628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83582738
121	NC_007641	CGC	2	6	10635	10640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582738
122	NC_007641	CGG	2	6	10853	10858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582739
123	NC_007641	CGA	2	6	10902	10907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83582739
124	NC_007641	ATC	2	6	11092	11097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83582739
125	NC_007641	CCG	2	6	11114	11119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582739
126	NC_007641	GCG	2	6	11213	11218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582739
127	NC_007641	TGG	2	6	11225	11230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83582739
128	NC_007641	GCC	2	6	11257	11262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582739
129	NC_007641	CGT	2	6	11352	11357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582739
130	NC_007641	GCC	2	6	11401	11406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582739
131	NC_007641	GCC	2	6	11614	11619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582739
132	NC_007641	TCC	2	6	11642	11647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83582739
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