MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid D

Total Repeats: 196

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007490	GT	3	6	196	201	0 %	50 %	50 %	0 %	552530954
2	NC_007490	CG	3	6	707	712	0 %	0 %	50 %	50 %	552530954
3	NC_007490	GC	3	6	3247	3252	0 %	0 %	50 %	50 %	77404778
4	NC_007490	CG	3	6	4081	4086	0 %	0 %	50 %	50 %	552530955
5	NC_007490	GC	3	6	4918	4923	0 %	0 %	50 %	50 %	552530957
6	NC_007490	AG	3	6	5935	5940	50 %	0 %	50 %	0 %	552530959
7	NC_007490	GC	3	6	7456	7461	0 %	0 %	50 %	50 %	77404779
8	NC_007490	GC	3	6	7488	7493	0 %	0 %	50 %	50 %	77404779
9	NC_007490	GC	4	8	7551	7558	0 %	0 %	50 %	50 %	77404779
10	NC_007490	GC	3	6	8030	8035	0 %	0 %	50 %	50 %	552530961
11	NC_007490	CA	3	6	8057	8062	50 %	0 %	0 %	50 %	552530961
12	NC_007490	GC	3	6	8205	8210	0 %	0 %	50 %	50 %	77404780
13	NC_007490	CG	3	6	8293	8298	0 %	0 %	50 %	50 %	77404780
14	NC_007490	GC	3	6	8302	8307	0 %	0 %	50 %	50 %	77404780
15	NC_007490	GC	3	6	8351	8356	0 %	0 %	50 %	50 %	77404780
16	NC_007490	GC	3	6	8414	8419	0 %	0 %	50 %	50 %	77404780
17	NC_007490	GC	3	6	8781	8786	0 %	0 %	50 %	50 %	552530962
18	NC_007490	GC	3	6	9632	9637	0 %	0 %	50 %	50 %	77404782
19	NC_007490	CG	3	6	10423	10428	0 %	0 %	50 %	50 %	77404782
20	NC_007490	GC	4	8	10869	10876	0 %	0 %	50 %	50 %	77404782
21	NC_007490	CG	3	6	11314	11319	0 %	0 %	50 %	50 %	77404783
22	NC_007490	CG	3	6	11734	11739	0 %	0 %	50 %	50 %	77404784
23	NC_007490	CG	3	6	11845	11850	0 %	0 %	50 %	50 %	77404784
24	NC_007490	GA	3	6	11923	11928	50 %	0 %	50 %	0 %	77404784
25	NC_007490	CG	3	6	13757	13762	0 %	0 %	50 %	50 %	77404787
26	NC_007490	AG	3	6	13850	13855	50 %	0 %	50 %	0 %	77404787
27	NC_007490	CG	3	6	13995	14000	0 %	0 %	50 %	50 %	77404787
28	NC_007490	CG	3	6	14188	14193	0 %	0 %	50 %	50 %	77404787
29	NC_007490	CG	3	6	14542	14547	0 %	0 %	50 %	50 %	77404787
30	NC_007490	GT	3	6	16633	16638	0 %	50 %	50 %	0 %	77404790
31	NC_007490	CG	3	6	16652	16657	0 %	0 %	50 %	50 %	77404790
32	NC_007490	GC	3	6	17226	17231	0 %	0 %	50 %	50 %	77404790
33	NC_007490	TC	3	6	17696	17701	0 %	50 %	0 %	50 %	552530964
34	NC_007490	AC	3	6	17944	17949	50 %	0 %	0 %	50 %	552530964
35	NC_007490	AG	3	6	18512	18517	50 %	0 %	50 %	0 %	552530964
36	NC_007490	GA	3	6	18565	18570	50 %	0 %	50 %	0 %	552530964
37	NC_007490	AC	3	6	19155	19160	50 %	0 %	0 %	50 %	77404792
38	NC_007490	GC	3	6	19256	19261	0 %	0 %	50 %	50 %	77404792
39	NC_007490	GC	3	6	19465	19470	0 %	0 %	50 %	50 %	77404792
40	NC_007490	AC	3	6	19826	19831	50 %	0 %	0 %	50 %	77404793
41	NC_007490	CT	3	6	20026	20031	0 %	50 %	0 %	50 %	77404793
42	NC_007490	GC	3	6	20342	20347	0 %	0 %	50 %	50 %	77404794
43	NC_007490	CG	3	6	20364	20369	0 %	0 %	50 %	50 %	77404794
44	NC_007490	GC	3	6	20859	20864	0 %	0 %	50 %	50 %	77404794
45	NC_007490	TG	3	6	20914	20919	0 %	50 %	50 %	0 %	77404794
46	NC_007490	CG	3	6	21079	21084	0 %	0 %	50 %	50 %	77404794
47	NC_007490	TC	3	6	21443	21448	0 %	50 %	0 %	50 %	77404794
48	NC_007490	GC	3	6	22182	22187	0 %	0 %	50 %	50 %	77404795
49	NC_007490	CG	4	8	22333	22340	0 %	0 %	50 %	50 %	77404796
50	NC_007490	GC	3	6	22455	22460	0 %	0 %	50 %	50 %	77404796
51	NC_007490	CG	3	6	22470	22475	0 %	0 %	50 %	50 %	77404796
52	NC_007490	GC	3	6	23290	23295	0 %	0 %	50 %	50 %	77404796
53	NC_007490	GC	3	6	23450	23455	0 %	0 %	50 %	50 %	77404796
54	NC_007490	GC	3	6	23558	23563	0 %	0 %	50 %	50 %	77404796
55	NC_007490	GC	3	6	23600	23605	0 %	0 %	50 %	50 %	77404796
56	NC_007490	CG	4	8	24029	24036	0 %	0 %	50 %	50 %	77404796
57	NC_007490	CG	3	6	24802	24807	0 %	0 %	50 %	50 %	77404797
58	NC_007490	CG	3	6	25358	25363	0 %	0 %	50 %	50 %	77404797
59	NC_007490	GC	3	6	25833	25838	0 %	0 %	50 %	50 %	77404797
60	NC_007490	GC	3	6	26575	26580	0 %	0 %	50 %	50 %	77404799
61	NC_007490	GC	4	8	28747	28754	0 %	0 %	50 %	50 %	77404800
62	NC_007490	GC	3	6	29412	29417	0 %	0 %	50 %	50 %	552530965
63	NC_007490	CG	3	6	29513	29518	0 %	0 %	50 %	50 %	552530965
64	NC_007490	CG	3	6	30309	30314	0 %	0 %	50 %	50 %	552530966
65	NC_007490	CG	3	6	30921	30926	0 %	0 %	50 %	50 %	552530966
66	NC_007490	GC	3	6	30931	30936	0 %	0 %	50 %	50 %	552530966
67	NC_007490	GC	3	6	34693	34698	0 %	0 %	50 %	50 %	77404805
68	NC_007490	GC	3	6	34999	35004	0 %	0 %	50 %	50 %	77404805
69	NC_007490	GC	4	8	35211	35218	0 %	0 %	50 %	50 %	77404805
70	NC_007490	GT	3	6	35812	35817	0 %	50 %	50 %	0 %	77404805
71	NC_007490	GC	3	6	36147	36152	0 %	0 %	50 %	50 %	77404806
72	NC_007490	GC	3	6	36548	36553	0 %	0 %	50 %	50 %	77404806
73	NC_007490	GC	3	6	36599	36604	0 %	0 %	50 %	50 %	77404806
74	NC_007490	CG	3	6	36775	36780	0 %	0 %	50 %	50 %	77404806
75	NC_007490	CG	3	6	36879	36884	0 %	0 %	50 %	50 %	77404806
76	NC_007490	GC	3	6	38800	38805	0 %	0 %	50 %	50 %	77404809
77	NC_007490	CG	3	6	39496	39501	0 %	0 %	50 %	50 %	77404810
78	NC_007490	GC	3	6	39535	39540	0 %	0 %	50 %	50 %	77404810
79	NC_007490	GC	3	6	39762	39767	0 %	0 %	50 %	50 %	77404810
80	NC_007490	CG	3	6	41437	41442	0 %	0 %	50 %	50 %	77404812
81	NC_007490	CG	5	10	41944	41953	0 %	0 %	50 %	50 %	77404812
82	NC_007490	CG	3	6	42723	42728	0 %	0 %	50 %	50 %	77404812
83	NC_007490	GC	4	8	42798	42805	0 %	0 %	50 %	50 %	77404812
84	NC_007490	CG	3	6	42859	42864	0 %	0 %	50 %	50 %	77404812
85	NC_007490	AG	3	6	43450	43455	50 %	0 %	50 %	0 %	77404812
86	NC_007490	CG	3	6	43583	43588	0 %	0 %	50 %	50 %	77404812
87	NC_007490	CG	3	6	44039	44044	0 %	0 %	50 %	50 %	77404812
88	NC_007490	GC	3	6	45543	45548	0 %	0 %	50 %	50 %	77404814
89	NC_007490	GC	3	6	46137	46142	0 %	0 %	50 %	50 %	77404814
90	NC_007490	GC	3	6	48253	48258	0 %	0 %	50 %	50 %	77404817
91	NC_007490	GA	3	6	49147	49152	50 %	0 %	50 %	0 %	77404817
92	NC_007490	GC	3	6	49683	49688	0 %	0 %	50 %	50 %	552530967
93	NC_007490	GC	3	6	49789	49794	0 %	0 %	50 %	50 %	552530967
94	NC_007490	GC	3	6	50053	50058	0 %	0 %	50 %	50 %	77404818
95	NC_007490	GC	3	6	50091	50096	0 %	0 %	50 %	50 %	77404818
96	NC_007490	GC	4	8	50340	50347	0 %	0 %	50 %	50 %	77404818
97	NC_007490	GC	3	6	50781	50786	0 %	0 %	50 %	50 %	77404819
98	NC_007490	CG	5	10	51039	51048	0 %	0 %	50 %	50 %	77404819
99	NC_007490	CG	3	6	52357	52362	0 %	0 %	50 %	50 %	77404821
100	NC_007490	GC	3	6	52817	52822	0 %	0 %	50 %	50 %	77404821
101	NC_007490	CG	3	6	53194	53199	0 %	0 %	50 %	50 %	77404822
102	NC_007490	CG	3	6	53354	53359	0 %	0 %	50 %	50 %	77404822
103	NC_007490	GC	3	6	53406	53411	0 %	0 %	50 %	50 %	77404823
104	NC_007490	GC	3	6	53452	53457	0 %	0 %	50 %	50 %	77404823
105	NC_007490	GC	3	6	53547	53552	0 %	0 %	50 %	50 %	77404823
106	NC_007490	GC	4	8	55091	55098	0 %	0 %	50 %	50 %	77404824
107	NC_007490	CT	3	6	55128	55133	0 %	50 %	0 %	50 %	77404824
108	NC_007490	CG	4	8	55212	55219	0 %	0 %	50 %	50 %	77404824
109	NC_007490	CG	3	6	55249	55254	0 %	0 %	50 %	50 %	77404824
110	NC_007490	GC	3	6	55319	55324	0 %	0 %	50 %	50 %	77404824
111	NC_007490	GC	3	6	55689	55694	0 %	0 %	50 %	50 %	77404824
112	NC_007490	GC	3	6	56057	56062	0 %	0 %	50 %	50 %	77404824
113	NC_007490	CG	3	6	56071	56076	0 %	0 %	50 %	50 %	77404824
114	NC_007490	GC	3	6	56092	56097	0 %	0 %	50 %	50 %	77404824
115	NC_007490	GC	5	10	57411	57420	0 %	0 %	50 %	50 %	77404826
116	NC_007490	CT	3	6	58333	58338	0 %	50 %	0 %	50 %	77404827
117	NC_007490	GC	3	6	58383	58388	0 %	0 %	50 %	50 %	77404827
118	NC_007490	GC	3	6	58795	58800	0 %	0 %	50 %	50 %	77404827
119	NC_007490	GC	3	6	60133	60138	0 %	0 %	50 %	50 %	77404829
120	NC_007490	CG	3	6	60260	60265	0 %	0 %	50 %	50 %	77404829
121	NC_007490	GC	3	6	60322	60327	0 %	0 %	50 %	50 %	77404829
122	NC_007490	CG	3	6	60685	60690	0 %	0 %	50 %	50 %	77404829
123	NC_007490	GC	4	8	60736	60743	0 %	0 %	50 %	50 %	77404829
124	NC_007490	CA	4	8	64142	64149	50 %	0 %	0 %	50 %	77404832
125	NC_007490	GC	3	6	64742	64747	0 %	0 %	50 %	50 %	77404832
126	NC_007490	AC	3	6	64753	64758	50 %	0 %	0 %	50 %	77404832
127	NC_007490	GC	3	6	64940	64945	0 %	0 %	50 %	50 %	77404832
128	NC_007490	CG	3	6	65855	65860	0 %	0 %	50 %	50 %	552530968
129	NC_007490	GC	3	6	65941	65946	0 %	0 %	50 %	50 %	552530968
130	NC_007490	GC	3	6	67958	67963	0 %	0 %	50 %	50 %	77404835
131	NC_007490	GC	3	6	67965	67970	0 %	0 %	50 %	50 %	77404835
132	NC_007490	GT	3	6	68075	68080	0 %	50 %	50 %	0 %	77404835
133	NC_007490	AT	3	6	68118	68123	50 %	50 %	0 %	0 %	77404835
134	NC_007490	GC	3	6	69041	69046	0 %	0 %	50 %	50 %	77404836
135	NC_007490	GC	3	6	69561	69566	0 %	0 %	50 %	50 %	77404837
136	NC_007490	TC	3	6	70024	70029	0 %	50 %	0 %	50 %	77404837
137	NC_007490	GC	3	6	70360	70365	0 %	0 %	50 %	50 %	77404837
138	NC_007490	CG	3	6	70738	70743	0 %	0 %	50 %	50 %	77404838
139	NC_007490	CG	3	6	71614	71619	0 %	0 %	50 %	50 %	77404839
140	NC_007490	GC	3	6	71925	71930	0 %	0 %	50 %	50 %	77404839
141	NC_007490	CG	3	6	72456	72461	0 %	0 %	50 %	50 %	77404839
142	NC_007490	CG	3	6	72526	72531	0 %	0 %	50 %	50 %	77404839
143	NC_007490	GC	3	6	72921	72926	0 %	0 %	50 %	50 %	77404839
144	NC_007490	TC	3	6	73114	73119	0 %	50 %	0 %	50 %	77404839
145	NC_007490	CG	3	6	73389	73394	0 %	0 %	50 %	50 %	77404840
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.