MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid D

Total Repeats: 1801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007490	CGC	2	6	35307	35312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404805
502	NC_007490	TTC	2	6	35348	35353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77404805
503	NC_007490	CGG	2	6	35397	35402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404805
504	NC_007490	GCG	2	6	35407	35412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404805
505	NC_007490	CCA	2	6	35506	35511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404805
506	NC_007490	TTG	2	6	35574	35579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77404805
507	NC_007490	CAT	2	6	35617	35622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404805
508	NC_007490	AAG	2	6	35636	35641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77404805
509	NC_007490	AGC	2	6	35741	35746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404805
510	NC_007490	GCT	2	6	35755	35760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404805
511	NC_007490	GAGC	2	8	35776	35783	25 %	0 %	50 %	25 %	77404805
512	NC_007490	GT	3	6	35812	35817	0 %	50 %	50 %	0 %	77404805
513	NC_007490	ATG	2	6	35823	35828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404805
514	NC_007490	TCA	2	6	36004	36009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404806
515	NC_007490	GC	3	6	36147	36152	0 %	0 %	50 %	50 %	77404806
516	NC_007490	CTT	2	6	36181	36186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77404806
517	NC_007490	CTC	2	6	36328	36333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77404806
518	NC_007490	ATCGAC	2	12	36452	36463	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	77404806
519	NC_007490	GC	3	6	36548	36553	0 %	0 %	50 %	50 %	77404806
520	NC_007490	GC	3	6	36599	36604	0 %	0 %	50 %	50 %	77404806
521	NC_007490	CTT	2	6	36646	36651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77404806
522	NC_007490	CGG	2	6	36683	36688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404806
523	NC_007490	GAG	2	6	36700	36705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404806
524	NC_007490	TCGG	2	8	36719	36726	0 %	25 %	50 %	25 %	77404806
525	NC_007490	CG	3	6	36775	36780	0 %	0 %	50 %	50 %	77404806
526	NC_007490	CG	3	6	36879	36884	0 %	0 %	50 %	50 %	77404806
527	NC_007490	AGCGC	2	10	36888	36897	20 %	0 %	40 %	40 %	77404806
528	NC_007490	CAT	2	6	36910	36915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404806
529	NC_007490	CGC	2	6	36940	36945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404806
530	NC_007490	CTT	3	9	36973	36981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77404806
531	NC_007490	TCA	2	6	36990	36995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404806
532	NC_007490	TCG	2	6	37030	37035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404807
533	NC_007490	GTC	2	6	37072	37077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404807
534	NC_007490	AAG	2	6	37195	37200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77404807
535	NC_007490	CGA	2	6	37202	37207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404807
536	NC_007490	CAC	2	6	37280	37285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404807
537	NC_007490	TGGA	2	8	37359	37366	25 %	25 %	50 %	0 %	77404807
538	NC_007490	GGA	2	6	37426	37431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404807
539	NC_007490	GAC	2	6	37440	37445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404807
540	NC_007490	TCG	2	6	37459	37464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404807
541	NC_007490	GAA	3	9	37491	37499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77404807
542	NC_007490	ATGT	2	8	37591	37598	25 %	50 %	25 %	0 %	77404807
543	NC_007490	CAT	2	6	37646	37651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404807
544	NC_007490	GCC	2	6	37659	37664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404807
545	NC_007490	CAG	2	6	37668	37673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404807
546	NC_007490	AAG	2	6	37709	37714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77404807
547	NC_007490	GAG	2	6	37783	37788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404807
548	NC_007490	GTC	2	6	37789	37794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404807
549	NC_007490	TCA	2	6	37817	37822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404807
550	NC_007490	GAT	2	6	37827	37832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404807
551	NC_007490	CGA	2	6	37852	37857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404807
552	NC_007490	AAT	2	6	37931	37936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77404807
553	NC_007490	CAG	2	6	38019	38024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404807
554	NC_007490	AGC	2	6	38025	38030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404807
555	NC_007490	GGGA	2	8	38073	38080	25 %	0 %	75 %	0 %	77404807
556	NC_007490	GCC	2	6	38110	38115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404807
557	NC_007490	TTC	2	6	38151	38156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77404807
558	NC_007490	AAGG	2	8	38464	38471	50 %	0 %	50 %	0 %	77404808
559	NC_007490	GAC	2	6	38494	38499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404808
560	NC_007490	ACG	2	6	38600	38605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404808
561	NC_007490	GCC	2	6	38745	38750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404809
562	NC_007490	GGA	2	6	38770	38775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404809
563	NC_007490	GC	3	6	38800	38805	0 %	0 %	50 %	50 %	77404809
564	NC_007490	TCG	2	6	38898	38903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404809
565	NC_007490	CAC	2	6	38926	38931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404809
566	NC_007490	CTG	2	6	38960	38965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404809
567	NC_007490	CCAGCC	2	12	39092	39103	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	77404810
568	NC_007490	CAG	2	6	39117	39122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404810
569	NC_007490	GAT	2	6	39133	39138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404810
570	NC_007490	GGC	2	6	39237	39242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404810
571	NC_007490	GAT	2	6	39243	39248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404810
572	NC_007490	GTCG	2	8	39257	39264	0 %	25 %	50 %	25 %	77404810
573	NC_007490	CGG	2	6	39274	39279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404810
574	NC_007490	G	6	6	39380	39385	0 %	0 %	100 %	0 %	77404810
575	NC_007490	GCA	2	6	39398	39403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404810
576	NC_007490	CCATG	2	10	39411	39420	20 %	20 %	20 %	40 %	77404810
577	NC_007490	GGC	2	6	39431	39436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404810
578	NC_007490	CG	3	6	39496	39501	0 %	0 %	50 %	50 %	77404810
579	NC_007490	GC	3	6	39535	39540	0 %	0 %	50 %	50 %	77404810
580	NC_007490	GCC	2	6	39552	39557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404810
581	NC_007490	GCCT	2	8	39588	39595	0 %	25 %	25 %	50 %	77404810
582	NC_007490	GAA	2	6	39705	39710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77404810
583	NC_007490	GAG	2	6	39744	39749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404810
584	NC_007490	GAGC	2	8	39756	39763	25 %	0 %	50 %	25 %	77404810
585	NC_007490	GC	3	6	39762	39767	0 %	0 %	50 %	50 %	77404810
586	NC_007490	GAC	3	9	39783	39791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404810
587	NC_007490	CGC	2	6	39800	39805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404810
588	NC_007490	GGGC	2	8	39838	39845	0 %	0 %	75 %	25 %	77404810
589	NC_007490	CCG	2	6	39853	39858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404810
590	NC_007490	TGG	2	6	39871	39876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77404810
591	NC_007490	G	6	6	39920	39925	0 %	0 %	100 %	0 %	77404810
592	NC_007490	AGA	2	6	40706	40711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77404811
593	NC_007490	CTC	2	6	40741	40746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77404811
594	NC_007490	CAT	2	6	40761	40766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404811
595	NC_007490	CGATC	2	10	40815	40824	20 %	20 %	20 %	40 %	77404811
596	NC_007490	ACCG	2	8	40933	40940	25 %	0 %	25 %	50 %	77404811
597	NC_007490	CGC	2	6	40970	40975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404811
598	NC_007490	GGC	2	6	41032	41037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404811
599	NC_007490	CAT	2	6	41050	41055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404811
600	NC_007490	GAA	2	6	41058	41063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77404811
601	NC_007490	CGA	2	6	41073	41078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404811
602	NC_007490	CTT	2	6	41097	41102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77404811
603	NC_007490	GGC	2	6	41104	41109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404811
604	NC_007490	GCC	2	6	41209	41214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404811
605	NC_007490	CTC	2	6	41230	41235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77404811
606	NC_007490	CGG	2	6	41263	41268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404811
607	NC_007490	CCG	2	6	41282	41287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404812
608	NC_007490	TGA	2	6	41430	41435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404812
609	NC_007490	CG	3	6	41437	41442	0 %	0 %	50 %	50 %	77404812
610	NC_007490	TGC	2	6	41562	41567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404812
611	NC_007490	CGT	2	6	41576	41581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404812
612	NC_007490	GCT	2	6	41635	41640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404812
613	NC_007490	CTCC	2	8	41714	41721	0 %	25 %	0 %	75 %	77404812
614	NC_007490	GCG	2	6	41878	41883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404812
615	NC_007490	CG	5	10	41944	41953	0 %	0 %	50 %	50 %	77404812
616	NC_007490	GGGT	2	8	41970	41977	0 %	25 %	75 %	0 %	77404812
617	NC_007490	CCGG	2	8	41998	42005	0 %	0 %	50 %	50 %	77404812
618	NC_007490	CGA	2	6	42031	42036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404812
619	NC_007490	CGG	2	6	42117	42122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404812
620	NC_007490	C	6	6	42189	42194	0 %	0 %	0 %	100 %	77404812
621	NC_007490	GCG	3	9	42218	42226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404812
622	NC_007490	GCT	2	6	42250	42255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404812
623	NC_007490	GCC	2	6	42284	42289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404812
624	NC_007490	GCTG	2	8	42352	42359	0 %	25 %	50 %	25 %	77404812
625	NC_007490	GGCT	2	8	42423	42430	0 %	25 %	50 %	25 %	77404812
626	NC_007490	CGC	2	6	42456	42461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404812
627	NC_007490	CGATG	2	10	42466	42475	20 %	20 %	40 %	20 %	77404812
628	NC_007490	CGA	2	6	42529	42534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404812
629	NC_007490	GCT	2	6	42565	42570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404812
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758	NC_007490	CGA	2	6	49280	49285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	552530967
759	NC_007490	GGC	2	6	49288	49293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	552530967
760	NC_007490	GCT	2	6	49342	49347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	552530967
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762	NC_007490	GGGC	2	8	49400	49407	0 %	0 %	75 %	25 %	552530967
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