MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid C

Total Repeats: 1575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007489	GCTGGC	2	12	34184	34195	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	77404724
502	NC_007489	TCCT	2	8	34251	34258	0 %	50 %	0 %	50 %	77404724
503	NC_007489	TCG	2	6	34264	34269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404724
504	NC_007489	GCC	2	6	34302	34307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404724
505	NC_007489	GCCGC	2	10	34318	34327	0 %	0 %	40 %	60 %	77404724
506	NC_007489	GAT	2	6	34343	34348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404724
507	NC_007489	CGC	2	6	34382	34387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404724
508	NC_007489	GTCG	2	8	34550	34557	0 %	25 %	50 %	25 %	77404724
509	NC_007489	ACG	2	6	34579	34584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404724
510	NC_007489	GC	3	6	34598	34603	0 %	0 %	50 %	50 %	77404724
511	NC_007489	GGC	2	6	34640	34645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404724
512	NC_007489	AGG	2	6	34648	34653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404724
513	NC_007489	CCG	2	6	34654	34659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404724
514	NC_007489	CGA	2	6	34673	34678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404724
515	NC_007489	AAG	2	6	34737	34742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77404724
516	NC_007489	TCA	2	6	34744	34749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404724
517	NC_007489	TGG	2	6	34783	34788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77404724
518	NC_007489	TGG	2	6	34801	34806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77404724
519	NC_007489	CCTTGC	2	12	34877	34888	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	77404724
520	NC_007489	CCGA	2	8	34896	34903	25 %	0 %	25 %	50 %	77404724
521	NC_007489	GCCC	3	12	34917	34928	0 %	0 %	25 %	75 %	77404724
522	NC_007489	CG	3	6	34933	34938	0 %	0 %	50 %	50 %	77404724
523	NC_007489	TGG	2	6	34981	34986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77404724
524	NC_007489	TGG	2	6	35083	35088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77404724
525	NC_007489	TCT	2	6	35107	35112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77404724
526	NC_007489	GCC	2	6	35148	35153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404724
527	NC_007489	GTG	2	6	35181	35186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77404724
528	NC_007489	GCT	2	6	35276	35281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404724
529	NC_007489	TCG	2	6	35314	35319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404724
530	NC_007489	TGA	2	6	35921	35926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404725
531	NC_007489	TGT	2	6	35930	35935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77404725
532	NC_007489	GTG	2	6	35968	35973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77404725
533	NC_007489	GCG	2	6	35982	35987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404725
534	NC_007489	GGA	2	6	36074	36079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404725
535	NC_007489	TG	3	6	36087	36092	0 %	50 %	50 %	0 %	77404725
536	NC_007489	GCC	2	6	36165	36170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404725
537	NC_007489	ACG	2	6	36190	36195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404725
538	NC_007489	CATC	2	8	36197	36204	25 %	25 %	0 %	50 %	77404725
539	NC_007489	GTC	2	6	36396	36401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404725
540	NC_007489	GCAG	2	8	36431	36438	25 %	0 %	50 %	25 %	77404725
541	NC_007489	CGCGG	2	10	36466	36475	0 %	0 %	60 %	40 %	77404725
542	NC_007489	CTG	2	6	36489	36494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404725
543	NC_007489	GC	3	6	36557	36562	0 %	0 %	50 %	50 %	77404725
544	NC_007489	GAA	2	6	36591	36596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77404725
545	NC_007489	GCA	2	6	36707	36712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404725
546	NC_007489	CCGC	2	8	36731	36738	0 %	0 %	25 %	75 %	77404725
547	NC_007489	ATC	2	6	36822	36827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404725
548	NC_007489	GAA	2	6	36852	36857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77404725
549	NC_007489	GAG	2	6	37002	37007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404725
550	NC_007489	CTG	2	6	37053	37058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404725
551	NC_007489	CGC	2	6	37092	37097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404725
552	NC_007489	GC	3	6	37096	37101	0 %	0 %	50 %	50 %	77404725
553	NC_007489	CAG	2	6	37245	37250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404725
554	NC_007489	GCA	2	6	37333	37338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404725
555	NC_007489	GCC	2	6	37435	37440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404725
556	NC_007489	TTG	2	6	37477	37482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77404725
557	NC_007489	CTGC	2	8	37514	37521	0 %	25 %	25 %	50 %	77404725
558	NC_007489	TGT	2	6	37580	37585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77404725
559	NC_007489	GAAG	2	8	38062	38069	50 %	0 %	50 %	0 %	77404726
560	NC_007489	CGGC	2	8	38070	38077	0 %	0 %	50 %	50 %	77404726
561	NC_007489	GC	3	6	38107	38112	0 %	0 %	50 %	50 %	77404726
562	NC_007489	TCA	2	6	38232	38237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404726
563	NC_007489	CCT	2	6	38391	38396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77404727
564	NC_007489	GCC	2	6	38415	38420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404727
565	NC_007489	TCG	2	6	38435	38440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404727
566	NC_007489	GAT	2	6	38446	38451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404727
567	NC_007489	GCC	2	6	38492	38497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404727
568	NC_007489	GCG	2	6	38553	38558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404727
569	NC_007489	CGG	2	6	38622	38627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404727
570	NC_007489	GAG	2	6	38644	38649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404727
571	NC_007489	CTG	2	6	38767	38772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404727
572	NC_007489	GAC	2	6	38794	38799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404727
573	NC_007489	TGC	2	6	38825	38830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404727
574	NC_007489	ATCCGG	2	12	38831	38842	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	77404727
575	NC_007489	GCCGG	2	10	38885	38894	0 %	0 %	60 %	40 %	77404727
576	NC_007489	CG	3	6	38966	38971	0 %	0 %	50 %	50 %	77404727
577	NC_007489	CGTC	2	8	38982	38989	0 %	25 %	25 %	50 %	77404727
578	NC_007489	ACT	2	6	39029	39034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404727
579	NC_007489	CAT	2	6	39036	39041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404727
580	NC_007489	CGC	2	6	39048	39053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404727
581	NC_007489	CAGC	2	8	40407	40414	25 %	0 %	25 %	50 %	77404728
582	NC_007489	CCA	2	6	40425	40430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404728
583	NC_007489	ACG	2	6	40454	40459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404728
584	NC_007489	GAAG	2	8	40473	40480	50 %	0 %	50 %	0 %	77404728
585	NC_007489	GGC	2	6	40493	40498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404728
586	NC_007489	GCAGCG	2	12	40680	40691	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	77404728
587	NC_007489	GAC	2	6	40696	40701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404728
588	NC_007489	GCTC	2	8	40710	40717	0 %	25 %	25 %	50 %	77404728
589	NC_007489	CGA	2	6	40722	40727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404728
590	NC_007489	CGG	2	6	40784	40789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404728
591	NC_007489	AGG	3	9	40863	40871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404728
592	NC_007489	ATC	2	6	40898	40903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404728
593	NC_007489	AGGCCG	2	12	40916	40927	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	77404728
594	NC_007489	GAT	2	6	40939	40944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404728
595	NC_007489	CAG	2	6	40948	40953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404728
596	NC_007489	AGG	2	6	41003	41008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404728
597	NC_007489	AGC	2	6	41027	41032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404728
598	NC_007489	CTG	2	6	41088	41093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404728
599	NC_007489	GCG	2	6	41170	41175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404728
600	NC_007489	CTG	2	6	41189	41194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404728
601	NC_007489	CGG	2	6	41199	41204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404728
602	NC_007489	ATG	2	6	41219	41224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404728
603	NC_007489	GAA	3	9	41239	41247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77404728
604	NC_007489	CGT	2	6	41295	41300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404728
605	NC_007489	GGA	2	6	41313	41318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404728
606	NC_007489	TTG	2	6	41324	41329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77404728
607	NC_007489	CAC	2	6	41341	41346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404728
608	NC_007489	ATC	2	6	41360	41365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404728
609	NC_007489	CTGC	2	8	41941	41948	0 %	25 %	25 %	50 %	77404729
610	NC_007489	GGA	2	6	41966	41971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404729
611	NC_007489	ATA	2	6	42154	42159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77404729
612	NC_007489	TGC	2	6	42203	42208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404729
613	NC_007489	CGCGT	2	10	42259	42268	0 %	20 %	40 %	40 %	77404729
614	NC_007489	CT	3	6	42788	42793	0 %	50 %	0 %	50 %	77404730
615	NC_007489	GCGG	2	8	42806	42813	0 %	0 %	75 %	25 %	77404730
616	NC_007489	GTAGCG	2	12	42825	42836	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	77404730
617	NC_007489	GCACC	2	10	42893	42902	20 %	0 %	20 %	60 %	77404730
618	NC_007489	CGT	2	6	42968	42973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404730
619	NC_007489	GACG	2	8	42974	42981	25 %	0 %	50 %	25 %	77404730
620	NC_007489	TGG	2	6	42989	42994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77404730
621	NC_007489	CAC	2	6	43014	43019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404730
622	NC_007489	GCG	2	6	43071	43076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404730
623	NC_007489	CAG	2	6	43116	43121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404730
624	NC_007489	AGCC	2	8	43161	43168	25 %	0 %	25 %	50 %	77404730
625	NC_007489	CCGGCC	2	12	43175	43186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404730
626	NC_007489	GCA	2	6	43187	43192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404730
627	NC_007489	CGCC	2	8	43211	43218	0 %	0 %	25 %	75 %	77404730
628	NC_007489	CGC	2	6	43279	43284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404730
629	NC_007489	GGCC	2	8	43313	43320	0 %	0 %	50 %	50 %	77404730
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