MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia felis URRWXCal2 plasmid pRFdelta

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007111	T	6	6	1467	1472	0 %	100 %	0 %	0 %	67459864
2	NC_007111	A	7	7	1537	1543	100 %	0 %	0 %	0 %	67459864
3	NC_007111	T	6	6	1554	1559	0 %	100 %	0 %	0 %	67459864
4	NC_007111	A	7	7	1939	1945	100 %	0 %	0 %	0 %	67459865
5	NC_007111	A	7	7	2217	2223	100 %	0 %	0 %	0 %	67459865
6	NC_007111	T	6	6	2398	2403	0 %	100 %	0 %	0 %	67459865
7	NC_007111	A	6	6	2409	2414	100 %	0 %	0 %	0 %	67459865
8	NC_007111	A	7	7	2426	2432	100 %	0 %	0 %	0 %	67459865
9	NC_007111	A	6	6	2505	2510	100 %	0 %	0 %	0 %	67459865
10	NC_007111	A	6	6	2700	2705	100 %	0 %	0 %	0 %	67459866
11	NC_007111	A	7	7	2902	2908	100 %	0 %	0 %	0 %	67459866
12	NC_007111	A	6	6	5395	5400	100 %	0 %	0 %	0 %	67459867
13	NC_007111	A	6	6	6392	6397	100 %	0 %	0 %	0 %	67459868
14	NC_007111	A	7	7	6813	6819	100 %	0 %	0 %	0 %	67459869
15	NC_007111	T	6	6	8242	8247	0 %	100 %	0 %	0 %	67459871
16	NC_007111	T	6	6	8695	8700	0 %	100 %	0 %	0 %	67459872
17	NC_007111	C	6	6	9973	9978	0 %	0 %	0 %	100 %	67459873
18	NC_007111	T	6	6	12166	12171	0 %	100 %	0 %	0 %	67459874
19	NC_007111	T	6	6	12702	12707	0 %	100 %	0 %	0 %	67459875
20	NC_007111	A	6	6	13546	13551	100 %	0 %	0 %	0 %	67459877
21	NC_007111	T	6	6	13582	13587	0 %	100 %	0 %	0 %	67459877
22	NC_007111	A	6	6	13744	13749	100 %	0 %	0 %	0 %	67459877
23	NC_007111	A	6	6	18063	18068	100 %	0 %	0 %	0 %	67459879
24	NC_007111	A	7	7	20178	20184	100 %	0 %	0 %	0 %	67459882
25	NC_007111	T	6	6	20463	20468	0 %	100 %	0 %	0 %	67459882
26	NC_007111	T	7	7	20832	20838	0 %	100 %	0 %	0 %	67459883
27	NC_007111	T	6	6	21195	21200	0 %	100 %	0 %	0 %	67459884
28	NC_007111	T	6	6	21228	21233	0 %	100 %	0 %	0 %	67459884
29	NC_007111	T	6	6	21613	21618	0 %	100 %	0 %	0 %	67459884
30	NC_007111	T	7	7	21641	21647	0 %	100 %	0 %	0 %	67459884
31	NC_007111	T	7	7	22908	22914	0 %	100 %	0 %	0 %	67459886
32	NC_007111	T	6	6	23900	23905	0 %	100 %	0 %	0 %	67459887
33	NC_007111	T	6	6	24009	24014	0 %	100 %	0 %	0 %	67459888
34	NC_007111	C	6	6	24066	24071	0 %	0 %	0 %	100 %	67459888
35	NC_007111	T	6	6	24929	24934	0 %	100 %	0 %	0 %	67459889
36	NC_007111	T	6	6	25064	25069	0 %	100 %	0 %	0 %	67459889
37	NC_007111	A	7	7	26543	26549	100 %	0 %	0 %	0 %	67459891
38	NC_007111	A	6	6	26669	26674	100 %	0 %	0 %	0 %	67459892
39	NC_007111	T	6	6	26716	26721	0 %	100 %	0 %	0 %	67459892
40	NC_007111	T	6	6	26789	26794	0 %	100 %	0 %	0 %	67459892
41	NC_007111	C	6	6	28341	28346	0 %	0 %	0 %	100 %	67459894
42	NC_007111	T	6	6	29190	29195	0 %	100 %	0 %	0 %	67459894
43	NC_007111	A	6	6	29219	29224	100 %	0 %	0 %	0 %	67459894
44	NC_007111	A	6	6	29386	29391	100 %	0 %	0 %	0 %	67459894
45	NC_007111	T	6	6	30310	30315	0 %	100 %	0 %	0 %	67459895
46	NC_007111	T	6	6	30615	30620	0 %	100 %	0 %	0 %	67459895
47	NC_007111	T	7	7	30633	30639	0 %	100 %	0 %	0 %	67459895
48	NC_007111	T	6	6	30815	30820	0 %	100 %	0 %	0 %	67459895
49	NC_007111	T	6	6	31110	31115	0 %	100 %	0 %	0 %	67459896
50	NC_007111	T	6	6	31595	31600	0 %	100 %	0 %	0 %	67459897
51	NC_007111	T	6	6	31779	31784	0 %	100 %	0 %	0 %	67459897
52	NC_007111	T	6	6	31869	31874	0 %	100 %	0 %	0 %	67459897
53	NC_007111	T	6	6	32122	32127	0 %	100 %	0 %	0 %	67459898
54	NC_007111	A	6	6	32140	32145	100 %	0 %	0 %	0 %	67459898
55	NC_007111	T	6	6	34643	34648	0 %	100 %	0 %	0 %	67459901
56	NC_007111	A	6	6	35454	35459	100 %	0 %	0 %	0 %	67459902
57	NC_007111	A	8	8	35571	35578	100 %	0 %	0 %	0 %	67459903
58	NC_007111	T	6	6	35735	35740	0 %	100 %	0 %	0 %	67459903
59	NC_007111	A	6	6	36857	36862	100 %	0 %	0 %	0 %	67459904
60	NC_007111	T	6	6	37746	37751	0 %	100 %	0 %	0 %	67459905
61	NC_007111	A	6	6	38588	38593	100 %	0 %	0 %	0 %	67459906

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.