MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia felis URRWXCal2 plasmid pRFdelta

Total Repeats: 507

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007111	ATC	2	6	886	891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459863
2	NC_007111	ATT	2	6	1349	1354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459864
3	NC_007111	AGT	2	6	1374	1379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459864
4	NC_007111	TAA	2	6	1425	1430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459864
5	NC_007111	ATA	2	6	1493	1498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459864
6	NC_007111	TTA	2	6	1598	1603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459864
7	NC_007111	ATT	2	6	1616	1621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459864
8	NC_007111	ATT	2	6	1864	1869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459865
9	NC_007111	AAT	2	6	1872	1877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459865
10	NC_007111	GGT	2	6	1888	1893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	67459865
11	NC_007111	CTA	2	6	1904	1909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459865
12	NC_007111	TAA	2	6	2049	2054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459865
13	NC_007111	TAA	2	6	2067	2072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459865
14	NC_007111	AAT	2	6	2110	2115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459865
15	NC_007111	ATT	2	6	2122	2127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459865
16	NC_007111	TAG	2	6	2166	2171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459865
17	NC_007111	CCA	2	6	2251	2256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	67459865
18	NC_007111	AAT	2	6	2301	2306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459865
19	NC_007111	TTA	2	6	2353	2358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459865
20	NC_007111	TTA	2	6	2485	2490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459865
21	NC_007111	TAT	2	6	2496	2501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459865
22	NC_007111	TAA	2	6	2535	2540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459865
23	NC_007111	TTA	2	6	2593	2598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459865
24	NC_007111	TAG	2	6	2643	2648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459866
25	NC_007111	AAT	2	6	2677	2682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459866
26	NC_007111	TTA	2	6	2712	2717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459866
27	NC_007111	AAT	2	6	2726	2731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459866
28	NC_007111	AAC	2	6	2734	2739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459866
29	NC_007111	ATT	2	6	2798	2803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459866
30	NC_007111	TTA	2	6	2853	2858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459866
31	NC_007111	TTC	2	6	2926	2931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459866
32	NC_007111	ATT	2	6	3447	3452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
33	NC_007111	AGA	2	6	3738	3743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459867
34	NC_007111	AAT	2	6	3790	3795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459867
35	NC_007111	TAC	3	9	3807	3815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459867
36	NC_007111	ACA	2	6	3972	3977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459867
37	NC_007111	TTA	2	6	3998	4003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
38	NC_007111	TAT	2	6	4070	4075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
39	NC_007111	GTA	2	6	4136	4141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459867
40	NC_007111	ATT	2	6	4166	4171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
41	NC_007111	CAT	2	6	4199	4204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459867
42	NC_007111	CAA	2	6	4216	4221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459867
43	NC_007111	TTA	2	6	4283	4288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
44	NC_007111	TTA	2	6	4304	4309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
45	NC_007111	ATT	2	6	4319	4324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
46	NC_007111	CAG	2	6	4329	4334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67459867
47	NC_007111	ATG	2	6	4427	4432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459867
48	NC_007111	GAA	2	6	4438	4443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459867
49	NC_007111	TTA	2	6	4462	4467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
50	NC_007111	ACA	2	6	4483	4488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459867
51	NC_007111	CCT	2	6	4573	4578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	67459867
52	NC_007111	ATA	3	9	4622	4630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459867
53	NC_007111	TAA	2	6	4632	4637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459867
54	NC_007111	GAA	2	6	4666	4671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459867
55	NC_007111	TAC	2	6	4764	4769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459867
56	NC_007111	AAT	2	6	4891	4896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459867
57	NC_007111	TTA	2	6	4909	4914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
58	NC_007111	ACA	2	6	5029	5034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459867
59	NC_007111	GAA	2	6	5145	5150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459867
60	NC_007111	AGG	2	6	5195	5200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	67459867
61	NC_007111	ATA	2	6	5222	5227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459867
62	NC_007111	TTA	2	6	5325	5330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
63	NC_007111	CAA	2	6	5651	5656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459867
64	NC_007111	AAT	2	6	5680	5685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459867
65	NC_007111	ATT	2	6	5759	5764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
66	NC_007111	GAA	2	6	5793	5798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459868
67	NC_007111	GTA	2	6	5896	5901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459868
68	NC_007111	ATA	2	6	5929	5934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459868
69	NC_007111	TGA	2	6	5936	5941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459868
70	NC_007111	GAA	2	6	6111	6116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459868
71	NC_007111	ATT	2	6	6126	6131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459868
72	NC_007111	CAA	2	6	6132	6137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459868
73	NC_007111	TGA	2	6	6182	6187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459868
74	NC_007111	CAA	2	6	6236	6241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459868
75	NC_007111	TCT	2	6	6299	6304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459868
76	NC_007111	TAG	2	6	6328	6333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459868
77	NC_007111	GAT	2	6	6402	6407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459868
78	NC_007111	ATT	2	6	6439	6444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459868
79	NC_007111	ATT	2	6	6455	6460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459868
80	NC_007111	GAT	2	6	6547	6552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459869
81	NC_007111	GGA	2	6	6619	6624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	67459869
82	NC_007111	TTA	2	6	6746	6751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459869
83	NC_007111	TTA	2	6	6956	6961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459869
84	NC_007111	GTA	2	6	7006	7011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459869
85	NC_007111	ATA	2	6	7124	7129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459869
86	NC_007111	ATT	2	6	7272	7277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459869
87	NC_007111	AGC	2	6	7359	7364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67459869
88	NC_007111	CTA	2	6	7384	7389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459869
89	NC_007111	ATC	2	6	7396	7401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459869
90	NC_007111	CTT	2	6	7416	7421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459869
91	NC_007111	TTA	2	6	7479	7484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459869
92	NC_007111	ACA	2	6	7550	7555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459870
93	NC_007111	AGT	2	6	7564	7569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459870
94	NC_007111	CCT	2	6	7614	7619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	67459870
95	NC_007111	TAT	2	6	7636	7641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459870
96	NC_007111	AAT	2	6	7948	7953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459871
97	NC_007111	AAT	2	6	7957	7962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459871
98	NC_007111	TAA	2	6	8077	8082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459871
99	NC_007111	TCC	2	6	8116	8121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	67459871
100	NC_007111	GAT	2	6	8144	8149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459871
101	NC_007111	TTC	2	6	8191	8196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459871
102	NC_007111	ATC	2	6	8248	8253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459871
103	NC_007111	TGA	3	9	8254	8262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459871
104	NC_007111	ATT	2	6	8415	8420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459872
105	NC_007111	TTG	2	6	8453	8458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67459872
106	NC_007111	ATA	2	6	8480	8485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459872
107	NC_007111	TAC	2	6	8504	8509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459872
108	NC_007111	ATG	2	6	8516	8521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459872
109	NC_007111	CCT	2	6	8570	8575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	67459872
110	NC_007111	CAT	2	6	8600	8605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459872
111	NC_007111	ATT	2	6	8659	8664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459872
112	NC_007111	CTA	2	6	8669	8674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459872
113	NC_007111	TGA	2	6	8817	8822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459872
114	NC_007111	CTT	2	6	8885	8890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459872
115	NC_007111	ATA	3	9	8902	8910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459872
116	NC_007111	TTC	2	6	9521	9526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459873
117	NC_007111	TCA	2	6	9553	9558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459873
118	NC_007111	CTT	2	6	9581	9586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459873
119	NC_007111	ATG	2	6	9779	9784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459873
120	NC_007111	ATA	2	6	9835	9840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459873
121	NC_007111	CAT	2	6	9854	9859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459873
122	NC_007111	TTA	2	6	9871	9876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459873
123	NC_007111	TCA	2	6	9925	9930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459873
124	NC_007111	CTA	2	6	9931	9936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459873
125	NC_007111	TGC	2	6	9987	9992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67459873
126	NC_007111	CTC	2	6	10074	10079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	67459873
127	NC_007111	CTA	2	6	10100	10105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459873
128	NC_007111	CTA	2	6	10126	10131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459873
129	NC_007111	ACT	2	6	10140	10145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459873
130	NC_007111	CTG	2	6	10214	10219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67459873
131	NC_007111	GAC	2	6	10247	10252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67459873
132	NC_007111	GCT	2	6	10314	10319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67459873
133	NC_007111	ATA	2	6	10349	10354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459873
134	NC_007111	ATC	2	6	10362	10367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459873
135	NC_007111	CTA	2	6	10390	10395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459873
136	NC_007111	TGC	2	6	10539	10544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67459873
137	NC_007111	ATT	2	6	10651	10656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459873
138	NC_007111	TGT	2	6	10665	10670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67459873
139	NC_007111	ATC	2	6	10671	10676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459873
140	NC_007111	TGC	2	6	10696	10701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67459873
141	NC_007111	ATG	2	6	10770	10775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459873
142	NC_007111	TGC	2	6	10791	10796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67459873
143	NC_007111	ATA	2	6	10909	10914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459873
144	NC_007111	AAT	2	6	10918	10923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459873
145	NC_007111	CAC	2	6	10965	10970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	67459873
146	NC_007111	TAT	2	6	11057	11062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459873
147	NC_007111	TGT	2	6	11127	11132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67459873
148	NC_007111	CTT	2	6	11357	11362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459874
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150	NC_007111	AAT	2	6	11571	11576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459874
151	NC_007111	TAT	2	6	11579	11584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459874
152	NC_007111	ATA	2	6	11591	11596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459874
153	NC_007111	ATG	2	6	11621	11626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459874
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155	NC_007111	TAT	2	6	11730	11735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459874
156	NC_007111	TTC	2	6	11742	11747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459874
157	NC_007111	TGC	2	6	11788	11793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67459874
158	NC_007111	TTG	2	6	11889	11894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67459874
159	NC_007111	CAA	2	6	11903	11908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459874
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162	NC_007111	CTA	2	6	12089	12094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459874
163	NC_007111	ATA	2	6	12308	12313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459875
164	NC_007111	TCT	2	6	12421	12426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459875
165	NC_007111	TAA	2	6	12429	12434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459875
166	NC_007111	TAT	2	6	12457	12462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459875
167	NC_007111	CTA	2	6	12477	12482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459875
168	NC_007111	TAC	2	6	12487	12492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459875
169	NC_007111	GAA	2	6	12694	12699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459875
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243	NC_007111	TAC	2	6	17742	17747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459879
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246	NC_007111	CAT	2	6	17975	17980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459879
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249	NC_007111	TAA	2	6	18246	18251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459880
250	NC_007111	TAC	2	6	18374	18379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459880
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254	NC_007111	TTA	2	6	18464	18469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459880
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