MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Rickettsia felis URRWXCal2 plasmid pRFdelta

Total Repeats: 756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007111	ATA	2	6	24211	24216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459888
502	NC_007111	AAT	2	6	24248	24253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459888
503	NC_007111	TCT	2	6	24308	24313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459888
504	NC_007111	TCA	2	6	24439	24444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459888
505	NC_007111	ATT	2	6	24465	24470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459888
506	NC_007111	TCAT	2	8	24499	24506	25 %	50 %	0 %	25 %	67459888
507	NC_007111	TTC	2	6	24519	24524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459888
508	NC_007111	TCC	2	6	24534	24539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	67459888
509	NC_007111	ATT	2	6	24579	24584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459888
510	NC_007111	TGT	2	6	24636	24641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67459888
511	NC_007111	TTC	2	6	24645	24650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459888
512	NC_007111	ACCAT	2	10	24661	24670	40 %	20 %	0 %	40 %	67459888
513	NC_007111	TA	3	6	24675	24680	50 %	50 %	0 %	0 %	67459888
514	NC_007111	ACC	2	6	24723	24728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	67459888
515	NC_007111	AC	3	6	24744	24749	50 %	0 %	0 %	50 %	67459888
516	NC_007111	T	6	6	24929	24934	0 %	100 %	0 %	0 %	67459889
517	NC_007111	TTC	2	6	24983	24988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459889
518	NC_007111	GA	3	6	25018	25023	50 %	0 %	50 %	0 %	67459889
519	NC_007111	ATA	2	6	25031	25036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459889
520	NC_007111	T	6	6	25064	25069	0 %	100 %	0 %	0 %	67459889
521	NC_007111	CTAT	2	8	25113	25120	25 %	50 %	0 %	25 %	67459889
522	NC_007111	TAT	2	6	25219	25224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459889
523	NC_007111	GGGTA	2	10	25231	25240	20 %	20 %	60 %	0 %	67459889
524	NC_007111	ATT	2	6	25268	25273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459889
525	NC_007111	ATG	2	6	25307	25312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459889
526	NC_007111	ATTT	2	8	25324	25331	25 %	75 %	0 %	0 %	67459889
527	NC_007111	TTA	2	6	25374	25379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459889
528	NC_007111	TTTC	2	8	25442	25449	0 %	75 %	0 %	25 %	67459890
529	NC_007111	GAA	2	6	25513	25518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459890
530	NC_007111	ATC	2	6	25581	25586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459890
531	NC_007111	TAT	2	6	25601	25606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459890
532	NC_007111	ATAA	2	8	25627	25634	75 %	25 %	0 %	0 %	67459890
533	NC_007111	TTA	2	6	25636	25641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459890
534	NC_007111	AT	3	6	25699	25704	50 %	50 %	0 %	0 %	67459890
535	NC_007111	TAA	2	6	25718	25723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459890
536	NC_007111	AGT	2	6	25784	25789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459890
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539	NC_007111	TAT	2	6	25850	25855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459890
540	NC_007111	TA	3	6	25946	25951	50 %	50 %	0 %	0 %	67459890
541	NC_007111	ACAT	2	8	25952	25959	50 %	25 %	0 %	25 %	67459890
542	NC_007111	TA	3	6	25974	25979	50 %	50 %	0 %	0 %	67459890
543	NC_007111	AT	3	6	25980	25985	50 %	50 %	0 %	0 %	67459890
544	NC_007111	TAAG	2	8	26004	26011	50 %	25 %	25 %	0 %	67459890
545	NC_007111	ATC	2	6	26193	26198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459891
546	NC_007111	ATT	2	6	26315	26320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459891
547	NC_007111	TAAG	2	8	26436	26443	50 %	25 %	25 %	0 %	67459891
548	NC_007111	CAAT	2	8	26481	26488	50 %	25 %	0 %	25 %	67459891
549	NC_007111	A	7	7	26543	26549	100 %	0 %	0 %	0 %	67459891
550	NC_007111	GCA	2	6	26562	26567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67459891
551	NC_007111	ATA	2	6	26580	26585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459891
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553	NC_007111	TTCT	2	8	26649	26656	0 %	75 %	0 %	25 %	67459892
554	NC_007111	A	6	6	26669	26674	100 %	0 %	0 %	0 %	67459892
555	NC_007111	T	6	6	26716	26721	0 %	100 %	0 %	0 %	67459892
556	NC_007111	T	6	6	26789	26794	0 %	100 %	0 %	0 %	67459892
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561	NC_007111	TTG	2	6	27296	27301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67459892
562	NC_007111	TAC	2	6	27328	27333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459892
563	NC_007111	TAT	2	6	27403	27408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459893
564	NC_007111	ATC	2	6	27409	27414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459893
565	NC_007111	ATC	2	6	27522	27527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459893
566	NC_007111	TCT	2	6	27540	27545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459893
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569	NC_007111	CTA	2	6	27577	27582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459893
570	NC_007111	ATT	2	6	27702	27707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459893
571	NC_007111	TAA	2	6	27756	27761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459893
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600	NC_007111	T	6	6	30310	30315	0 %	100 %	0 %	0 %	67459895
601	NC_007111	TTC	2	6	30325	30330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459895
602	NC_007111	ATCTT	2	10	30339	30348	20 %	60 %	0 %	20 %	67459895
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