MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia felis URRWXCal2 plasmid pRF

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007110	TA	3	6	780	785	50 %	50 %	0 %	0 %	67459794
2	NC_007110	GT	3	6	1817	1822	0 %	50 %	50 %	0 %	67459796
3	NC_007110	TA	3	6	1934	1939	50 %	50 %	0 %	0 %	67459796
4	NC_007110	TA	3	6	1995	2000	50 %	50 %	0 %	0 %	67459796
5	NC_007110	AT	3	6	2284	2289	50 %	50 %	0 %	0 %	67459796
6	NC_007110	AT	3	6	2448	2453	50 %	50 %	0 %	0 %	67459796
7	NC_007110	GA	3	6	3688	3693	50 %	0 %	50 %	0 %	67459798
8	NC_007110	TA	4	8	3759	3766	50 %	50 %	0 %	0 %	67459798
9	NC_007110	TA	3	6	4598	4603	50 %	50 %	0 %	0 %	67459798
10	NC_007110	TA	3	6	4648	4653	50 %	50 %	0 %	0 %	67459798
11	NC_007110	AT	3	6	6152	6157	50 %	50 %	0 %	0 %	67459799
12	NC_007110	AG	3	6	7183	7188	50 %	0 %	50 %	0 %	67459800
13	NC_007110	TA	3	6	7255	7260	50 %	50 %	0 %	0 %	67459800
14	NC_007110	TG	3	6	7297	7302	0 %	50 %	50 %	0 %	67459800
15	NC_007110	TC	3	6	7332	7337	0 %	50 %	0 %	50 %	67459800
16	NC_007110	TA	3	6	7558	7563	50 %	50 %	0 %	0 %	67459801
17	NC_007110	TA	3	6	8008	8013	50 %	50 %	0 %	0 %	67459802
18	NC_007110	TA	3	6	8046	8051	50 %	50 %	0 %	0 %	67459802
19	NC_007110	AT	3	6	8679	8684	50 %	50 %	0 %	0 %	67459803
20	NC_007110	CT	3	6	8707	8712	0 %	50 %	0 %	50 %	67459803
21	NC_007110	CT	3	6	9628	9633	0 %	50 %	0 %	50 %	67459804
22	NC_007110	CT	3	6	9816	9821	0 %	50 %	0 %	50 %	67459804
23	NC_007110	TA	3	6	10080	10085	50 %	50 %	0 %	0 %	67459804
24	NC_007110	GT	4	8	11114	11121	0 %	50 %	50 %	0 %	67459804
25	NC_007110	TC	3	6	11649	11654	0 %	50 %	0 %	50 %	67459805
26	NC_007110	TC	3	6	11755	11760	0 %	50 %	0 %	50 %	67459805
27	NC_007110	TA	3	6	11831	11836	50 %	50 %	0 %	0 %	67459805
28	NC_007110	TA	3	6	11969	11974	50 %	50 %	0 %	0 %	67459805
29	NC_007110	TG	3	6	12879	12884	0 %	50 %	50 %	0 %	67459806
30	NC_007110	AT	4	8	13086	13093	50 %	50 %	0 %	0 %	67459807
31	NC_007110	TC	3	6	13389	13394	0 %	50 %	0 %	50 %	67459808
32	NC_007110	AT	3	6	13490	13495	50 %	50 %	0 %	0 %	67459808
33	NC_007110	AT	3	6	13788	13793	50 %	50 %	0 %	0 %	67459808
34	NC_007110	TA	3	6	14036	14041	50 %	50 %	0 %	0 %	67459808
35	NC_007110	TG	3	6	14379	14384	0 %	50 %	50 %	0 %	67459809
36	NC_007110	AT	3	6	14830	14835	50 %	50 %	0 %	0 %	67459809
37	NC_007110	TA	3	6	15347	15352	50 %	50 %	0 %	0 %	67459810
38	NC_007110	AT	3	6	15746	15751	50 %	50 %	0 %	0 %	67459811
39	NC_007110	CT	3	6	16041	16046	0 %	50 %	0 %	50 %	67459811
40	NC_007110	AT	3	6	16913	16918	50 %	50 %	0 %	0 %	67459811
41	NC_007110	CT	3	6	17988	17993	0 %	50 %	0 %	50 %	67459812
42	NC_007110	AT	3	6	18286	18291	50 %	50 %	0 %	0 %	67459812
43	NC_007110	TA	3	6	18431	18436	50 %	50 %	0 %	0 %	67459812
44	NC_007110	CT	3	6	19530	19535	0 %	50 %	0 %	50 %	67459814
45	NC_007110	TA	3	6	19769	19774	50 %	50 %	0 %	0 %	67459814
46	NC_007110	GA	3	6	19874	19879	50 %	0 %	50 %	0 %	67459815
47	NC_007110	TA	3	6	20132	20137	50 %	50 %	0 %	0 %	67459816
48	NC_007110	GT	3	6	20251	20256	0 %	50 %	50 %	0 %	67459816
49	NC_007110	AC	3	6	20577	20582	50 %	0 %	0 %	50 %	67459816
50	NC_007110	AT	3	6	21013	21018	50 %	50 %	0 %	0 %	67459817
51	NC_007110	AG	3	6	22411	22416	50 %	0 %	50 %	0 %	67459818
52	NC_007110	AG	3	6	22518	22523	50 %	0 %	50 %	0 %	67459818
53	NC_007110	AT	3	6	22586	22591	50 %	50 %	0 %	0 %	67459818
54	NC_007110	AT	3	6	22760	22765	50 %	50 %	0 %	0 %	67459818
55	NC_007110	AT	3	6	23063	23068	50 %	50 %	0 %	0 %	67459818
56	NC_007110	AG	3	6	23301	23306	50 %	0 %	50 %	0 %	67459818
57	NC_007110	AG	3	6	23430	23435	50 %	0 %	50 %	0 %	67459818
58	NC_007110	TA	3	6	23985	23990	50 %	50 %	0 %	0 %	67459819
59	NC_007110	CA	3	6	25348	25353	50 %	0 %	0 %	50 %	67459819
60	NC_007110	TC	3	6	25508	25513	0 %	50 %	0 %	50 %	67459819
61	NC_007110	TA	4	8	25894	25901	50 %	50 %	0 %	0 %	67459819
62	NC_007110	AG	4	8	27266	27273	50 %	0 %	50 %	0 %	67459820
63	NC_007110	AT	3	6	27489	27494	50 %	50 %	0 %	0 %	67459820
64	NC_007110	AG	3	6	27637	27642	50 %	0 %	50 %	0 %	67459820
65	NC_007110	AC	3	6	27668	27673	50 %	0 %	0 %	50 %	67459820
66	NC_007110	TG	3	6	29047	29052	0 %	50 %	50 %	0 %	67459822
67	NC_007110	GA	3	6	32393	32398	50 %	0 %	50 %	0 %	67459825
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69	NC_007110	AT	3	6	34623	34628	50 %	50 %	0 %	0 %	67459828
70	NC_007110	AT	3	6	35426	35431	50 %	50 %	0 %	0 %	67459829
71	NC_007110	AT	3	6	35695	35700	50 %	50 %	0 %	0 %	67459829
72	NC_007110	TA	3	6	36003	36008	50 %	50 %	0 %	0 %	67459829
73	NC_007110	AT	3	6	36687	36692	50 %	50 %	0 %	0 %	67459831
74	NC_007110	TA	3	6	36710	36715	50 %	50 %	0 %	0 %	67459831
75	NC_007110	AT	3	6	36784	36789	50 %	50 %	0 %	0 %	67459831
76	NC_007110	TA	3	6	36978	36983	50 %	50 %	0 %	0 %	67459832
77	NC_007110	GA	4	8	37867	37874	50 %	0 %	50 %	0 %	67459832
78	NC_007110	AT	3	6	38631	38636	50 %	50 %	0 %	0 %	67459832
79	NC_007110	AG	3	6	38740	38745	50 %	0 %	50 %	0 %	67459832
80	NC_007110	AG	3	6	39610	39615	50 %	0 %	50 %	0 %	67459833
81	NC_007110	GA	3	6	39830	39835	50 %	0 %	50 %	0 %	67459833
82	NC_007110	AG	3	6	39845	39850	50 %	0 %	50 %	0 %	67459833
83	NC_007110	AG	3	6	40220	40225	50 %	0 %	50 %	0 %	67459833
84	NC_007110	TA	3	6	40537	40542	50 %	50 %	0 %	0 %	67459833
85	NC_007110	TA	3	6	42072	42077	50 %	50 %	0 %	0 %	67459835
86	NC_007110	TA	3	6	42358	42363	50 %	50 %	0 %	0 %	67459835
87	NC_007110	AT	3	6	42776	42781	50 %	50 %	0 %	0 %	67459836
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90	NC_007110	TA	3	6	48241	48246	50 %	50 %	0 %	0 %	67459843
91	NC_007110	AC	3	6	48310	48315	50 %	0 %	0 %	50 %	67459843
92	NC_007110	GA	3	6	48584	48589	50 %	0 %	50 %	0 %	67459844
93	NC_007110	AT	3	6	49265	49270	50 %	50 %	0 %	0 %	67459845
94	NC_007110	TA	3	6	49512	49517	50 %	50 %	0 %	0 %	67459845
95	NC_007110	TA	3	6	49540	49545	50 %	50 %	0 %	0 %	67459845
96	NC_007110	AT	3	6	49546	49551	50 %	50 %	0 %	0 %	67459845
97	NC_007110	TA	3	6	51451	51456	50 %	50 %	0 %	0 %	67459848
98	NC_007110	AC	3	6	51472	51477	50 %	0 %	0 %	50 %	67459848
99	NC_007110	TA	4	8	52095	52102	50 %	50 %	0 %	0 %	67459849
100	NC_007110	AC	3	6	52451	52456	50 %	0 %	0 %	50 %	67459849
101	NC_007110	TC	4	8	54392	54399	0 %	50 %	0 %	50 %	67459850
102	NC_007110	TC	3	6	54665	54670	0 %	50 %	0 %	50 %	67459851
103	NC_007110	TA	3	6	55192	55197	50 %	50 %	0 %	0 %	67459852
104	NC_007110	AT	3	6	55423	55428	50 %	50 %	0 %	0 %	67459852
105	NC_007110	AT	3	6	55978	55983	50 %	50 %	0 %	0 %	67459854
106	NC_007110	AT	3	6	56482	56487	50 %	50 %	0 %	0 %	67459854
107	NC_007110	CT	3	6	56922	56927	0 %	50 %	0 %	50 %	67459855
108	NC_007110	AT	3	6	57031	57036	50 %	50 %	0 %	0 %	67459855
109	NC_007110	AT	3	6	58349	58354	50 %	50 %	0 %	0 %	67459856
110	NC_007110	AT	3	6	59286	59291	50 %	50 %	0 %	0 %	67459858
111	NC_007110	AT	3	6	59391	59396	50 %	50 %	0 %	0 %	67459858
112	NC_007110	AT	3	6	60811	60816	50 %	50 %	0 %	0 %	67459859
113	NC_007110	CT	3	6	61729	61734	0 %	50 %	0 %	50 %	67459861
114	NC_007110	TG	3	6	62081	62086	0 %	50 %	50 %	0 %	67459861

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.