MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia felis URRWXCal2 chromosome

Total Repeats: 1035

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007109	TAACG	2	10	1066	1075	40 %	20 %	20 %	20 %	67458394
2	NC_007109	TTAAT	2	10	1952	1961	40 %	60 %	0 %	0 %	67458395
3	NC_007109	TTTTA	2	10	2641	2650	20 %	80 %	0 %	0 %	67458396
4	NC_007109	ATTTA	2	10	2994	3003	40 %	60 %	0 %	0 %	67458396
5	NC_007109	GGTCA	2	10	4382	4391	20 %	20 %	40 %	20 %	67458397
6	NC_007109	TAAAT	2	10	5091	5100	60 %	40 %	0 %	0 %	67458397
7	NC_007109	ATAAA	2	10	5552	5561	80 %	20 %	0 %	0 %	67458397
8	NC_007109	AGCAG	2	10	13878	13887	40 %	0 %	40 %	20 %	67458404
9	NC_007109	GTTTA	2	10	17545	17554	20 %	60 %	20 %	0 %	67458411
10	NC_007109	CGCTC	2	10	20104	20113	0 %	20 %	20 %	60 %	67458413
11	NC_007109	AGAAC	2	10	26469	26478	60 %	0 %	20 %	20 %	67458415
12	NC_007109	TTACT	2	10	27400	27409	20 %	60 %	0 %	20 %	67458416
13	NC_007109	TAAAT	2	10	31070	31079	60 %	40 %	0 %	0 %	67458419
14	NC_007109	TTTGT	2	10	31526	31535	0 %	80 %	20 %	0 %	67458420
15	NC_007109	AATAA	2	10	32668	32677	80 %	20 %	0 %	0 %	67458422
16	NC_007109	CTCAT	2	10	33423	33432	20 %	40 %	0 %	40 %	67458424
17	NC_007109	TTGTT	2	10	35379	35388	0 %	80 %	20 %	0 %	67458426
18	NC_007109	TTTGC	2	10	37758	37767	0 %	60 %	20 %	20 %	67458427
19	NC_007109	GTTAA	2	10	38462	38471	40 %	40 %	20 %	0 %	67458428
20	NC_007109	TGAGT	2	10	38492	38501	20 %	40 %	40 %	0 %	67458428
21	NC_007109	TGTCT	2	10	38866	38875	0 %	60 %	20 %	20 %	67458429
22	NC_007109	CTTTT	2	10	43414	43423	0 %	80 %	0 %	20 %	67458433
23	NC_007109	TTATT	2	10	43845	43854	20 %	80 %	0 %	0 %	67458433
24	NC_007109	TTTTA	2	10	43954	43963	20 %	80 %	0 %	0 %	67458433
25	NC_007109	TTTAT	2	10	45139	45148	20 %	80 %	0 %	0 %	67458435
26	NC_007109	TAAAG	2	10	48066	48075	60 %	20 %	20 %	0 %	67458438
27	NC_007109	AAAGT	2	10	48613	48622	60 %	20 %	20 %	0 %	67458438
28	NC_007109	ATCCA	2	10	53105	53114	40 %	20 %	0 %	40 %	67458444
29	NC_007109	ACAGT	2	10	53247	53256	40 %	20 %	20 %	20 %	67458444
30	NC_007109	TTGAT	2	10	55316	55325	20 %	60 %	20 %	0 %	67458445
31	NC_007109	ATTTA	2	10	57196	57205	40 %	60 %	0 %	0 %	67458447
32	NC_007109	TTAAT	2	10	59624	59633	40 %	60 %	0 %	0 %	67458450
33	NC_007109	AACCG	2	10	61041	61050	40 %	0 %	20 %	40 %	67458451
34	NC_007109	TTAGT	2	10	62536	62545	20 %	60 %	20 %	0 %	67458453
35	NC_007109	TAATA	2	10	67883	67892	60 %	40 %	0 %	0 %	67458458
36	NC_007109	ATATT	2	10	68588	68597	40 %	60 %	0 %	0 %	67458459
37	NC_007109	ATTAT	2	10	68836	68845	40 %	60 %	0 %	0 %	67458459
38	NC_007109	AAAAC	2	10	76638	76647	80 %	0 %	0 %	20 %	67458462
39	NC_007109	ATAAA	2	10	79606	79615	80 %	20 %	0 %	0 %	67458464
40	NC_007109	TAAAA	2	10	81924	81933	80 %	20 %	0 %	0 %	67458467
41	NC_007109	AAAAC	2	10	82620	82629	80 %	0 %	0 %	20 %	67458467
42	NC_007109	TTTAA	2	10	82696	82705	40 %	60 %	0 %	0 %	67458467
43	NC_007109	TGAAA	2	10	84146	84155	60 %	20 %	20 %	0 %	67458469
44	NC_007109	CAAGA	2	10	84752	84761	60 %	0 %	20 %	20 %	67458470
45	NC_007109	AGGAC	2	10	86144	86153	40 %	0 %	40 %	20 %	67458471
46	NC_007109	CTTGT	2	10	87344	87353	0 %	60 %	20 %	20 %	67458472
47	NC_007109	ATGAT	2	10	88261	88270	40 %	40 %	20 %	0 %	67458473
48	NC_007109	GGCTT	2	10	88597	88606	0 %	40 %	40 %	20 %	67458474
49	NC_007109	AAATC	2	10	90072	90081	60 %	20 %	0 %	20 %	67458477
50	NC_007109	TTAAC	2	10	91209	91218	40 %	40 %	0 %	20 %	67458478
51	NC_007109	TATAA	2	10	91301	91310	60 %	40 %	0 %	0 %	67458478
52	NC_007109	TTATA	2	10	91675	91684	40 %	60 %	0 %	0 %	67458479
53	NC_007109	TTTTA	2	10	93276	93285	20 %	80 %	0 %	0 %	67458480
54	NC_007109	GCTTT	2	10	94909	94918	0 %	60 %	20 %	20 %	67458481
55	NC_007109	TATGT	2	10	95559	95568	20 %	60 %	20 %	0 %	67458481
56	NC_007109	AGAAA	2	10	97475	97484	80 %	0 %	20 %	0 %	67458481
57	NC_007109	AGAAA	2	10	97629	97638	80 %	0 %	20 %	0 %	67458481
58	NC_007109	GTTTT	2	10	98160	98169	0 %	80 %	20 %	0 %	67458482
59	NC_007109	CTTGG	2	10	98977	98986	0 %	40 %	40 %	20 %	67458482
60	NC_007109	ATTGC	2	10	102490	102499	20 %	40 %	20 %	20 %	67458483
61	NC_007109	ACAAG	2	10	102757	102766	60 %	0 %	20 %	20 %	67458483
62	NC_007109	AGTTT	2	10	103150	103159	20 %	60 %	20 %	0 %	67458484
63	NC_007109	TTAGT	2	10	103673	103682	20 %	60 %	20 %	0 %	67458484
64	NC_007109	ATATA	2	10	104576	104585	60 %	40 %	0 %	0 %	67458484
65	NC_007109	TATTT	2	10	107172	107181	20 %	80 %	0 %	0 %	67458485
66	NC_007109	CAAAG	2	10	107564	107573	60 %	0 %	20 %	20 %	67458485
67	NC_007109	TAATT	2	10	110110	110119	40 %	60 %	0 %	0 %	67458487
68	NC_007109	AAAGA	2	10	110636	110645	80 %	0 %	20 %	0 %	67458488
69	NC_007109	TCATT	2	10	111751	111760	20 %	60 %	0 %	20 %	67458489
70	NC_007109	ATCCG	2	10	117149	117158	20 %	20 %	20 %	40 %	67458496
71	NC_007109	CCCAT	2	10	119438	119447	20 %	20 %	0 %	60 %	67458499
72	NC_007109	TGCGG	2	10	122337	122346	0 %	20 %	60 %	20 %	67458501
73	NC_007109	CTTGA	2	10	128026	128035	20 %	40 %	20 %	20 %	67458504
74	NC_007109	CTTGA	2	10	128134	128143	20 %	40 %	20 %	20 %	67458504
75	NC_007109	TAATT	2	10	133636	133645	40 %	60 %	0 %	0 %	67458508
76	NC_007109	TTTTA	2	10	134340	134349	20 %	80 %	0 %	0 %	67458508
77	NC_007109	CATTG	2	10	134804	134813	20 %	40 %	20 %	20 %	67458509
78	NC_007109	ATTTA	2	10	135432	135441	40 %	60 %	0 %	0 %	67458510
79	NC_007109	TCTAC	2	10	137156	137165	20 %	40 %	0 %	40 %	67458511
80	NC_007109	TATTG	2	10	138086	138095	20 %	60 %	20 %	0 %	67458512
81	NC_007109	TAAGC	2	10	138450	138459	40 %	20 %	20 %	20 %	67458513
82	NC_007109	AAATA	2	10	139618	139627	80 %	20 %	0 %	0 %	67458514
83	NC_007109	CAACC	2	10	139995	140004	40 %	0 %	0 %	60 %	67458514
84	NC_007109	TCTTT	2	10	140205	140214	0 %	80 %	0 %	20 %	67458514
85	NC_007109	TAAAT	2	10	140982	140991	60 %	40 %	0 %	0 %	67458514
86	NC_007109	CAGAT	2	10	142099	142108	40 %	20 %	20 %	20 %	67458515
87	NC_007109	CCGCA	2	10	143058	143067	20 %	0 %	20 %	60 %	67458516
88	NC_007109	AAATC	2	10	143302	143311	60 %	20 %	0 %	20 %	67458516
89	NC_007109	CTAAT	2	10	144922	144931	40 %	40 %	0 %	20 %	67458519
90	NC_007109	AGCAG	2	10	146110	146119	40 %	0 %	40 %	20 %	67458520
91	NC_007109	TAATA	2	10	147485	147494	60 %	40 %	0 %	0 %	67458523
92	NC_007109	GATTG	2	10	148561	148570	20 %	40 %	40 %	0 %	67458523
93	NC_007109	ATTAA	2	10	149128	149137	60 %	40 %	0 %	0 %	67458523
94	NC_007109	TTTAA	2	10	149339	149348	40 %	60 %	0 %	0 %	67458524
95	NC_007109	TAAGC	2	10	150067	150076	40 %	20 %	20 %	20 %	67458524
96	NC_007109	TAAAG	2	10	150255	150264	60 %	20 %	20 %	0 %	67458524
97	NC_007109	TAACA	2	10	150412	150421	60 %	20 %	0 %	20 %	67458524
98	NC_007109	TTTGT	2	10	151045	151054	0 %	80 %	20 %	0 %	67458525
99	NC_007109	TTTTA	2	10	153177	153186	20 %	80 %	0 %	0 %	67458528
100	NC_007109	AGGTA	2	10	157456	157465	40 %	20 %	40 %	0 %	67458532
101	NC_007109	AAAGC	2	10	157883	157892	60 %	0 %	20 %	20 %	67458532
102	NC_007109	AATTT	2	10	159052	159061	40 %	60 %	0 %	0 %	67458533
103	NC_007109	AACCG	2	10	159141	159150	40 %	0 %	20 %	40 %	67458533
104	NC_007109	TCATA	2	10	166476	166485	40 %	40 %	0 %	20 %	67458542
105	NC_007109	ATCAA	2	10	166670	166679	60 %	20 %	0 %	20 %	67458542
106	NC_007109	TGCAG	2	10	166920	166929	20 %	20 %	40 %	20 %	67458542
107	NC_007109	TAATG	2	10	168673	168682	40 %	40 %	20 %	0 %	67458543
108	NC_007109	AGAAA	2	10	169706	169715	80 %	0 %	20 %	0 %	67458544
109	NC_007109	GCAGG	2	10	170365	170374	20 %	0 %	60 %	20 %	67458545
110	NC_007109	CTTTA	2	10	170883	170892	20 %	60 %	0 %	20 %	67458546
111	NC_007109	ATTTC	2	10	170901	170910	20 %	60 %	0 %	20 %	67458546
112	NC_007109	TCAGA	2	10	172884	172893	40 %	20 %	20 %	20 %	67458548
113	NC_007109	GAAAC	2	10	173442	173451	60 %	0 %	20 %	20 %	67458548
114	NC_007109	AGAAA	2	10	177502	177511	80 %	0 %	20 %	0 %	67458553
115	NC_007109	TTAAT	2	10	178731	178740	40 %	60 %	0 %	0 %	67458554
116	NC_007109	ATTTT	2	10	178931	178940	20 %	80 %	0 %	0 %	67458554
117	NC_007109	TAGAA	2	10	179023	179032	60 %	20 %	20 %	0 %	67458554
118	NC_007109	GGCAA	2	10	179532	179541	40 %	0 %	40 %	20 %	67458555
119	NC_007109	TGAAA	2	10	180318	180327	60 %	20 %	20 %	0 %	67458555
120	NC_007109	CCATA	2	10	180806	180815	40 %	20 %	0 %	40 %	67458556
121	NC_007109	AATTA	2	10	187366	187375	60 %	40 %	0 %	0 %	67458559
122	NC_007109	AAAAT	2	10	189110	189119	80 %	20 %	0 %	0 %	67458562
123	NC_007109	ACTTA	2	10	189906	189915	40 %	40 %	0 %	20 %	67458563
124	NC_007109	TATCA	2	10	193656	193665	40 %	40 %	0 %	20 %	67458566
125	NC_007109	AATTT	2	10	195076	195085	40 %	60 %	0 %	0 %	67458566
126	NC_007109	ATTTC	2	10	195184	195193	20 %	60 %	0 %	20 %	67458566
127	NC_007109	ACCAA	2	10	195853	195862	60 %	0 %	0 %	40 %	67458567
128	NC_007109	AGATA	2	10	201253	201262	60 %	20 %	20 %	0 %	67458574
129	NC_007109	ATTTT	2	10	201933	201942	20 %	80 %	0 %	0 %	67458576
130	NC_007109	ATTTT	2	10	202697	202706	20 %	80 %	0 %	0 %	67458577
131	NC_007109	CTTCT	2	10	203623	203632	0 %	60 %	0 %	40 %	67458578
132	NC_007109	TTGCA	2	10	209117	209126	20 %	40 %	20 %	20 %	67458584
133	NC_007109	ATATA	2	10	210768	210777	60 %	40 %	0 %	0 %	67458585
134	NC_007109	AGAAA	2	10	212671	212680	80 %	0 %	20 %	0 %	67458587
135	NC_007109	TGTAG	2	10	213326	213335	20 %	40 %	40 %	0 %	67458588
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