MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia felis URRWXCal2 chromosome

Total Repeats: 31425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007109	ATA	2	6	23492	23497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458414
502	NC_007109	AGAAAG	2	12	23501	23512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458414
503	NC_007109	TAG	2	6	23522	23527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458414
504	NC_007109	GTT	2	6	23551	23556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67458414
505	NC_007109	ATA	3	9	23633	23641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458414
506	NC_007109	TGA	2	6	23667	23672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458414
507	NC_007109	AGAA	2	8	23677	23684	75 %	0 %	25 %	0 %	67458414
508	NC_007109	A	6	6	23701	23706	100 %	0 %	0 %	0 %	67458414
509	NC_007109	ATC	2	6	23814	23819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458414
510	NC_007109	AGCA	2	8	23828	23835	50 %	0 %	25 %	25 %	67458414
511	NC_007109	TCT	2	6	23863	23868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67458414
512	NC_007109	ATC	2	6	24030	24035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458414
513	NC_007109	AGCA	2	8	24044	24051	50 %	0 %	25 %	25 %	67458414
514	NC_007109	TCT	2	6	24079	24084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67458414
515	NC_007109	ATA	2	6	24200	24205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458414
516	NC_007109	TAG	2	6	24288	24293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458414
517	NC_007109	AGA	2	6	24416	24421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458414
518	NC_007109	AGAAGT	2	12	24435	24446	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	67458414
519	NC_007109	TCA	2	6	24484	24489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458414
520	NC_007109	ATG	2	6	24497	24502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458414
521	NC_007109	GAA	2	6	24511	24516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458414
522	NC_007109	GAA	2	6	24670	24675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458414
523	NC_007109	AAG	2	6	24677	24682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458414
524	NC_007109	GCATTA	2	12	24763	24774	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	67458414
525	NC_007109	AGAA	2	8	24824	24831	75 %	0 %	25 %	0 %	67458414
526	NC_007109	GAA	2	6	24886	24891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458414
527	NC_007109	A	8	8	24890	24897	100 %	0 %	0 %	0 %	67458414
528	NC_007109	A	6	6	24918	24923	100 %	0 %	0 %	0 %	67458414
529	NC_007109	GTT	2	6	24949	24954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67458414
530	NC_007109	ATA	2	6	24968	24973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458414
531	NC_007109	TAA	2	6	25011	25016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458414
532	NC_007109	TGA	2	6	25038	25043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458414
533	NC_007109	AGA	2	6	25044	25049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458414
534	NC_007109	TAA	2	6	25095	25100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458414
535	NC_007109	CTA	2	6	25151	25156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458414
536	NC_007109	AAT	2	6	25180	25185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458414
537	NC_007109	TTCA	2	8	25211	25218	25 %	50 %	0 %	25 %	67458414
538	NC_007109	ATTTAA	2	12	25221	25232	50 %	50 %	0 %	0 %	67458414
539	NC_007109	AAT	2	6	25243	25248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458414
540	NC_007109	TTA	2	6	25349	25354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458414
541	NC_007109	AATTAT	2	12	25444	25455	50 %	50 %	0 %	0 %	67458414
542	NC_007109	TTA	2	6	25475	25480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458414
543	NC_007109	TA	3	6	25523	25528	50 %	50 %	0 %	0 %	67458414
544	NC_007109	AAT	2	6	25576	25581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458414
545	NC_007109	AT	3	6	25580	25585	50 %	50 %	0 %	0 %	67458414
546	NC_007109	TAA	2	6	25641	25646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458414
547	NC_007109	AATA	2	8	25704	25711	75 %	25 %	0 %	0 %	67458414
548	NC_007109	GTT	2	6	25714	25719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67458414
549	NC_007109	AAC	2	6	25763	25768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67458414
550	NC_007109	TAT	2	6	25797	25802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458414
551	NC_007109	GTA	2	6	25805	25810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458414
552	NC_007109	TAC	2	6	25818	25823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458414
553	NC_007109	ATT	2	6	25841	25846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458414
554	NC_007109	TAAA	2	8	25850	25857	75 %	25 %	0 %	0 %	67458414
555	NC_007109	A	6	6	26421	26426	100 %	0 %	0 %	0 %	67458415
556	NC_007109	AGAAC	2	10	26469	26478	60 %	0 %	20 %	20 %	67458415
557	NC_007109	GCT	2	6	26545	26550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67458415
558	NC_007109	ATA	2	6	26561	26566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458415
559	NC_007109	A	6	6	26624	26629	100 %	0 %	0 %	0 %	67458415
560	NC_007109	AAT	2	6	26650	26655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458415
561	NC_007109	TTTA	2	8	26693	26700	25 %	75 %	0 %	0 %	67458415
562	NC_007109	TA	3	6	26712	26717	50 %	50 %	0 %	0 %	67458415
563	NC_007109	TAC	2	6	26906	26911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458416
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565	NC_007109	GCA	3	9	27000	27008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67458416
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570	NC_007109	ATT	2	6	27317	27322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458416
571	NC_007109	ATA	2	6	27357	27362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458416
572	NC_007109	TAAA	2	8	27370	27377	75 %	25 %	0 %	0 %	67458416
573	NC_007109	TTACT	2	10	27400	27409	20 %	60 %	0 %	20 %	67458416
574	NC_007109	GTA	2	6	27580	27585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458416
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592	NC_007109	ATA	2	6	28413	28418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458417
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600	NC_007109	AAAT	2	8	28760	28767	75 %	25 %	0 %	0 %	67458417
601	NC_007109	ATTA	2	8	28788	28795	50 %	50 %	0 %	0 %	67458417
602	NC_007109	GAT	2	6	28812	28817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458417
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609	NC_007109	ATTT	2	8	29143	29150	25 %	75 %	0 %	0 %	67458418
610	NC_007109	ATA	2	6	29211	29216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458418
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613	NC_007109	TTA	2	6	29282	29287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458418
614	NC_007109	TAT	2	6	29299	29304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458418
615	NC_007109	GAG	2	6	29334	29339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	67458418
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617	NC_007109	CAT	2	6	29376	29381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458418
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622	NC_007109	TA	3	6	29614	29619	50 %	50 %	0 %	0 %	67458418
623	NC_007109	CT	3	6	29645	29650	0 %	50 %	0 %	50 %	67458418
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630	NC_007109	ACC	2	6	29878	29883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	67458418
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