MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 megaplasmid

Total Repeats: 6738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006569	GAT	2	6	27	32	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709230
2	NC_006569	GCC	2	6	112	117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709230
3	NC_006569	GGC	2	6	123	128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709230
4	NC_006569	AGG	2	6	158	163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56709230
5	NC_006569	GAC	2	6	184	189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709230
6	NC_006569	GCC	2	6	256	261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709230
7	NC_006569	CGC	2	6	401	406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709230
8	NC_006569	AGG	2	6	464	469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56709230
9	NC_006569	AGG	2	6	494	499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56709230
10	NC_006569	TCG	2	6	563	568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709230
11	NC_006569	GCT	2	6	672	677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709230
12	NC_006569	CGA	2	6	681	686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709230
13	NC_006569	CTG	2	6	784	789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709230
14	NC_006569	AGC	2	6	909	914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708792
15	NC_006569	TCG	2	6	1077	1082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708792
16	NC_006569	CGC	2	6	1189	1194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708792
17	NC_006569	GAA	2	6	1196	1201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56708792
18	NC_006569	TCG	2	6	1320	1325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708792
19	NC_006569	CGC	2	6	1362	1367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708792
20	NC_006569	TGC	2	6	1399	1404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708792
21	NC_006569	GCC	2	6	1470	1475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708792
22	NC_006569	GAT	2	6	1478	1483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708792
23	NC_006569	TGG	2	6	1620	1625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708792
24	NC_006569	TGG	3	9	1630	1638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708792
25	NC_006569	CAT	2	6	1648	1653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708792
26	NC_006569	ATC	2	6	1665	1670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708792
27	NC_006569	GCG	2	6	1692	1697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708792
28	NC_006569	CCG	2	6	1698	1703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708792
29	NC_006569	GCG	2	6	1815	1820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708793
30	NC_006569	GCC	2	6	1837	1842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708793
31	NC_006569	AAG	2	6	1885	1890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56708793
32	NC_006569	GGC	2	6	2037	2042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708793
33	NC_006569	GCC	2	6	2086	2091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708793
34	NC_006569	GCC	2	6	2156	2161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708793
35	NC_006569	TGG	2	6	2177	2182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708793
36	NC_006569	GCC	2	6	2294	2299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708793
37	NC_006569	GTG	2	6	2371	2376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708793
38	NC_006569	GCC	2	6	2402	2407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708793
39	NC_006569	CCG	2	6	2408	2413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708793
40	NC_006569	CTG	2	6	2470	2475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708793
41	NC_006569	ACC	2	6	2584	2589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708793
42	NC_006569	CCG	2	6	2720	2725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708793
43	NC_006569	CGC	2	6	2757	2762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708793
44	NC_006569	TCG	2	6	2795	2800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708793
45	NC_006569	CGG	2	6	2909	2914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708793
46	NC_006569	CGA	2	6	2946	2951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708793
47	NC_006569	CCA	2	6	2985	2990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708793
48	NC_006569	GCC	2	6	3050	3055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708793
49	NC_006569	CGG	2	6	3214	3219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708794
50	NC_006569	CGA	2	6	3228	3233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708794
51	NC_006569	CTG	2	6	3386	3391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708794
52	NC_006569	AGC	2	6	3405	3410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708794
53	NC_006569	ACC	2	6	3561	3566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708794
54	NC_006569	GAT	2	6	3614	3619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708794
55	NC_006569	GCC	2	6	3647	3652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708794
56	NC_006569	CCG	2	6	4205	4210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708795
57	NC_006569	GCC	2	6	4228	4233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708795
58	NC_006569	TTC	2	6	4326	4331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56708795
59	NC_006569	ATC	2	6	4356	4361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708795
60	NC_006569	TCG	2	6	4465	4470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708795
61	NC_006569	GCC	2	6	4518	4523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708795
62	NC_006569	CCG	2	6	4538	4543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708795
63	NC_006569	ATC	2	6	4551	4556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708795
64	NC_006569	GAG	2	6	4567	4572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56708795
65	NC_006569	GCC	2	6	4627	4632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708796
66	NC_006569	ATC	2	6	4735	4740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708796
67	NC_006569	GAC	2	6	4741	4746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708796
68	NC_006569	CGA	2	6	4800	4805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708796
69	NC_006569	TCG	2	6	4856	4861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708796
70	NC_006569	CAC	2	6	5029	5034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708797
71	NC_006569	CAG	2	6	5042	5047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708797
72	NC_006569	GCG	2	6	5104	5109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708797
73	NC_006569	GCG	2	6	5162	5167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708797
74	NC_006569	CTG	2	6	5175	5180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708797
75	NC_006569	CGC	2	6	5213	5218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708797
76	NC_006569	GCC	2	6	5257	5262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708797
77	NC_006569	CGG	2	6	5329	5334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708797
78	NC_006569	GGC	2	6	5358	5363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708797
79	NC_006569	AAG	2	6	5385	5390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56708797
80	NC_006569	CGG	2	6	5470	5475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708797
81	NC_006569	TCA	2	6	5521	5526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708797
82	NC_006569	AGA	2	6	5698	5703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56708797
83	NC_006569	CGC	2	6	5713	5718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708797
84	NC_006569	CCA	3	9	5782	5790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708797
85	NC_006569	ACT	2	6	5941	5946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708797
86	NC_006569	ATC	2	6	5988	5993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708797
87	NC_006569	GCG	2	6	6058	6063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708798
88	NC_006569	CGG	2	6	6102	6107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708798
89	NC_006569	GCT	2	6	6126	6131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708798
90	NC_006569	GCT	2	6	6252	6257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708798
91	NC_006569	GGC	2	6	6276	6281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708798
92	NC_006569	GCT	2	6	6372	6377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708798
93	NC_006569	GTG	2	6	6382	6387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708798
94	NC_006569	GCC	2	6	6452	6457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708799
95	NC_006569	CTG	2	6	6528	6533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708799
96	NC_006569	CGA	2	6	6539	6544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708799
97	NC_006569	GCC	2	6	6627	6632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708799
98	NC_006569	CGC	2	6	6649	6654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708799
99	NC_006569	GCC	2	6	6738	6743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708799
100	NC_006569	CTG	2	6	6798	6803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708799
101	NC_006569	TGA	2	6	6881	6886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708799
102	NC_006569	GGA	2	6	6986	6991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56708800
103	NC_006569	CAG	2	6	7065	7070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708800
104	NC_006569	CCG	2	6	7165	7170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708800
105	NC_006569	CGC	2	6	7273	7278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708800
106	NC_006569	TGC	2	6	7357	7362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708800
107	NC_006569	GCT	2	6	7367	7372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708800
108	NC_006569	GCC	2	6	7379	7384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708800
109	NC_006569	TTC	2	6	7402	7407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56708800
110	NC_006569	GCC	2	6	7429	7434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708800
111	NC_006569	CGA	2	6	7451	7456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708800
112	NC_006569	GGC	2	6	7461	7466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708800
113	NC_006569	GCT	2	6	7475	7480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708800
114	NC_006569	GGT	2	6	7505	7510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708800
115	NC_006569	CGA	2	6	7538	7543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708800
116	NC_006569	GCT	2	6	7573	7578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708800
117	NC_006569	CGC	2	6	7597	7602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708800
118	NC_006569	CGA	2	6	7655	7660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708800
119	NC_006569	GGT	2	6	7727	7732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708800
120	NC_006569	TGA	2	6	7801	7806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708800
121	NC_006569	CGC	2	6	7814	7819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708800
122	NC_006569	ATG	2	6	7859	7864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708801
123	NC_006569	GGC	2	6	7888	7893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708801
124	NC_006569	GGC	2	6	7987	7992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708801
125	NC_006569	TTG	2	6	8046	8051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56708801
126	NC_006569	TGG	2	6	8061	8066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708801
127	NC_006569	GGC	3	9	8155	8163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708801
128	NC_006569	TGC	2	6	8193	8198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708801
129	NC_006569	GCT	3	9	8299	8307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708801
130	NC_006569	GGC	2	6	8347	8352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708801
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132	NC_006569	GGT	2	6	8491	8496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708801
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