MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 megaplasmid

Total Repeats: 9642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_006569	GCC	2	6	210369	210374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708983
4002	NC_006569	CAG	2	6	210426	210431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708983
4003	NC_006569	CGCGC	2	10	210434	210443	0 %	0 %	40 %	60 %	56708983
4004	NC_006569	GGC	2	6	210473	210478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708983
4005	NC_006569	GCC	2	6	210486	210491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708983
4006	NC_006569	TGA	2	6	210494	210499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708983
4007	NC_006569	GCC	2	6	210511	210516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708983
4008	NC_006569	CCAG	2	8	210521	210528	25 %	0 %	25 %	50 %	56708983
4009	NC_006569	AGAT	2	8	210643	210650	50 %	25 %	25 %	0 %	56708983
4010	NC_006569	CCCGC	2	10	210653	210662	0 %	0 %	20 %	80 %	56708983
4011	NC_006569	CGT	2	6	210716	210721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708983
4012	NC_006569	ATC	2	6	210723	210728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708983
4013	NC_006569	AAG	2	6	210834	210839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56708983
4014	NC_006569	GCA	2	6	210857	210862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708983
4015	NC_006569	CG	3	6	210934	210939	0 %	0 %	50 %	50 %	56708983
4016	NC_006569	CG	3	6	210994	210999	0 %	0 %	50 %	50 %	56708983
4017	NC_006569	CCG	2	6	211024	211029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708983
4018	NC_006569	CGC	2	6	211061	211066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708983
4019	NC_006569	CG	3	6	211115	211120	0 %	0 %	50 %	50 %	56708983
4020	NC_006569	GCC	2	6	211178	211183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708983
4021	NC_006569	TCTT	2	8	211240	211247	0 %	75 %	0 %	25 %	56708983
4022	NC_006569	CAG	2	6	211275	211280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708983
4023	NC_006569	GGCG	2	8	211290	211297	0 %	0 %	75 %	25 %	56708983
4024	NC_006569	GCT	2	6	211475	211480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708983
4025	NC_006569	CTG	3	9	211563	211571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708983
4026	NC_006569	TCG	2	6	211591	211596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708983
4027	NC_006569	TTG	2	6	211723	211728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56708984
4028	NC_006569	GCC	2	6	211760	211765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708984
4029	NC_006569	CAG	2	6	211835	211840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708984
4030	NC_006569	TCA	2	6	211887	211892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708984
4031	NC_006569	GGC	2	6	211913	211918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708984
4032	NC_006569	CATGGG	2	12	211963	211974	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56708984
4033	NC_006569	GCC	2	6	211976	211981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708984
4034	NC_006569	CCA	2	6	211999	212004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708984
4035	NC_006569	CGGTG	2	10	212015	212024	0 %	20 %	60 %	20 %	56708984
4036	NC_006569	CCA	2	6	212122	212127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708984
4037	NC_006569	GCT	2	6	212158	212163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708984
4038	NC_006569	CCG	2	6	212224	212229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708984
4039	NC_006569	CTG	2	6	212243	212248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708984
4040	NC_006569	CGC	2	6	212258	212263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708984
4041	NC_006569	AAC	2	6	212324	212329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708984
4042	NC_006569	GCCA	2	8	212428	212435	25 %	0 %	25 %	50 %	56708984
4043	NC_006569	GATCA	2	10	212438	212447	40 %	20 %	20 %	20 %	56708984
4044	NC_006569	CGCC	2	8	212448	212455	0 %	0 %	25 %	75 %	56708984
4045	NC_006569	GC	3	6	212530	212535	0 %	0 %	50 %	50 %	56708984
4046	NC_006569	TTC	2	6	212564	212569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56708984
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4049	NC_006569	A	7	7	212641	212647	100 %	0 %	0 %	0 %	56708984
4050	NC_006569	GGGAG	2	10	212704	212713	20 %	0 %	80 %	0 %	56708984
4051	NC_006569	CTC	2	6	212768	212773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56708985
4052	NC_006569	GTG	2	6	212817	212822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708985
4053	NC_006569	GCC	2	6	212885	212890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708985
4054	NC_006569	TTG	2	6	212976	212981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56708985
4055	NC_006569	GAA	2	6	212993	212998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56708985
4056	NC_006569	GAA	2	6	213002	213007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56708985
4057	NC_006569	TGG	2	6	213052	213057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708985
4058	NC_006569	ATG	2	6	213096	213101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708985
4059	NC_006569	CTT	2	6	213109	213114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56708985
4060	NC_006569	CGAG	2	8	213164	213171	25 %	0 %	50 %	25 %	56708985
4061	NC_006569	CTC	2	6	213224	213229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56708985
4062	NC_006569	GCCC	2	8	213361	213368	0 %	0 %	25 %	75 %	56708985
4063	NC_006569	TCG	2	6	213408	213413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708985
4064	NC_006569	GC	3	6	213512	213517	0 %	0 %	50 %	50 %	56708985
4065	NC_006569	GTG	2	6	213570	213575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708985
4066	NC_006569	GCT	2	6	213607	213612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708985
4067	NC_006569	AT	3	6	213648	213653	50 %	50 %	0 %	0 %	56708985
4068	NC_006569	CAT	2	6	213844	213849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708985
4069	NC_006569	CTT	2	6	213862	213867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56708985
4070	NC_006569	CAG	2	6	213869	213874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708985
4071	NC_006569	GGTT	2	8	213889	213896	0 %	50 %	50 %	0 %	56708985
4072	NC_006569	GCG	2	6	214087	214092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708985
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4074	NC_006569	CCGGG	2	10	214259	214268	0 %	0 %	60 %	40 %	56708985
4075	NC_006569	AAC	2	6	214287	214292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708985
4076	NC_006569	AC	3	6	214291	214296	50 %	0 %	0 %	50 %	56708985
4077	NC_006569	GCCG	2	8	214302	214309	0 %	0 %	50 %	50 %	56708985
4078	NC_006569	CAT	2	6	214340	214345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708985
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4080	NC_006569	CCT	2	6	215003	215008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56708986
4081	NC_006569	GGT	2	6	215045	215050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708986
4082	NC_006569	ATC	2	6	215058	215063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708986
4083	NC_006569	GC	3	6	215072	215077	0 %	0 %	50 %	50 %	56708986
4084	NC_006569	GCG	2	6	215088	215093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708986
4085	NC_006569	GCCC	2	8	215189	215196	0 %	0 %	25 %	75 %	56708986
4086	NC_006569	CGCGC	2	10	215202	215211	0 %	0 %	40 %	60 %	56708986
4087	NC_006569	GCC	2	6	215220	215225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708986
4088	NC_006569	GC	3	6	215226	215231	0 %	0 %	50 %	50 %	56708986
4089	NC_006569	GC	3	6	215290	215295	0 %	0 %	50 %	50 %	56708986
4090	NC_006569	GGCTG	2	10	215296	215305	0 %	20 %	60 %	20 %	56708986
4091	NC_006569	CGG	2	6	215314	215319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708986
4092	NC_006569	CGG	3	9	215323	215331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708986
4093	NC_006569	CCT	2	6	215356	215361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56708986
4094	NC_006569	CTC	2	6	215366	215371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56708986
4095	NC_006569	TGA	2	6	215377	215382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708986
4096	NC_006569	GGCG	2	8	215402	215409	0 %	0 %	75 %	25 %	56708986
4097	NC_006569	GTC	2	6	215413	215418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708986
4098	NC_006569	TGC	2	6	215464	215469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708986
4099	NC_006569	CGG	2	6	215510	215515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708986
4100	NC_006569	TTG	2	6	215596	215601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56708986
4101	NC_006569	CGA	2	6	215765	215770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708986
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4103	NC_006569	GGCCG	2	10	215781	215790	0 %	0 %	60 %	40 %	56708986
4104	NC_006569	CGC	2	6	215829	215834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708986
4105	NC_006569	TCA	2	6	215872	215877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708986
4106	NC_006569	GCG	3	9	215898	215906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708986
4107	NC_006569	GGC	2	6	215966	215971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708986
4108	NC_006569	CGG	2	6	216038	216043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708986
4109	NC_006569	TGC	2	6	216055	216060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708986
4110	NC_006569	CG	3	6	216065	216070	0 %	0 %	50 %	50 %	56708986
4111	NC_006569	CAC	2	6	216119	216124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708986
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4113	NC_006569	CGG	3	9	216166	216174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708986
4114	NC_006569	GC	3	6	216183	216188	0 %	0 %	50 %	50 %	56708986
4115	NC_006569	CG	3	6	216320	216325	0 %	0 %	50 %	50 %	56708987
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4119	NC_006569	GGGT	2	8	216533	216540	0 %	25 %	75 %	0 %	56708987
4120	NC_006569	GC	3	6	216676	216681	0 %	0 %	50 %	50 %	56708987
4121	NC_006569	GCC	2	6	216703	216708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708987
4122	NC_006569	GGC	2	6	216722	216727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708987
4123	NC_006569	TCC	3	9	216747	216755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56708987
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4125	NC_006569	CGC	2	6	216773	216778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708987
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4493	NC_006569	CCGCA	2	10	232689	232698	20 %	0 %	20 %	60 %	56708995
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4495	NC_006569	GC	3	6	232722	232727	0 %	0 %	50 %	50 %	56708995
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4497	NC_006569	GCG	2	6	232759	232764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708995
4498	NC_006569	GCG	2	6	232770	232775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708995
4499	NC_006569	CAGG	2	8	232785	232792	25 %	0 %	50 %	25 %	56708995
4500	NC_006569	GC	3	6	232977	232982	0 %	0 %	50 %	50 %	56708995

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