MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 megaplasmid

Total Repeats: 9642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_006569	ACA	3	9	183188	183196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708952
3502	NC_006569	CCG	2	6	183197	183202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708952
3503	NC_006569	CAA	2	6	183366	183371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708952
3504	NC_006569	GGCT	2	8	183411	183418	0 %	25 %	50 %	25 %	56708952
3505	NC_006569	TGC	2	6	183437	183442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708952
3506	NC_006569	GCC	2	6	183571	183576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708952
3507	NC_006569	TCA	2	6	183641	183646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708952
3508	NC_006569	CAT	2	6	183651	183656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708952
3509	NC_006569	CCGG	2	8	183682	183689	0 %	0 %	50 %	50 %	56708952
3510	NC_006569	GC	3	6	183734	183739	0 %	0 %	50 %	50 %	56708952
3511	NC_006569	GTC	2	6	183745	183750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708952
3512	NC_006569	GAG	2	6	183766	183771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56708952
3513	NC_006569	ACA	2	6	183806	183811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708952
3514	NC_006569	GGC	2	6	183874	183879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708952
3515	NC_006569	TGAC	2	8	184037	184044	25 %	25 %	25 %	25 %	56708953
3516	NC_006569	AGA	2	6	184055	184060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56708953
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3518	NC_006569	CGC	2	6	184116	184121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708953
3519	NC_006569	CCGG	2	8	184125	184132	0 %	0 %	50 %	50 %	56708953
3520	NC_006569	CGG	2	6	184335	184340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708953
3521	NC_006569	TGGCG	2	10	184408	184417	0 %	20 %	60 %	20 %	56708953
3522	NC_006569	CTGG	2	8	184422	184429	0 %	25 %	50 %	25 %	56708953
3523	NC_006569	GAG	2	6	184435	184440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56708953
3524	NC_006569	GCTGG	2	10	184530	184539	0 %	20 %	60 %	20 %	56708953
3525	NC_006569	TGC	2	6	184541	184546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708953
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3530	NC_006569	CGG	2	6	184800	184805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708953
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3533	NC_006569	CTT	2	6	184836	184841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56708953
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3540	NC_006569	CGT	2	6	185097	185102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708953
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3542	NC_006569	TGC	2	6	185150	185155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708953
3543	NC_006569	TGG	2	6	185216	185221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708953
3544	NC_006569	GC	3	6	185293	185298	0 %	0 %	50 %	50 %	56708953
3545	NC_006569	TGT	2	6	185346	185351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56708953
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3551	NC_006569	TCA	2	6	185675	185680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708953
3552	NC_006569	GGGC	2	8	185717	185724	0 %	0 %	75 %	25 %	56708953
3553	NC_006569	CAT	2	6	185745	185750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708953
3554	NC_006569	GCC	2	6	185793	185798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708953
3555	NC_006569	GCCA	2	8	185803	185810	25 %	0 %	25 %	50 %	56708953
3556	NC_006569	TTA	2	6	185823	185828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56708953
3557	NC_006569	CGT	2	6	185832	185837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708953
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3559	NC_006569	GCC	2	6	185881	185886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708953
3560	NC_006569	GCTGGG	2	12	185931	185942	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	56708953
3561	NC_006569	CTGT	2	8	186064	186071	0 %	50 %	25 %	25 %	56708953
3562	NC_006569	CTGG	2	8	186087	186094	0 %	25 %	50 %	25 %	56708953
3563	NC_006569	TTC	2	6	186119	186124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56708953
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3565	NC_006569	CGC	2	6	186189	186194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708953
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3568	NC_006569	GGTC	2	8	186405	186412	0 %	25 %	50 %	25 %	56708954
3569	NC_006569	GAA	2	6	186439	186444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56708954
3570	NC_006569	ATG	2	6	186455	186460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708954
3571	NC_006569	GC	3	6	186559	186564	0 %	0 %	50 %	50 %	56708954
3572	NC_006569	CAG	2	6	186570	186575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708954
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3574	NC_006569	CGC	2	6	186760	186765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708954
3575	NC_006569	GC	3	6	186772	186777	0 %	0 %	50 %	50 %	56708954
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3581	NC_006569	CGC	2	6	187204	187209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708954
3582	NC_006569	CAA	2	6	187213	187218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708954
3583	NC_006569	CGG	2	6	187220	187225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708954
3584	NC_006569	ATG	2	6	187397	187402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708954
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3587	NC_006569	CG	3	6	187728	187733	0 %	0 %	50 %	50 %	56708955
3588	NC_006569	GCG	2	6	187802	187807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708955
3589	NC_006569	GC	3	6	187814	187819	0 %	0 %	50 %	50 %	56708955
3590	NC_006569	GAC	2	6	187999	188004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708955
3591	NC_006569	CTGA	2	8	188006	188013	25 %	25 %	25 %	25 %	56708955
3592	NC_006569	GACA	2	8	188078	188085	50 %	0 %	25 %	25 %	56708955
3593	NC_006569	CGC	2	6	188102	188107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708955
3594	NC_006569	GATG	2	8	188173	188180	25 %	25 %	50 %	0 %	56708955
3595	NC_006569	CCG	2	6	188193	188198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708955
3596	NC_006569	GGCG	2	8	188289	188296	0 %	0 %	75 %	25 %	56708955
3597	NC_006569	CGG	2	6	188404	188409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708956
3598	NC_006569	TGC	2	6	188451	188456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708956
3599	NC_006569	TGTTC	2	10	188502	188511	0 %	60 %	20 %	20 %	56708956
3600	NC_006569	AGC	2	6	188612	188617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708956
3601	NC_006569	CAA	2	6	188698	188703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708956
3602	NC_006569	CG	3	6	188730	188735	0 %	0 %	50 %	50 %	56708956
3603	NC_006569	GGCG	2	8	188859	188866	0 %	0 %	75 %	25 %	56708956
3604	NC_006569	TCA	2	6	188904	188909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708956
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3606	NC_006569	GCG	2	6	189039	189044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708957
3607	NC_006569	TGG	2	6	189116	189121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708957
3608	NC_006569	CGC	2	6	189224	189229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708957
3609	NC_006569	GGA	2	6	189243	189248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56708957
3610	NC_006569	GCC	2	6	189333	189338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708957
3611	NC_006569	GAT	2	6	189357	189362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708957
3612	NC_006569	GGT	2	6	189431	189436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708957
3613	NC_006569	GAA	2	6	189450	189455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56708957
3614	NC_006569	GC	3	6	189466	189471	0 %	0 %	50 %	50 %	56708957
3615	NC_006569	GCG	2	6	189625	189630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708957
3616	NC_006569	ATG	2	6	189637	189642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708957
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3618	NC_006569	CGT	2	6	189695	189700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708957
3619	NC_006569	AC	3	6	189930	189935	50 %	0 %	0 %	50 %	56708958
3620	NC_006569	TGCG	2	8	189936	189943	0 %	25 %	50 %	25 %	56708958
3621	NC_006569	CAG	2	6	190069	190074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708959
3622	NC_006569	CTGAC	2	10	190091	190100	20 %	20 %	20 %	40 %	56708959
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3993	NC_006569	GC	3	6	209849	209854	0 %	0 %	50 %	50 %	56708982
3994	NC_006569	TCG	2	6	209969	209974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708982
3995	NC_006569	GCC	2	6	210040	210045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708982
3996	NC_006569	AGC	2	6	210059	210064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708982
3997	NC_006569	TTG	2	6	210147	210152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56708983
3998	NC_006569	CCG	2	6	210206	210211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708983
3999	NC_006569	GTC	2	6	210231	210236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708983
4000	NC_006569	CCG	3	9	210305	210313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708983

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