MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 megaplasmid

Total Repeats: 9642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_006569	AGG	2	6	158668	158673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56708933
3002	NC_006569	CTG	2	6	158685	158690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708933
3003	NC_006569	GCA	2	6	158747	158752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708933
3004	NC_006569	GGC	2	6	158777	158782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708933
3005	NC_006569	TCA	2	6	158806	158811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708933
3006	NC_006569	CGC	2	6	158894	158899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708933
3007	NC_006569	GC	3	6	158912	158917	0 %	0 %	50 %	50 %	56708933
3008	NC_006569	CGC	2	6	158921	158926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708933
3009	NC_006569	CAG	2	6	159125	159130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708934
3010	NC_006569	GCA	2	6	159132	159137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708934
3011	NC_006569	GC	3	6	159178	159183	0 %	0 %	50 %	50 %	56708934
3012	NC_006569	CGG	3	9	159235	159243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708934
3013	NC_006569	GC	4	8	159262	159269	0 %	0 %	50 %	50 %	56708934
3014	NC_006569	GC	3	6	159446	159451	0 %	0 %	50 %	50 %	56708934
3015	NC_006569	ACC	2	6	159543	159548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708934
3016	NC_006569	GCCAGC	2	12	159576	159587	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	56708934
3017	NC_006569	GCG	2	6	159588	159593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708934
3018	NC_006569	CCG	2	6	159610	159615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708934
3019	NC_006569	GGGTG	2	10	159645	159654	0 %	20 %	80 %	0 %	56708934
3020	NC_006569	GC	3	6	159660	159665	0 %	0 %	50 %	50 %	56708934
3021	NC_006569	CAAGC	2	10	159668	159677	40 %	0 %	20 %	40 %	56708934
3022	NC_006569	CGCCAG	2	12	159680	159691	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	56708934
3023	NC_006569	CAA	2	6	159715	159720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708934
3024	NC_006569	GC	3	6	159775	159780	0 %	0 %	50 %	50 %	56708934
3025	NC_006569	CCA	2	6	159783	159788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708934
3026	NC_006569	AGC	2	6	159816	159821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708934
3027	NC_006569	GGT	2	6	159878	159883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708934
3028	NC_006569	GAG	2	6	159905	159910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56708934
3029	NC_006569	CAGC	2	8	159949	159956	25 %	0 %	25 %	50 %	56708934
3030	NC_006569	CGC	2	6	159968	159973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708934
3031	NC_006569	CAGCGC	2	12	159983	159994	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	56708934
3032	NC_006569	GCC	2	6	160006	160011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708934
3033	NC_006569	GGC	2	6	160070	160075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708934
3034	NC_006569	GCG	2	6	160092	160097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708934
3035	NC_006569	GCG	2	6	160135	160140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708934
3036	NC_006569	TGA	2	6	160316	160321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708935
3037	NC_006569	TCG	2	6	160334	160339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708935
3038	NC_006569	GA	3	6	160367	160372	50 %	0 %	50 %	0 %	56708935
3039	NC_006569	GCCACC	2	12	160435	160446	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	56708935
3040	NC_006569	GCCA	2	8	160514	160521	25 %	0 %	25 %	50 %	56708935
3041	NC_006569	GCC	2	6	160527	160532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708935
3042	NC_006569	GAG	2	6	160555	160560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56708935
3043	NC_006569	GC	3	6	160620	160625	0 %	0 %	50 %	50 %	56708935
3044	NC_006569	GCT	2	6	160665	160670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708935
3045	NC_006569	GGC	2	6	160687	160692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708935
3046	NC_006569	TCA	2	6	160766	160771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708935
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3048	NC_006569	CGT	2	6	160797	160802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708935
3049	NC_006569	GCA	2	6	160922	160927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708935
3050	NC_006569	CTTGC	2	10	160936	160945	0 %	40 %	20 %	40 %	56708935
3051	NC_006569	GC	4	8	160971	160978	0 %	0 %	50 %	50 %	56708935
3052	NC_006569	GCC	2	6	161033	161038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708935
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3054	NC_006569	CAC	2	6	161062	161067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708935
3055	NC_006569	CTG	2	6	161071	161076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708935
3056	NC_006569	CGG	2	6	161163	161168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708935
3057	NC_006569	GTG	2	6	161212	161217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708935
3058	NC_006569	CCG	2	6	161218	161223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708935
3059	NC_006569	CGC	2	6	161344	161349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708935
3060	NC_006569	GC	3	6	161357	161362	0 %	0 %	50 %	50 %	56708935
3061	NC_006569	GCCT	2	8	161383	161390	0 %	25 %	25 %	50 %	56708935
3062	NC_006569	CCA	2	6	161394	161399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708935
3063	NC_006569	GC	3	6	161457	161462	0 %	0 %	50 %	50 %	56708935
3064	NC_006569	GGT	2	6	161469	161474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708935
3065	NC_006569	ACG	2	6	161576	161581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708935
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3068	NC_006569	CGC	2	6	161908	161913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708936
3069	NC_006569	ATC	2	6	161954	161959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708936
3070	NC_006569	CTG	2	6	161969	161974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708936
3071	NC_006569	CTG	2	6	161986	161991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708936
3072	NC_006569	CAG	2	6	162037	162042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708936
3073	NC_006569	TGGT	2	8	162098	162105	0 %	50 %	50 %	0 %	56708936
3074	NC_006569	CGG	2	6	162159	162164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708936
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3076	NC_006569	CGCGA	2	10	162214	162223	20 %	0 %	40 %	40 %	56708936
3077	NC_006569	ATC	2	6	162236	162241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708936
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3080	NC_006569	AACCGG	2	12	162283	162294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708936
3081	NC_006569	ACG	2	6	162308	162313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708936
3082	NC_006569	GC	4	8	162321	162328	0 %	0 %	50 %	50 %	56708936
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3085	NC_006569	CAG	2	6	162427	162432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708936
3086	NC_006569	GAT	2	6	162555	162560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708936
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3089	NC_006569	CAG	2	6	162619	162624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708936
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3092	NC_006569	AG	3	6	162676	162681	50 %	0 %	50 %	0 %	56708936
3093	NC_006569	GAT	2	6	162795	162800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708937
3094	NC_006569	CCTG	2	8	162825	162832	0 %	25 %	25 %	50 %	56708937
3095	NC_006569	GCC	2	6	162844	162849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708937
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3098	NC_006569	AG	3	6	162885	162890	50 %	0 %	50 %	0 %	56708937
3099	NC_006569	GC	3	6	162936	162941	0 %	0 %	50 %	50 %	56708937
3100	NC_006569	GGC	2	6	162951	162956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708937
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3103	NC_006569	CTGCCG	2	12	163111	163122	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	56708937
3104	NC_006569	GGA	2	6	163128	163133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56708937
3105	NC_006569	GC	3	6	163196	163201	0 %	0 %	50 %	50 %	56708937
3106	NC_006569	GCG	2	6	163293	163298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708937
3107	NC_006569	GC	3	6	163301	163306	0 %	0 %	50 %	50 %	56708937
3108	NC_006569	CGC	2	6	163374	163379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708937
3109	NC_006569	GC	3	6	163579	163584	0 %	0 %	50 %	50 %	56708938
3110	NC_006569	CGC	2	6	163614	163619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708938
3111	NC_006569	GGC	2	6	163670	163675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708938
3112	NC_006569	CGT	2	6	163794	163799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708938
3113	NC_006569	CGGG	2	8	163813	163820	0 %	0 %	75 %	25 %	56708938
3114	NC_006569	CAG	2	6	163835	163840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708938
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3119	NC_006569	ACC	2	6	163970	163975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708938
3120	NC_006569	GCT	2	6	164112	164117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708938
3121	NC_006569	CGC	2	6	164133	164138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708938
3122	NC_006569	GGT	2	6	164161	164166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708938
3123	NC_006569	TGA	2	6	164179	164184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708938
3124	NC_006569	CGG	2	6	164220	164225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708938
3125	NC_006569	CGCAC	2	10	164276	164285	20 %	0 %	20 %	60 %	56708938
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3239	NC_006569	GTC	2	6	169885	169890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708941
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3243	NC_006569	CGA	2	6	170038	170043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708941
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3245	NC_006569	CAC	2	6	170173	170178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708941
3246	NC_006569	CGA	2	6	170238	170243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708941
3247	NC_006569	GGC	2	6	170306	170311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708941
3248	NC_006569	CAC	2	6	170341	170346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708941
3249	NC_006569	GTC	2	6	170365	170370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708941
3250	NC_006569	GAT	2	6	170392	170397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708941
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3280	NC_006569	GGCT	2	8	171965	171972	0 %	25 %	50 %	25 %	56708942
3281	NC_006569	TGC	2	6	172029	172034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708942
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3284	NC_006569	CGG	2	6	172260	172265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708942
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3332	NC_006569	GTC	2	6	174867	174872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708944
3333	NC_006569	GCCC	2	8	174893	174900	0 %	0 %	25 %	75 %	56708944
3334	NC_006569	CGG	2	6	174905	174910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708944
3335	NC_006569	GCG	2	6	174932	174937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708944
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3337	NC_006569	ACTGG	2	10	175100	175109	20 %	20 %	40 %	20 %	56708945
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3342	NC_006569	TGC	2	6	175264	175269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708945
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3350	NC_006569	GC	4	8	175639	175646	0 %	0 %	50 %	50 %	56708945
3351	NC_006569	CCG	2	6	175671	175676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708945
3352	NC_006569	CGCGC	2	10	175712	175721	0 %	0 %	40 %	60 %	56708945
3353	NC_006569	CGG	2	6	175726	175731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708945
3354	NC_006569	GC	3	6	175748	175753	0 %	0 %	50 %	50 %	56708945
3355	NC_006569	CGC	2	6	175772	175777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708945
3356	NC_006569	G	6	6	175793	175798	0 %	0 %	100 %	0 %	56708945
3357	NC_006569	TGG	2	6	175828	175833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708945
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3359	NC_006569	GGC	2	6	175844	175849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708945
3360	NC_006569	GGC	2	6	175852	175857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708945
3361	NC_006569	GC	3	6	175926	175931	0 %	0 %	50 %	50 %	56708945
3362	NC_006569	GCTG	2	8	175945	175952	0 %	25 %	50 %	25 %	56708945
3363	NC_006569	TG	3	6	175957	175962	0 %	50 %	50 %	0 %	56708945
3364	NC_006569	CAG	2	6	176082	176087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708946
3365	NC_006569	CAGGAT	2	12	176127	176138	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	56708946
3366	NC_006569	AGAA	2	8	176152	176159	75 %	0 %	25 %	0 %	56708946
3367	NC_006569	CCCGAT	2	12	176184	176195	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	56708946
3368	NC_006569	GCA	2	6	176204	176209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708946
3369	NC_006569	GT	3	6	176312	176317	0 %	50 %	50 %	0 %	56708946
3370	NC_006569	CGA	2	6	176318	176323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708946
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3372	NC_006569	GAT	2	6	176352	176357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708946
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3374	NC_006569	ATC	2	6	176527	176532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708946
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3453	NC_006569	TCG	2	6	180671	180676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708950
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3492	NC_006569	CCG	2	6	182593	182598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708951
3493	NC_006569	GGCACC	2	12	182625	182636	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	56708951
3494	NC_006569	GC	3	6	182732	182737	0 %	0 %	50 %	50 %	56708951
3495	NC_006569	GGC	2	6	182967	182972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708952
3496	NC_006569	CGG	2	6	183048	183053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708952
3497	NC_006569	CGG	2	6	183069	183074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708952
3498	NC_006569	CCG	2	6	183100	183105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708952
3499	NC_006569	GAG	2	6	183121	183126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56708952
3500	NC_006569	GCG	2	6	183137	183142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708952

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