MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 megaplasmid

Total Repeats: 9642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2004	NC_006569	GTC	2	6	102628	102633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708889
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2006	NC_006569	GGC	4	12	102688	102699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708889
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2012	NC_006569	TCCG	2	8	103191	103198	0 %	25 %	25 %	50 %	56708889
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2123	NC_006569	ACCG	2	8	109160	109167	25 %	0 %	25 %	50 %	56708895
2124	NC_006569	TGC	2	6	109182	109187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708895
2125	NC_006569	TGCG	2	8	109206	109213	0 %	25 %	50 %	25 %	56708895
2126	NC_006569	TTCGCC	2	12	109265	109276	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	56708895
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2128	NC_006569	CGG	2	6	109420	109425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708895
2129	NC_006569	TTC	2	6	109512	109517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56708895
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2131	NC_006569	CCG	2	6	109536	109541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708895
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2134	NC_006569	TCT	2	6	110758	110763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56709232
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2162	NC_006569	GGC	2	6	112180	112185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708897
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2229	NC_006569	AGC	2	6	115288	115293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708898
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2231	NC_006569	CGCCC	2	10	115467	115476	0 %	0 %	20 %	80 %	56708898
2232	NC_006569	CCCG	2	8	115482	115489	0 %	0 %	25 %	75 %	56708898
2233	NC_006569	CACCG	2	10	115548	115557	20 %	0 %	20 %	60 %	56708898
2234	NC_006569	GTC	2	6	115638	115643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708898
2235	NC_006569	CCTCG	2	10	115760	115769	0 %	20 %	20 %	60 %	56708898
2236	NC_006569	TCTCCC	2	12	115777	115788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56708898
2237	NC_006569	AACG	2	8	115816	115823	50 %	0 %	25 %	25 %	56708898
2238	NC_006569	GCCC	2	8	115957	115964	0 %	0 %	25 %	75 %	56708899
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2241	NC_006569	GATG	2	8	116070	116077	25 %	25 %	50 %	0 %	56708899
2242	NC_006569	GAAA	2	8	116096	116103	75 %	0 %	25 %	0 %	56708899
2243	NC_006569	GCG	2	6	116123	116128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708899
2244	NC_006569	GGC	2	6	116163	116168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708899
2245	NC_006569	TGC	2	6	116216	116221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708899
2246	NC_006569	AAC	2	6	116281	116286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708899
2247	NC_006569	TGT	2	6	116300	116305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56708899
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2270	NC_006569	CG	3	6	117496	117501	0 %	0 %	50 %	50 %	56708900
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2275	NC_006569	ATC	2	6	117561	117566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708900
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2362	NC_006569	TGC	2	6	121937	121942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708903
2363	NC_006569	ACA	2	6	121989	121994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708904
2364	NC_006569	ATG	2	6	122066	122071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708904
2365	NC_006569	TTCCA	2	10	122108	122117	20 %	40 %	0 %	40 %	56708904
2366	NC_006569	CGGATG	2	12	122120	122131	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56708904
2367	NC_006569	AAG	2	6	122132	122137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56708904
2368	NC_006569	AGG	2	6	122145	122150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56708904
2369	NC_006569	GC	3	6	122184	122189	0 %	0 %	50 %	50 %	56708904
2370	NC_006569	GCCT	2	8	122228	122235	0 %	25 %	25 %	50 %	56708904
2371	NC_006569	ACC	2	6	122265	122270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708904
2372	NC_006569	GGT	2	6	122326	122331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708904
2373	NC_006569	TGG	2	6	122424	122429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708904
2374	NC_006569	CTG	2	6	122525	122530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708904
2375	NC_006569	TCGC	2	8	122600	122607	0 %	25 %	25 %	50 %	56708904
2376	NC_006569	TGT	2	6	122727	122732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56708904
2377	NC_006569	AAGG	2	8	123042	123049	50 %	0 %	50 %	0 %	56708905
2378	NC_006569	TCG	2	6	123115	123120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708905
2379	NC_006569	TGT	2	6	123127	123132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56708905
2380	NC_006569	GCA	2	6	123178	123183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708905
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2382	NC_006569	GTC	2	6	123222	123227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708905
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2384	NC_006569	TGG	2	6	123352	123357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708906
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2388	NC_006569	CTG	2	6	123470	123475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708906
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2397	NC_006569	CTTG	2	8	123994	124001	0 %	50 %	25 %	25 %	56708906
2398	NC_006569	GTT	2	6	124063	124068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56708906
2399	NC_006569	TGA	2	6	124110	124115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708906
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2405	NC_006569	CTG	2	6	124445	124450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708906
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2481	NC_006569	GTAG	2	8	129019	129026	25 %	25 %	50 %	0 %	56708909
2482	NC_006569	GCG	2	6	129277	129282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708910
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2488	NC_006569	GTC	2	6	129482	129487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708910
2489	NC_006569	CGT	2	6	129502	129507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708910
2490	NC_006569	CCG	2	6	129525	129530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708910
2491	NC_006569	GAC	2	6	129563	129568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708910
2492	NC_006569	CGG	2	6	129622	129627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708910
2493	NC_006569	GCGG	2	8	129641	129648	0 %	0 %	75 %	25 %	56708910
2494	NC_006569	CG	3	6	129707	129712	0 %	0 %	50 %	50 %	56708910
2495	NC_006569	TCG	2	6	129753	129758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708910
2496	NC_006569	TCA	2	6	129792	129797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708910
2497	NC_006569	GAA	2	6	129817	129822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56708910
2498	NC_006569	CGGA	2	8	129928	129935	25 %	0 %	50 %	25 %	56708910
2499	NC_006569	GCCCG	2	10	129940	129949	0 %	0 %	40 %	60 %	56708910
2500	NC_006569	CGGG	2	8	129952	129959	0 %	0 %	75 %	25 %	56708910

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