MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 megaplasmid

Total Repeats: 9642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_006569	GGC	2	6	70100	70105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708861
1502	NC_006569	CTG	2	6	70125	70130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708861
1503	NC_006569	CGC	2	6	70216	70221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708861
1504	NC_006569	GCT	2	6	70238	70243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708861
1505	NC_006569	TAT	2	6	70245	70250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56708861
1506	NC_006569	GGTC	2	8	70258	70265	0 %	25 %	50 %	25 %	56708861
1507	NC_006569	GCT	2	6	70334	70339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708861
1508	NC_006569	GGC	2	6	70421	70426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708861
1509	NC_006569	GC	3	6	70425	70430	0 %	0 %	50 %	50 %	56708861
1510	NC_006569	CCG	2	6	70460	70465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708861
1511	NC_006569	CAA	2	6	70487	70492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708861
1512	NC_006569	TGC	2	6	70495	70500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708861
1513	NC_006569	G	6	6	70508	70513	0 %	0 %	100 %	0 %	56708861
1514	NC_006569	CGC	2	6	70540	70545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708861
1515	NC_006569	TGG	2	6	70546	70551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708861
1516	NC_006569	CGA	2	6	70552	70557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708861
1517	NC_006569	TCG	2	6	70584	70589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708861
1518	NC_006569	GCTG	2	8	70684	70691	0 %	25 %	50 %	25 %	56708861
1519	NC_006569	CGG	2	6	70710	70715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708861
1520	NC_006569	GGC	2	6	70719	70724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708861
1521	NC_006569	TC	3	6	70816	70821	0 %	50 %	0 %	50 %	56708862
1522	NC_006569	GGA	2	6	70904	70909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56708862
1523	NC_006569	GC	3	6	70929	70934	0 %	0 %	50 %	50 %	56708862
1524	NC_006569	GAC	2	6	70935	70940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708862
1525	NC_006569	GGC	2	6	71030	71035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708862
1526	NC_006569	GGT	2	6	71069	71074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708862
1527	NC_006569	GCC	2	6	71126	71131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708862
1528	NC_006569	CGACAC	2	12	71225	71236	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	56708862
1529	NC_006569	TGC	2	6	71319	71324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708863
1530	NC_006569	CAT	2	6	71360	71365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708863
1531	NC_006569	GAA	2	6	71366	71371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56708863
1532	NC_006569	GGCACC	2	12	71379	71390	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	56708863
1533	NC_006569	GC	3	6	71475	71480	0 %	0 %	50 %	50 %	56708863
1534	NC_006569	TCGC	2	8	71483	71490	0 %	25 %	25 %	50 %	56708863
1535	NC_006569	ATG	2	6	71502	71507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708863
1536	NC_006569	GAC	2	6	71520	71525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708863
1537	NC_006569	TGG	3	9	71542	71550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708863
1538	NC_006569	CGCC	2	8	71557	71564	0 %	0 %	25 %	75 %	56708863
1539	NC_006569	T	7	7	71594	71600	0 %	100 %	0 %	0 %	56708863
1540	NC_006569	GATCA	2	10	71691	71700	40 %	20 %	20 %	20 %	56708863
1541	NC_006569	GA	3	6	71736	71741	50 %	0 %	50 %	0 %	56708863
1542	NC_006569	GCT	2	6	71901	71906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709228
1543	NC_006569	TCG	2	6	71928	71933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709228
1544	NC_006569	GGC	2	6	71948	71953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709228
1545	NC_006569	CG	3	6	71957	71962	0 %	0 %	50 %	50 %	56709228
1546	NC_006569	CAGA	2	8	71996	72003	50 %	0 %	25 %	25 %	56709228
1547	NC_006569	CGG	2	6	72045	72050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709228
1548	NC_006569	T	6	6	72056	72061	0 %	100 %	0 %	0 %	56709228
1549	NC_006569	GGC	2	6	72071	72076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709228
1550	NC_006569	ACC	2	6	72092	72097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56709228
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1552	NC_006569	CGC	2	6	72182	72187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708864
1553	NC_006569	GGA	2	6	72191	72196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56708864
1554	NC_006569	ACG	2	6	72244	72249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708864
1555	NC_006569	CGA	2	6	72377	72382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708864
1556	NC_006569	CCG	2	6	72562	72567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708864
1557	NC_006569	GC	3	6	72614	72619	0 %	0 %	50 %	50 %	56708864
1558	NC_006569	CGGTG	2	10	72641	72650	0 %	20 %	60 %	20 %	56708864
1559	NC_006569	GACA	2	8	72689	72696	50 %	0 %	25 %	25 %	56708864
1560	NC_006569	GCC	2	6	72768	72773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708865
1561	NC_006569	GGC	2	6	72839	72844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708865
1562	NC_006569	CTG	2	6	72861	72866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708865
1563	NC_006569	GCC	2	6	72921	72926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708865
1564	NC_006569	GCC	2	6	72972	72977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708865
1565	NC_006569	GCG	2	6	73090	73095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708865
1566	NC_006569	CT	3	6	73234	73239	0 %	50 %	0 %	50 %	56708865
1567	NC_006569	GGGCC	2	10	73241	73250	0 %	0 %	60 %	40 %	56708865
1568	NC_006569	CTG	2	6	73269	73274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708865
1569	NC_006569	GCCC	2	8	73438	73445	0 %	0 %	25 %	75 %	56708865
1570	NC_006569	CCGGC	2	10	73493	73502	0 %	0 %	40 %	60 %	56708865
1571	NC_006569	GC	3	6	73544	73549	0 %	0 %	50 %	50 %	56708865
1572	NC_006569	GGC	2	6	73554	73559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708865
1573	NC_006569	GC	3	6	73595	73600	0 %	0 %	50 %	50 %	56708865
1574	NC_006569	G	7	7	73649	73655	0 %	0 %	100 %	0 %	56708865
1575	NC_006569	ACA	2	6	73715	73720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708866
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1578	NC_006569	CTGG	2	8	73861	73868	0 %	25 %	50 %	25 %	56708866
1579	NC_006569	GGC	2	6	73980	73985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708867
1580	NC_006569	CTG	2	6	73991	73996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708867
1581	NC_006569	CCGC	2	8	74026	74033	0 %	0 %	25 %	75 %	56708867
1582	NC_006569	CGA	2	6	74041	74046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708867
1583	NC_006569	GCC	2	6	74108	74113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708867
1584	NC_006569	GGCCG	2	10	74119	74128	0 %	0 %	60 %	40 %	56708867
1585	NC_006569	ACC	2	6	74153	74158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708867
1586	NC_006569	CGC	2	6	74171	74176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708867
1587	NC_006569	CCG	2	6	74190	74195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708867
1588	NC_006569	GGC	2	6	74206	74211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708867
1589	NC_006569	TCC	2	6	74217	74222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56708867
1590	NC_006569	CGT	2	6	74237	74242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708867
1591	NC_006569	CCG	2	6	74256	74261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708867
1592	NC_006569	GGGC	2	8	74275	74282	0 %	0 %	75 %	25 %	56708867
1593	NC_006569	AGGTCA	2	12	74310	74321	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	56708867
1594	NC_006569	CAC	2	6	74356	74361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708867
1595	NC_006569	GTTC	2	8	74436	74443	0 %	50 %	25 %	25 %	56708867
1596	NC_006569	TCG	2	6	74451	74456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708867
1597	NC_006569	GCC	2	6	74489	74494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708867
1598	NC_006569	GCC	2	6	74625	74630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708868
1599	NC_006569	C	6	6	74629	74634	0 %	0 %	0 %	100 %	56708868
1600	NC_006569	CGCGCC	2	12	74647	74658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708868
1601	NC_006569	GGC	2	6	74680	74685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708868
1602	NC_006569	CTG	2	6	74755	74760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708868
1603	NC_006569	CTG	2	6	74908	74913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708868
1604	NC_006569	CGC	2	6	75009	75014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708868
1605	NC_006569	GCA	2	6	75030	75035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708868
1606	NC_006569	GGA	2	6	75042	75047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56708868
1607	NC_006569	CTGGC	2	10	75097	75106	0 %	20 %	40 %	40 %	56708868
1608	NC_006569	GGT	2	6	75129	75134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708868
1609	NC_006569	CTG	2	6	75328	75333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708868
1610	NC_006569	TGG	2	6	75360	75365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708868
1611	NC_006569	AAG	2	6	75397	75402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56708868
1612	NC_006569	GCC	2	6	75421	75426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708868
1613	NC_006569	CGACCT	2	12	75611	75622	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	56709231
1614	NC_006569	GAA	2	6	75675	75680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56709231
1615	NC_006569	A	6	6	75725	75730	100 %	0 %	0 %	0 %	56709231
1616	NC_006569	TCA	2	6	76213	76218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708869
1617	NC_006569	T	6	6	76270	76275	0 %	100 %	0 %	0 %	56708869
1618	NC_006569	CTT	2	6	76311	76316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56708869
1619	NC_006569	CAA	2	6	76464	76469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708869
1620	NC_006569	TCG	2	6	76480	76485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708869
1621	NC_006569	GCT	2	6	76536	76541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708869
1622	NC_006569	ACTG	2	8	76557	76564	25 %	25 %	25 %	25 %	56708869
1623	NC_006569	TGCT	2	8	76591	76598	0 %	50 %	25 %	25 %	56708869
1624	NC_006569	GAG	2	6	76650	76655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56708869
1625	NC_006569	TCA	2	6	76663	76668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708869
1626	NC_006569	GCG	2	6	76843	76848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708869
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