MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 megaplasmid

Total Repeats: 9642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_006569	CAA	2	6	46011	46016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708840
1002	NC_006569	CGC	2	6	46062	46067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708840
1003	NC_006569	CAT	2	6	46083	46088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708840
1004	NC_006569	ACA	2	6	46229	46234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708840
1005	NC_006569	ACC	2	6	46249	46254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708840
1006	NC_006569	GGT	2	6	46272	46277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708840
1007	NC_006569	CCG	2	6	46394	46399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708840
1008	NC_006569	AGC	2	6	46484	46489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708840
1009	NC_006569	GGT	2	6	46518	46523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708840
1010	NC_006569	CAT	2	6	46560	46565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708840
1011	NC_006569	CGCC	2	8	46629	46636	0 %	0 %	25 %	75 %	56708840
1012	NC_006569	GCC	3	9	46642	46650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708840
1013	NC_006569	GGA	2	6	46665	46670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56708840
1014	NC_006569	CAA	2	6	46698	46703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708840
1015	NC_006569	CGA	2	6	46770	46775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708840
1016	NC_006569	CGA	2	6	46800	46805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708840
1017	NC_006569	GAT	2	6	46810	46815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708840
1018	NC_006569	CTG	2	6	47014	47019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708841
1019	NC_006569	GCG	2	6	47050	47055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708841
1020	NC_006569	CGGG	2	8	47074	47081	0 %	0 %	75 %	25 %	56708841
1021	NC_006569	GGC	2	6	47106	47111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708841
1022	NC_006569	CCA	2	6	47201	47206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708841
1023	NC_006569	CGGCTC	2	12	47280	47291	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	56708841
1024	NC_006569	CCGC	2	8	47333	47340	0 %	0 %	25 %	75 %	56708841
1025	NC_006569	GGT	2	6	47346	47351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708841
1026	NC_006569	AAC	2	6	47356	47361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708841
1027	NC_006569	CCG	2	6	47448	47453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708841
1028	NC_006569	CG	4	8	47460	47467	0 %	0 %	50 %	50 %	56708841
1029	NC_006569	GTT	2	6	47503	47508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56708841
1030	NC_006569	CTC	2	6	47553	47558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56708841
1031	NC_006569	GGT	2	6	47703	47708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708841
1032	NC_006569	CAA	2	6	47829	47834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708841
1033	NC_006569	CAA	2	6	47847	47852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708841
1034	NC_006569	CGGCAT	2	12	47868	47879	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56708841
1035	NC_006569	CCG	2	6	47888	47893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708841
1036	NC_006569	TCG	2	6	47912	47917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708841
1037	NC_006569	CGG	2	6	48101	48106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708841
1038	NC_006569	TGC	2	6	48113	48118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708841
1039	NC_006569	CCG	2	6	48128	48133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708841
1040	NC_006569	GCT	2	6	48138	48143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708841
1041	NC_006569	CGG	2	6	48180	48185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708841
1042	NC_006569	GACC	2	8	48294	48301	25 %	0 %	25 %	50 %	56708842
1043	NC_006569	GCT	2	6	48352	48357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708842
1044	NC_006569	ATCC	2	8	48394	48401	25 %	25 %	0 %	50 %	56708842
1045	NC_006569	GCA	2	6	48426	48431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708842
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1047	NC_006569	CGCC	2	8	48547	48554	0 %	0 %	25 %	75 %	56708842
1048	NC_006569	CCG	2	6	48619	48624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708842
1049	NC_006569	TGC	2	6	48675	48680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708842
1050	NC_006569	GCT	2	6	48700	48705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708842
1051	NC_006569	CGA	2	6	48714	48719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708842
1052	NC_006569	CAT	2	6	48757	48762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708842
1053	NC_006569	CGA	2	6	48763	48768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708842
1054	NC_006569	GCG	2	6	48785	48790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708842
1055	NC_006569	GCCA	2	8	48800	48807	25 %	0 %	25 %	50 %	56708842
1056	NC_006569	ACCG	2	8	48833	48840	25 %	0 %	25 %	50 %	56708842
1057	NC_006569	GAC	2	6	48875	48880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708842
1058	NC_006569	AC	3	6	48879	48884	50 %	0 %	0 %	50 %	56708842
1059	NC_006569	GC	3	6	48935	48940	0 %	0 %	50 %	50 %	56708842
1060	NC_006569	GCC	2	6	48959	48964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708842
1061	NC_006569	GGC	2	6	48971	48976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708842
1062	NC_006569	GCT	2	6	49003	49008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708842
1063	NC_006569	CCG	2	6	49017	49022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708842
1064	NC_006569	GCA	2	6	49041	49046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708842
1065	NC_006569	CGC	2	6	49048	49053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708842
1066	NC_006569	TGTCGA	2	12	49069	49080	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	56708842
1067	NC_006569	CCCCG	2	10	49086	49095	0 %	0 %	20 %	80 %	56708842
1068	NC_006569	GGA	2	6	49099	49104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56708842
1069	NC_006569	GCTG	2	8	49193	49200	0 %	25 %	50 %	25 %	56708843
1070	NC_006569	GC	3	6	49256	49261	0 %	0 %	50 %	50 %	56708843
1071	NC_006569	TGA	2	6	49349	49354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708843
1072	NC_006569	GGCG	2	8	49371	49378	0 %	0 %	75 %	25 %	56708843
1073	NC_006569	CTG	3	9	49402	49410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708843
1074	NC_006569	CGG	2	6	49418	49423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708843
1075	NC_006569	CTG	2	6	49438	49443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708843
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1080	NC_006569	CTG	2	6	49618	49623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708843
1081	NC_006569	CGG	3	9	49649	49657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708843
1082	NC_006569	CTGG	2	8	49674	49681	0 %	25 %	50 %	25 %	56708843
1083	NC_006569	GTC	2	6	49687	49692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708843
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1087	NC_006569	CGCC	2	8	49883	49890	0 %	0 %	25 %	75 %	56708843
1088	NC_006569	GCT	2	6	49893	49898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708843
1089	NC_006569	TGT	2	6	49919	49924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56708843
1090	NC_006569	CGC	2	6	49932	49937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708843
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1095	NC_006569	GC	3	6	50050	50055	0 %	0 %	50 %	50 %	56708844
1096	NC_006569	CCG	2	6	50203	50208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708844
1097	NC_006569	GC	3	6	50232	50237	0 %	0 %	50 %	50 %	56708844
1098	NC_006569	CGGGC	2	10	50252	50261	0 %	0 %	60 %	40 %	56708844
1099	NC_006569	CGC	2	6	50270	50275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708844
1100	NC_006569	GC	3	6	50281	50286	0 %	0 %	50 %	50 %	56708844
1101	NC_006569	GGCG	2	8	50309	50316	0 %	0 %	75 %	25 %	56708844
1102	NC_006569	GC	3	6	50323	50328	0 %	0 %	50 %	50 %	56708844
1103	NC_006569	GCC	2	6	50358	50363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708844
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1105	NC_006569	GCCC	2	8	50563	50570	0 %	0 %	25 %	75 %	56708845
1106	NC_006569	CAA	2	6	50608	50613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708845
1107	NC_006569	CAA	2	6	50650	50655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708845
1108	NC_006569	CAT	2	6	50677	50682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708845
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1110	NC_006569	GCC	2	6	50738	50743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708845
1111	NC_006569	GTCTG	2	10	50751	50760	0 %	40 %	40 %	20 %	56708845
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1113	NC_006569	AAG	2	6	50840	50845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56708845
1114	NC_006569	CGAG	2	8	50930	50937	25 %	0 %	50 %	25 %	56708846
1115	NC_006569	CG	4	8	50948	50955	0 %	0 %	50 %	50 %	56708846
1116	NC_006569	CGCC	2	8	51014	51021	0 %	0 %	25 %	75 %	56708846
1117	NC_006569	CGC	2	6	51065	51070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708846
1118	NC_006569	GCA	2	6	51158	51163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708846
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1123	NC_006569	GGC	2	6	51967	51972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708847
1124	NC_006569	TGG	2	6	51977	51982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708847
1125	NC_006569	GGC	2	6	52056	52061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708847
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1127	NC_006569	CAT	2	6	52206	52211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708847
1128	NC_006569	GTG	2	6	52255	52260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708847
1129	NC_006569	GGC	2	6	52296	52301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708847
1130	NC_006569	CG	3	6	52339	52344	0 %	0 %	50 %	50 %	56708847
1131	NC_006569	TGG	2	6	52379	52384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708847
1132	NC_006569	GCC	2	6	52385	52390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708847
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1135	NC_006569	GA	3	6	52436	52441	50 %	0 %	50 %	0 %	56708847
1136	NC_006569	GGCGA	2	10	52516	52525	20 %	0 %	60 %	20 %	56708847
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1148	NC_006569	GCC	2	6	53693	53698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708849
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1239	NC_006569	GGATC	2	10	58365	58374	20 %	20 %	40 %	20 %	56708851
1240	NC_006569	GC	4	8	58417	58424	0 %	0 %	50 %	50 %	56708851
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1242	NC_006569	GAT	2	6	58530	58535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708851
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1244	NC_006569	TCA	2	6	58560	58565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708851
1245	NC_006569	CTT	2	6	58576	58581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56708851
1246	NC_006569	GTCCTC	2	12	58609	58620	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	56708851
1247	NC_006569	TGG	2	6	58626	58631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708851
1248	NC_006569	CCAG	2	8	58632	58639	25 %	0 %	25 %	50 %	56708851
1249	NC_006569	GGT	2	6	58714	58719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708851
1250	NC_006569	GGC	2	6	58822	58827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708851
1251	NC_006569	GCC	2	6	58888	58893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708851
1252	NC_006569	CGT	2	6	58953	58958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708851
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1500	NC_006569	GCT	2	6	70094	70099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708861

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