MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 megaplasmid

Total Repeats: 9642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_006569	CCTCGT	2	12	484506	484517	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	56709217
9502	NC_006569	GTG	2	6	484541	484546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56709217
9503	NC_006569	CG	3	6	484642	484647	0 %	0 %	50 %	50 %	56709218
9504	NC_006569	CGC	5	15	484678	484692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709218
9505	NC_006569	CGGG	2	8	484728	484735	0 %	0 %	75 %	25 %	56709218
9506	NC_006569	AACCG	2	10	484737	484746	40 %	0 %	20 %	40 %	56709218
9507	NC_006569	TCG	2	6	484814	484819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709218
9508	NC_006569	GC	4	8	484914	484921	0 %	0 %	50 %	50 %	56709218
9509	NC_006569	CAG	2	6	484969	484974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709218
9510	NC_006569	GCA	2	6	484983	484988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709218
9511	NC_006569	CG	3	6	485077	485082	0 %	0 %	50 %	50 %	56709218
9512	NC_006569	CAGC	2	8	485083	485090	25 %	0 %	25 %	50 %	56709218
9513	NC_006569	GCT	2	6	485100	485105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709218
9514	NC_006569	GCC	2	6	485109	485114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709218
9515	NC_006569	TGGC	2	8	485117	485124	0 %	25 %	50 %	25 %	56709218
9516	NC_006569	GCG	2	6	485150	485155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709218
9517	NC_006569	CCG	2	6	485169	485174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709218
9518	NC_006569	GCG	3	9	485183	485191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709218
9519	NC_006569	GGT	2	6	485230	485235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56709218
9520	NC_006569	CG	3	6	485619	485624	0 %	0 %	50 %	50 %	56709219
9521	NC_006569	CGA	2	6	485635	485640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709219
9522	NC_006569	GGT	2	6	485707	485712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56709219
9523	NC_006569	ACC	2	6	485748	485753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56709219
9524	NC_006569	GTC	2	6	485789	485794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709219
9525	NC_006569	GAC	2	6	485805	485810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709219
9526	NC_006569	GCC	2	6	485935	485940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709220
9527	NC_006569	GAT	2	6	485950	485955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709220
9528	NC_006569	GTG	2	6	485963	485968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56709220
9529	NC_006569	GCGTT	2	10	486021	486030	0 %	40 %	40 %	20 %	56709220
9530	NC_006569	GC	3	6	486073	486078	0 %	0 %	50 %	50 %	56709220
9531	NC_006569	CCG	2	6	486080	486085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709220
9532	NC_006569	GGC	2	6	486088	486093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709220
9533	NC_006569	CGGGC	2	10	486112	486121	0 %	0 %	60 %	40 %	56709220
9534	NC_006569	GCC	2	6	486191	486196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709220
9535	NC_006569	CAC	2	6	486226	486231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56709220
9536	NC_006569	GTCAGC	2	12	486251	486262	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56709220
9537	NC_006569	GCC	2	6	486268	486273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709220
9538	NC_006569	TCA	2	6	486282	486287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56709220
9539	NC_006569	GC	3	6	486296	486301	0 %	0 %	50 %	50 %	56709220
9540	NC_006569	CGT	2	6	486361	486366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709220
9541	NC_006569	GC	3	6	486442	486447	0 %	0 %	50 %	50 %	56709220
9542	NC_006569	TCG	2	6	486482	486487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709220
9543	NC_006569	GGC	2	6	486526	486531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709220
9544	NC_006569	CCA	2	6	486734	486739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56709221
9545	NC_006569	TCA	2	6	486756	486761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56709221
9546	NC_006569	TGA	2	6	486852	486857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709221
9547	NC_006569	CAG	2	6	486874	486879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709221
9548	NC_006569	AGA	2	6	486882	486887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56709221
9549	NC_006569	GC	3	6	486897	486902	0 %	0 %	50 %	50 %	56709221
9550	NC_006569	CCG	2	6	486903	486908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709221
9551	NC_006569	CGG	2	6	486949	486954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709221
9552	NC_006569	AC	3	6	486972	486977	50 %	0 %	0 %	50 %	56709221
9553	NC_006569	ACCG	2	8	487006	487013	25 %	0 %	25 %	50 %	56709221
9554	NC_006569	CGC	2	6	487095	487100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709221
9555	NC_006569	CCA	2	6	487116	487121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56709221
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9557	NC_006569	CAC	2	6	487210	487215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56709221
9558	NC_006569	GCC	4	12	487219	487230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709221
9559	NC_006569	GC	3	6	487265	487270	0 %	0 %	50 %	50 %	56709221
9560	NC_006569	CGA	2	6	487300	487305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709221
9561	NC_006569	GTCCA	2	10	487340	487349	20 %	20 %	20 %	40 %	56709221
9562	NC_006569	CTC	2	6	487351	487356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56709221
9563	NC_006569	GCC	2	6	487357	487362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709221
9564	NC_006569	CAT	2	6	487390	487395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56709221
9565	NC_006569	CGG	2	6	487404	487409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709221
9566	NC_006569	ATGCA	2	10	487418	487427	40 %	20 %	20 %	20 %	56709221
9567	NC_006569	GC	3	6	487578	487583	0 %	0 %	50 %	50 %	56709221
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9571	NC_006569	CTCA	2	8	487654	487661	25 %	25 %	0 %	50 %	56709221
9572	NC_006569	CTG	2	6	487681	487686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709221
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9574	NC_006569	CGA	2	6	487821	487826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709221
9575	NC_006569	ATGAC	2	10	488133	488142	40 %	20 %	20 %	20 %	56709222
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9577	NC_006569	CGGCG	2	10	488206	488215	0 %	0 %	60 %	40 %	56709222
9578	NC_006569	GCTG	2	8	488229	488236	0 %	25 %	50 %	25 %	56709222
9579	NC_006569	C	6	6	488274	488279	0 %	0 %	0 %	100 %	56709222
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9583	NC_006569	GAC	2	6	488453	488458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709222
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9585	NC_006569	GGC	2	6	488697	488702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709222
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9587	NC_006569	CGA	2	6	488824	488829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709222
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9589	NC_006569	TCT	2	6	488953	488958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56709222
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9593	NC_006569	TTC	2	6	489203	489208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56709224
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9596	NC_006569	GCG	2	6	489344	489349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709224
9597	NC_006569	CCG	2	6	489371	489376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709224
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9603	NC_006569	CCAGAC	2	12	489763	489774	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	56709225
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9606	NC_006569	CAG	2	6	489974	489979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709225
9607	NC_006569	GCT	2	6	489995	490000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709225
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9612	NC_006569	GC	3	6	490398	490403	0 %	0 %	50 %	50 %	56709226
9613	NC_006569	TGC	2	6	490421	490426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709226
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9618	NC_006569	ACAA	2	8	490634	490641	75 %	0 %	0 %	25 %	56709227
9619	NC_006569	GCC	2	6	490658	490663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709227
9620	NC_006569	CG	3	6	490664	490669	0 %	0 %	50 %	50 %	56709227
9621	NC_006569	CCG	2	6	490680	490685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709227
9622	NC_006569	GTGCC	2	10	490691	490700	0 %	20 %	40 %	40 %	56709227
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9624	NC_006569	CAT	2	6	490764	490769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56709227
9625	NC_006569	GGGC	2	8	490782	490789	0 %	0 %	75 %	25 %	56709227
9626	NC_006569	GCG	2	6	490823	490828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709227
9627	NC_006569	GCA	2	6	490836	490841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709227
9628	NC_006569	GGC	2	6	490852	490857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709227
9629	NC_006569	CCA	2	6	490866	490871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56709227
9630	NC_006569	CGG	3	9	490886	490894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709227
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9633	NC_006569	GCGCA	2	10	491173	491182	20 %	0 %	40 %	40 %	56709227
9634	NC_006569	GCC	2	6	491241	491246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709227
9635	NC_006569	CGGG	2	8	491251	491258	0 %	0 %	75 %	25 %	56709227
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9637	NC_006569	CGG	3	9	491304	491312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709227
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