MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 megaplasmid

Total Repeats: 9642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006569	CAC	2	6	22176	22181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708816
502	NC_006569	CGC	2	6	22253	22258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708816
503	NC_006569	CGC	2	6	22307	22312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708816
504	NC_006569	GTT	2	6	22380	22385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56708816
505	NC_006569	GGC	2	6	22386	22391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708816
506	NC_006569	TTG	2	6	22399	22404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56708816
507	NC_006569	TTGCTG	2	12	22450	22461	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	56708816
508	NC_006569	CGCGG	2	10	22470	22479	0 %	0 %	60 %	40 %	56708816
509	NC_006569	TCGCC	2	10	22481	22490	0 %	20 %	20 %	60 %	56708816
510	NC_006569	GCG	2	6	22531	22536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708816
511	NC_006569	ACC	2	6	22543	22548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708816
512	NC_006569	TTCCAG	2	12	22599	22610	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	56708816
513	NC_006569	CG	4	8	22643	22650	0 %	0 %	50 %	50 %	56708816
514	NC_006569	TCATAG	2	12	22693	22704	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	56708816
515	NC_006569	CAC	2	6	22815	22820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708816
516	NC_006569	GC	3	6	22835	22840	0 %	0 %	50 %	50 %	56708816
517	NC_006569	GCG	2	6	22845	22850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708816
518	NC_006569	GCC	2	6	22876	22881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708816
519	NC_006569	CCT	2	6	22904	22909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56708816
520	NC_006569	GGC	2	6	22947	22952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708816
521	NC_006569	TTTC	2	8	22970	22977	0 %	75 %	0 %	25 %	56708816
522	NC_006569	CGC	2	6	23100	23105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708817
523	NC_006569	ATC	2	6	23183	23188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708817
524	NC_006569	GC	4	8	23217	23224	0 %	0 %	50 %	50 %	56708817
525	NC_006569	CTT	2	6	23292	23297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56708817
526	NC_006569	CG	4	8	23343	23350	0 %	0 %	50 %	50 %	56708817
527	NC_006569	GTT	2	6	23362	23367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56708817
528	NC_006569	CAC	2	6	23413	23418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708817
529	NC_006569	CCGC	2	8	23423	23430	0 %	0 %	25 %	75 %	56708817
530	NC_006569	GC	3	6	23452	23457	0 %	0 %	50 %	50 %	56708817
531	NC_006569	CTC	2	6	23491	23496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56708817
532	NC_006569	TGT	2	6	23550	23555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56708817
533	NC_006569	CAAG	2	8	23607	23614	50 %	0 %	25 %	25 %	56708817
534	NC_006569	GAG	2	6	23618	23623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56708817
535	NC_006569	TTGA	2	8	23642	23649	25 %	50 %	25 %	0 %	56708817
536	NC_006569	GC	4	8	23676	23683	0 %	0 %	50 %	50 %	56708817
537	NC_006569	TCG	2	6	23696	23701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708817
538	NC_006569	GCC	2	6	23722	23727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708817
539	NC_006569	G	6	6	23887	23892	0 %	0 %	100 %	0 %	56708817
540	NC_006569	CG	3	6	23927	23932	0 %	0 %	50 %	50 %	56708817
541	NC_006569	CGG	2	6	23949	23954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708817
542	NC_006569	CAC	2	6	23962	23967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708817
543	NC_006569	CGG	2	6	23976	23981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708817
544	NC_006569	GTG	2	6	24068	24073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708817
545	NC_006569	TCA	2	6	24078	24083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708817
546	NC_006569	TGC	2	6	24101	24106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708817
547	NC_006569	CG	3	6	24111	24116	0 %	0 %	50 %	50 %	56708817
548	NC_006569	CAC	2	6	24121	24126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708817
549	NC_006569	GCC	2	6	24167	24172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708817
550	NC_006569	CA	3	6	24213	24218	50 %	0 %	0 %	50 %	56708817
551	NC_006569	GC	3	6	24272	24277	0 %	0 %	50 %	50 %	56708817
552	NC_006569	GCC	2	6	24332	24337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708817
553	NC_006569	CGC	2	6	24357	24362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708817
554	NC_006569	GC	3	6	24361	24366	0 %	0 %	50 %	50 %	56708817
555	NC_006569	GA	3	6	24396	24401	50 %	0 %	50 %	0 %	56708817
556	NC_006569	CGC	2	6	24420	24425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708817
557	NC_006569	TCA	2	6	24453	24458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708817
558	NC_006569	CCCGG	2	10	24967	24976	0 %	0 %	40 %	60 %	56708818
559	NC_006569	CGA	2	6	25047	25052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708818
560	NC_006569	CGC	2	6	25067	25072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708818
561	NC_006569	GAT	2	6	25101	25106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708818
562	NC_006569	CGC	2	6	25131	25136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708818
563	NC_006569	GC	4	8	25148	25155	0 %	0 %	50 %	50 %	56708818
564	NC_006569	GTG	2	6	25171	25176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708818
565	NC_006569	GCC	2	6	25192	25197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708818
566	NC_006569	CCA	2	6	25217	25222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708818
567	NC_006569	GCC	2	6	25267	25272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708818
568	NC_006569	TGCCGG	2	12	25313	25324	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56708818
569	NC_006569	GCC	2	6	25375	25380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708818
570	NC_006569	GCC	2	6	25384	25389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708818
571	NC_006569	CAT	2	6	25392	25397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708818
572	NC_006569	GGC	2	6	25431	25436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708818
573	NC_006569	GCT	2	6	25443	25448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708818
574	NC_006569	GCGAT	2	10	25484	25493	20 %	20 %	40 %	20 %	56708818
575	NC_006569	GCG	2	6	25499	25504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708818
576	NC_006569	GGCG	2	8	25509	25516	0 %	0 %	75 %	25 %	56708818
577	NC_006569	GTCG	2	8	25518	25525	0 %	25 %	50 %	25 %	56708818
578	NC_006569	CGG	2	6	25547	25552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708818
579	NC_006569	CTGG	2	8	25555	25562	0 %	25 %	50 %	25 %	56708818
580	NC_006569	GCT	2	6	25647	25652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708818
581	NC_006569	CGC	2	6	25701	25706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708818
582	NC_006569	GC	3	6	25705	25710	0 %	0 %	50 %	50 %	56708818
583	NC_006569	CAT	2	6	25731	25736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708818
584	NC_006569	ACC	2	6	25759	25764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708818
585	NC_006569	GATC	2	8	25805	25812	25 %	25 %	25 %	25 %	56708818
586	NC_006569	GCGG	2	8	25817	25824	0 %	0 %	75 %	25 %	56708818
587	NC_006569	AGC	2	6	25895	25900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708818
588	NC_006569	GCC	2	6	26009	26014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708818
589	NC_006569	GC	4	8	26082	26089	0 %	0 %	50 %	50 %	56708818
590	NC_006569	GC	3	6	26126	26131	0 %	0 %	50 %	50 %	56708818
591	NC_006569	AATACG	2	12	26183	26194	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56708818
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594	NC_006569	GGC	2	6	26294	26299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708819
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596	NC_006569	GGC	2	6	26371	26376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708819
597	NC_006569	CCA	2	6	26433	26438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708819
598	NC_006569	CGG	2	6	26641	26646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708819
599	NC_006569	GGT	2	6	26656	26661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708819
600	NC_006569	GC	3	6	26742	26747	0 %	0 %	50 %	50 %	56708819
601	NC_006569	GTG	2	6	26783	26788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708819
602	NC_006569	GAAG	2	8	26794	26801	50 %	0 %	50 %	0 %	56708819
603	NC_006569	GGC	2	6	26807	26812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708819
604	NC_006569	GCGT	2	8	26848	26855	0 %	25 %	50 %	25 %	56708819
605	NC_006569	CGG	3	9	26946	26954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708819
606	NC_006569	CAG	2	6	26963	26968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708819
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608	NC_006569	GCCT	2	8	27047	27054	0 %	25 %	25 %	50 %	56708819
609	NC_006569	TGA	2	6	27075	27080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708819
610	NC_006569	GCA	2	6	27111	27116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708819
611	NC_006569	GCT	3	9	27139	27147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708819
612	NC_006569	GGC	2	6	27212	27217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708819
613	NC_006569	TGGCC	2	10	27226	27235	0 %	20 %	40 %	40 %	56708819
614	NC_006569	GCCA	2	8	27260	27267	25 %	0 %	25 %	50 %	56708819
615	NC_006569	GC	3	6	27294	27299	0 %	0 %	50 %	50 %	56708819
616	NC_006569	TGG	2	6	27312	27317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708819
617	NC_006569	GAT	2	6	27355	27360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708819
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619	NC_006569	GC	3	6	27437	27442	0 %	0 %	50 %	50 %	56708819
620	NC_006569	CGC	2	6	27488	27493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708820
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623	NC_006569	GTCT	2	8	27537	27544	0 %	50 %	25 %	25 %	56708820
624	NC_006569	GAT	2	6	27554	27559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708820
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628	NC_006569	CG	3	6	27792	27797	0 %	0 %	50 %	50 %	56708820
629	NC_006569	GAC	2	6	27804	27809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708820
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631	NC_006569	CTG	2	6	27852	27857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708820
632	NC_006569	AAG	2	6	28053	28058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56708820
633	NC_006569	CGA	2	6	28064	28069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708820
634	NC_006569	CGC	2	6	28109	28114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708820
635	NC_006569	TCGG	2	8	28161	28168	0 %	25 %	50 %	25 %	56708820
636	NC_006569	GA	3	6	28240	28245	50 %	0 %	50 %	0 %	56708820
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653	NC_006569	CTT	2	6	28962	28967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56708822
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661	NC_006569	TGG	2	6	29300	29305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708822
662	NC_006569	CGA	2	6	29330	29335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708822
663	NC_006569	GGCG	2	8	29385	29392	0 %	0 %	75 %	25 %	56708822
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668	NC_006569	GGC	2	6	29694	29699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708823
669	NC_006569	GGC	3	9	29728	29736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708823
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671	NC_006569	G	6	6	29772	29777	0 %	0 %	100 %	0 %	56708823
672	NC_006569	CCGA	2	8	29791	29798	25 %	0 %	25 %	50 %	56708823
673	NC_006569	GCC	2	6	29824	29829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708823
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681	NC_006569	GCA	2	6	30224	30229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708823
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747	NC_006569	TGA	2	6	33402	33407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708828
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