MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 megaplasmid

Total Repeats: 9642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_006569	GTCG	2	8	284624	284631	0 %	25 %	50 %	25 %	56709043
5502	NC_006569	GCC	2	6	284733	284738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709043
5503	NC_006569	G	6	6	284781	284786	0 %	0 %	100 %	0 %	56709043
5504	NC_006569	CTC	2	6	284802	284807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56709043
5505	NC_006569	CTA	2	6	284837	284842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56709043
5506	NC_006569	GGC	2	6	284916	284921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709043
5507	NC_006569	GC	3	6	285096	285101	0 %	0 %	50 %	50 %	56709043
5508	NC_006569	GAA	2	6	285435	285440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56709044
5509	NC_006569	GCC	2	6	285502	285507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709044
5510	NC_006569	GGC	4	12	285601	285612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709044
5511	NC_006569	CG	4	8	285660	285667	0 %	0 %	50 %	50 %	56709044
5512	NC_006569	TTC	2	6	285679	285684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56709044
5513	NC_006569	TTC	2	6	285739	285744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56709044
5514	NC_006569	GCCA	2	8	285749	285756	25 %	0 %	25 %	50 %	56709044
5515	NC_006569	GCGCT	3	15	285786	285800	0 %	20 %	40 %	40 %	56709044
5516	NC_006569	GAA	2	6	286111	286116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56709044
5517	NC_006569	GCCC	2	8	286157	286164	0 %	0 %	25 %	75 %	56709044
5518	NC_006569	GCC	2	6	286165	286170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709044
5519	NC_006569	GCC	2	6	286240	286245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709044
5520	NC_006569	TC	3	6	286282	286287	0 %	50 %	0 %	50 %	56709044
5521	NC_006569	GCCG	2	8	286366	286373	0 %	0 %	50 %	50 %	56709044
5522	NC_006569	CAGCG	2	10	286375	286384	20 %	0 %	40 %	40 %	56709044
5523	NC_006569	ATC	2	6	286466	286471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56709044
5524	NC_006569	CGGGG	2	10	286479	286488	0 %	0 %	80 %	20 %	56709044
5525	NC_006569	GC	3	6	286606	286611	0 %	0 %	50 %	50 %	56709044
5526	NC_006569	CCG	2	6	286655	286660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709044
5527	NC_006569	GC	4	8	286700	286707	0 %	0 %	50 %	50 %	56709044
5528	NC_006569	CGG	3	9	286746	286754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709044
5529	NC_006569	TGC	2	6	286756	286761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709044
5530	NC_006569	CAT	2	6	286888	286893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56709044
5531	NC_006569	CAG	2	6	287070	287075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709045
5532	NC_006569	CCTG	2	8	287098	287105	0 %	25 %	25 %	50 %	56709045
5533	NC_006569	GCG	2	6	287232	287237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709045
5534	NC_006569	CG	3	6	287236	287241	0 %	0 %	50 %	50 %	56709045
5535	NC_006569	CGC	2	6	287253	287258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709045
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5541	NC_006569	TGC	2	6	287937	287942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709046
5542	NC_006569	GAC	2	6	287982	287987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709046
5543	NC_006569	GC	3	6	287997	288002	0 %	0 %	50 %	50 %	56709046
5544	NC_006569	GTC	2	6	288073	288078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709046
5545	NC_006569	GGAA	2	8	288085	288092	50 %	0 %	50 %	0 %	56709046
5546	NC_006569	GGC	2	6	288096	288101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709046
5547	NC_006569	CG	3	6	288120	288125	0 %	0 %	50 %	50 %	56709046
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5550	NC_006569	CCGCC	2	10	288164	288173	0 %	0 %	20 %	80 %	56709046
5551	NC_006569	GAC	2	6	288201	288206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709046
5552	NC_006569	TTGTA	2	10	288266	288275	20 %	60 %	20 %	0 %	56709046
5553	NC_006569	GC	3	6	288315	288320	0 %	0 %	50 %	50 %	56709046
5554	NC_006569	GAT	2	6	288323	288328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709046
5555	NC_006569	CGC	2	6	288342	288347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709046
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5557	NC_006569	CGC	2	6	288449	288454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709046
5558	NC_006569	ACG	2	6	288489	288494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709046
5559	NC_006569	ACG	2	6	288612	288617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709046
5560	NC_006569	GCG	2	6	288618	288623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709046
5561	NC_006569	CG	3	6	288658	288663	0 %	0 %	50 %	50 %	56709046
5562	NC_006569	GCG	2	6	288781	288786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709046
5563	NC_006569	GCA	2	6	288821	288826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709046
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5568	NC_006569	GAT	2	6	289056	289061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709046
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5571	NC_006569	GC	3	6	289174	289179	0 %	0 %	50 %	50 %	56709047
5572	NC_006569	GCA	2	6	289189	289194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709047
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5574	NC_006569	GCGCG	2	10	289226	289235	0 %	0 %	60 %	40 %	56709047
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5578	NC_006569	CAT	2	6	289307	289312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56709047
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5580	NC_006569	GAAAA	2	10	289410	289419	80 %	0 %	20 %	0 %	56709047
5581	NC_006569	AGAA	2	8	289428	289435	75 %	0 %	25 %	0 %	56709047
5582	NC_006569	TCGAC	2	10	289465	289474	20 %	20 %	20 %	40 %	56709047
5583	NC_006569	CAC	3	9	289492	289500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56709047
5584	NC_006569	CCGC	2	8	289533	289540	0 %	0 %	25 %	75 %	56709047
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5589	NC_006569	GCA	2	6	289732	289737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709047
5590	NC_006569	GCG	2	6	289801	289806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709047
5591	NC_006569	A	6	6	289850	289855	100 %	0 %	0 %	0 %	56709047
5592	NC_006569	ACC	2	6	289857	289862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56709047
5593	NC_006569	CGG	2	6	289949	289954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709047
5594	NC_006569	ATG	2	6	289956	289961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709047
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5596	NC_006569	TCA	2	6	290023	290028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56709047
5597	NC_006569	CGG	2	6	290030	290035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709047
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5599	NC_006569	CGC	2	6	290084	290089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709047
5600	NC_006569	CG	3	6	290178	290183	0 %	0 %	50 %	50 %	56709047
5601	NC_006569	GAT	3	9	290327	290335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709047
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5603	NC_006569	CAG	2	6	290393	290398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709047
5604	NC_006569	G	6	6	290398	290403	0 %	0 %	100 %	0 %	56709047
5605	NC_006569	CGG	2	6	290440	290445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709048
5606	NC_006569	GTT	2	6	290452	290457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56709048
5607	NC_006569	TGCAA	2	10	290496	290505	40 %	20 %	20 %	20 %	56709048
5608	NC_006569	CAG	2	6	290654	290659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709048
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5614	NC_006569	A	6	6	290872	290877	100 %	0 %	0 %	0 %	56709048
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5618	NC_006569	GCA	2	6	291465	291470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709049
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5620	NC_006569	TGCCGA	2	12	291624	291635	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56709049
5621	NC_006569	CGA	3	9	291633	291641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709049
5622	NC_006569	CGC	2	6	291690	291695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709049
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5624	NC_006569	TGG	2	6	291765	291770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56709049
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5992	NC_006569	TGC	2	6	309155	309160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709065
5993	NC_006569	GC	4	8	309159	309166	0 %	0 %	50 %	50 %	56709065
5994	NC_006569	TGC	2	6	309203	309208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709065
5995	NC_006569	TGCGGG	2	12	309272	309283	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	56709065
5996	NC_006569	CTG	2	6	309306	309311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709065
5997	NC_006569	GCT	2	6	309315	309320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709065
5998	NC_006569	GAG	2	6	309382	309387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56709065
5999	NC_006569	CG	3	6	309396	309401	0 %	0 %	50 %	50 %	56709065
6000	NC_006569	CG	3	6	309450	309455	0 %	0 %	50 %	50 %	56709065

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