MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 megaplasmid

Total Repeats: 9642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_006569	ATG	2	6	256917	256922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709018
5002	NC_006569	CCG	2	6	256960	256965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709018
5003	NC_006569	GAT	2	6	256982	256987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709018
5004	NC_006569	TGG	2	6	256993	256998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56709018
5005	NC_006569	GGAT	2	8	257076	257083	25 %	25 %	50 %	0 %	56709019
5006	NC_006569	CAC	2	6	257197	257202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56709019
5007	NC_006569	CCA	2	6	257250	257255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56709019
5008	NC_006569	GGGC	2	8	257262	257269	0 %	0 %	75 %	25 %	56709019
5009	NC_006569	CAT	2	6	257347	257352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56709019
5010	NC_006569	GGC	2	6	257423	257428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709019
5011	NC_006569	TGC	2	6	257451	257456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709019
5012	NC_006569	CGGT	2	8	257478	257485	0 %	25 %	50 %	25 %	56709019
5013	NC_006569	CGG	2	6	257530	257535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709019
5014	NC_006569	CAA	2	6	257536	257541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56709019
5015	NC_006569	ATC	2	6	257678	257683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56709019
5016	NC_006569	GC	3	6	257732	257737	0 %	0 %	50 %	50 %	56709019
5017	NC_006569	TCG	2	6	257742	257747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709019
5018	NC_006569	TCG	2	6	257784	257789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709019
5019	NC_006569	CGGAAC	2	12	257806	257817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709019
5020	NC_006569	CGG	2	6	257827	257832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709019
5021	NC_006569	GGT	2	6	257857	257862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56709019
5022	NC_006569	CGC	2	6	257913	257918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709019
5023	NC_006569	CTGG	2	8	257944	257951	0 %	25 %	50 %	25 %	56709019
5024	NC_006569	GC	5	10	258002	258011	0 %	0 %	50 %	50 %	56709019
5025	NC_006569	CGA	2	6	258259	258264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709020
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5029	NC_006569	GC	3	6	258456	258461	0 %	0 %	50 %	50 %	56709020
5030	NC_006569	CGC	2	6	258548	258553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709020
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5033	NC_006569	GCTG	2	8	258769	258776	0 %	25 %	50 %	25 %	56709020
5034	NC_006569	CGC	2	6	258862	258867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709020
5035	NC_006569	CG	3	6	258899	258904	0 %	0 %	50 %	50 %	56709020
5036	NC_006569	CGG	2	6	258957	258962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709020
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5038	NC_006569	GAT	2	6	259044	259049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709020
5039	NC_006569	CTGG	2	8	259067	259074	0 %	25 %	50 %	25 %	56709020
5040	NC_006569	GTC	2	6	259086	259091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709020
5041	NC_006569	GCG	2	6	259098	259103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709020
5042	NC_006569	GC	3	6	259130	259135	0 %	0 %	50 %	50 %	56709020
5043	NC_006569	CCG	2	6	259136	259141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709020
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5045	NC_006569	GC	3	6	259167	259172	0 %	0 %	50 %	50 %	56709020
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5053	NC_006569	GC	3	6	259387	259392	0 %	0 %	50 %	50 %	56709020
5054	NC_006569	GGC	2	6	259403	259408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709020
5055	NC_006569	GAG	2	6	259482	259487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56709020
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5059	NC_006569	ACC	2	6	259800	259805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56709020
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5095	NC_006569	TCGG	2	8	261237	261244	0 %	25 %	50 %	25 %	56709021
5096	NC_006569	GAATG	2	10	261500	261509	40 %	20 %	40 %	0 %	56709022
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5105	NC_006569	CG	3	6	261888	261893	0 %	0 %	50 %	50 %	56709022
5106	NC_006569	GC	3	6	261925	261930	0 %	0 %	50 %	50 %	56709022
5107	NC_006569	CGG	2	6	261934	261939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709022
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5112	NC_006569	GC	3	6	262174	262179	0 %	0 %	50 %	50 %	56709022
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5118	NC_006569	GCT	2	6	262393	262398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709022
5119	NC_006569	GGC	2	6	262423	262428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709022
5120	NC_006569	GC	3	6	262427	262432	0 %	0 %	50 %	50 %	56709022
5121	NC_006569	GCAT	2	8	262524	262531	25 %	25 %	25 %	25 %	56709023
5122	NC_006569	GC	3	6	262550	262555	0 %	0 %	50 %	50 %	56709023
5123	NC_006569	TGC	2	6	262634	262639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709023
5124	NC_006569	GGT	2	6	262644	262649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56709023
5125	NC_006569	GGC	2	6	262657	262662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709023
5126	NC_006569	CGC	2	6	262679	262684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709023
5127	NC_006569	GGC	2	6	262762	262767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709023
5128	NC_006569	GGGC	2	8	262804	262811	0 %	0 %	75 %	25 %	56709023
5129	NC_006569	TGC	2	6	262838	262843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709023
5130	NC_006569	TGA	2	6	262856	262861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709023
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5132	NC_006569	GGGC	2	8	263038	263045	0 %	0 %	75 %	25 %	56709023
5133	NC_006569	GCC	2	6	263098	263103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709023
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5136	NC_006569	TTCTGG	2	12	263184	263195	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	56709024
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5140	NC_006569	CCG	2	6	263325	263330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709024
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5143	NC_006569	CGG	2	6	263544	263549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709024
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5145	NC_006569	GTG	2	6	263615	263620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56709024
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5152	NC_006569	ATC	3	9	263879	263887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56709024
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5358	NC_006569	GCGCA	2	10	275706	275715	20 %	0 %	40 %	40 %	56709035
5359	NC_006569	CAT	2	6	275727	275732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56709035
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5364	NC_006569	ACCG	2	8	275908	275915	25 %	0 %	25 %	50 %	56709035
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5492	NC_006569	CGAC	2	8	283619	283626	25 %	0 %	25 %	50 %	56709042
5493	NC_006569	CAGGGC	2	12	283662	283673	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	56709042
5494	NC_006569	GCC	2	6	283926	283931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709042
5495	NC_006569	CAAA	2	8	284146	284153	75 %	0 %	0 %	25 %	56709043
5496	NC_006569	AAC	2	6	284154	284159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56709043
5497	NC_006569	GGC	2	6	284186	284191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709043
5498	NC_006569	GT	3	6	284194	284199	0 %	50 %	50 %	0 %	56709043
5499	NC_006569	CGG	2	6	284509	284514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709043
5500	NC_006569	GCG	2	6	284566	284571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709043

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