MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia typhi str. Wilmington

Total Repeats: 807

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006142	TAACG	2	10	992	1001	40 %	20 %	20 %	20 %	51473217
2	NC_006142	TTAAT	2	10	1883	1892	40 %	60 %	0 %	0 %	51473218
3	NC_006142	TTTTA	2	10	2444	2453	20 %	80 %	0 %	0 %	51473219
4	NC_006142	ATTTA	2	10	2797	2806	40 %	60 %	0 %	0 %	51473219
5	NC_006142	GCAAA	2	10	3254	3263	60 %	0 %	20 %	20 %	51473220
6	NC_006142	TAAAT	2	10	4753	4762	60 %	40 %	0 %	0 %	51473220
7	NC_006142	GTAGT	2	10	5064	5073	20 %	40 %	40 %	0 %	51473220
8	NC_006142	AATAC	2	10	6715	6724	60 %	20 %	0 %	20 %	51473221
9	NC_006142	AAACC	2	10	7874	7883	60 %	0 %	0 %	40 %	51473223
10	NC_006142	TGATT	2	10	8222	8231	20 %	60 %	20 %	0 %	51473223
11	NC_006142	CGAGA	2	10	9646	9655	40 %	0 %	40 %	20 %	51473224
12	NC_006142	TGACA	2	10	14923	14932	40 %	20 %	20 %	20 %	51473229
13	NC_006142	TCAAT	2	10	15496	15505	40 %	40 %	0 %	20 %	51473229
14	NC_006142	TGAAT	2	10	15550	15559	40 %	40 %	20 %	0 %	51473229
15	NC_006142	AGATA	2	10	17506	17515	60 %	20 %	20 %	0 %	51473229
16	NC_006142	TATTT	2	10	20675	20684	20 %	80 %	0 %	0 %	51473231
17	NC_006142	TCCTC	2	10	22734	22743	0 %	40 %	0 %	60 %	51473234
18	NC_006142	AAACC	2	10	23375	23384	60 %	0 %	0 %	40 %	51473234
19	NC_006142	ATAGC	2	10	24628	24637	40 %	20 %	20 %	20 %	51473235
20	NC_006142	ATGCT	2	10	25341	25350	20 %	40 %	20 %	20 %	51473236
21	NC_006142	TGATA	2	10	27699	27708	40 %	40 %	20 %	0 %	51473239
22	NC_006142	AATGA	2	10	27793	27802	60 %	20 %	20 %	0 %	51473239
23	NC_006142	TTTGT	2	10	28009	28018	0 %	80 %	20 %	0 %	51473239
24	NC_006142	TATTT	2	10	29838	29847	20 %	80 %	0 %	0 %	51473241
25	NC_006142	CTTTG	2	10	31524	31533	0 %	60 %	20 %	20 %	51473241
26	NC_006142	ACCAT	2	10	32850	32859	40 %	20 %	0 %	40 %	51473241
27	NC_006142	GCAAT	2	10	36482	36491	40 %	20 %	20 %	20 %	51473243
28	NC_006142	TATAT	2	10	37707	37716	40 %	60 %	0 %	0 %	51473243
29	NC_006142	AAACT	2	10	38171	38180	60 %	20 %	0 %	20 %	51473243
30	NC_006142	AAAAC	2	10	40812	40821	80 %	0 %	0 %	20 %	51473244
31	NC_006142	TTTCT	2	10	41488	41497	0 %	80 %	0 %	20 %	51473245
32	NC_006142	AAGTA	2	10	43054	43063	60 %	20 %	20 %	0 %	51473245
33	NC_006142	TCTTG	2	10	43472	43481	0 %	60 %	20 %	20 %	51473245
34	NC_006142	ATTAT	2	10	44664	44673	40 %	60 %	0 %	0 %	51473246
35	NC_006142	TAAAA	2	10	45631	45640	80 %	20 %	0 %	0 %	51473246
36	NC_006142	ATATA	2	10	47240	47249	60 %	40 %	0 %	0 %	51473247
37	NC_006142	GATTT	2	10	48635	48644	20 %	60 %	20 %	0 %	51473248
38	NC_006142	ATCAT	2	10	51418	51427	40 %	40 %	0 %	20 %	51473252
39	NC_006142	ACAAG	2	10	52338	52347	60 %	0 %	20 %	20 %	51473253
40	NC_006142	TTTCA	2	10	55100	55109	20 %	60 %	0 %	20 %	51473255
41	NC_006142	GTAAT	2	10	55461	55470	40 %	40 %	20 %	0 %	51473255
42	NC_006142	TACTT	2	10	55929	55938	20 %	60 %	0 %	20 %	51473256
43	NC_006142	ATTAA	2	10	56549	56558	60 %	40 %	0 %	0 %	51473257
44	NC_006142	GTTTT	2	10	56626	56635	0 %	80 %	20 %	0 %	51473257
45	NC_006142	TATTT	2	10	57320	57329	20 %	80 %	0 %	0 %	51473257
46	NC_006142	TTTAT	2	10	59585	59594	20 %	80 %	0 %	0 %	51473260
47	NC_006142	TTTGC	2	10	65218	65227	0 %	60 %	20 %	20 %	51473263
48	NC_006142	ATGGA	2	10	70532	70541	40 %	20 %	40 %	0 %	51473264
49	NC_006142	ATGGA	2	10	70682	70691	40 %	20 %	40 %	0 %	51473264
50	NC_006142	ATGGA	2	10	70832	70841	40 %	20 %	40 %	0 %	51473264
51	NC_006142	ATGGA	2	10	70982	70991	40 %	20 %	40 %	0 %	51473264
52	NC_006142	ATGGA	2	10	71132	71141	40 %	20 %	40 %	0 %	51473264
53	NC_006142	ATGGA	2	10	71282	71291	40 %	20 %	40 %	0 %	51473264
54	NC_006142	AAAGA	2	10	71491	71500	80 %	0 %	20 %	0 %	51473264
55	NC_006142	AAATC	2	10	72268	72277	60 %	20 %	0 %	20 %	51473264
56	NC_006142	ACTAA	2	10	75813	75822	60 %	20 %	0 %	20 %	51473267
57	NC_006142	AATTA	2	10	78703	78712	60 %	40 %	0 %	0 %	51473270
58	NC_006142	TCTTT	2	10	81893	81902	0 %	80 %	0 %	20 %	51473274
59	NC_006142	TGATT	2	10	85157	85166	20 %	60 %	20 %	0 %	51473276
60	NC_006142	TAATT	2	10	95320	95329	40 %	60 %	0 %	0 %	51473284
61	NC_006142	ATTTA	2	10	95667	95676	40 %	60 %	0 %	0 %	51473284
62	NC_006142	TTTTA	2	10	96024	96033	20 %	80 %	0 %	0 %	51473284
63	NC_006142	TTTTA	2	10	96072	96081	20 %	80 %	0 %	0 %	51473284
64	NC_006142	CATTG	2	10	96488	96497	20 %	40 %	20 %	20 %	51473285
65	NC_006142	TGTAT	2	10	98400	98409	20 %	60 %	20 %	0 %	51473287
66	NC_006142	ATATA	2	10	98998	99007	60 %	40 %	0 %	0 %	51473287
67	NC_006142	AGAAA	2	10	99379	99388	80 %	0 %	20 %	0 %	51473288
68	NC_006142	AATTT	2	10	99389	99398	40 %	60 %	0 %	0 %	51473288
69	NC_006142	TATTG	2	10	99767	99776	20 %	60 %	20 %	0 %	51473288
70	NC_006142	CAAAA	2	10	100223	100232	80 %	0 %	0 %	20 %	51473289
71	NC_006142	AAATA	2	10	101410	101419	80 %	20 %	0 %	0 %	51473290
72	NC_006142	CAACC	2	10	101787	101796	40 %	0 %	0 %	60 %	51473290
73	NC_006142	TTAGC	2	10	105978	105987	20 %	40 %	20 %	20 %	51473292
74	NC_006142	TAATA	2	10	106288	106297	60 %	40 %	0 %	0 %	51473292
75	NC_006142	TAATA	2	10	106364	106373	60 %	40 %	0 %	0 %	51473293
76	NC_006142	CATAG	2	10	106980	106989	40 %	20 %	20 %	20 %	51473293
77	NC_006142	ATTAA	2	10	108001	108010	60 %	40 %	0 %	0 %	51473293
78	NC_006142	TTTAA	2	10	108224	108233	40 %	60 %	0 %	0 %	51473294
79	NC_006142	TAACA	2	10	109297	109306	60 %	20 %	0 %	20 %	51473294
80	NC_006142	TTTTA	2	10	110284	110293	20 %	80 %	0 %	0 %	51473295
81	NC_006142	TTAGT	2	10	110588	110597	20 %	60 %	20 %	0 %	51473296
82	NC_006142	GATAT	2	10	111083	111092	40 %	40 %	20 %	0 %	51473296
83	NC_006142	AGGTA	2	10	114997	115006	40 %	20 %	40 %	0 %	51473299
84	NC_006142	ATATT	2	10	116138	116147	40 %	60 %	0 %	0 %	51473299
85	NC_006142	ATGTT	2	10	118415	118424	20 %	60 %	20 %	0 %	51473303
86	NC_006142	ATAAA	2	10	118613	118622	80 %	20 %	0 %	0 %	51473303
87	NC_006142	GTTAT	2	10	118645	118654	20 %	60 %	20 %	0 %	51473303
88	NC_006142	AATTT	2	10	120578	120587	40 %	60 %	0 %	0 %	51473304
89	NC_006142	CTTTA	2	10	121902	121911	20 %	60 %	0 %	20 %	51473305
90	NC_006142	TCATA	2	10	122735	122744	40 %	40 %	0 %	20 %	51473305
91	NC_006142	CAATT	2	10	122895	122904	40 %	40 %	0 %	20 %	51473305
92	NC_006142	TATTT	2	10	123900	123909	20 %	80 %	0 %	0 %	51473305
93	NC_006142	GTATG	2	10	134725	134734	20 %	40 %	40 %	0 %	51473311
94	NC_006142	AAACC	2	10	136947	136956	60 %	0 %	0 %	40 %	51473312
95	NC_006142	ATGAT	2	10	137073	137082	40 %	40 %	20 %	0 %	51473312
96	NC_006142	TATAG	2	10	139002	139011	40 %	40 %	20 %	0 %	51473314
97	NC_006142	GTTTG	2	10	139435	139444	0 %	60 %	40 %	0 %	51473316
98	NC_006142	TTTTA	2	10	139657	139666	20 %	80 %	0 %	0 %	51473316
99	NC_006142	TAAAA	2	10	140841	140850	80 %	20 %	0 %	0 %	51473318
100	NC_006142	ATTTA	2	10	140908	140917	40 %	60 %	0 %	0 %	51473319
101	NC_006142	TATCA	2	10	144070	144079	40 %	40 %	0 %	20 %	51473320
102	NC_006142	ATATT	2	10	144385	144394	40 %	60 %	0 %	0 %	51473321
103	NC_006142	ATTTT	2	10	145817	145826	20 %	80 %	0 %	0 %	51473322
104	NC_006142	TAATA	2	10	149094	149103	60 %	40 %	0 %	0 %	51473325
105	NC_006142	TAAAA	2	10	149943	149952	80 %	20 %	0 %	0 %	51473326
106	NC_006142	TGGTG	2	10	150077	150086	0 %	40 %	60 %	0 %	51473326
107	NC_006142	TTAAT	2	10	150979	150988	40 %	60 %	0 %	0 %	51473328
108	NC_006142	TATAA	2	10	150999	151008	60 %	40 %	0 %	0 %	51473328
109	NC_006142	AAGAA	2	10	152591	152600	80 %	0 %	20 %	0 %	51473328
110	NC_006142	TGGAT	2	10	154795	154804	20 %	40 %	40 %	0 %	51473332
111	NC_006142	CAAGT	2	10	156709	156718	40 %	20 %	20 %	20 %	51473332
112	NC_006142	ACAGA	2	10	157352	157361	60 %	0 %	20 %	20 %	51473334
113	NC_006142	TATAC	2	10	168714	168723	40 %	40 %	0 %	20 %	51473340
114	NC_006142	GTAGA	2	10	169123	169132	40 %	20 %	40 %	0 %	51473340
115	NC_006142	GATAT	2	10	171673	171682	40 %	40 %	20 %	0 %	51473341
116	NC_006142	AGATA	2	10	174613	174622	60 %	20 %	20 %	0 %	51473344
117	NC_006142	AATTT	2	10	176162	176171	40 %	60 %	0 %	0 %	51473345
118	NC_006142	ATTAT	2	10	176290	176299	40 %	60 %	0 %	0 %	51473345
119	NC_006142	GTTTT	2	10	176754	176763	0 %	80 %	20 %	0 %	51473345
120	NC_006142	TAAAA	2	10	177471	177480	80 %	20 %	0 %	0 %	51473345
121	NC_006142	GTTTT	2	10	178774	178783	0 %	80 %	20 %	0 %	51473346
122	NC_006142	ATACC	2	10	183826	183835	40 %	20 %	0 %	40 %	51473351
123	NC_006142	ATATA	2	10	187020	187029	60 %	40 %	0 %	0 %	51473355
124	NC_006142	AATTT	2	10	187030	187039	40 %	60 %	0 %	0 %	51473355
125	NC_006142	AAAAC	2	10	187450	187459	80 %	0 %	0 %	20 %	51473356
126	NC_006142	AAAGT	2	10	187772	187781	60 %	20 %	20 %	0 %	51473356
127	NC_006142	AATAA	2	10	188338	188347	80 %	20 %	0 %	0 %	51473356
128	NC_006142	TCATA	2	10	190831	190840	40 %	40 %	0 %	20 %	51473359
129	NC_006142	AGAAA	2	10	191067	191076	80 %	0 %	20 %	0 %	51473359
130	NC_006142	AGCTA	2	10	191189	191198	40 %	20 %	20 %	20 %	51473359
131	NC_006142	AATAG	2	10	191618	191627	60 %	20 %	20 %	0 %	51473359
132	NC_006142	TACTC	2	10	191736	191745	20 %	40 %	0 %	40 %	51473359
133	NC_006142	AAGTG	2	10	192179	192188	40 %	20 %	40 %	0 %	51473359
134	NC_006142	AAAGC	2	10	193524	193533	60 %	0 %	20 %	20 %	51473360
135	NC_006142	CAATA	2	10	193625	193634	60 %	20 %	0 %	20 %	51473360
136	NC_006142	GAGTT	2	10	194720	194729	20 %	40 %	40 %	0 %	51473362
137	NC_006142	TTATT	2	10	197811	197820	20 %	80 %	0 %	0 %	51473367
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