MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia typhi str. Wilmington

Total Repeats: 2453

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006142	ATAA	2	8	815	822	75 %	25 %	0 %	0 %	51473216
2	NC_006142	ACAG	2	8	1632	1639	50 %	0 %	25 %	25 %	51473218
3	NC_006142	AGTA	2	8	2294	2301	50 %	25 %	25 %	0 %	51473219
4	NC_006142	TTAT	2	8	2605	2612	25 %	75 %	0 %	0 %	51473219
5	NC_006142	TAAT	2	8	2719	2726	50 %	50 %	0 %	0 %	51473219
6	NC_006142	TTAT	2	8	2827	2834	25 %	75 %	0 %	0 %	51473219
7	NC_006142	TATT	2	8	3547	3554	25 %	75 %	0 %	0 %	51473220
8	NC_006142	AGAA	2	8	4150	4157	75 %	0 %	25 %	0 %	51473220
9	NC_006142	AATA	2	8	5209	5216	75 %	25 %	0 %	0 %	51473220
10	NC_006142	TCAC	2	8	5248	5255	25 %	25 %	0 %	50 %	51473220
11	NC_006142	ACCT	2	8	6364	6371	25 %	25 %	0 %	50 %	51473221
12	NC_006142	ACCA	2	8	6448	6455	50 %	0 %	0 %	50 %	51473221
13	NC_006142	TAAA	2	8	6456	6463	75 %	25 %	0 %	0 %	51473221
14	NC_006142	ATAA	2	8	6619	6626	75 %	25 %	0 %	0 %	51473221
15	NC_006142	ACTT	2	8	6840	6847	25 %	50 %	0 %	25 %	51473222
16	NC_006142	CCTG	2	8	7667	7674	0 %	25 %	25 %	50 %	51473223
17	NC_006142	CAAT	2	8	9454	9461	50 %	25 %	0 %	25 %	51473224
18	NC_006142	CATG	2	8	9477	9484	25 %	25 %	25 %	25 %	51473224
19	NC_006142	ATGA	2	8	9553	9560	50 %	25 %	25 %	0 %	51473224
20	NC_006142	AAAT	2	8	10269	10276	75 %	25 %	0 %	0 %	51473224
21	NC_006142	TAAA	2	8	10549	10556	75 %	25 %	0 %	0 %	51473225
22	NC_006142	TAAA	2	8	10576	10583	75 %	25 %	0 %	0 %	51473225
23	NC_006142	TCAT	2	8	10973	10980	25 %	50 %	0 %	25 %	51473225
24	NC_006142	TCTT	2	8	11439	11446	0 %	75 %	0 %	25 %	51473226
25	NC_006142	TAAT	2	8	12024	12031	50 %	50 %	0 %	0 %	51473227
26	NC_006142	GCTT	2	8	12039	12046	0 %	50 %	25 %	25 %	51473227
27	NC_006142	TTTA	2	8	12187	12194	25 %	75 %	0 %	0 %	51473227
28	NC_006142	AATA	2	8	12958	12965	75 %	25 %	0 %	0 %	51473228
29	NC_006142	GCTC	2	8	13162	13169	0 %	25 %	25 %	50 %	51473228
30	NC_006142	AATA	2	8	15250	15257	75 %	25 %	0 %	0 %	51473229
31	NC_006142	AGCA	2	8	15678	15685	50 %	0 %	25 %	25 %	51473229
32	NC_006142	TGGA	2	8	15792	15799	25 %	25 %	50 %	0 %	51473229
33	NC_006142	GAAA	2	8	16308	16315	75 %	0 %	25 %	0 %	51473229
34	NC_006142	TATG	2	8	16579	16586	25 %	50 %	25 %	0 %	51473229
35	NC_006142	AAAG	2	8	16637	16644	75 %	0 %	25 %	0 %	51473229
36	NC_006142	TTCA	2	8	17361	17368	25 %	50 %	0 %	25 %	51473229
37	NC_006142	TAAA	2	8	18000	18007	75 %	25 %	0 %	0 %	51473229
38	NC_006142	TACC	2	8	19823	19830	25 %	25 %	0 %	50 %	51473230
39	NC_006142	GCTA	2	8	20017	20024	25 %	25 %	25 %	25 %	51473230
40	NC_006142	CTTG	2	8	20191	20198	0 %	50 %	25 %	25 %	51473231
41	NC_006142	ATGC	2	8	20209	20216	25 %	25 %	25 %	25 %	51473231
42	NC_006142	AACA	2	8	20222	20229	75 %	0 %	0 %	25 %	51473231
43	NC_006142	AAGC	2	8	20708	20715	50 %	0 %	25 %	25 %	51473231
44	NC_006142	TAAA	2	8	21542	21549	75 %	25 %	0 %	0 %	51473232
45	NC_006142	TAAT	2	8	21557	21564	50 %	50 %	0 %	0 %	51473232
46	NC_006142	AAAT	2	8	21859	21866	75 %	25 %	0 %	0 %	51473233
47	NC_006142	TATC	2	8	21996	22003	25 %	50 %	0 %	25 %	51473233
48	NC_006142	CAAT	2	8	22165	22172	50 %	25 %	0 %	25 %	51473233
49	NC_006142	ATAA	2	8	22987	22994	75 %	25 %	0 %	0 %	51473234
50	NC_006142	TCAA	2	8	23177	23184	50 %	25 %	0 %	25 %	51473234
51	NC_006142	TAAA	2	8	23488	23495	75 %	25 %	0 %	0 %	51473234
52	NC_006142	AAGA	2	8	24618	24625	75 %	0 %	25 %	0 %	51473235
53	NC_006142	ACTT	2	8	25001	25008	25 %	50 %	0 %	25 %	51473235
54	NC_006142	AAGA	2	8	25725	25732	75 %	0 %	25 %	0 %	51473237
55	NC_006142	TTAA	2	8	26173	26180	50 %	50 %	0 %	0 %	51473238
56	NC_006142	CAAT	2	8	27291	27298	50 %	25 %	0 %	25 %	51473239
57	NC_006142	TTTC	2	8	27466	27473	0 %	75 %	0 %	25 %	51473239
58	NC_006142	TGAT	2	8	27489	27496	25 %	50 %	25 %	0 %	51473239
59	NC_006142	CTTG	2	8	28246	28253	0 %	50 %	25 %	25 %	51473240
60	NC_006142	GCAA	2	8	28417	28424	50 %	0 %	25 %	25 %	51473240
61	NC_006142	CTTC	2	8	29722	29729	0 %	50 %	0 %	50 %	51473241
62	NC_006142	TATC	2	8	30134	30141	25 %	50 %	0 %	25 %	51473241
63	NC_006142	ATAA	2	8	30237	30244	75 %	25 %	0 %	0 %	51473241
64	NC_006142	AGCA	2	8	30750	30757	50 %	0 %	25 %	25 %	51473241
65	NC_006142	TTTG	2	8	30840	30847	0 %	75 %	25 %	0 %	51473241
66	NC_006142	ATTC	2	8	30905	30912	25 %	50 %	0 %	25 %	51473241
67	NC_006142	AACG	2	8	31798	31805	50 %	0 %	25 %	25 %	51473241
68	NC_006142	AAAT	2	8	31829	31836	75 %	25 %	0 %	0 %	51473241
69	NC_006142	ATTA	2	8	32064	32071	50 %	50 %	0 %	0 %	51473241
70	NC_006142	AATA	2	8	32110	32117	75 %	25 %	0 %	0 %	51473241
71	NC_006142	AAGT	2	8	32591	32598	50 %	25 %	25 %	0 %	51473241
72	NC_006142	TCCT	2	8	33280	33287	0 %	50 %	0 %	50 %	51473242
73	NC_006142	ATTT	2	8	33321	33328	25 %	75 %	0 %	0 %	51473242
74	NC_006142	GTTA	2	8	34192	34199	25 %	50 %	25 %	0 %	51473242
75	NC_006142	TTAA	2	8	34418	34425	50 %	50 %	0 %	0 %	51473242
76	NC_006142	AATT	2	8	35079	35086	50 %	50 %	0 %	0 %	51473242
77	NC_006142	ACTA	2	8	35383	35390	50 %	25 %	0 %	25 %	51473242
78	NC_006142	ATTT	2	8	35689	35696	25 %	75 %	0 %	0 %	51473242
79	NC_006142	AATT	2	8	35757	35764	50 %	50 %	0 %	0 %	51473242
80	NC_006142	ATTT	2	8	36088	36095	25 %	75 %	0 %	0 %	51473243
81	NC_006142	CATA	2	8	36359	36366	50 %	25 %	0 %	25 %	51473243
82	NC_006142	AAAT	2	8	36666	36673	75 %	25 %	0 %	0 %	51473243
83	NC_006142	TAAA	2	8	36950	36957	75 %	25 %	0 %	0 %	51473243
84	NC_006142	TGAT	2	8	37102	37109	25 %	50 %	25 %	0 %	51473243
85	NC_006142	CAAG	2	8	37121	37128	50 %	0 %	25 %	25 %	51473243
86	NC_006142	TGAT	2	8	38143	38150	25 %	50 %	25 %	0 %	51473243
87	NC_006142	AATA	2	8	38336	38343	75 %	25 %	0 %	0 %	51473243
88	NC_006142	CATT	2	8	38509	38516	25 %	50 %	0 %	25 %	51473243
89	NC_006142	GACC	2	8	38681	38688	25 %	0 %	25 %	50 %	51473243
90	NC_006142	CATA	2	8	39560	39567	50 %	25 %	0 %	25 %	51473244
91	NC_006142	ATAC	2	8	39622	39629	50 %	25 %	0 %	25 %	51473244
92	NC_006142	ACCC	2	8	39634	39641	25 %	0 %	0 %	75 %	51473244
93	NC_006142	TAAA	2	8	39665	39672	75 %	25 %	0 %	0 %	51473244
94	NC_006142	GAAT	2	8	39680	39687	50 %	25 %	25 %	0 %	51473244
95	NC_006142	CAAT	2	8	40021	40028	50 %	25 %	0 %	25 %	51473244
96	NC_006142	ATTA	2	8	40500	40507	50 %	50 %	0 %	0 %	51473244
97	NC_006142	ATTC	2	8	41478	41485	25 %	50 %	0 %	25 %	51473245
98	NC_006142	TAAT	2	8	42303	42310	50 %	50 %	0 %	0 %	51473245
99	NC_006142	AGAA	2	8	42406	42413	75 %	0 %	25 %	0 %	51473245
100	NC_006142	AAAT	2	8	42977	42984	75 %	25 %	0 %	0 %	51473245
101	NC_006142	TAAG	2	8	43221	43228	50 %	25 %	25 %	0 %	51473245
102	NC_006142	ATGC	2	8	43438	43445	25 %	25 %	25 %	25 %	51473245
103	NC_006142	GCTT	2	8	43940	43947	0 %	50 %	25 %	25 %	51473245
104	NC_006142	AATT	2	8	44032	44039	50 %	50 %	0 %	0 %	51473245
105	NC_006142	TAAA	2	8	44142	44149	75 %	25 %	0 %	0 %	51473245
106	NC_006142	ATTT	2	8	44158	44165	25 %	75 %	0 %	0 %	51473245
107	NC_006142	ATGT	2	8	44247	44254	25 %	50 %	25 %	0 %	51473245
108	NC_006142	TGTT	2	8	44846	44853	0 %	75 %	25 %	0 %	51473246
109	NC_006142	AATT	2	8	46309	46316	50 %	50 %	0 %	0 %	51473246
110	NC_006142	GAAA	2	8	46323	46330	75 %	0 %	25 %	0 %	51473246
111	NC_006142	TTTC	2	8	46438	46445	0 %	75 %	0 %	25 %	51473246
112	NC_006142	TCTT	2	8	46910	46917	0 %	75 %	0 %	25 %	51473246
113	NC_006142	TTTA	2	8	47199	47206	25 %	75 %	0 %	0 %	51473247
114	NC_006142	AAAT	2	8	47303	47310	75 %	25 %	0 %	0 %	51473247
115	NC_006142	TACT	2	8	47351	47358	25 %	50 %	0 %	25 %	51473247
116	NC_006142	AATC	2	8	48346	48353	50 %	25 %	0 %	25 %	51473248
117	NC_006142	TAAC	2	8	48361	48368	50 %	25 %	0 %	25 %	51473248
118	NC_006142	GAAA	2	8	49232	49239	75 %	0 %	25 %	0 %	51473249
119	NC_006142	GATT	2	8	49281	49288	25 %	50 %	25 %	0 %	51473249
120	NC_006142	TAAT	2	8	51473	51480	50 %	50 %	0 %	0 %	51473252
121	NC_006142	TAAT	2	8	51854	51861	50 %	50 %	0 %	0 %	51473252
122	NC_006142	TAAC	2	8	51914	51921	50 %	25 %	0 %	25 %	51473252
123	NC_006142	AATT	2	8	52226	52233	50 %	50 %	0 %	0 %	51473253
124	NC_006142	ATAA	2	8	52662	52669	75 %	25 %	0 %	0 %	51473253
125	NC_006142	ACCA	2	8	52784	52791	50 %	0 %	0 %	50 %	51473253
126	NC_006142	TTAT	2	8	53424	53431	25 %	75 %	0 %	0 %	51473254
127	NC_006142	AGAT	2	8	53483	53490	50 %	25 %	25 %	0 %	51473254
128	NC_006142	AGAT	2	8	54146	54153	50 %	25 %	25 %	0 %	51473254
129	NC_006142	CCAT	2	8	55348	55355	25 %	25 %	0 %	50 %	51473255
130	NC_006142	AAAC	2	8	55529	55536	75 %	0 %	0 %	25 %	51473255
131	NC_006142	TAAT	2	8	55572	55579	50 %	50 %	0 %	0 %	51473256
132	NC_006142	ATAG	2	8	56305	56312	50 %	25 %	25 %	0 %	51473256
133	NC_006142	ACAA	2	8	56350	56357	75 %	0 %	0 %	25 %	51473257
134	NC_006142	TATT	2	8	56366	56373	25 %	75 %	0 %	0 %	51473257
135	NC_006142	AAAT	2	8	56457	56464	75 %	25 %	0 %	0 %	51473257
136	NC_006142	CAAA	2	8	56506	56513	75 %	0 %	0 %	25 %	51473257
137	NC_006142	TCAT	2	8	56708	56715	25 %	50 %	0 %	25 %	51473257
138	NC_006142	AATC	2	8	57073	57080	50 %	25 %	0 %	25 %	51473257
139	NC_006142	TATT	2	8	57285	57292	25 %	75 %	0 %	0 %	51473257
140	NC_006142	AGCA	2	8	57791	57798	50 %	0 %	25 %	25 %	51473258
141	NC_006142	AGTA	2	8	57855	57862	50 %	25 %	25 %	0 %	51473258
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