MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia typhi str. Wilmington

Total Repeats: 22278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_006142	TGA	2	6	144186	144191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473320
3002	NC_006142	GCA	2	6	144215	144220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473320
3003	NC_006142	TG	3	6	144236	144241	0 %	50 %	50 %	0 %	51473320
3004	NC_006142	ATC	2	6	144253	144258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473320
3005	NC_006142	TAA	2	6	144261	144266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473320
3006	NC_006142	TAA	2	6	144306	144311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473321
3007	NC_006142	ATATT	2	10	144385	144394	40 %	60 %	0 %	0 %	51473321
3008	NC_006142	T	6	6	144393	144398	0 %	100 %	0 %	0 %	51473321
3009	NC_006142	T	6	6	144518	144523	0 %	100 %	0 %	0 %	51473321
3010	NC_006142	GTG	2	6	144524	144529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473321
3011	NC_006142	GGC	2	6	144598	144603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51473321
3012	NC_006142	AAT	2	6	144617	144622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473321
3013	NC_006142	ATT	2	6	144627	144632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473321
3014	NC_006142	ATA	2	6	144647	144652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473321
3015	NC_006142	ATAA	2	8	144687	144694	75 %	25 %	0 %	0 %	51473321
3016	NC_006142	A	6	6	144714	144719	100 %	0 %	0 %	0 %	51473321
3017	NC_006142	AAT	2	6	144729	144734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473321
3018	NC_006142	TAT	2	6	144759	144764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473321
3019	NC_006142	AT	3	6	144803	144808	50 %	50 %	0 %	0 %	51473321
3020	NC_006142	CTA	2	6	144839	144844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473321
3021	NC_006142	CTG	2	6	144873	144878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473321
3022	NC_006142	CTA	2	6	144929	144934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473321
3023	NC_006142	T	8	8	144941	144948	0 %	100 %	0 %	0 %	51473321
3024	NC_006142	T	6	6	144981	144986	0 %	100 %	0 %	0 %	51473321
3025	NC_006142	TTC	2	6	145074	145079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473321
3026	NC_006142	ATTT	2	8	145088	145095	25 %	75 %	0 %	0 %	51473321
3027	NC_006142	AT	3	6	145103	145108	50 %	50 %	0 %	0 %	51473321
3028	NC_006142	ATT	2	6	145125	145130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473321
3029	NC_006142	A	6	6	145165	145170	100 %	0 %	0 %	0 %	51473321
3030	NC_006142	TGT	2	6	145213	145218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473321
3031	NC_006142	A	6	6	145345	145350	100 %	0 %	0 %	0 %	51473322
3032	NC_006142	AGA	2	6	145401	145406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473322
3033	NC_006142	AAT	2	6	145485	145490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473322
3034	NC_006142	GCTT	2	8	145521	145528	0 %	50 %	25 %	25 %	51473322
3035	NC_006142	GAA	2	6	145555	145560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473322
3036	NC_006142	GCA	2	6	145561	145566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473322
3037	NC_006142	TAA	2	6	145568	145573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473322
3038	NC_006142	ATA	2	6	145642	145647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473322
3039	NC_006142	GGT	2	6	145714	145719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473322
3040	NC_006142	ATT	2	6	145729	145734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473322
3041	NC_006142	TGA	2	6	145758	145763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473322
3042	NC_006142	ATTTT	2	10	145817	145826	20 %	80 %	0 %	0 %	51473322
3043	NC_006142	GAA	2	6	145843	145848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473322
3044	NC_006142	TAT	2	6	145913	145918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473322
3045	NC_006142	TGA	2	6	145994	145999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473322
3046	NC_006142	AAAGAA	2	12	146083	146094	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	51473322
3047	NC_006142	TCAAGC	2	12	146100	146111	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	51473322
3048	NC_006142	ATA	3	9	146114	146122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473322
3049	NC_006142	CTG	2	6	146147	146152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473322
3050	NC_006142	AAG	2	6	146165	146170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473322
3051	NC_006142	AGA	2	6	146184	146189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473322
3052	NC_006142	AGT	2	6	146289	146294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473322
3053	NC_006142	AGA	2	6	146295	146300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473322
3054	NC_006142	GGT	2	6	146308	146313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473322
3055	NC_006142	AAT	2	6	146332	146337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473322
3056	NC_006142	CA	3	6	146348	146353	50 %	0 %	0 %	50 %	51473322
3057	NC_006142	TTA	2	6	146357	146362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473322
3058	NC_006142	CAA	2	6	146525	146530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473323
3059	NC_006142	AT	3	6	146534	146539	50 %	50 %	0 %	0 %	51473323
3060	NC_006142	GGT	2	6	146617	146622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473323
3061	NC_006142	T	6	6	146702	146707	0 %	100 %	0 %	0 %	51473323
3062	NC_006142	GCT	2	6	146753	146758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473323
3063	NC_006142	TAA	2	6	146803	146808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473323
3064	NC_006142	ATC	2	6	146878	146883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473323
3065	NC_006142	AGT	2	6	146915	146920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473323
3066	NC_006142	GTA	2	6	146937	146942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473323
3067	NC_006142	TGT	2	6	147001	147006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473323
3068	NC_006142	TCG	2	6	147061	147066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473323
3069	NC_006142	AAG	2	6	147087	147092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473323
3070	NC_006142	AAG	2	6	147117	147122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473323
3071	NC_006142	AAAG	2	8	147152	147159	75 %	0 %	25 %	0 %	51473323
3072	NC_006142	ATA	2	6	147164	147169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473323
3073	NC_006142	GGTGAT	2	12	147206	147217	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	51473323
3074	NC_006142	GCA	2	6	147224	147229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473323
3075	NC_006142	AT	3	6	147233	147238	50 %	50 %	0 %	0 %	51473323
3076	NC_006142	TGC	2	6	147241	147246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473323
3077	NC_006142	TA	3	6	147294	147299	50 %	50 %	0 %	0 %	51473323
3078	NC_006142	AAAG	2	8	147310	147317	75 %	0 %	25 %	0 %	51473323
3079	NC_006142	AGT	2	6	147378	147383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473323
3080	NC_006142	T	6	6	147416	147421	0 %	100 %	0 %	0 %	51473324
3081	NC_006142	ATT	2	6	147449	147454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473324
3082	NC_006142	AGT	2	6	147484	147489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473324
3083	NC_006142	AAG	2	6	147495	147500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473324
3084	NC_006142	TAG	2	6	147501	147506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473324
3085	NC_006142	AAG	2	6	147510	147515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473324
3086	NC_006142	GAAT	2	8	147517	147524	50 %	25 %	25 %	0 %	51473324
3087	NC_006142	AGC	2	6	147562	147567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473324
3088	NC_006142	CAA	2	6	147624	147629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473324
3089	NC_006142	AGA	2	6	147742	147747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473324
3090	NC_006142	TAT	2	6	147790	147795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473324
3091	NC_006142	ATA	2	6	147870	147875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473324
3092	NC_006142	CT	3	6	147924	147929	0 %	50 %	0 %	50 %	51473324
3093	NC_006142	ATAG	2	8	147935	147942	50 %	25 %	25 %	0 %	51473324
3094	NC_006142	GAA	2	6	147944	147949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473324
3095	NC_006142	TTG	2	6	147960	147965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473324
3096	NC_006142	ATG	2	6	147981	147986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473324
3097	NC_006142	GGT	2	6	148037	148042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473324
3098	NC_006142	TAT	2	6	148057	148062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473324
3099	NC_006142	TGC	2	6	148129	148134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473324
3100	NC_006142	TAA	2	6	148138	148143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473324
3101	NC_006142	T	6	6	148206	148211	0 %	100 %	0 %	0 %	51473324
3102	NC_006142	CAC	2	6	148212	148217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51473324
3103	NC_006142	ATA	2	6	148271	148276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473324
3104	NC_006142	A	6	6	148286	148291	100 %	0 %	0 %	0 %	51473324
3105	NC_006142	AGTA	2	8	148300	148307	50 %	25 %	25 %	0 %	51473324
3106	NC_006142	GAA	2	6	148343	148348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473324
3107	NC_006142	A	6	6	148436	148441	100 %	0 %	0 %	0 %	51473324
3108	NC_006142	ATA	3	9	148448	148456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473324
3109	NC_006142	AAG	2	6	148527	148532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473324
3110	NC_006142	TTA	2	6	148605	148610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473324
3111	NC_006142	AGA	2	6	148621	148626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473324
3112	NC_006142	TAA	2	6	148630	148635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473324
3113	NC_006142	TAA	3	9	148641	148649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473324
3114	NC_006142	ATCT	2	8	148665	148672	25 %	50 %	0 %	25 %	51473324
3115	NC_006142	ATA	2	6	148683	148688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473324
3116	NC_006142	GAA	2	6	148709	148714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473324
3117	NC_006142	AGT	2	6	148753	148758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473324
3118	NC_006142	TAAT	2	8	148761	148768	50 %	50 %	0 %	0 %	51473324
3119	NC_006142	TGA	2	6	148771	148776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473324
3120	NC_006142	AGA	2	6	148777	148782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473324
3121	NC_006142	GAT	2	6	148835	148840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473324
3122	NC_006142	ATG	3	9	148863	148871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473324
3123	NC_006142	A	6	6	148874	148879	100 %	0 %	0 %	0 %	51473324
3124	NC_006142	GT	3	6	148926	148931	0 %	50 %	50 %	0 %	51473324
3125	NC_006142	ATGA	2	8	149053	149060	50 %	25 %	25 %	0 %	51473325
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3245	NC_006142	A	7	7	154620	154626	100 %	0 %	0 %	0 %	51473331
3246	NC_006142	ATAA	2	8	154656	154663	75 %	25 %	0 %	0 %	51473332
3247	NC_006142	AACTAC	2	12	154715	154726	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	51473332
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3249	NC_006142	GGT	2	6	154782	154787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473332
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3493	NC_006142	TCA	2	6	166754	166759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473340
3494	NC_006142	A	7	7	166773	166779	100 %	0 %	0 %	0 %	51473340
3495	NC_006142	TTTA	2	8	166803	166810	25 %	75 %	0 %	0 %	51473340
3496	NC_006142	GCT	2	6	166851	166856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473340
3497	NC_006142	TGG	2	6	166864	166869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473340
3498	NC_006142	AG	3	6	166914	166919	50 %	0 %	50 %	0 %	51473340
3499	NC_006142	TTGT	2	8	167020	167027	0 %	75 %	25 %	0 %	51473340
3500	NC_006142	ATG	2	6	167115	167120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473340

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