MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia typhi str. Wilmington

Total Repeats: 22278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_006142	CTT	2	6	70226	70231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473264
1503	NC_006142	AGAA	2	8	70250	70257	75 %	0 %	25 %	0 %	51473264
1504	NC_006142	AAGA	2	8	70292	70299	75 %	0 %	25 %	0 %	51473264
1505	NC_006142	A	6	6	70316	70321	100 %	0 %	0 %	0 %	51473264
1506	NC_006142	TTA	2	6	70328	70333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473264
1507	NC_006142	TAT	2	6	70344	70349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473264
1508	NC_006142	TGA	2	6	70377	70382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473264
1509	NC_006142	GAT	3	9	70390	70398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473264
1510	NC_006142	CAAA	2	8	70416	70423	75 %	0 %	0 %	25 %	51473264
1511	NC_006142	A	6	6	70421	70426	100 %	0 %	0 %	0 %	51473264
1512	NC_006142	GCA	2	6	70498	70503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473264
1513	NC_006142	ATGGA	2	10	70532	70541	40 %	20 %	40 %	0 %	51473264
1514	NC_006142	AGA	2	6	70554	70559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473264
1515	NC_006142	AGC	2	6	70587	70592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473264
1516	NC_006142	AGA	2	6	70602	70607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473264
1517	NC_006142	AGA	2	6	70632	70637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473264
1518	NC_006142	GCA	2	6	70639	70644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473264
1519	NC_006142	AGA	2	6	70653	70658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473264
1520	NC_006142	ATGGA	2	10	70682	70691	40 %	20 %	40 %	0 %	51473264
1521	NC_006142	AGA	2	6	70704	70709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473264
1522	NC_006142	AGC	2	6	70737	70742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473264
1523	NC_006142	AGA	2	6	70752	70757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473264
1524	NC_006142	AGA	2	6	70782	70787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473264
1525	NC_006142	GCA	2	6	70789	70794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473264
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1528	NC_006142	AGA	2	6	70854	70859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473264
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1531	NC_006142	AGA	2	6	70932	70937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473264
1532	NC_006142	GCA	2	6	70939	70944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473264
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1535	NC_006142	AGA	2	6	71004	71009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473264
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1539	NC_006142	GCA	2	6	71089	71094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473264
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1541	NC_006142	ATGGA	2	10	71132	71141	40 %	20 %	40 %	0 %	51473264
1542	NC_006142	AGA	2	6	71154	71159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473264
1543	NC_006142	AGC	2	6	71187	71192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473264
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1545	NC_006142	AGA	2	6	71232	71237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473264
1546	NC_006142	GCA	2	6	71239	71244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473264
1547	NC_006142	AGA	2	6	71253	71258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473264
1548	NC_006142	ATGGA	2	10	71282	71291	40 %	20 %	40 %	0 %	51473264
1549	NC_006142	AGA	2	6	71304	71309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473264
1550	NC_006142	AGC	2	6	71337	71342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473264
1551	NC_006142	AGA	2	6	71352	71357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473264
1552	NC_006142	AGA	2	6	71382	71387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473264
1553	NC_006142	GCA	2	6	71389	71394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473264
1554	NC_006142	AGA	2	6	71403	71408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473264
1555	NC_006142	GAA	3	9	71473	71481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473264
1556	NC_006142	AAAGA	2	10	71491	71500	80 %	0 %	20 %	0 %	51473264
1557	NC_006142	CAG	2	6	71513	71518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473264
1558	NC_006142	A	6	6	71539	71544	100 %	0 %	0 %	0 %	51473264
1559	NC_006142	AGA	2	6	71556	71561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473264
1560	NC_006142	TAG	2	6	71600	71605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473264
1561	NC_006142	ACA	2	6	71628	71633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473264
1562	NC_006142	TGA	2	6	71640	71645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473264
1563	NC_006142	TAG	2	6	71649	71654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473264
1564	NC_006142	TCA	2	6	71703	71708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473264
1565	NC_006142	TGA	2	6	71754	71759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473264
1566	NC_006142	A	6	6	71759	71764	100 %	0 %	0 %	0 %	51473264
1567	NC_006142	AACA	2	8	71809	71816	75 %	0 %	0 %	25 %	51473264
1568	NC_006142	GAA	2	6	71826	71831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473264
1569	NC_006142	TGCTGA	2	12	71874	71885	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	51473264
1570	NC_006142	TCA	2	6	71888	71893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473264
1571	NC_006142	ATG	2	6	71900	71905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473264
1572	NC_006142	ATA	2	6	71948	71953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473264
1573	NC_006142	A	6	6	71953	71958	100 %	0 %	0 %	0 %	51473264
1574	NC_006142	CAG	2	6	71969	71974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473264
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1576	NC_006142	ATA	2	6	72113	72118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473264
1577	NC_006142	ATT	2	6	72203	72208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473264
1578	NC_006142	AAATC	2	10	72268	72277	60 %	20 %	0 %	20 %	51473264
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1582	NC_006142	ATA	2	6	72335	72340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473264
1583	NC_006142	AAT	2	6	72385	72390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473264
1584	NC_006142	A	6	6	72424	72429	100 %	0 %	0 %	0 %	51473264
1585	NC_006142	TAT	3	9	72447	72455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473264
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1587	NC_006142	TAA	2	6	72489	72494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473264
1588	NC_006142	A	6	6	72510	72515	100 %	0 %	0 %	0 %	51473264
1589	NC_006142	ATT	2	6	72539	72544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473264
1590	NC_006142	A	6	6	72553	72558	100 %	0 %	0 %	0 %	51473264
1591	NC_006142	TTA	2	6	72578	72583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473264
1592	NC_006142	AATT	2	8	72591	72598	50 %	50 %	0 %	0 %	51473264
1593	NC_006142	TTC	2	6	73246	73251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473265
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1595	NC_006142	GAA	2	6	73292	73297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473265
1596	NC_006142	TAT	2	6	73309	73314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473265
1597	NC_006142	TTA	2	6	73320	73325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473265
1598	NC_006142	TGT	2	6	73333	73338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473265
1599	NC_006142	TAT	2	6	73342	73347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473265
1600	NC_006142	TAC	2	6	73387	73392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473265
1601	NC_006142	CCA	2	6	73427	73432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51473265
1602	NC_006142	TAG	2	6	73465	73470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473265
1603	NC_006142	AAG	2	6	73495	73500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473265
1604	NC_006142	ATA	2	6	73511	73516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473265
1605	NC_006142	AAT	2	6	73787	73792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473266
1606	NC_006142	A	6	6	73818	73823	100 %	0 %	0 %	0 %	51473266
1607	NC_006142	T	6	6	73845	73850	0 %	100 %	0 %	0 %	51473266
1608	NC_006142	AGT	2	6	73876	73881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473266
1609	NC_006142	ACC	2	6	73882	73887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51473266
1610	NC_006142	TAT	2	6	73905	73910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473266
1611	NC_006142	AG	3	6	73918	73923	50 %	0 %	50 %	0 %	51473266
1612	NC_006142	TAGC	2	8	73985	73992	25 %	25 %	25 %	25 %	51473266
1613	NC_006142	AGTA	2	8	74002	74009	50 %	25 %	25 %	0 %	51473266
1614	NC_006142	AAT	2	6	74020	74025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473266
1615	NC_006142	GTT	2	6	74072	74077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473266
1616	NC_006142	AAT	2	6	74080	74085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473266
1617	NC_006142	TAT	2	6	74086	74091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473266
1618	NC_006142	ATTA	2	8	74095	74102	50 %	50 %	0 %	0 %	51473266
1619	NC_006142	TTTC	2	8	74110	74117	0 %	75 %	0 %	25 %	51473266
1620	NC_006142	GATA	2	8	74132	74139	50 %	25 %	25 %	0 %	51473266
1621	NC_006142	TAA	2	6	74146	74151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473266
1622	NC_006142	ATT	2	6	74191	74196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473266
1623	NC_006142	A	6	6	74230	74235	100 %	0 %	0 %	0 %	51473266
1624	NC_006142	AT	3	6	74304	74309	50 %	50 %	0 %	0 %	51473266
1625	NC_006142	TGAT	2	8	74318	74325	25 %	50 %	25 %	0 %	51473266
1626	NC_006142	AAC	2	6	74326	74331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473266
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