MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia typhi str. Wilmington

Total Repeats: 22278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_006142	AGC	2	6	43180	43185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473245
1002	NC_006142	TAAG	2	8	43221	43228	50 %	25 %	25 %	0 %	51473245
1003	NC_006142	ATT	2	6	43325	43330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473245
1004	NC_006142	TA	3	6	43345	43350	50 %	50 %	0 %	0 %	51473245
1005	NC_006142	GGC	2	6	43361	43366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51473245
1006	NC_006142	TAA	2	6	43381	43386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473245
1007	NC_006142	A	6	6	43396	43401	100 %	0 %	0 %	0 %	51473245
1008	NC_006142	A	6	6	43418	43423	100 %	0 %	0 %	0 %	51473245
1009	NC_006142	ATGC	2	8	43438	43445	25 %	25 %	25 %	25 %	51473245
1010	NC_006142	AAT	2	6	43460	43465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473245
1011	NC_006142	TCTTG	2	10	43472	43481	0 %	60 %	20 %	20 %	51473245
1012	NC_006142	GCA	2	6	43640	43645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473245
1013	NC_006142	CTAAAG	2	12	43656	43667	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	51473245
1014	NC_006142	GT	3	6	43677	43682	0 %	50 %	50 %	0 %	51473245
1015	NC_006142	TTG	2	6	43686	43691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473245
1016	NC_006142	TAA	2	6	43698	43703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473245
1017	NC_006142	TCT	2	6	43712	43717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473245
1018	NC_006142	TAT	2	6	43731	43736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473245
1019	NC_006142	AT	3	6	43735	43740	50 %	50 %	0 %	0 %	51473245
1020	NC_006142	AT	3	6	43763	43768	50 %	50 %	0 %	0 %	51473245
1021	NC_006142	TTG	2	6	43803	43808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473245
1022	NC_006142	TCTATC	2	12	43819	43830	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	51473245
1023	NC_006142	AT	3	6	43846	43851	50 %	50 %	0 %	0 %	51473245
1024	NC_006142	TCA	2	6	43883	43888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473245
1025	NC_006142	T	8	8	43922	43929	0 %	100 %	0 %	0 %	51473245
1026	NC_006142	GCTT	2	8	43940	43947	0 %	50 %	25 %	25 %	51473245
1027	NC_006142	ATC	2	6	43951	43956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473245
1028	NC_006142	TAGCAA	2	12	43986	43997	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	51473245
1029	NC_006142	AATT	2	8	44032	44039	50 %	50 %	0 %	0 %	51473245
1030	NC_006142	TAC	2	6	44046	44051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473245
1031	NC_006142	TAAA	2	8	44142	44149	75 %	25 %	0 %	0 %	51473245
1032	NC_006142	ATTT	2	8	44158	44165	25 %	75 %	0 %	0 %	51473245
1033	NC_006142	A	6	6	44227	44232	100 %	0 %	0 %	0 %	51473245
1034	NC_006142	ATGT	2	8	44247	44254	25 %	50 %	25 %	0 %	51473245
1035	NC_006142	AAT	2	6	44417	44422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473245
1036	NC_006142	ATTAT	2	10	44664	44673	40 %	60 %	0 %	0 %	51473246
1037	NC_006142	A	6	6	44727	44732	100 %	0 %	0 %	0 %	51473246
1038	NC_006142	GTA	2	6	44739	44744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473246
1039	NC_006142	AT	3	6	44766	44771	50 %	50 %	0 %	0 %	51473246
1040	NC_006142	A	7	7	44829	44835	100 %	0 %	0 %	0 %	51473246
1041	NC_006142	TG	3	6	44838	44843	0 %	50 %	50 %	0 %	51473246
1042	NC_006142	TGTT	2	8	44846	44853	0 %	75 %	25 %	0 %	51473246
1043	NC_006142	TAC	2	6	44872	44877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473246
1044	NC_006142	GCA	2	6	44883	44888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473246
1045	NC_006142	TCT	2	6	44889	44894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473246
1046	NC_006142	TCA	2	6	45000	45005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473246
1047	NC_006142	ATC	2	6	45012	45017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473246
1048	NC_006142	T	6	6	45019	45024	0 %	100 %	0 %	0 %	51473246
1049	NC_006142	AT	3	6	45037	45042	50 %	50 %	0 %	0 %	51473246
1050	NC_006142	AT	3	6	45057	45062	50 %	50 %	0 %	0 %	51473246
1051	NC_006142	ATC	2	6	45146	45151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473246
1052	NC_006142	T	8	8	45272	45279	0 %	100 %	0 %	0 %	51473246
1053	NC_006142	TAT	2	6	45319	45324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473246
1054	NC_006142	A	6	6	45509	45514	100 %	0 %	0 %	0 %	51473246
1055	NC_006142	AAG	2	6	45552	45557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473246
1056	NC_006142	TAAAA	2	10	45631	45640	80 %	20 %	0 %	0 %	51473246
1057	NC_006142	TA	3	6	45773	45778	50 %	50 %	0 %	0 %	51473246
1058	NC_006142	TC	3	6	45831	45836	0 %	50 %	0 %	50 %	51473246
1059	NC_006142	CTG	2	6	45868	45873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473246
1060	NC_006142	ATA	2	6	45880	45885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473246
1061	NC_006142	TCT	2	6	45888	45893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473246
1062	NC_006142	ATG	2	6	45932	45937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473246
1063	NC_006142	TAG	2	6	45961	45966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473246
1064	NC_006142	CAA	2	6	45991	45996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473246
1065	NC_006142	TGA	2	6	46174	46179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473246
1066	NC_006142	A	6	6	46232	46237	100 %	0 %	0 %	0 %	51473246
1067	NC_006142	TCA	2	6	46260	46265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473246
1068	NC_006142	AATT	2	8	46309	46316	50 %	50 %	0 %	0 %	51473246
1069	NC_006142	GAAA	2	8	46323	46330	75 %	0 %	25 %	0 %	51473246
1070	NC_006142	TTTC	2	8	46438	46445	0 %	75 %	0 %	25 %	51473246
1071	NC_006142	TTA	2	6	46476	46481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473246
1072	NC_006142	CTT	2	6	46496	46501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473246
1073	NC_006142	A	6	6	46503	46508	100 %	0 %	0 %	0 %	51473246
1074	NC_006142	AGC	2	6	46520	46525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473246
1075	NC_006142	TA	3	6	46543	46548	50 %	50 %	0 %	0 %	51473246
1076	NC_006142	AT	3	6	46557	46562	50 %	50 %	0 %	0 %	51473246
1077	NC_006142	A	6	6	46571	46576	100 %	0 %	0 %	0 %	51473246
1078	NC_006142	TAA	2	6	46624	46629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473246
1079	NC_006142	TCT	2	6	46697	46702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473246
1080	NC_006142	TCA	2	6	46788	46793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473246
1081	NC_006142	TAA	2	6	46825	46830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473246
1082	NC_006142	TAA	2	6	46835	46840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473246
1083	NC_006142	TCTT	2	8	46910	46917	0 %	75 %	0 %	25 %	51473246
1084	NC_006142	GTTCTA	2	12	46941	46952	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	51473246
1085	NC_006142	GTA	2	6	47160	47165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473247
1086	NC_006142	TTA	2	6	47170	47175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473247
1087	NC_006142	TTTA	2	8	47199	47206	25 %	75 %	0 %	0 %	51473247
1088	NC_006142	ATATA	2	10	47240	47249	60 %	40 %	0 %	0 %	51473247
1089	NC_006142	AAAT	2	8	47303	47310	75 %	25 %	0 %	0 %	51473247
1090	NC_006142	TACT	2	8	47351	47358	25 %	50 %	0 %	25 %	51473247
1091	NC_006142	ATC	2	6	47365	47370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473247
1092	NC_006142	CTT	2	6	48151	48156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473248
1093	NC_006142	AT	3	6	48173	48178	50 %	50 %	0 %	0 %	51473248
1094	NC_006142	AGT	2	6	48190	48195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473248
1095	NC_006142	AAT	2	6	48269	48274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473248
1096	NC_006142	CTT	2	6	48314	48319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473248
1097	NC_006142	CTT	2	6	48339	48344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473248
1098	NC_006142	AATC	2	8	48346	48353	50 %	25 %	0 %	25 %	51473248
1099	NC_006142	TAAC	2	8	48361	48368	50 %	25 %	0 %	25 %	51473248
1100	NC_006142	ATA	2	6	48392	48397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473248
1101	NC_006142	ATA	2	6	48471	48476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473248
1102	NC_006142	TAT	2	6	48550	48555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473248
1103	NC_006142	TAT	2	6	48569	48574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473248
1104	NC_006142	CAA	2	6	48601	48606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473248
1105	NC_006142	GATTT	2	10	48635	48644	20 %	60 %	20 %	0 %	51473248
1106	NC_006142	TGA	2	6	48675	48680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473248
1107	NC_006142	T	6	6	48707	48712	0 %	100 %	0 %	0 %	51473248
1108	NC_006142	ATT	2	6	48713	48718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473248
1109	NC_006142	ATT	2	6	48731	48736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473248
1110	NC_006142	CTT	2	6	49216	49221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473249
1111	NC_006142	GAAA	2	8	49232	49239	75 %	0 %	25 %	0 %	51473249
1112	NC_006142	TTA	2	6	49254	49259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473249
1113	NC_006142	GATT	2	8	49281	49288	25 %	50 %	25 %	0 %	51473249
1114	NC_006142	TAC	2	6	49289	49294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473249
1115	NC_006142	T	6	6	49473	49478	0 %	100 %	0 %	0 %	51473250
1116	NC_006142	CAT	2	6	49509	49514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473250
1117	NC_006142	AT	3	6	49529	49534	50 %	50 %	0 %	0 %	51473250
1118	NC_006142	TCA	2	6	49535	49540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473250
1119	NC_006142	TA	3	6	49593	49598	50 %	50 %	0 %	0 %	51473250
1120	NC_006142	TCT	2	6	49654	49659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473250
1121	NC_006142	ATT	2	6	49684	49689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473250
1122	NC_006142	AAT	2	6	51155	51160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473251
1123	NC_006142	ATC	2	6	51176	51181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473251
1124	NC_006142	ATT	2	6	51237	51242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473251
1125	NC_006142	TAA	3	9	51248	51256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473251
1126	NC_006142	AGT	2	6	51288	51293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473252
1127	NC_006142	ATC	2	6	51382	51387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473252
1128	NC_006142	T	6	6	51404	51409	0 %	100 %	0 %	0 %	51473252
1129	NC_006142	ATCAT	2	10	51418	51427	40 %	40 %	0 %	20 %	51473252
1130	NC_006142	TTC	2	6	51456	51461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473252
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