MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia typhi str. Wilmington

Total Repeats: 22278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_006142	ATA	2	6	290607	290612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473432
6002	NC_006142	TAA	2	6	290619	290624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473432
6003	NC_006142	A	6	6	290651	290656	100 %	0 %	0 %	0 %	51473432
6004	NC_006142	TAT	2	6	290681	290686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473432
6005	NC_006142	TAC	2	6	290719	290724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473432
6006	NC_006142	GA	3	6	290756	290761	50 %	0 %	50 %	0 %	51473432
6007	NC_006142	TTA	2	6	290763	290768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473432
6008	NC_006142	CAG	2	6	290867	290872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473432
6009	NC_006142	A	6	6	290905	290910	100 %	0 %	0 %	0 %	51473432
6010	NC_006142	AGT	2	6	290956	290961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473433
6011	NC_006142	GTT	2	6	291104	291109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473433
6012	NC_006142	AAT	2	6	291110	291115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473433
6013	NC_006142	TA	3	6	291149	291154	50 %	50 %	0 %	0 %	51473433
6014	NC_006142	ATG	2	6	291201	291206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473433
6015	NC_006142	GGT	2	6	291320	291325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473433
6016	NC_006142	GTA	2	6	291347	291352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473433
6017	NC_006142	ATA	2	6	292960	292965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473434
6018	NC_006142	ATGT	2	8	293011	293018	25 %	50 %	25 %	0 %	51473434
6019	NC_006142	TAT	2	6	293032	293037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473434
6020	NC_006142	GTT	2	6	293065	293070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473434
6021	NC_006142	CAT	2	6	293122	293127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473434
6022	NC_006142	AAT	2	6	293153	293158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473434
6023	NC_006142	TCT	2	6	293181	293186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473434
6024	NC_006142	TGC	2	6	293201	293206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473434
6025	NC_006142	ATC	2	6	293313	293318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473434
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6027	NC_006142	TTC	2	6	293367	293372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473434
6028	NC_006142	ATT	2	6	293373	293378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473434
6029	NC_006142	TAC	2	6	293413	293418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473435
6030	NC_006142	T	6	6	293423	293428	0 %	100 %	0 %	0 %	51473435
6031	NC_006142	GTT	2	6	293432	293437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473435
6032	NC_006142	TTC	2	6	293488	293493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473435
6033	NC_006142	T	6	6	293494	293499	0 %	100 %	0 %	0 %	51473435
6034	NC_006142	T	8	8	293526	293533	0 %	100 %	0 %	0 %	51473435
6035	NC_006142	AT	3	6	293567	293572	50 %	50 %	0 %	0 %	51473435
6036	NC_006142	ATATCT	2	12	293618	293629	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	51473435
6037	NC_006142	TTC	2	6	293647	293652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473435
6038	NC_006142	ACC	2	6	293653	293658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51473435
6039	NC_006142	TGA	2	6	293738	293743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473435
6040	NC_006142	CA	3	6	293781	293786	50 %	0 %	0 %	50 %	51473435
6041	NC_006142	TTA	2	6	293813	293818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473435
6042	NC_006142	TTTG	2	8	293832	293839	0 %	75 %	25 %	0 %	51473435
6043	NC_006142	ACG	2	6	293857	293862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473435
6044	NC_006142	TAAA	2	8	293865	293872	75 %	25 %	0 %	0 %	51473435
6045	NC_006142	GCT	2	6	293891	293896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473435
6046	NC_006142	TCT	2	6	293987	293992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473435
6047	NC_006142	AAT	2	6	294006	294011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473435
6048	NC_006142	TCA	2	6	294059	294064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473435
6049	NC_006142	ATT	2	6	294074	294079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473435
6050	NC_006142	CTG	2	6	294152	294157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473435
6051	NC_006142	TTA	2	6	294213	294218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473435
6052	NC_006142	TAC	2	6	294271	294276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473435
6053	NC_006142	ATC	2	6	294277	294282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473435
6054	NC_006142	T	7	7	294297	294303	0 %	100 %	0 %	0 %	51473435
6055	NC_006142	TAA	2	6	294343	294348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473435
6056	NC_006142	TCA	2	6	294377	294382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473435
6057	NC_006142	TTA	2	6	294447	294452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473435
6058	NC_006142	TCA	2	6	294458	294463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473435
6059	NC_006142	ATC	2	6	294490	294495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473435
6060	NC_006142	ACA	2	6	294521	294526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473435
6061	NC_006142	AGT	2	6	294535	294540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473435
6062	NC_006142	ATT	2	6	294557	294562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473435
6063	NC_006142	ATCC	2	8	294576	294583	25 %	25 %	0 %	50 %	51473435
6064	NC_006142	CAT	2	6	294592	294597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473435
6065	NC_006142	AGTAT	2	10	294608	294617	40 %	40 %	20 %	0 %	51473435
6066	NC_006142	CTT	2	6	294648	294653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473435
6067	NC_006142	CTA	3	9	294735	294743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473435
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6070	NC_006142	ATT	2	6	295009	295014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473436
6071	NC_006142	TAA	2	6	295067	295072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473436
6072	NC_006142	AAAT	2	8	295105	295112	75 %	25 %	0 %	0 %	51473436
6073	NC_006142	T	6	6	295145	295150	0 %	100 %	0 %	0 %	51473436
6074	NC_006142	TCC	2	6	295211	295216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51473436
6075	NC_006142	TAA	2	6	295252	295257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473436
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6081	NC_006142	AATG	2	8	295430	295437	50 %	25 %	25 %	0 %	51473437
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6091	NC_006142	TAT	2	6	295785	295790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473437
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6101	NC_006142	TA	3	6	296421	296426	50 %	50 %	0 %	0 %	51473438
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6108	NC_006142	A	6	6	296546	296551	100 %	0 %	0 %	0 %	51473438
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6113	NC_006142	AT	4	8	296756	296763	50 %	50 %	0 %	0 %	51473439
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6117	NC_006142	T	6	6	296858	296863	0 %	100 %	0 %	0 %	51473439
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6121	NC_006142	T	6	6	297084	297089	0 %	100 %	0 %	0 %	51473439
6122	NC_006142	CAGT	2	8	297129	297136	25 %	25 %	25 %	25 %	51473439
6123	NC_006142	AGA	2	6	297218	297223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473439
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